Aplicaciones de micro arreglos de DNA, RNA Y proteínas Flashcards
Los micro arreglos son una metodología que permite la identificación de
Moléculas de AND O ARN mediante hibridacion en una estructura de vidrio o silicona
Principio de los micro arreglos
Hibridacion
Q es la hibridacion
Unión de 2 cadenas complementarias de ADN
Consiste en que distintos fragmentos de DNA X HIBRIDACION y x complementariedad de base se unen
Micro arreglos
Fundamento de micro arreglos
Hibridacion de ac nucleicos AND O ARN
-Principio de complementariedad
La detección es por
Fluorescencia BN marcadas
Se va obtener señal en donde haya hibridacion V O F
V
PERMITE LA LECTRURA DE MILES DE VARIANTES EN UN SOLO ENSAYO V o f
V
Tipos
ADN
ARN
Metilacion
Proteínas
Tipo de micro arreglo de ADN
SNPs: se detectan variantes genéticas especificas
Tipo de micro arreglo ARN
Análisis de expresión genética
Se realiza el cDNA, EL RNA es muy inestable
Tipo de micro arreglo de metilacion
Análisis y comparación de sitios de metilacion CpG
TIPO DE microarreglo de proteínas
Análisis de proteínas mediante la utilización de ac específicos
Se distribuyen en
Oligonucleotidos sobre una estructura de silicona(portaobjetos)
15-25 nucleotidos
Cuantas copias contiene un oligonucleotido
Miles
A los oligos se le agregan
Fragmentos de DNA derivado de librerías
Las variantes se analizan de manera simultánea V o f
Verdadero
El resultado se ve reflejado por
Fluorescencia
Las librerías son
Colecciones de clonas de DNA
Para generar las librerías se necesitan
Células del organismo a estudiar(leucocitos)-> extracción de DNA
Los cortes son con
Enzimas de restricción(digestión controlada)
Se van a generar fragmentos de restricción de distint tamaño que se
Translapan
Ya que esta el fragmento digerido se
Une al vector y se clona en bacterias o levaduras
Para cortar se necesita
Modificación de concentración y tiempo
Micro arreglo diseñado para la identificación d un polimorfismo específico en cada celda
ADN(SNPs CHIP)
Es la variante que tiene fluoroforo diferente
Oligo
En los micro arreglos de ADN
En cada celda se encuentra un oligo esp para cada SNP
Los micro arreglos de ADN ven
Polimorfismo bailelicos
Genotipos-> CC, CA, AA
PARA Que se usan los micro arreglos de ADN
Forense: permite identificar individuos mediante la amplificación de micro arreglos SNPs
Ciencias de salud: analiza polimorfismo en enfermedades metabólicas
Que hacen los micro arreglos de ARN
Análisis comparativos entre perfiles de expresión de células sanas vs células del px enfermo
Que identifica los micro arreglos de ARN
Rutas metabólicas implicadas e enfermedades (cáncer)
El RNA permite conocer
La expresión diferencial entre un px y otro
En los micro arreglos de RNA la fluorescencia es proporciona al
Nivel de expresión del gen
Usos de micro arreglos de ARN
-Ciencias de la salud: análisis de células sanas y enfermas
Análisis comparativo entre tejidos
-microbiología: estudios de patogenicidad, resistencia bacteriana
Aplicaciones de los micro arreglos de ARN
Diagnóstico de enf de manera temprana
Estudios de cáncer
Guías de tratamiento
Estudio de nuevos fármacos
En los micro arreglos de metilacion la metilacion es
La transferencia en el carbono 5 de la citocina presente en las islas CpG
Quien es el donante de metilos
S-adenosil metionina
Por quien es mediado la metilacion
ADN metiltransferasas
La metilacion une hace
Activa o inactiva genes
Proyecto de los micro arreglos de metilacion
Human Methylation 450 beadchip (ilumina)
Cubre el __ de genes referenciados y _____ islas CpG
99%
250,00 islas
Que hace el bisulfito
Identifica citocinas no metiladas y las cambia x una timina o uracilo
Que es lo unico imp de los micro arreglos de proteínas
Es la unión de proteína con ac
