Pyrimidines et purines (3h) Flashcards
Les purines et les pyrimidines sont des composantes de quelles structures:
- ADN
- ARN
- ATP
- GTP
- UTP
- Enzymes
les pyrimidines et des purines sont des bases qui peuvent exister sous quelles formes:
- seules ou
- en tant que blocs structuraux de l’ADN et l’ARN
Quelles sont les 2 principales sources d’apport des bases (purine et pyrimidine)?
- synthèse de novo couteuse en énergie: produit à partir des acides aminés GAG: glycine, aspartate, glutamine
-
les voies de sauvetage: réutilisation des purines et pyrimidines qui sont fournis par :
- la diète (source alimentaire)
- par catabolisme des acides nucléiques (ADN, ARN) intratissulaires
exam: entre la purine et la pyrimidine, laquelle a une structure plus complexe?
purine
ou sont dégradé les acides nucléiques (ADN, ARN) d’origines alimentaires:
intestin par les nucléases et les nucléotidases d’origine pancréatique
Sont dégradés en :
- nucléotides
- bases libres
il arrive quoi aux purines et pyrimidines pas catabolisées
sont recylcées et réincorporées dans nucléotides par des voies de sauvetage
Où a lieu la synthèse novo des purines
Hepatocytes du foie
Exam: ou sont catabolisées les purines et en quoi
dans gros intestin et sont catabolisées en acide urique
Quelles sont les 3 principales pyrimidines:
CUT PY
- cytosine
- thymine
- uracil
Fonctions des pyrimidines;
- blocs structuraux de l’adn (thymine, cytosine) et de l’arn (uracil, cytosine)
- intermédiaires dans de nombreuses réactions de synthèse (les dérives des pyrimidines)
exam: Quels sont les produits du catabolisme (degradation) des pyrimidines:
- beta-alanine
- ammoniac: toxique: mais complètement métabolisé via cycle de l’urée
- CO2
Produits solubes: ne se précipitent pas
exam: Je suis celle qui a une vie “banale” puisque je ne cause pas de problème en milieu clinique/hopital…
pyrimidine
car le produit de leur catabolisme est solube (co2, ammoniac, beta-alanine) : ne précipite pas
V ou F: l’organisme doit synthétisé BEAUCOUP PLUS de bases pyrimidines que de bases purines.
vrai: cela est réalisé dans le but de rétablir l’équilibre quantitatif global dans la cellule car les bases pyrimidiques ne sont pas recyclées de façon quantitative
2 sources de synthèse/apport des pyrimidines:
- synthèse de novo à partir des acides aminés dans: organes et tissus
- voie de sauvetage: réutilisation des nucléoSides intracellulaires
Produits du catabolisme des bases pyrimidines (uracile, cytosine, thymine);
bases solubes:
- ions NH4, acétyl coA, Co2, succinyl coA
- Nh4 (ammonium) toxique mais métabolisé dans cycle urée
exam: V ou F: le catabolisme des pyrimidines génère une grande quantité d’énergie
Faux!
génère pas de quantité significative d’énergie
Quelles sont les 2 principales purines;
- adénine
- guanine
Comment existent les purines:
- seules
- ou associé à un pentose (5C)
- à ribose (souvent)
- à désoxyribose
formant ainsi un nucléoTIDE
quelles sont les 2 façons chez humain pour acquérir purines;
- synthèse de novo: dans les hépayocytes du foie à partir des acides aminés
-
voie de sauvetage (purine réutilisées)
- d’origine alimentaire
- venant de l’adénosine lors du turnover normal des acides aminés
V ou F: les purines ont une structure peu complexe qui a couté peu d’énergie à produire:
faux: les purines ont une structure complexe qui a couté BEAUCOUP d’énergie à produire
V ou F: les purines d’origines alimentaires sont utilisées de façon significative pour la synthèse des acides nucléiques tissulaires.
