Métabolisme acides aminés et protéines (3h) Flashcards
De quoi sont composées les protéines:
- 1 carbone central
- 1 groupement carboxyle (COOH) - C terminal
- 1 groupement aminé (NH2) - N terminal
- 1 chaine latérale variable (R)
photo
qu’est-ce qui distingue les acides aminés entre eux?
la chaine latérale variable (R)
Exam: d’où provient l’ammonium (NH4+)
de la désamination du groupement amine (NH2) “N terminal de l’acide aminé”. L’ammonium est extrêmement TOXIQUE pour l’organisme.
AA:
- utilisation
- stockage
- son constituant chimique caractéristique
- utilisation énergétique secondaire
- peut être mis en réserve dans organisme
- azote = constituant chimique caractéristique des acides aminés et des protéines
peptide et protéines
polymère d’aa reliés entre eux par des liaisons peptidiques (CO-NH): lien covalent/fort
liaison entre un groupement carboxyle et un groupement aminé de 2 dif
Quel effet a le ph sur les aa
les groupement carboxyle (NOOH) et aminé (NH2) peuvent s’ioniser, en fx du pH.
Exam: qu’est-ce que des “zwitterions”
les molécules avec des charges + et - simultanées.
Ex important: les a.a portent simultanément une charge positive et négative au pH physiologique (7.4).
les COOH et NH2 à pH neutre sont:
- ionisé
- neutre (les deux portent une charge, à cause qu’ils sont ionisés, qui va égaliser l’autre)
De quoi dépendent les propriétés acido-basiques des a.a?
- des groupement COOH et NH2
- de la présence ou non d’une fc acidique ou basique sur la chaine latérale (r)
- de l’environnement local (si liés en peptides ou protéines)
Exam: définis pK
pH auquel une molécule ionisable existe à 50% sous forme ionisée et à 50% sous forme non-ionisée
- COOH <–>COO-
- NH2 <–> NH3+
Il existe plusieurs pK. Explique:
les a.a ont plusieurs pK(s) selon leur différents groupements:
- 1 pour le COOH
- 1 pour le NH2
- 1 pour une chaine latérale (R) mais parfois slmt: slmt dans le cas ou la chaîne latérale est IONISABLE
Exam: qu’est-ce que le point isoélectrique (PI)?
le pH auquel la charge nette de l’a.a est zéro
(en d’autre terme, pH auquel les 2 groupements - caroxyle et aminé- sont ionisés (1 porte une a=charge + et l’autre une charge - ce qui rend neutre).
exam: Les acides aminés ont combien de point isoélectrique (PI)?
1 seul !
Sur une courbe de filtration, il y a ________ pk s’il y a une chaine ionisable sur la chaine latérale (R).
Sur une courbe de filtration, il y a ________ pk s’il y a PAS de chaine ionisable sur la chaine latérale (R).
Sur une courbe de filtration, il y a 3 pk s’il y a une chaine ionisable sur la chaine latérale (R).
Sur une courbe de filtration, il y a 2 pk s’il y a PAS de chaine ionisable sur la chaine latérale (R).
le pH de l’environnement est _____ que le premier pk.
le pH de l’environnement est _____ que le deuxième pk.
le pH de l’environnement est PLUS PETIT que le premier pk.
le pH de l’environnement est PLUS GRAND que le deuxième pk.
Exam: quelle molécule joue le rôle de transporteur d’ammonium
glutamine
va circuler dans l’organisme car ammonium (NH4) est toxique pour le corps
le glutamate a une chaine ionisable. V ou F:
Vrai! il va conférer un 3ieme pK a son a.a
Glutamine:
Glutamate + 1 AZOTE
C’est une fx ionisable mais basique
On a 3 pK dans quel seul cas:
Dans le cas que l’a.a a une chaine ionisable.
Si elle a pas de chaine ionisable, elle a slmt 2 pK.
Exam: Quels sont les acides aminées essentiels ?
(ceux qu’on a besoin d’ingérer par alimentation car peuvent pas être synthétisés par corps).
isoleucine
leucine
lysine
méthionine
phénylalanine
thréonine
tryptophane
valine
I Love You My Precious Treasure TaVir
les acides aminés non essentiels sont:
synthétisés par organisme donc on a pas besoin de les ingérer dans notre alimentation
exam: quels sont les 3 rôles des acides aminés
- synthèse des protéines
- rôle énergétique: BCP MOINS IMPORTANT que les glucides/lipides
- précurseur de molécules contenant de l’azote
Comment l’azote est incroporé dans d’autres types de molécules?
par les acides aminés
ex: heme, hormones thyroïdienne, catécholamines, neurotransmetteurs
Les protéines de notre corps sont synthétisées à partir de combien d’a.a
à partir de 20 a.a élémentaires
Exam: de quoi dépend la structure d’une protéine
de sa séquence en acide aminé
Niveau de structure des protéines:
primaire: séquence en acide aminé
secondaire: domaines qui se répartissent spontannément (feuillet alpha et beta)
tetritaire: conformation tridimentionnelle globale d’une protéine
quaternaire: intercation entre plusieurs polypeptides (dimères, trimères, etc) pour faire une enzyme
Exam: Quelles sont les 3 sources d’acides aminés de l’organisme:
- par synthèse: slmt pour les acides aminés non-essentiels, fait à partir d’acides organiques et azote
- alimentation: les protéines ingérées sont digérées en** a.a essentiels **
- catabolisme des protéines de l’orgaisme (turnover de protéines)
exa,m: Comme pour les lipides et les glucides, il y a une entreposage corporel pour les acides aminés. V ou F
Faux: le reservoir corporel d’a.a n’est pas entreposé. Tout ce qui n’est pas utilisé rapidement par la synthède des protéines va être dégradé et éliminés par:
- désamination/transamination (enlève azote)
- décarboxylation
explique cycle d’anabolisme et catabolisme des protéines:
Anabolisme de 400g/j d’a.a en protéines
catabolisme de 400g/j de protéine en a.a.
