Proteinas: modelaje molecular y estructuras 3D Flashcards
Que son las proteínas
Moléculas que realizan las acciones codificadas por medio de genes
Al presentar su correcta estructura terciaria o conformación podrá realizar de manera adecuada su
Función
Secuencia lineal de aa
Estructura primaria
Plegamiento local de la cadena en hélices alfa o láminas beta a
Estructura secundaria
Plegamineto tridimensional mas amplio que permite la función
Estructura Terciaria
Organización de varias subunidades proteicas. Organización multimerica
Estructura cuaternaria
Quienes son la unidad de construcción de las proteínas
Aa
Al carbono central se le unen 4 grupos químicos q son
Amino: NH2
Carboxilo COOH
Átomo de hidrogeno H
Cadena lateral o grupo R: variable
La estructura de las proteínas esta formada por
Un carbono central
Las cadenas laterales de los aa varían en
Tamaño
Forma
Hidrofobicidad
Carga
Reactividad
Los aa se agrupan según su
Carga
Ácidos y básicos, hidrofobicidad, aa especiales
Dan la estructura única a cada aa
Grupos R q son los variantes
Los enlaces______ son los mas fuertes. Entre aa y aa hay enlace______
Covalentes
Peptidico
Estructura primaria
Es lineal y siempre
1.Se polimerizan aa
2. Peptido: cadena corta de aa unidos por enlaces peptidicos(20-30)
3. Polipeptidos: cadenas largas >100-400
Tamaño es en Da
Consiste en los espacios que se generan después del plegamiento de la proteína
Estructura secundaria
En ausencia de interracion de enlaces no covalentes estabilizadoras el polipeptido adquiere una estructura …..
Espiral
Cuando se estabilizan los____
___ en algunos residuos, se adquieren las etsructuras(elementos de soporte interno): ….
Los puentes de hidrogeno
Se adquieren las: hélices alfa y hojas beta
En las hélices alfa el átomo carbonil-oxigeno de cada peptido esta unidos por ____ _____ al átomo ______
Puentes de hidrogeno
Amino-hidrogeno
En la hélice alfa todos los puentes de hidrógeno donadores estan dirigidos hacia
La misma dirección y por eso se hace la hélice
En la hélice alfa los grupos R estan en los
Extremos
En la hélice alfa la hidrofobicidad o hidrosolubilidad estan determinados por
Los grupos R
Cada aminoácido tiene diferentes cadenas R y eso lo
Diferencia de los demás
De que consiste las hojas beta
En hebras cortas
5-8 residuos
Quien determina la direccionalidad de la lamina B
El enlace peptidico
Como pueden ser las laminas B
Paralela o antiparalela
Que son las hojas beta
Hebras paralelas de dos cadenas de aa formadas por los puentes de hidrogeno entre N-H Y (C=O)
Como se da la estructura terciaria
Unión o mezcla de las estructuras secundarias
Estructura que puede tener entre 3 o 4 residuos o giros
Secundaria
En donde se localizan los giros o residuos
En la base de la proteína
Permiten presentar estructuras mas compactas
Giros
Como esta estabilizada la estructura terciaria
Mediante interraciones hidrofobicas de las cadenas laterales NO polares
Se refiere a la conformación tridimensional de una proteína
Estructura terciaria
Características de las estructuras terciarias
Tienen puentes de hidrogeno de las cadenas letales polares
Mantienen a la estructura secundaria(hélices alfa y laminas beta) compactadas juntas
Confiere propiedades biológicas
Que son los motivos
Estructura especifica terciaria que tienen una función especifica
Combinaciones de estructuras secundarias-> función especifica
Ejemplo de estructura terciaria
Dedos de zinc
Porque se confirman los dedos de zinc
3 estructuras secundarias:
-hélice alfa
-2 hebras beta con orientación antiparalela
-la forma que adopta parece dedo
En donde estan presentes los dedos de zinc
En moléculas de unión a DNA
Estructura caracterizada por 2 hélices alfa unidad una a otra
Hélice super enrollada
Por quien es estabilizado la hélice superenrrollada
Interraciones entre cadenas hidrofobicas entre las cadenas laterales de los aminoácidos
Tienen un patrón de repetición cada 7 aa
En la hélice superenrrollada quien esta en la posición 1
Valían, ala niña y metionina que ayudan a mantener la estabilidad porque son aa hidrofobicos
En la posición 4 de la hélice superenrrollada quien esta
La leucina q es hidrofobica
La hélice superenrrollada es una estructura
ANFIPATICA
Quienes deciden si el giro será mas compacto o distendible
Los grupos R
Que son los dominios
Subdivisiones de la estructura terciaria
Conjunto de motivos
Características estructurales q pueden tener los dominios
Abundancia de un aa en particular
Secuencias conservadoras
Un motivo en particular(dedos de zinc)
Características de la estructura terciaria HA
3 subunidades
2 cadena de polipeptidos (HA1, HA2)
Dominio globular: distal
Dominio fibroso: proximal(2 alfa hélice y hebras B)
Que determina al dominio
Su función
Todas las proteínas presentan la estructura cuaternaria
Nooo
Nivel mas alto de organiaaacion proteica
Ensamblajes macromoleculares
La estructura cuaternaria implica la formación de estructuras multimercas. En q consisten las estructuras multimericas
2 o mas subunidades proteínas
Cuantas cadenas polipeptidicas contiene el ensamblaje macromoleculares
10 o cientos
Ejemplo de ensamblajes moleculares
Capsaide de los virus
Filamentos del citoesqueleto
Maquinaria transcripcional
En donde se localizan los giros o residuos
En la base de la proteína
Porque son formados los giros
Por puentes de hidrogenos entre los residuos
Se refiere a la conformación tridimensional de una proteína
Estructura terciaria
De cuantos aa consisten los dominios
100-150 aa en distintas combinaciones de motivos