faux: les purines d’origines alimentaires ne sont pas utilisées de façon significative pour la synthèse des acides nucléiques tissulaires
exam: Il y a peu de purines d’origine alimentaire utilisées, mais il arrive quoi à celles qui sont absorbées:
elles sont catabolisées/dégradées en acide urique dans la cellule intestinale par l’enzyme xanthine oxidase
Ensuite excrétées via l’urine
Ou se fait le catabolisme des purines;
foie et reins
Étapes impliquées dans catabolisme des purines:
- dégradation de la nucléotide AMP et GMP: on enlève groupe phosphate et groupe ribose et on libère groupe amine
-
formation de produits solubes
AMP donne hypoxanthine (solube)
GMP donne xanthine (solube)
exam: v ou f: le catabolisme des purines produit des molécules solubes donc pas de risque de précipitation:
vrai: l’hypoxantine et la xanthine (produit de l’amp et de la gmp) sont des molécules solubes
par contre, l’enzyme xanthine oxidase (XO) intervient sur la xanthine et va la transformer en acide urique qui est insolube!
acide urique existe aussi sous forme:
d’urate de sodium qui est très peu solube
Exam: qu’est-ce qui entraine la goutte?
la cristallisation de l’urate de sodium (produit du catabolisme des purines qui a été produit via la xanthine oxidase) dans les tissus entraine une réaction inflammatoire intra-articulaire (arthrite)
Qu’est-ce que hyperuricémie?
- diminution de l’excrétion rénale de l’acide urique
- donc concentration plasmique d’acide urique augmente à des niveaux qui éxcèdent la solubilité limitée de l’acide urique
- donc se cristallise en urate de sodium et se dépose dans articulation: –> provoque réponse inflammatoire qui se manifeste en: goutte et arthrite
Examen: quel est le seul moyen de diagnostiquer la goutte?
poncter articulation pour démontrer en labo présence de cristaux d’acide urique dans l’échantillon de liquide synovial prélevé (90% dans l’articulation du grand métatarse/grand orteil)
Examen: traitement pour la goutte:
allopurinol: va inhibier l’action de xanthine oxidase (enzyme) ce qui va dire quelle ne pourra plus dégradée la xanthine en acide urique (insolube)! Donc, il y aura ++ de xanthine (solube)
allupironol donner pour le métabolisme de désiquilibre de purine
qu’est-ce que des porphyrines?
molécules cycliques formées de 4 anneaux pyrrole
Quelle est un synonyme de l’hème?
ferroprotophorphyrine IX
anneau de protoporphy
Je suis un groupe prostétique (partie d’une protéine qui n’est pas une protéine)
hème
Quelles fonctions confère l’hème à la strucuture?
- réduction/oxydation
- transfer d’électron
Ex: l’hème de l’hémoglobine lui confère la capacité de se lier de façon reversible à l’oxygène, permettant aux globules rouges de le distribuer
exam: Où est synthétisé l’hème ?
dans le foie où elle est intégrée a une série de protéines (cytochrome p450, enzymes) et dans la moelle osseuse (hémoglobine)
V ou F: le fer est au centre du goupement hème. On trouve cette structure dans chacune des 4 chaines de protéines dans les molécules d’hémoglobines qui eux sont dans des globules rouges.
vrai
Exam: quelles sont les sites de synthèse de l’hème:
- 85% de l’hème est produite par les cellules erythroïdes (futures globules rouges) de la moelle osseuse pour son incorporation dans l’hémoglobine
- 15% est produite par les hépatocytes du foie où l’hème est utilisée pour la synthèse des cytochromes et autres enzymes et intégrée à ceux-ci
Où on lieu les réactions de synthèse pour l’hème?
