Rearreglos Genomicos Flashcards
Que son los rearreglos genómicos
Cambios en el DNA, van de miles de bases hasta regiones completas de cromosomas
Osea cambio a nivel cromosómico
Pueden ser
Duplicaciones, inversiones, inserciones o deleciones
Las enfermedades generadas por los rearreglos genómicos se les conoce como
Desórdenes genéticos
3 mecanismos por los cuales ocurren los rearreglos genómicos
-NAHR->recomb homologa no alelica->mediada x LCR
-NHEJ->Non-homologous end-joining
-FoSTeS-> fork staling and template switching
Diferencias entre mutuaciones vs rearreglos
Mutuaciones: errores durante la replicacion o reparación del DNA
Rearreglos: causados por características genómicas estructurales
Que son los LCR
Fragmentos de DNA 10-300kb y tienen similitud entre 95 y 97%
En que regiones se localizan los LCR
Pericentrmericas, subtelomericas e intersticiales
Que cromosomas tienen la mayor cantidad de duplicaciones de LCR
22 y Y
Los rearreglos RECURRENTES o NAHR recurrente estan delimitados por o se dan por
LCRs
Los rearreglos NO recurrentes cuentan con regiones
Cortas de sobrelapamiento SRO
Que es el break point
Donde se llevan a cabo los rearreglos genómicos osea deleciones y duplicaciones
Break point clustering es por
Secuencias palindromicas
Nahr ocurren en
Regiones (hot spot) de los LCRs
Porque la recombinacion de NAHR pueden tener in alineamiento erróneo
Debido a la presencia de los LCR q tienen una gran similitud entre las secuencias
Cuando los LCRs estan en diferentes cromosomas se generan
Translocaciones
Cuando los LCRs estan en el mismo cromosoma pero diferentes cromáticas y en la misma orientaciones se generan
Deleciones o duplicaciones
Cuando los LCRs estan en el mismo cromosoma eso en orientación opuesta se generan
Inversiones
Nahr ocurre en hot spots osea en las regiones en donde se encuentren los
LCRs
Estudios han demostrado que la recombinacion de alelos homólogos AHR pueden tener hot spots adyacentes a los que de NAHR V O F
V
NAHR aparte de ocurrir en hot spots ocurre en
Mitosis y meiosis
NAHR ocurre en meiosis si los rearreglos se presentan en
Células germinales y se puede manifestar como desorden genético
NAHR ocurren en mitosis resultando en
Mosaicos de poblaciones de células que portan el rearreglos genómico ->cancer
Ejemplo de cuando el mosaico puede presentar el desarrollo de la enfermedad en un sitio especifico en los NAHR de mitosis
Neurofibromatosis segmentaría
La eficiencia de los Nahr ESTÁ INFLUENCIADA X
Longitud del LCR: 10-400kb, mayor longitud
Cercanía entre los LCR
Identidad del >96%
Deleciones y duplicaciones no ocurren en la misma frecuencia V o f
V
En la meiosis NAHR puede llevarse a cabo en
La misma cromatida: intracromatida
Cromatidas hermanas: intercromatida
Cromosoma homologo: intercromosomal
El mecanismo de NAHR se puede utilizar como predictor de desórdenes genómicos V o f
V
NHEJ es un mecanismos utilizado para la
Reparación de DSB: doble strand breaks
NHEJ son provocados por errores en la recombinacion por
Radiación o por especies reactivas de oxígeno
4 pasos de NEHJ
1 detección de DSB
2 puenteo de los extremos dañados
3 modificación de los extremos para compatibilidad
4 ligación de los extremos
Que hacen las proteínas Ku
Se adhieren a extremos para darles características químicas para q se vuelvan a unir->hace puenteo de extremos->los deja listo para q se unan a otra hebra
Quien se encarga de la modificación de los extremos para compatibilidad
Artemis: DNA-PKca
Polimerasa: mu y Y al revés osea lamda
Quien se encarga de la ligación de extremos finales
XRCC: DNA ligasa IV
FoSTeS es un mecanismo derivado de la
Replicacion
Estructuras que favorecen la formación de FoSTeS
DNA Palindromico
Estructuras de stemloop
Estructuras cruciformes
