Relation entre l'ADN et le phénotype Flashcards
Génome codant
Gènes
Produit phénotype
Faible %
Génome non-codant
régulation de l’expression des gènes
Variabilité ds régulation de transcr -> variabilité de la pénétrance et de l’expressivité (régulation expression) de certains phénotypes -> variabilité phénotype
Densité génique
Plus faible pour les organismes plus complexes
Variabilité ds régulation de transcr (non codant)
- Promoteur basal : très proche
- Région rég : sites de liaison pour facteurs de transcr spécifiques
- Région affectant la condensation : cible de mod histone, méthyl ADN
Point de polymorphisme simple
- variabilité phénotype
- codant et non codant
maj SNP
ADN intergénique et introns
Variabilité pénétrance et expressivité (tous du même génotype pour le gène d’intérêt )
Polymorphisme régions régulatrices et entourant le gène intérêt
- Région rég fct + et mutant - : augm expression de l’allèle fct et dim pénétrance allèle mutant
- Région rég fct - et mutant + : dim expression de l’allèle fct et augm expr pénétrance allèle mutant
Quelle est l’implication de SHH dans la formation des doigts? Comment peut-on expliquer la formation des doigts supplémentaires chez les individus souffrant de polydactylie?
polydactylie
- la présence et de la concentration prot détermine le positionnement
- SHH crée une zone de polarisation qui déclenche la formation des doigts au bon endroit
- SHH exprimé un côté : 5 doigts
- SHH exprimé 2 côtés : plus exprimé -> plus de doigts
Qu’arrive-t-il à un individu homozygote pour une mutation directement dans le gène SHH?
pas de SHH : un doigt
Où se situe le point de polymorphisme (ou mutation) expliquant la polydactylie chez ces familles?
ds l’intron d’un gène à 1 000 000 bp du gène SHH
Vrai ou faux. Le gène SHH responsable de la formation des doigts est seulement présent chez l’humain.
Faux, régions conservées ds d’autres espèces
Vrai ou faux. Les sites de polymorphisme dans les régions régulatrices peuvent se trouver à une bonne distance du gène affecté.
Vrai
Épigénétique
changements stables et transmissibles lors de la mitose, sans altération des séquences de nucléotides
Marqueurs modifiant accès ADN et gènes transcrits
- Modifications de la condensation de l’ADN dans des régions précises -> Silencing : ARN, Modification histone, Méthylation ADN
=> essentielles pour l’établissement du destin cellulaire
Méthylation ADN
Processus d’extinction de gènes
- L’ajout de groupement méthyle (CH3) directement sur l’ADN (au niveau des cytosines ou adénines) -> d’hétérochromatine
- Lors de la division cellulaire, les groupements méthyles sont maintenus -> influence lignée c
- Retiré lors méiose et formation gamète
- rajouté dès formation sper/ovocyte
Complexes remodelants
histones modifiées post- traductionnelle ou non ->
- L’ajout d’un groupement méthyle (CH3) -> répression de la transcription (d’hétérochromatine)
- L’ajout d’acétyle ou d’un groupement phosphate neutralise la charge des histones et permet un accès facilité à l’ADN -> Augmente la transcription.
L’exemple du syndrome du X fragile
présence d’un plus grand nombre de répétitions que la normale sur une région du chromosome X contenant plusieurs îlots CpG -> méthylation du promoteur
du gène FMR1 -> problèmes de développement (des troubles d’apprentissage et des troubles cognitifs : trouble de langage, déficience intellectuelle légère à modérée..)
- prémutation : Symptômes neurodégénératifs déclenchés chez la personne âgée.
- mutation complète (plus de répétitions) :
Problèmes neurologiques lors du développement
Facteur modifiant épigénétique
- Marqueurs modifiant accès ADN et gènes transcrits
- Facteur externe
- Facteur interne
Facteur externe modifiant épigénétique
Environnement
• Nutrition
• Exercice
• Polluant (tabac, amiante, métaux lourds…)
• Drogue (médicaments)
• Température (si vous êtes une plante…)
Facteur interne modifiant épigénétique
Hormone, âge
Altération des marqueurs épigénétiques
- liés à maladie et cancer
- effets plus importants pendant développement
- adultes : produit nouvelles c pouvant être affectées par mod
Épigénétique et générations
Apparence d’hérédité transgénérationnelle : Les cellules germinales en développement et qui seront à l’origine de la génération F2 sont déjà présentes (et ont donc pu être exposées) au cours du développement embryonnaire de la génération F1 malgré effacement intensif
Exemples de modifications épigénétiques prénatales
- Pollution et asthme
- Plomb et développement cognitif
- Famine ou malnutrition et risque de maladies métabolique
modifications épigénétiques prénatales
Effet si facteur au moment de la conception ou plus tard dans le développement