la 1iere et les 3 dernières réactions ont lieu dans la mitochondries et les 4 autres dans cytosol
EXAM:
V ou F: toutes les cellules produisent de l’hème
Vrai
toutes les cellules peuvent produire de l’hème SAUF les globules rouges qui n’ont plus de mitochondries
résume très brèvement les réactions de synthèse de l’hème
pour faire hème il y a plusieurs réactions et le produit de chaque est toujours quelque chose comme:
proto/co-prophynogène
Prophyrie:
affections génétiques dues à
des mutations de gènes codant les enzymes intervenant dans la biosynthèse de l’hème
Les porphyries sont pas fréquentes mais sont importantes à connaitre dans des diagnostiques différentiels rares. Quels types de symptômes?
douleurs abdominales
symptômes neuropsychiatriques
exam: À quelle type de deficience sont associées les porphyries:
deficience partielle dans l’une des l’enzyme de synthèse de l’hème
Exam: Quelle est la conséquence d’une porphyrie:
- deficience partielle dans l’une des l’enzyme de synthèse de l’hème
- donc deficience de synthèse de l’hème
- en conséquent: une diminution de la synthèse de l’hémoglobine avec anémie
Fun fact: les loups-garous et dracula seraient peut-être atteint de porphyrie vu leurs symptomes:
- sortie nocturne
- boit sang pour compenser deficience en hémoglobine/hème
- teint pâle
- douleurs abdominales intermittentes (crises de porphyries aigües)
Structure HgB:
4 chaines de protéines, chacune d’entre elles possédant un groupe hème avec son atome de fer
Quelle est la protéine rouge présente dans les GR du corps:
hémoglobine
exam: HgB responsable de :
- transport oxygène dans corps
- la possibilité de transporter O2 lui est conféré par la présence des 4 atomes de fer de son hème
- chaque atome de fer peut se lier de façon réversible à une molécule d’oxygène
exam: Lors de la dégradation de l’hémoglobine que se passe-t’il avec les structures?
- les 4 chaines de protéines vont être catabolisé en acide aminé
- chaque atome de fer au centre d’un group hème va être recyclé via la transfferin (transporte le fer)
exam: pourquoi le sang est rouge?
à cause du fer de dans l’hème
exam: Une fois que le sang passe dans les poumons, quelle est sa couleur et pourquoi?
quand le sang passe dans les poumons l’hème (son fer) se lie à l’oxygène ce qui lui donne la couleur rouge vif qu’on trouve dans les artères
Quelle est la couleur du sang dans le système veineux et pourquoi?
l’hémoglobine livre son oxygène aux tissus et le sang devient rouge foncé
V ou F: le sang veineux est bleu
faux: les veines paraissent bleues parce que la peau absorbe une portion de la lumière et que le bleu diffuse plus facilement que le rouge
Cycle de vie des GR et dégradés où
90-120 jours
dégradés par macrophages dans rate, foie, système réticulo-endothéliale
hémoglobine catabolisé en quoi
- globine (portion protéine)
- hème (portion non-protéine)
Globine est catabolisé en quoi
acides aminés qui seront réutilisés pour la biosynthèse des protéines ou transformés en différents intermédiaires
L’hème se débarasse de son fer qui joindre la __________. Qui va amener ce fer et le redistribuer aux ___________ pour sa __________
L’hème se débarasse de son fer qui joindre la TRANSFÉRRINE. Qui va amener ce fer et le redistribuer aux tissus pour sa RÉUTILISABLE.
Je suis une protéines de transport plasmatique du fer;
transférrine
Exam: Que se passe-t’il avec l’hème libéré de son fer ?
Redeviens la protoporphyrine IX dont l’anneau sera clivé dans le système RE et deviendra ainsi de la biliverdine (pigment bleu-vert)
Exam: La biliverdine est reduite en
bilirubine lyposolube non conjugé (pigment jaune-orangé)
Examen: est-ce que la bilirubin lyposolube (non conjugée) peut voyager seule dans le sang et explique son trajet?
- Non, la bilirubine lyposolube (lipophylique) ne peut pas voyager seule dans le sang ! Elle se lie à l’albumine qui va l’amener au foie.
