Rearreglos Genomicos Flashcards

1
Q

Que son los rearreglos genómicos

A

Cambios en el DNA, van de miles de bases hasta regiones completas de cromosomas
Osea cambio a nivel cromosómico

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2
Q

Pueden ser

A

Duplicaciones, inversiones, inserciones o deleciones

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3
Q

Las enfermedades generadas por los rearreglos genómicos se les conoce como

A

Desórdenes genéticos

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4
Q

3 mecanismos por los cuales ocurren los rearreglos genómicos

A

-NAHR->recomb homologa no alelica->mediada x LCR
-NHEJ->Non-homologous end-joining
-FoSTeS-> fork staling and template switching

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5
Q

Diferencias entre mutuaciones vs rearreglos

A

Mutuaciones: errores durante la replicacion o reparación del DNA
Rearreglos: causados por características genómicas estructurales

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6
Q

Que son los LCR

A

Fragmentos de DNA 10-300kb y tienen similitud entre 95 y 97%

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7
Q

En que regiones se localizan los LCR

A

Pericentrmericas, subtelomericas e intersticiales

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8
Q

Que cromosomas tienen la mayor cantidad de duplicaciones de LCR

A

22 y Y

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9
Q

Los rearreglos RECURRENTES o NAHR recurrente estan delimitados por o se dan por

A

LCRs

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10
Q

Los rearreglos NO recurrentes cuentan con regiones

A

Cortas de sobrelapamiento SRO

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11
Q

Que es el break point

A

Donde se llevan a cabo los rearreglos genómicos osea deleciones y duplicaciones

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12
Q

Break point clustering es por

A

Secuencias palindromicas

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13
Q

Nahr ocurren en

A

Regiones (hot spot) de los LCRs

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14
Q

Porque la recombinacion de NAHR pueden tener in alineamiento erróneo

A

Debido a la presencia de los LCR q tienen una gran similitud entre las secuencias

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15
Q

Cuando los LCRs estan en diferentes cromosomas se generan

A

Translocaciones

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16
Q

Cuando los LCRs estan en el mismo cromosoma pero diferentes cromáticas y en la misma orientaciones se generan

A

Deleciones o duplicaciones

17
Q

Cuando los LCRs estan en el mismo cromosoma eso en orientación opuesta se generan

A

Inversiones

18
Q

Nahr ocurre en hot spots osea en las regiones en donde se encuentren los

A

LCRs

19
Q

Estudios han demostrado que la recombinacion de alelos homólogos AHR pueden tener hot spots adyacentes a los que de NAHR V O F

A

V

20
Q

NAHR aparte de ocurrir en hot spots ocurre en

A

Mitosis y meiosis

21
Q

NAHR ocurre en meiosis si los rearreglos se presentan en

A

Células germinales y se puede manifestar como desorden genético

22
Q

NAHR ocurren en mitosis resultando en

A

Mosaicos de poblaciones de células que portan el rearreglos genómico ->cancer

23
Q

Ejemplo de cuando el mosaico puede presentar el desarrollo de la enfermedad en un sitio especifico en los NAHR de mitosis

A

Neurofibromatosis segmentaría

24
Q

La eficiencia de los Nahr ESTÁ INFLUENCIADA X

A

Longitud del LCR: 10-400kb, mayor longitud
Cercanía entre los LCR
Identidad del >96%

25
Q

Deleciones y duplicaciones no ocurren en la misma frecuencia V o f

A

V

26
Q

En la meiosis NAHR puede llevarse a cabo en

A

La misma cromatida: intracromatida
Cromatidas hermanas: intercromatida
Cromosoma homologo: intercromosomal

27
Q

El mecanismo de NAHR se puede utilizar como predictor de desórdenes genómicos V o f

A

V

28
Q

NHEJ es un mecanismos utilizado para la

A

Reparación de DSB: doble strand breaks

29
Q

NHEJ son provocados por errores en la recombinacion por

A

Radiación o por especies reactivas de oxígeno

30
Q

4 pasos de NEHJ

A

1 detección de DSB
2 puenteo de los extremos dañados
3 modificación de los extremos para compatibilidad
4 ligación de los extremos

31
Q

Que hacen las proteínas Ku

A

Se adhieren a extremos para darles características químicas para q se vuelvan a unir->hace puenteo de extremos->los deja listo para q se unan a otra hebra

32
Q

Quien se encarga de la modificación de los extremos para compatibilidad

A

Artemis: DNA-PKca
Polimerasa: mu y Y al revés osea lamda

33
Q

Quien se encarga de la ligación de extremos finales

A

XRCC: DNA ligasa IV

34
Q

FoSTeS es un mecanismo derivado de la

A

Replicacion

35
Q

Estructuras que favorecen la formación de FoSTeS

A

DNA Palindromico
Estructuras de stemloop
Estructuras cruciformes