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Virologie II > Picornaviridae > Flashcards

Picornaviridae Flashcards

1
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux, les virus de cette famille ont une enveloppe.

A

Faux - Pas d’enveloppe

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Q

Picornaviridae - Quelle est l’ordre de cette famille ?

A

Picornavirales

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3
Q

Picornaviridae - Quelle est la classification de Baltimore des Picornaviridae ?

A

Baltimore IV

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4
Q

Picornaviridae - Quels sont les virus capables d’infecter à faible pH (quel pH?) et à pH ~physiologique ?

A

Enterovirus et cardiovirus infectent à ~3 (estomac).

Rhinovirus et aphtovirus infectent à ~6 (voie respiratoire)

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5
Q

Picornaviridae - Quelle est la forme de la capside et quelles sont les protéines importantes pour sa formation ?

A

La capside est de forme icosaédrique. Elle est composée de protomères, chacun composé de 4 protéines : VP1, VP2, VP3, VP4.

VP1-2-3 forment des coins pour la surface externe, alors que VP4 stabilise la capside par la surface interne (on ne la voit donc pas de l’extérieur)

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6
Q

Picornaviridae - Qu’entend-on par le terme protomère ?

A

Plusieurs protéines qui s’autoassemblent. Ici, elles forment des coins.

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7
Q

Picornaviridae - Quel est le récepteur de cette famille et le site de liaison au récepteur ?

A

Différentes molécules à la surface des cellules servent de récepteur aux Picornaviridae. Poliovirus se lie à un récepteur de type Ig alors que FMDV s’attache à une intégrine. Le site de liaison peut être entre les protomères (canyons) ou sur les protomères (plateau).

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8
Q

Picornaviridae - À l’intérieur d’un genre il y a de la diversité génétiques. Comment les sérotypes sont-ils déterminés?

A

Par l’extrémité C-terminale des protéines de la capside sur la surface externe du virion.

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9
Q

Picornaviridae - les génomes virales varient en longueur, mais on un caractéristique unique et commune, laquelle ?

A

Présence d’un protéine qui est liée de manière covalente à l’extrémité 5’ - VPg. La région non-codante 5’ est très structurée et contient des régions qui contrôlent la réplication du génome et la traduction.

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10
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - les génomes de cette famille ont un seul ORF

A

Vrai - un seul long ORF qui est traité pour former des protéines virales individuelles.

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11
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - les génomes contiennent à leur extrémité 3’ une queue poly(A) et un coiffe en 5’

A

Faux - ils ont seulement un queue poly(A)

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12
Q

Picornaviridae - Parle moi des 9 étapes de la réplication.

A
  1. attachement - change selon les genres
  2. entrée par endocytose. Fusion des membranes par le faible pH et décapsidation de la membrane afin de permettre la libération du génome dans le cytoplasme -
  3. traduction - ne possède pas de coiffe 5’, cette séquence est remplacée par par une séquence interne IRES qui peut initier la traduction
  4. transformation des protéines - autoclivage
  5. synthèse du brin -
  6. synthèse du brin +
  7. traduction (phase 2) - les protéines de la capside
  8. morphogénèse
  9. libération hors de la cellule
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13
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - L’entrée du génome se fait par injection.

A

Faux, par endocytose

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14
Q

Picornaviridae - Détaille moi la traduction

mots clefs :

  • IRES
  • facteurs d’initiation
  • polyprotéine
  • P1 - P2 - P3
  • protéases virales
A

Au cours de l’initiation de la traduction cellulaire, la sous-unité ribosomique 40S est recrutée sur l’ARNm par eIF3. Ce facteur se lie à eIF4 qui fait partie d’un complexe (eIF4A et eIF4E). eIF4A est une hélicase qui déroule l’ARN. eIF4E est la protéine qui positionne la sous-unité 40S sur l’ARNm.

La traduction entraine la production dune polyprotéines qui sera clivée par des protéases virales. La polyprotéine est divisée en trois régions P1, P2 et P3. P1 code pour les protéines de la capside alors que P2 et P3 codent pour des protéines associées à la transformation et la réplication. Les protéases virales se dégagent de la polyprotéines par auto-clivage. 2Apro clive P1 du reste alors que 3Cpro et 3CDpro clive le reste (clivage secondaire). 3CD contient la polymérase virale.

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15
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - la traduction dépendant de l’IRES ne nécessite pas de coiffe en 5’

A

Vrai - la séquence IRES remplace la coiffe 5’. Le complexe eIF3-40S est recruté sur l’ARNm viral par l’interaction de eIF4G avec IRES.

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16
Q

Picornaviridae - quelles sont les protéases impliquées dans le clivage de la polyprotéine ?

A
  • 2Apro clive p1 du reste.