- Dans le foie, la bilirubine sera conjonguée et deviendra solube.
- Elle est donc sécrétée dans les canaux biliaires (entreposage dans canaux biliaire et devient composante de la bile).
- Lors de la digestion, le repas stimule la bile qui est excrétée dans le petit intestin (duodénum).
- la bilrubine se trouve vite dans GROS INTESTIN ou elle est digérée par bactéries pour former: l’urobilinogène (incolore)
- la + grande portion de l’urobilinogène est oxidée par bactérie intestinale et devient : stercobilinogene (incolore) et encore oxydée par enzymes de la flore intestinale pour donner stercobiline (selles couleur brune)
- une petite portion de l’urobilinogène est réabsorbée vers le sang et retourne vers le foie: petite portion échappe au foie et se rendra aux reins par voie sanguine.
- rein transforme urobilinogène en urobiline (jaune) et sera ecrété dans urine.
exam: Qu’est-ce qui forme la famille des pigments biliaires?
bilirubine et ses métabolites
Quel organe conjuge la bilirubine?
le foie qui ajoute 2 acides glucoroniques à la bilirubine non-conjugée pour faire de la bilirubine conjugée qui va pouvoir prendre les canaux biliaires et aller dans vesicule biliaire
Quand est-ce que bile (qui contien bilirubine conjugée) est sécrétée et ou?
lors d’une stimulis comme repas (besoin pour digérer les lipides)
sécrété via ampoule de vater dans la partie D2 du duodénum
Il arrive quoi a bile dans gros intestin
- Bacteries du gros intestin digère bile en urobiliogène incolore.
- La MAJEURE partie de l’urobilinogène dans gros intestin se fait oxydée par bacteries en stercobilinogène incolore. Le stercobilinogène incolore se fait oxydée par les enzymes des bactéries de la flore intestinale en stercobiline brune qui va donné la couleure brune aux selles.
2.1. La MINEURE partie de l’urobilinogène dans gros intestin emprunte les voies sanguines, rejoint les reins où elle est tranformée en urobiline jaune qui va être excrétée via urine qui en conséquent est jaune.
Produit ultime de la dégradation de l’hème et hémoglobine;
bilirubine
Quel est le rôle du foie, au sujet de la bilirubine, en circonsatnces normales:
Le foie est:
- en mesure de conjuger toute la bilirubine produite
- en mesure d’assurer le catabolisme de la bilirubine
- en mesure d’assurer l’élimination de la bilirubine
exam: Qu’est-ce que ictère et causes?
Accumulation de bilirubine (hyperbilirubinémie) qui se présente sous forme de ces symptômes: démangaisons cutanées, coloration jaune de la peau, coloration jaune des muqueuses (comme les yeux) et urine orangée (métabolites de bilirubine qui passent), selles pâles.
Causes:
- insuffisance du foie: cirrhose hépatique due à l’alcool
- déstruction importante de globules rouges (anémie hémolytique: globules rouges éclatent dans le sang)
- obstruction au niveau du canal biliaire
- tumeur près de l’ampoule de vater ou qui comprime cholédocque
- calcul bilaire
- cholycistite
- chez bb: enzymes dans le foie sont pas encore à maturité pour conjuger bilirubine
- tumeur pancréas qui comprime canal biliaire
Hématome:
accumulation de sang dans tissus
exam: Changement de couleur de l’hématome due aux:
production des différents pigments produit par le catabolisme de l’hème des globules rouges présent dans les tissus lésés
Exam: cause des selles blanches/pâles:
bilirubine n’est pas arrivée dans l’intestin (occlusion du canal biliaire ou ampoule de vater)
Exam: Quelles sont les étapes d’une contusion/bleu:
Quelles sont les voies de sauvetage des purines et des pyrimidines ?
- la diète (source alimentaire)
- par catabolisme des acides nucléiques (ADN, ARN) intratissulaires
