RNA splicing e Editing, Maturazione pre-rRNA e pre-tRNA Flashcards
Introni autocatalitici 1
200-500 nucleotidi
Guanosina accessoria
Intorni autocatalitici 2
400-1000
OH di adenosina
Introni tRna
Endoribonucleasi, fosfodiesterasi e chinasi, tRna ligasi, fosfoidrolasi
Introni archei
Endonucleasi idrolizzano legami fosfodiesterici in sito don e accettore. Poi estremità introne riunite da ligasi
Ligasi lega esoni
Introni spliceosomiali
Nucleotide GU in esone-introne e AG in introne-esone. Tratto poli pirimidine e dentro A
2 transesterificazioni -> oh in 2 di adenosina rompe giunzione esone-introne legando 1 nucleotide introne su P
oh di 3 espone rompe introne-esone
Spliceosoma
Complesso di 5 ribonucleoproteine con componente proteica e una snRna
U1 lega splicing in 5 e U2AF e BBP legano tratto poli pirimidinico -> E
U2 scalza BBP -> A
trimero U4-5-6 avvicina sito splicing 5 e 3 -> B1
U6 scalza U1 in sito 5 -> B2
U6 e U2 vanno su Oh in 2 adenosina -> B*
attacco nucleofilo su sito 5 di Oh di A con P di introne finale -> C1
U5 aiuta a posizionare Oh in 3 esone 1 per attacco Nu si sito 3 -> C2
Tipi di splicing
Alternativo e costitutivo
Attivatori e repressori famiglie
Delle proteine S/R
Delle proteine hnRnp
Editing
Pan editing (inserzione o no di uridina)
Editing semplice esempio di apoB
rRna procarioti ed eucarioti
Tipi di rRna . Modifiche sul trascritto primario da Rnasi, dopo endonucleasi che portano frammenti intermedi. Regioni superflue rimosse da esonucleasi
rRna eucarioti
Quali sono le modifiche sui siti di taglio da snoRNP (C/D e H/ACA)
tRna processamento procarioti ed eucarioti
Procarioti: esonucleasi Rnasi P toglie regione estesa in 5 e endo ed esco in estremità 3
Tripletta CCA
Eucarioti: Rnasi P (endonucleasi) e Rnasi Z (endonucleasi) tolgono estensioni in 5 e 3
Se non c è CCA interviene nucleotidica transferasi
Introne tolto da chinasi e fosfatasi
Traslocazione nucleocito
Carrioferrine per pori nucleari. NLS (Seq localiz nucleare) e NES (Seq esportazione nucleare)
Traslocazione nucleo cito per rRna eucarioti
Nel nucleolo prodotto 90s con prot ribosomali e fattori non ribosomiali
Tipi di aminoacil tRna sintetasi classi
2 e 1
Aminoacilazione tRna
AA e atp. tRna e aminoaciladenilato
Controlli aminoacil tRna sintetasi
Interazione AA con sito di legame catalitico
tRna si lega in modo specifico all anticodone corretto
Liberazione aminoacil trna
Trasporto mRNA maturo al citosol
mRNP proteine. Sistema tramp. Complessi giunzioni esoniche EJC per stabilità e controllo. Upf1 e 2 controllo qualità. Complessi maskin