- 3Cpro et 3CDpro clivent le reste - elles représentent le clivage secondaire.

17
Q

Picornaviridae - Quel segment contient la polymérase virale ? et que nécessite la polymérase pour synthétiser l’ARN ?

A

3CD - plus précisément - 3D.

L’enzyme nécesite la présence d’un gabarit d’ARN (ARN sb négatif) et une amorce (IRES - VPg)

18
Q

Picornaviridae - Quelle protéine sert d’amorce pour la synthèse de l’ARN par la RdRp

A

VPg - qui représente IRES.

19
Q

Picornaviridae - Le brin négatif sert de gabarit pour la réplication du génome viral. La proportion du brin + et - est différente dans le cytoplasme. Lequel est le plus abondant et pourquoi ?

A

Le brin + est synthétisé 30 à 70 fois plus que le brin -. Le brin négatif ne sert qu’à faire des brins positifs qui eux servent à reformer des virions et à faire des protéines.

20
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - l’infection entraîne la destruction de l’appareil de Golgi et du RE

A

Vrai - Au fur et à mesure de la réplication, le Golgi et le RE vont se fractionner. On se retrouve avec un cytoplasme rempli de vésicules membranées doubles qui sont le site de la réplication virale

21
Q

Picornaviridae - où est le site de la réplication de lA’RN viral ?

A

Dans les vésicules membranées doubles, dans le cytoplasme - qui proviennent du fractionnement de l’appareil de Golgi et du RE - ca permettrait d’avoir tout à proximité pour la synthèse

22
Q

Picornaviridae - Le génome n’est pas seulement un ARNm, mais aussi le gabarit pour la synthèse de l’ARN -.
Comment la RdRp et le ribosome évitent-ils les collisions ?

A

Les deux procédés ne se produisent pas simultanément. Les protéines qui stimulent la traduction dépendante de l’IRES sont clivées par la protéase virale 3Cpro. La traduction est régulée à la baisse et les ribosomes sont retirés de l’ADNm.

Il y a une distance temporelle entre les deux processsu : le temps que la RdRp se forme on fait de la traduction et à la fin on va finir par cliver les protéines de la traduction pour faire que de la réplication.

23
Q

Picornaviridae - Que fait :

  • 2A
  • 2B
  • 2C
  • 2BC
  • 3AB
  • L
A

2A clive la polyprotéine et stimule la synthèse du brin - de l’ARN

2B est impliquée dans le stade précoce de la synthèse de lA’RN viral, la formation de vésicules et la libération des virus de la cellule.

2C initie la synthèse du brin-. C’est une hélicase, et elle dirige les complexes de réplication vers les membranes des vésicules.

2BC est impliquée dans la formation de vésicules

3AB ancre la VPg dans des membranes pour l’étape d’amorçage de la synthèse de lA’RN

L est produit que par quelques viurs. C’est une protéase

24
Q

Picornaviridae - D’où vient la grande diversité génétique de cette famille ?

A

Le taux d’erreur de la RdRp est élevé (1 sur 1000nt) - mauvaise incorporation des base et absence de révision.

25
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - les pircornavirus sont une grande adaptabilité

A

Vrai - leur taux d’erreur très élevé implique une adaptation aux défenses et permet de maximiser la diversité.

26
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - La recombinaison chez cette famille est peu fréquente.

A

FAUX - très fréquent, ce qui augmente la diversité génétique. En plus, la réplication se déroule dans les vésicules membranées doubles se qui permet d’avoir les gabarits proches.

27
Q

Picornaviridae - Comment se déroule l’assemblage ?

mots clefs

  • P1
  • VP
  • protomère
  • capside remplie/vide
A

P1 est clivée en VP0-3-1 par 3CDpro. 5 protomères s’assemblent en pentamère qui formeront une capside vide. Le claive de VP0 en VP2 et VP4 produit la particule infectieuse finale

28
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - le clivage de VP0 en VP1 et VP2 produit la particule infectieuse finale

A

FAUX - VP0 est clivé en VP2 et VP4.

VP1 provient du clivage de P1.

29
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - la traduction cellulaire n’est pas compromise par la traduction virale

A

Faux - La traduction de l’ARNm cellulaire est interrompue. eIF4G est clivé après l’avoir utilisé

30
Q

Picornaviridae - comment se déroule la libération du virus ?

A

Les cellules qui subissent l’infection présente des effets cytophatique qui incluent la prolifération de vésicules membraneuses, les changements dans la perméabilité de la membrane, la fuite de composants intracellulaire et le plissement de l’ensemble de la cellule qui devient ridée avant de déclencher l’apoptose.

31
Q

Picornaviridae - Vrai ou faux - les virus déclenche l’apoptose de la cellule

A

Vrai - méthode de libération du virus.

Virologie II (11 decks)

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