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Virologie II > Retroviridae > Flashcards

Retroviridae Flashcards

1
Q

Retroviridae - Les 7 genres de la famille sont divisés en deux groupes. Quels sont-ils? Et pour quoi codent-ils?

A

Les rétrovirus simples: Gag, Pro, Pol, Env

Les rétrovirus complexes: Gag, Pro, Pol, Env, protéines régulatrices

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2
Q

Les rétrovirids sont phylogénétiquement liés à d’autres rétroéléments, comme:

A
  • autres familles de virus (Hepadnaviridae)
  • rétrotransposons
  • introns auto-clivés
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3
Q

Retroviridae - Décris la structure générale de la particule (sans nommer toutes les protéines)

A

Particule sphérique enveloppée, environ 100 nm de diamètre

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4
Q

Retroviridae - Nomme les 8 protéines principales de la particule mature

A 
SU: surface
TM: protéine transmembranaire
PR: protéase
MA: matrice
NC: nucléocapside
CA: capside
IN: intégrase
RT: transcriptase inverse
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5
Q

Retrovidirae - Quelle est la classification de Baltimore des retrovirids?

A

Baltimore VI : ARNsb+ en 2 copies, donc fonctionnellement diploïde, pour donner une molécule d’ADNdb

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6
Q

Retroviridae - Quelle est la longueur du génome?

A

13,7 kb

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7
Q

Retroviridae - VRAI ou FAUX Le génome possède une coiffe 5’ et une queue poly A.

A

VRAI

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8
Q

Retroviridae - Quels sont les 5 blocs importants de la séquence du génome?

A

U5: site requis pour l’integration provirale
Gag: antigène spécifique de groupe
Pol: polymérase
Env: enveloppe
U3: expression des gènes viraux et intégration ADN

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9
Q

Retroviridae - Parle moi des 16 étapes de la réplication du virus

A

La protéine d’enveloppe virale se lie à un récepteur cellulaire à la surface.
Le core est libéré dans le cytoplasme (fusion des membranes).
Transcription de l’ARN viral en ADNdb.
ADN va dans le noyau et s’insère dans le génome cellulaire par l’ARN poly II.
Des transcrits vont dans le noyau et d’autres sont traduits par des ribosomes cytoplasmiques en polyprotéines (précurseur Gag, Gag-Pol).
D’autres sont épissées en ARNm qui code pour précurseur de la polyprot Env.
Env est transportée vers Golgi pour former SU-TM.
Env mature vont à la surface.
Les composants du virion se rejoignent au site de brougeonnement.
Assemblage face interne de la membrane plasmique.
PR clive Gag et Gag-Pol = production virions matures.

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10
Q

Retroviridae - Quelle sous-unité du produit protéique Env se lie en premier au récepteur cellulaire?

A

SU

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11
Q

Retroviridae - La fusion membranaire à l’entrée est dirigée principalement par quelle sous-unité de Env?

A

TM

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12
Q

Retroviridae - À quel endroit spécifique de la membrane cellulaire se fait l’entrée du virus?

A

régions qui possèdent une composition lipidique spéciale appelée radeaux lipidiques

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13
Q

Retroviridae - VRAI ou FAUX L’entrée du virus est dépendante du pH?

A

FAUX

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14
Q

Retroviridae - Quel est le dogme central de la biologie moléculaire? Est-ce que les rétrovirids y adhèrent?

A

Le transfert de l’info génétique est unidirectionnel: ADN - ARN - protéine, et non ils n’y adhèrent pas

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15
Q

Retroviridae - Quel est le signal qui déclenche la synthèse de l’ADN?

A

L’exposition de la nucléocapside virale à des niveaux élevés de nucléotides dans le cytoplasme

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16
Q

Retroviridae - Nomme moi les 3 composants essentiels de la réaction de la transcriptase inverse.

A

ARN génomique viral,

une amorce, transcriptase inverse

17
Q

Retroviridae - Qu’est-ce qui explique le taux élevé de recombinaison génétique?

