Filoviridae Flashcards
Filoviridae - expliquee le rôle des protéines structurales de filovirus
Les protéines structurales des Filo peuvent être divisées en 2 types :
1. celles qui sont associées à la CAPSIDE (impliquées dans l’assemblage et à l’entrée)
- celles formant la ribonucléocapside (RNC) (impliquées dans la transcription et la réplication du génome)
La glycoporétine joue un rôle dans la pénétration du virus, la pathogénèse et l’antigénécité. GP0 est initialement une simple molécule qui sera clivée dans la voie de sécrétion pour donner la forme mature.
M joue un rôle dans le bourgeonnement et conduit à l’enveloppement de la RNC.
Filoviridae - Quels sont les manières d’être infecter par un filovirus?
Contact direct avec patients ou cadavres infectés: sperme, sécrétions génitales, peau, piqûres par aiguille, abattage primates, aérosols
Filoviridae - Quels sont les symptômes d’une infection mortelle à Filovirus?
Nécrose des tissus de plusieurs organes (foie, rein, rate)
Filoviridae - Lorsqu’on travaille avec ces virus, quelle catégorie de biosécurité doivent adopter les chercheurs ?
Biosécurité 4
Filoviridae - Vrai ou faux - les virus possèdent une enveloppe
vrai
Filoviridae - Quelle est la classification de Baltimore ?
V
Filoviridae - Quelle est l’ordre des Filovirids ?
Mononegavirales
Filoviridae - Cette famille contient plusieurs genres, mais seulement 1 contient plus d’une espèces, laquelle ?
Ebolavirus
Filoviridae - Quelle est la structure du génome ?
ARN non segmenté polarité négative. Le génome contient 7 gènes :
Une caractéristique unique et importante du génome de cette famille est le chevauchement génique : le site de terminaison d’un gène chevauche le site d’initiation du suivant.
Le génome a trois régions non codantes :
- 5’ (trailer)
- 3’ (leader)
- intergéniques
Filoviridae - Quelle est la forme des virions ? parle moi de la structure générale ?
Particules filamenteuses qui ont un diamètre d’~80nm et de longueur variable. La particule contient une ribonucléoprotéine (RNP) hélicoïdale comprenant une molécule unique d’ARN simple brin négatif lié à deux protéines : nucléoprotéine et VP30.
La surface extérieure du virion consiste en une protéine de matrice (M), une enveloppe de la membrane plasmique cellulaire et des glycoprotéines (GP) ancrés à la membrane
Filoviridae - Vrai ou faux - comme pour les Réroviridae, les Filo contiennent deux molécules d’ARN simple brin négatives
Faux, les Filo ont une molécule d’ARN unique.
Filoviridae - L’ARN est attaché à deux protéines dans le virions, lesquelles ?
Nucléoprotéine N et VP30
Filoviridae - La surface extérieure du virion consiste en trois parties :
- protéine de matrice (M)
- enveloppe de la membrane plasmique cellulaire
- des glycoprotéines ancrées dans la membrane
Filoviridae - À quoi correspond le chevauchement génique ?
Le site de temrinaison d’un gène en amont chevauche le site d’initiation d’un gène en aval. Au lieu d’avoir 6 nt propre (codon strop et start), on a 4-5 nt, avec un chevauchement de 1-2 nt. Le nombre de chevauchements varie selon les espèces.
Filoviridae - Vrai ou faux - comme pour les Flavi, les Filo contiennent des régions non-codantes dans leur génome.
Vrai. Ces régions n’ont pas les mêmes fonctions.
Filo : régions non codantes intergéniques (IR), région en 3’ non traduite (leader), région en 5’ non traduite (trailer). Néanmoins, les séquences 3’ et 5’ UTR sont hautement conservées et pourraient former des structures en tige-boucle
Flavi : 3’ structure tige-boucle pour la traduction et protection et 5’ très structuré pour la traduction
Filoviridae - Quelle protéine joue un rôle dans la pénétration du virus, la pathogénèse et l’antigénécité
La glycoprotéine GP - il faut deux ORF pour la transcrire et une édition transcriptionnelle
Filoviridae - Comment se présente la GP (glycoprotéine) initialement ?
Sous la forme d’une molécule précurseur GP0. Elle est clivée dans la voie de sécrétion pour donner GP1 et 2 qui et la forme mature de la protéine.
Filoviridae - Vrai ou faux - les spicules des viurs sont formés par trois hétérodimères de GPmature
Vrai
Filoviridae - Quelle est la protéine la plus abondante ? et à quoi sert-elle ?
M est la protéine de matrice. Elle joue un rôle critique dans le processus du bourgeonnement et conduit à l’enveloppement de la RNC par la membrane plasmique. Elle joue également un rôle dans la régulation et la transcription du génome
Filoviridae - Quelles sont les protéines formant la ribonucléocapsides (RNC) ?
N, VP30, VP35 et L
Filoviridae - Les protéines N, VP30, VP35 et L se lient à la molécule d’ARN génomique pour former la RNC, à quoi servent elles ?
- N s’autoassemble pour former des structures de forme tubulaire essentielles à la formation de la RNC
- VP30 se lie à l’ext 3’ pour activer la transcription, pour faire un pont entre la RNC et la polymérase L et pour supprimer la réponse immunitaire antivirale de la cellule
- L et VP35 forment le complexe de la polymérase.
- L est la RdRp
- VP35 est un cofacteur qui choisi si on fait la transcription ou la réplication
Filoviridae - quelle est la protéine de polymérase RdRp ?
L. Elle est associée à VP35, cofacteur affectant le mode de synthèse de l’ARN.
Filoviridae - Explique les 11 étapes de la réplication
- la GP peut se lier à une gamme de récepteurs
- le virus pénètre par endocytose et est internalisé dans un macropinosome
- e virus est acheminé vers un compartment edosomal contenant des protéase qui vont cliver la GP
- Le clivage de GP et le faible pH déclenchent la fusion entre les membrane virales et endosomale
- La RNP est relâchée dans le cytoplasme où le génome est ensuite répliqué et transcrit
- Les ARNm viraux sont ensuite traduits par des ribosomes cellulaires
- Les ARNm de la GP sont traduits par des ribosomes insérés dans le RE
- Les porétines GP sont ensuites glycosylées, trimérisées et transportées vers la nanbrane plasmique via le Golgi
- Le complexe RNP est assemblé et associé avec les protéines insérées è la membrane
- Les virions matures bourgeonnent
Filoviridae - Vrai ou faux - Comme pour les Flaviviridae, l’entrée implique l’endocytose des virions
Vrai - ici c’est même une macropinocytose
