Flaviviridae Flashcards
Flaviviridae - Qu’entend-on nous par Arbovirus ?
Terme utilisé pour désigner un groupe de virus transmis par des vecteurs arthropodes.
Flaviviridae - Vrai ou Faux - es arbovirus sont considérés dans la taxonomie officielle
Faux - c’est un regroupement de plusieurs familles. Il n’y a pas de lien phylogénétique, pas d’ancêtre commun. Seul le mode de transmission est similaire.
Flaviviridae - Quels sont les familles comprises dans les Arbovirus ?
Togaviridae, Flaviviridae, Reoviridae, Bunyaviridae
Flaviviridae - vrai ou faux - les Flavivirus, genre de la famille, se trouvent sur les 6 continents
Vrai
Flaviviridae - Quelle est la structure du virion ?
Le virions a un dimaètre d’environ 50nm. Il est constitué d’une membrane lipidique, d’une enveloppe glycoprotéique et d’une membrane protéique. E code pour l’enveloppe (dimère de E) et M code pour la membrane protéique (dimère de M).
La nucléocapside est constituée de protéines de la capside et de l’ARN génomique. L’ARN est attaché à la capside.
Les deux protéines les plus importantes sont E et M. E forment des dimères et recouvre la membrane protéique. M attache la membrane interne à l’enveloppe protéique externe.
Flaviviridae - les virions ont-ils une membrane lipidique, soit une enveloppe ?
Oui - l’enveloppe (E) glycoprotéique est importante pour la fusion et la liaison.
Flaviviridae - Expliquer les étapes importantes dans le cycle de réplication des flaviviridae (7 étapes)
- la liaison et l’entrée implique l’endocytose médiée par un récepteur
- le bas pH de l,endosome induit la fusion de l’enveloppe du virion avec les membranes de la vésicule
- le génome ARN est libér dans le cytoplasme
- Les protéines virales sont produite par le clivage de la polyprotéines
- La réplication du génome à partir d’un brin négatif intermédiaire se produit entièrement dans le cytoplasme
- Les novueaux nirions acquièrent une enveloppe par bourgeonnement dans le RE
- Les virus transitent par la voie de sécrétion de l’hôte et sont libéré à la surface de la cellule
Flaviviridae - Vrai ou faux - les protéines M et E sont les plus abondantes dans le virion. Elles entrent en contact avec la nucléocapside pour la stabiliser.
Faux - E et M n’entrent pas en contact avec la nucléocapside
E recouvre la membrane protéique de M qui attache la membrane interne (lipidique) à E, l’enveloppe.
Flaviviridae -Quelle est la structure du génome ?
Le génome est ARN sb + de longueur d’environ 11kb. Le génome possède une coiffe en 5’ qui stabilise l’ARN viral, initie la traduction et déjoue les défenses antivirales de l’hôte. Le génome a un ORF, mais pas de queue poly(A)
La région non-codante 5’ (NCR 5’) est très structurée et est impliquée dans la traduction et la réplication du génome. La région 3’ non codante a une structure tige-boucle (aide à la traduction) et confère une protection contre les attaques cellulaires
La longue polyprotéine comprend une partie structurale en 5’ (C, M et E) et non structurale en 3’ (NS, NS3, NS5)
Flaviviridae - comme les Picornaviridae, les Flavi ne possèdent pas de queue poly(A) , ni de coiffe en 5’, mais une séquence IRES.
Faux, ils possèdent une coiffe en 5’ qui stabilise l’ARN viral, initie la traduction et déjoue les défenses antivirales de l’hôte.
Ils n’ont pas de queue poly(A)
Flaviviridae - Vrai ou faux - comme les Picornaviridae, les Flavi possèdent d’un ORF
Vrai - un ORF pour une polyprotéine
Flaviviridae - Quelle est la classification de Baltimore ?
IV
Flaviviridae - Quelles sont les fonctions des régions NCR 5’ et 3’ du génome ?
NCR5’ est très structurée et est impliquée dans la tradcution et la réplication du génome
NCR3’ contient une structure en tige-boucle qui joue un rôle dan la traduction et elle contient d’autres structures qui confèrent une résistance à l’attaque cellulaire des exoribonucléases.
Flaviviridae -La séquence non-structurale du génome code pour 3 protéines importantes, lesquelles ?
NS3 : protéase et hélicase
NS5 : RdRp
Flaviviridae - la région codante en 5’ code pour quel type de protéines?
Protéines structurales : C, M et E
