RNA splicing e Editing, Maturazione pre-rRNA e pre-tRNA

Question 1

Introni autocatalitici 1

Answer 1

200-500 nucleotidi
Guanosina accessoria

Question 2

Intorni autocatalitici 2

Answer 2

400-1000
OH di adenosina

Question 3

Introni tRna

Answer 3

Endoribonucleasi, fosfodiesterasi e chinasi, tRna ligasi, fosfoidrolasi

Question 4

Introni archei

Answer 4

Endonucleasi idrolizzano legami fosfodiesterici in sito don e accettore. Poi estremità introne riunite da ligasi
Ligasi lega esoni

Question 5

Introni spliceosomiali

Answer 5

Nucleotide GU in esone-introne e AG in introne-esone. Tratto poli pirimidine e dentro A
2 transesterificazioni -> oh in 2 di adenosina rompe giunzione esone-introne legando 1 nucleotide introne su P
oh di 3 espone rompe introne-esone

Question 6

Spliceosoma

Answer 6

Complesso di 5 ribonucleoproteine con componente proteica e una snRna
U1 lega splicing in 5 e U2AF e BBP legano tratto poli pirimidinico -> E
U2 scalza BBP -> A
trimero U4-5-6 avvicina sito splicing 5 e 3 -> B1
U6 scalza U1 in sito 5 -> B2
U6 e U2 vanno su Oh in 2 adenosina -> B*
attacco nucleofilo su sito 5 di Oh di A con P di introne finale -> C1
U5 aiuta a posizionare Oh in 3 esone 1 per attacco Nu si sito 3 -> C2

Question 7

Tipi di splicing

Answer 7

Alternativo e costitutivo

Question 8

Attivatori e repressori famiglie

Answer 8

Delle proteine S/R
Delle proteine hnRnp

Question 9

Editing

Answer 9

Pan editing (inserzione o no di uridina)
Editing semplice esempio di apoB

Question 10

rRna procarioti ed eucarioti

Answer 10

Tipi di rRna . Modifiche sul trascritto primario da Rnasi, dopo endonucleasi che portano frammenti intermedi. Regioni superflue rimosse da esonucleasi

Question 11

rRna eucarioti

Answer 11

Quali sono le modifiche sui siti di taglio da snoRNP (C/D e H/ACA)

Question 12

tRna processamento procarioti ed eucarioti

Answer 12

Procarioti: esonucleasi Rnasi P toglie regione estesa in 5 e endo ed esco in estremità 3
Tripletta CCA
Eucarioti: Rnasi P (endonucleasi) e Rnasi Z (endonucleasi) tolgono estensioni in 5 e 3
Se non c è CCA interviene nucleotidica transferasi
Introne tolto da chinasi e fosfatasi

Question 13

Traslocazione nucleocito

Answer 13

Carrioferrine per pori nucleari. NLS (Seq localiz nucleare) e NES (Seq esportazione nucleare)

Question 14

Traslocazione nucleo cito per rRna eucarioti

Answer 14

Nel nucleolo prodotto 90s con prot ribosomali e fattori non ribosomiali

Question 15

Tipi di aminoacil tRna sintetasi classi

Answer 15

2 e 1

Question 16

Aminoacilazione tRna

Answer 16

AA e atp. tRna e aminoaciladenilato

Question 17

Controlli aminoacil tRna sintetasi

Answer 17

Interazione AA con sito di legame catalitico
tRna si lega in modo specifico all anticodone corretto
Liberazione aminoacil trna

Question 18

Trasporto mRNA maturo al citosol

Answer 18

mRNP proteine. Sistema tramp. Complessi giunzioni esoniche EJC per stabilità e controllo. Upf1 e 2 controllo qualità. Complessi maskin