DNA e RNA, CROMATINA Flashcards
Basi azotate minori nel DNA
5-metilcitosina
N6-metiladenosina
N2-metilguanina
Basi azotate minori nel RNA
inosina
Pseudouracile
7-metil guanina
Modifiche spontanee ai nucleotidi
Deaminazione
Depurinazione e depurimidinazione
Alchilazione
Modifiche ai nucleotidi da agenti esogeni
Radiazioni UV
agenti alchilanti
Agenti deaminanti
Regole di chargaff
DNA da diversi tessuti in uguali specie è uguale
Non cambia per nutrizione e stimoli esterni
Uguale somma di purine e pirimidine
Diversa % di somma GC e AT
Watson e crick
2 catene polinucleotidiche, antiparallele, destrorse, complementari
Diametro 30A, distanza nucleotidi 3,4A, 10,5 nucleotidi per giro
Conformazioni alternative DNA
A -> larga e corta. Disidratata. Bassa umidità e alto contenuto salino
Z -> lunga e stretta. Ricca di G e C, a monte di regioni da trascrivere. cpg. Etanolo
Strutture secondarie DNA INSOLITE
Cruciforme
Forcina
Scivolata
Tripla elica
Quartetti di G (regioni telomeriche del cromosoma)
DNA curvo
rRNA modifiche strutturali struttura 3
Motivo Pseudonodo
A cerniera di ribosio
Tetra ansa
Piega K
Funzioni RNA
Sintesi
Modificazione RNA
Replicazione
Stabilità
Regolazione espressione genica
Trasporto intracell di proteina
Catalisi
Cromatina tipi
Etero cromatina (costitutiva e facoltativa)
Eucromatina
Fibra 10nm come si forma
Ottamero: tetramero h3 e h4 avvolto da DNA con caf1. Entra h2a e h2b dimentico con nap1
Fibra 30nm come si forma
H1 lega nucleosoma all esterno facondoli avvicinare. Coda N terminale tiene nucleosoma vicini per interazioni ioniche, sito di modifiche chimiche regolando compattazione
Modifiche covalenti chimica prote istoniche
Su lisina acetilazione/deac -> idrolizzano HAT e HDAC
lisina e arginina Met/demet con HMT e HDM
Serina e trentina forfo/defosfo
Ubiquitazione
Rimodellamento nucleosomi
Scivolamento (ISWI)
eliminazione core proteico (ISWI)
sostituzione istone principale con minore (SWR1)
