Rc nucléaires Flashcards
mécanismes de liaison des rn (5)
- ligand
- détection du signal par LBD du RN
- Reconnaissance du gène cible par le DBD du RN
- Réponse transcriptionnelle
- arnm
Points en communs des RN classiques/endocriniens (GR,MR,PR,AR,ERa/b, RARa/b)
liaison de haute affinité
et
ligand =lipides hormonaux
domaine af1 (4) n-terminale
- structure prim variable
- 50-600 AA
- ACTIVITÉ TRANSACTIVATRICE CONSTITUTIVE INDÉPENDANTE DU LIGAND (AF1 : effet mm a état basal)
- sensible au modif post-traductionnelles
DBD (3)
- structure bien conservée
- liaison à ADN (p-box)
- dimérisation faible
région charnière NLS
contient séquence signal de localisation nucléaire
LBD(5)
région c -terminale
- Liaison au ligand
- Activité transactivatrice dépendante du ligand (af2)
- Dimérisation forte
- Structure secondaire : 12 hélice alpha
- lie coactivateurs + HSP
Variabilité de région AF1
longueur et AA variable
4 modifications post-traductionnelles (AF1)
phospho
ubiqui
sumo
acétylation
sites de phospho des RN (3 AA) et sur quels rc + prédominant ?
Ser, Tyr, Thr
rc stéroidiens > n-stéroidiens
conséquence de la phospho ?
Influence activité transcriptionnelle du RN
Doigts de zing du dbd
2 modules et fcts
module 1 : Proximal-box => reconnait 1/2 site de l’Élément de réponse
Module 2 : Distal-Box:=> dimérisation et reconnaissance de distance entre demis-sites de l ‘ER
3 types de RN et leurs éléments de réponse
- stéroidiens/homo= > palindrome (n=3 nucléotides)
- hétérodimères de RXR => répétition directe (n=variable)
- Homodimères => répétion directe (n =variable)
LBD : structure ?
- 12 hélices a
- 2 feuillets b (s1-S2)
- forment un sandwich 3 étages anti//
LBD : site de liaison : (2 carac)
- cavité hydrophobe
- Volume de 0 à >1500
Impact des changements allostériques LBD-coactivateurs (4)
- forme une pince électrostatique entre H12 et H3
- pince xpose une surface d’intéraction ak coactivateurs sur H12
OU
-coact. lient LBD via motif LXXLL
-liaison ligand => ^ intéraction LBD et motif => act. transcriptionnelle du rn
Intéraction LBD antagoniste (2)
- antagoniste positionne H12 pr compétitionner et bloquer accès à la pince
- induction d’une crevasse entre H12 et H3 + favorise recrutement de Corépresseurs au LBD qui peuvent accommoder le segment LxxxlxxxL des corép.
Mécanismes d’activation transcriptionnelle des rn
liaison ligand au rn => dissociation chaperones + dimérisation rc => translocation ds noyau et liaison ak ER=> recrutement de prots co-activateurs et ouverture chromatine => facteurs transcriptionnels => activation/inhibition du gène
Activation/inh. des rc stéroïdiens
complexe RN-HSP séquestré ds cytoplasme => liaison ligand sur complexe => dissociation des hsp et dimérisation => migration au noyau => liaison coACTIVATEURS=> transcription des gènes cibles
rc stéroides (5)
ar, er, gr,mr,pr
Rc n-stéroi (……)
LXR, FXR, PPAR, RAR,PXR,TR, VDR
Activation/inh. des rc non stéroïdiens
Complexe rn-corépresseurs présents sur région promotrice du gène cible => dissociation des Corép et association avec les coACt. => transcription des gènes
Dimérisation permet 3 trucs:
affinité
spécificité
diversité
de la liaison à l’ADN
Rappel : 2 étapes activation transcriptionnelle
- Décondensation de la chromatine
2. recrutement de l’ARNpolymérase et machine transcrip. au promoteur
condensation chromatine est due à quoi ?
RN associés ak des Corép qui recrutent HDAC => déacétylation => répression transcp + chromatine condensée