PROTEINE/nomi specifici Flashcards
NLS
segnale di localizzazione nucleare, si trova nelle proteine che entrano nel nucleo. E’ un segnale che non può essere rimosso (divisione cellulare). Costituito da una piccola sequenza di amminoacidi basici.
NES
segnale di esportazione nucleare, per la proteina che deve uscire dal nucleo.
importina
Proteina che trasporta le molecole proteiche dal citoplasma cellulare al nucleo. Lo fa legandosi a specifiche sequenze di riconoscimento, chiamate sequenze di localizzazione nucleare NLS. Una volta dentro devono essere separate.
esportina
proteina per portare fuori dal nucleo le proteine del nucleo. Legata al NES e a RAN GTP. GTP si idrolizza in GDP è libera tutte insieme le proteine. Le esportine tornano nel nucleo.
Ran-GAP
proteina attivatrice della GTP-asi
Ran-GEF
fattore di scambio dei nucleotidi guanilici. Promuove lo scambio di GDP con il GTP.
CPN
complesso del poro nucleare
proteine scaffold
pinzare tenere nella posizione giusta il dna nel terzo livello di condensazione (domini ad anse)
proteine SMC
del mantenimento strutturale del cromosoma, tipologia di proteine scaffold.
condensine
per condensare il dna. si trova alla base di ogni ansa nel terzo livello di condensazione del dna. una proteina SMC
coesine
permettono di tenere legati 2 cromatidi fratelli dopo la replicazione del dna. Mantengono l’appaiamento dei due cromatidi fratelli. una proteina SMC.
Geni housekeeping
trascritti da tutte le cellule (sempre eucromatina)
dinamina
serve a staccare le vescicole di trasporto.
proteine snare
servono per la fusione della vescicola con la membrana, per il trasporto vescicolare. Si legano ad altre proteine nella membrana e fanno avvenire la fusione.
RAB GTPASI
dirigono verso il bersaglio. Effettori di questa proteina si trovano sulle membrane target e prendono contatto con le proteine Rab. Controllano la specificità e direzionalità del movimento delle vescicole. Controllano l’aggancio delle vescicole alla corretta membrana bersaglio.
peptidasi
taglia i segnali.
CAD
enzimi dnasi, che tagliano il dna durante l’apoptosi in corrispondenza del dna linker. E’ presente nella cellula ma inattivo
endonucleasi G
enzima importante per il taglio del dna nell’apoptosi.
caspasi
enzima proteolitico che regola l’apoptosi, e che uccide la cellula. Va attivato. Irreversibile.
GrB2
proteina adattatore che collega il suo recettore a un’altra proteina SOS. E’ una proteina monomerica che prima del segnale è legata a gdp e dopo è legata gtp.
Proteina SOS
ras-gef. Attiva la sostituzione del gdp con gtp e lo fa sulla proteina Ras
raf
proteina che attiva fosforilando le proteine mek e le proteine erk.
Myc
controlla la trascrizione di tutti quei geni che permettono di superare il punto di restrizione per entrare nel nuovo ciclo cellulare. Controlla la trascrizione della ciclina d e del gene e2f.
chinasi
enzimi la cui funzione è la fosforilazione.
fosfatasi
enzima la cui funzione è defosforilare.
MPF
Maturation promotion factor, costituito da ciclina b e Cdk1.
CAK
chinasi attivatrice che aggiunge un gruppo fosfato al MPF.
Wee1
aggiunge 2 gruppi fosfato inibitori alla ciclina b legata al cdk1. Iperfosforila inattivando ancora di + il complesso.
Cdc25
toglie 2 gruppi fosfato inibitori dal complesso cdk1 e ciclina-b.
Rb
proteina retinoblastoma che funge da freno molecolare.
M-cdk
complesso attivo ciclina b e cdk1, che attiva un complesso ubiquitina ligasi che lavora sulla ciclina b e sulla securina.
APC/C
ubiquitina ligasi, che promuove l’anafase o il ciclosoma. Regolata dalla cdc20. I 2 insieme degradano la securina e liberano la separasi.