A

Les deux génomes sont utilisés comme gabarits dans le processus RT. Le génome est revêtu d’un protéine de nucléocapside (NC) qui facilite le template switching et la processivité.

18
Q

Retroviridae - De quelle nature est l’amorce? Comment est-elle acquise? À quoi se lie-t-elle?

A

C’est une molécule d’ARNt. Elle est acquise à partir de la cellule pendant l’assemblage du virion. Elle se lie au site de liaison d’amorce (PBS) à proximité de l’extrémité 5’.

19
Q

Retroviridae - Où a lieu la synthèse d’ADN?

A

Dans le cytoplasme, plus précisément dans la structure sous-virale appelée le complexe RT

20
Q

Retroviridae - Quelles sont les activités catalytiques de la transcriptase inverse?

A

1) Polymérisation ARN ou ADN
2) Déroulement de l’ADN
3) Hydrolyse de l’ARN par la RNase H

21
Q

Retroviridae - Que fait le domaine RNase H de la RT?

A
  1. Dégrade l’ARNg après avoir été copié en ADNc
  2. Crée l’amorce pour la synthèse ADN+
  3. Supprime cette amorce et l’amorce ARNt de l’ADN viral naissant
22
Q

Retroviridae - Décris moi la réplication des rétrovirids

A
  • Synthèse d’un produit de 100 nts de brin ADN- qui comprend l’amorce ARNt appelé ADN strong-stop -
  • Il y a dégradation de l’extrémité 5’ par la RNase H
  • 1er échange de gabarit: liaison entre séquence R de l’ADN strong-stop et séquence complémentaire r avant la queue poly-A qui aboutit à la substitution de l’extrémité 5’ à 3’
  • Copie du génome entier de 3’ à 5’ en même temps que la dissolution de l’ARN par la RNase H
  • Initiation de la synthèse de l’ADN à brin + : le produit de la digestion de l’ARN est un fragment comprenant un polypurine (ppt) qui sert d’amorce pour la synthèse de l’ADN+
  • Le produit appelé ADN strong-stop + commence à la fin de l’ADN- et se termine après avoir copié 18 nts de l’amorce ARNt
  • L’extrémité 3’ sb de ADN + se lie aux séquences complémentaires (PBS) à l’extrémité 3’ de l’ADN-
  • 2e échange de gabarit: l’hybridation des séquences PBS fournit un gabarit à ADN circulaire pour la polymérisation. Le brin + est synthétisé en utilisant le brin - comme gabarit
23
Q

Retroviridae - Pourquoi on dit de la transcription inverse rétrovirale qu’elle correspond à une réplication destructrice?

A

Car il n’Y a pa de gain net de génome, mais plutôt une substitution de 2 ARNsb+ pour 1 molécule ADNdb

24
Q

Retroviridae - Quels sont les deux modèles de recombinaison au cours de la transcription inverse?

A

1) Copy choice durant la synthèse du brin - : la synthèse du brin - de l’ADN commence sur une génome et passe au 2e génome à un point de rupture, à un site de pause ou à un emplacement aléatoire
2) Strand displacement model durant la synthèse du brin + : la synthèse de l’ADN à brin + commence à des sites internes avec des amorces ARN produites par la RNase H. Les fragments sont déplacés par la RT et sont assimilés sur l’ADN du 2e génome.

25
Q

Retroviridae - Qui catalyse l’insertion spécifique du génome viral dans le génome cellulaire?

A

l’intégrase rétrovirale (IN)

26
Q

Retroviridae - Décris l’intégration du provirus dans le génome cellulaire.

A

2 paires de base (AA et TT) sont perdues aux deux extrémités du provirus et un site cible de 6pb dans l’ADN de l’hôte est dupliqué de chaque côté de l’ADN viral, ce qui crée des extrémités identiques

27
Q

Retroviridae - Définis les rétroéléments.

A

Séquences liées à la RT dérivées de rétrovirus qui on été trouvées dans les génomes cellulaires

Virologie II (11 decks)

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