Donc rien de se conserve! Tout ce qui est ingéré est dégradé
provenance des protéines digérées alimentaires:
environ 100g/jour
- protéine végétales (protéines incomplètes)
- protéine animales (protéines complètes) possède tous les aa essentiels
Provenance d’autres protéines digérées?
environ 30-5-g/jours
- protéine enzymatiques sécrétées dans le tube digestif
- protéines provenant des cellules muqueuses mortes
Provenance d’autres protéines digérées?
environ 30-5-g/jours
- protéine enzymatiques sécrétées dans le tube digestif
- protéines provenant des cellules muqueuses mortes
Ou et comment débute la digestion des protéines
débute dans l’Estomac
par
1. acide gastrique: sécrétée par les cells pariétales
2. pepsine: sécrétée sous forme inactive (pepsinogène) par les cellules principales de l’estomac
Décris pepsine
- sécrétée sous formeinactive: pepsinogène
- en milieu acide (pH < 5) le pepsinogène est clivé et produit la pepsine active
- pepsine peut aussi cliver pepsinogène (auto-activation)
- pepsine dégrade 10-15% d’une protéine ingérée: dégrade en GROS POPLYPEPTIDE
Que se passe à la pepsine dans le duodenum
elle perd son activité car l’acidité gastrique est neutralisée par le bicarbonate des sécrétions pancréatiques
Quelles molécules s’occuppent de la digestion dans le duodenum:
des protéases sécrétées par le pancréas
- trypsine
- chymotrypsine
- elastase
- carboxypeptidase
la CECT du pancréas
Comment l’auto-digestion, au niveau du duodenum est stoppé?
les protéases pancréatiques (la CECT) comportent un fragment d’acide aminé qui va bloquer leur siite active: sont sécrétées sous forme inactive. Le fragment doit être clivé pour que l’activité des protéases débute.
comme la pepsine aussi
quelle est la forme active de toutes les protéases pancréatiques inactives suivantes:
- Trypsinogène
- chymotrypsinogène
- proélastase
- procarboxipeptidase
- Trypsinogène: trypsine
- chymotrypsinogène: chyotrypsine
- proélastase: élastase
- procarboxipeptidase: carbopeptidase
exam: Explique le concept qui implique l’entérokinéase:
- entérokinase est sécrétée par la muqueuse intestinale.
- elle clive la trypsinogène pour l’activer forme active: trypsine.
- la trypsine initie la cascade d’activation de tous les autres enzymes pancréatiques dans le duodenum
il arrive quoi au fragment de protéines qui entre dans intestin
digéré par plusieurs protéases
dans l’intestin, qui clive les fragments de protéine en PETITS peptides?
- trypsine
- chymotrypsine
Après que la trypsine et la chymotrysine ont clivé les frag. de protéines en petits peptides, qui va cliver les petits peptides?
carboxypeptidase
élastine fait quoi
clive les fibres d’élastine
Par qui est complétée la digestion des protéines:
par l’Action des enzymes de la muqueuse intestinale:
- dipeptidase
- aminopeptidase
- carboxypeptidase
au final les protéines sont dégradées en quoi?
tripeptides, dipeptides et acides aminés libres
Comment les protéines sont absorbées?
les acides aminées, les dipeptides et tripeptides passent les membranes en utilisant des transporteurs actifs
- transporteur couplé au transfert de sodium
Il arrive quoi au dipeptides et tripeptides une fois absrobées?
sont dégradés en acides aminés libres dans les cellules épithéliales avant d’entrer dans la circulation sanguine
“ce qu’on observe dans le sang c juste des a.a libres”
Est-ce que les protéines entières sont absorbées ?
non, sauf dans de rares cas.
sont capté par endocytose puis relachés dans la circulation par exocytose
2 choses à retenir sur azote:
- on peut rien faire avec ça:chimiquement inerte et inutilisable par vivants
- les microorganismes sont importants pour capter azote(N2) et le transformer en ammoniac (toxique). : captent azote dans air ambiant et l’amène dans organisme.
Dans le cycle de l’azote:
l’azote devient l’ammonium et nitrate et vice-versa
ex: les végétaux absorbent nitrate et ammonium du sol, les animaux se nourissent de végétaux, les organismes et végétaux meurent et se putréfient, sous l’action bact. leur composés azotés transformés encore en ammonium
Dans le cycle de l’azote, l’azote peut devenir 2 choses;
ammoniac (NH3): absorber par végétaux
Nitrite (NO2-) -> Nitrate (NO3-): absorber par MO du sol