E2F
fattore di trascrizione che viene bloccato con il legame con la Rb. Deve controllare la trascrizione dei geni che permettono il passaggio alla fase S.
geminina
proteina che toglie l’autorizzazione e impedisce una seconda replicazione del dna.
ATM
analizza errori sul doppio filamento.
ATR
chinasi, controlla danni solo sul singolo filamento.
CHK1 e CHK2
bloccano cdc25, portandolo fuori dal nucleo, mentre controllano il dna dopo G2. E fosforilano la proteina 53.
p53
fattore di trascrizione, importante nel controllo del ciclo cellulare. Controlla la trascrizione di geni specifici. Valuta il danno della cellula e la indirizza in 2 vie diverse.
p21
gene inibitore del complesso ciclina-cdk. impedisce di superare il punto di restrizione per correggere i danni.
Mad/Bub
complesso che sequestra la cdc20 per non far avvenire l’anafase, se i cinetocori non sono attaccati bene.
CAD
enzima dnasi che taglia in corrispondenza del dna linker il DNA nel processo di apoptosi, in multipli di 200. Viene aiutato dall’enzima endonucleasi-G liberato dai mitocondri.
Annessina V
Per visualizzare le cellule che vanno in apoptosi, ha un’affinità naturale per la fosfatidilserina.
Enzima TdT
Serve per visualizzare se una cellula sta andando in apoptosi, in quanto si lega all’estremita 3 del dna, se vedo tante estremità fluorescenti vuol dire che dna è stato tagliato. Metodo TUNEL.
Card
caspasi iniziatrice della via intrinseca
Ded
caspasi iniziatrice della via estrinseca
caspasi esecutrici
possono tagliare almeno 100 substrati. Tagliano:
-proteine citoscheletro
-proteolisi lamina nucleare
-proteolisi adesioni focali
-attivano le flippasi
-degradano le proteine che fanno parte del sistema di trasduzione delle proteine
-tagliano i CAD che effettuano il taglio del dna
segnali di morte
apoptosi in via estrinseca, si legano a recettori attivi solo in forma trimerica. E’ una proteina transmembrana.
ras
gtpasi che attiva raf, che attiva mek, che attiva erk, che attiva myc
GFP
proteina fluorescente scoperta nel 2008, trovata nella medusa e nel zebra-fish.
GLUT 1/2/3
proteine carrier, che trasportano e facilitano il passaggio del glucosio:
1- negli eritrociti
2 - nelle cellule epatiche
4 - nei muscoli scheletrici e nel tessuto adiposo. (ha un recettore dell’isulina)
scramblasi
enzima che richiede ioni calcio e che rende simmetrica la crescita dei due strati di membrana del REL.
Bip
proteina della famiglia delle chaperonine, che tirano le proteine dentro il reticolo endoplasmatico nella sintesi post-traduzione.
glucosidasi 1 e 2
tolgono 2 glucosi dal oligosaccaride nella n-glicosilazione
HSP70-90
si legano alle proteine man mano che vengono sintetizzate e coprono regioni di queste perchè cosi non si associno a delle proteine scorrette. Assicurano la rinaturazione di proteine che sono state denaturalizzate.
HSP60/GROEL/GROES
catturano le proteine mal ripiegate attraverso delle interazioni idrofobiche con il bordo della botte. Proteina viene aiutata a raggiungere la conformazione nativa con il consumo di energia.
Calnessina e calreticulina
sono 2 lectine che si legano a specifici oligosaccaridi legati in N.
clatrina
tipo di vescicola che riveste durante l’esocitosi e l’endocitosi.
COP1
rivestimento delle vescicole di recupero
COP2
rivestimento delle vescicole i transizione
triskellion
struttura della clatrina, 3 catene pesanti e 3 leggere (una svastica a 3 bracci).
Sar 1
proteina cha il via al trasporto vescicolare con cop2,
GEF
hanno il compito di attivare Ras
