Poetz 1 Flashcards

1
Q

Sous forme de quel type de molécules d’ADN est organisé le génome des procaryotes ?

A

Il s’agit d’un génome haploïde sous forme de réplicon, c’est à dire ADN à réplication autonome. Majoritairement codants.

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2
Q

Quelle est la taille habituelle des chromosomes des procaryotes ?

A

Inférieure à 10 Mb.

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3
Q

Comment peut on caractériser la réplication ?

A

Elle est semi conservative, bi directionelle à partir de deux fourches de réplications qui mettent en jeu deux complexes enzymatiques. terminaison quand les deux fourches se rencontrent.

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4
Q

Dans certains cas, un mécanisme de terminaison a lieu. Lesquels ?

A

ça peut être le système ter-Tus de E.Coli ou encore RTP.

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5
Q

Qu’est-ce que la ségrégation du chromosome ?

A

La migration du chromosome vers les cellules filles, en faisant une décaténation et condensation du chromosome.

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6
Q

Quand a lieu la réplication ?

A

Lors du cycle de division cellulaire, quand la quantité de DnaA et DnaA-ATP est suffisante dans la cellule, provoquant une réplication et ségrégation co-égulés.

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7
Q

Qu’est-ce que FtsZ et FtsK ?

A

FtsZ est une protéine assemblée en anneau qui intéragit avec FtsK, qui pompe l’ADN jusqu’à trouver le site de la dernière recombinaison. Celle-ci se fait et la ségrégation des chromosomes peut alors avoir lieu.

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8
Q

Comment fonctionne SeqA ?

A

Il s’agit d’une protéine capable de se lier sur les sites méthylés dans les sites de fixation de DnaA dans son promoteur : sa présence empêche l’association de DnaA (facteur d’initiation de réplication) sur le promoteur et donc la réplication précoce.

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9
Q

Qu’est-ce qu’un plasmide ?

A

Il s’agit de molécules d’ADN circulaires, super enroulés et autoréplicative, qui ne sont pas nécessaires à la survie de la bactérie. Ils confèrent seulement un avantage. Il peut y avoir plusieurs types de plasmides dans un seul même MO.

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10
Q

Quels sont les phénotypes généralement retrouvés dnas des plasmides

A
Gènes de résistance
Production de composés toxiques
Symbiose
Pathogénicité
Métabolisme, croissance
Modification de génome.
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11
Q

Qu’est-ce que le réplicon minimal ?

A

Il s’agit d’une molécule d’ADN circulaire d’environ 3 kb qui comporte une séquence Ori et un gène codant pour les protéines nécessaires à sa réplication.

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12
Q

A quel moment est-ce que le nombre de plasmides est maximal dans le cycle d’une cellule ?

A

Il est maximal à la fin de la phase exponentielle.

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13
Q

Qu’est-ce que le mécanisme de réplication en theta ?

A

Il s’agit d’un mécanisme ou l’initiation se fait au sein de l’ADN circulaire, avec formation d’une bulle et réplication des deux brins dans les deux sens jusqu’à dédoublement et séparation des cercles.

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14
Q

Qu’est-ce que le rolling circle ?

A

Pour les plasmides possédant une SSO et DBO. Rep vient vers DBO et induit une coupe de son côté 5’, sa tyrosine interagit avec et se fixe dessus. Rep commence à synthétiser en se servant du côté 3’ coupé comme amorce et ce brin se sépare du cercle au fur et a mesure que le nouveau se forme autour. Puis, séparation, ligation des extrémités pour former un simple brin. la rep se sert alors de SSO pour mettre un primer ARN et finaliser la synthèse du deuxième brin, aboutissant à deux plasmides.

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15
Q

Comment fonctionne une réplication de plasmide linéaire ?

A

Ces séquences d’ADN possèdent des sortes de télomères même si leurs fonctions sont différentes des eucaryote. Lors de la formation de la bulle et réplication, on aura une dupliquation des télomères côte à côte qui sera détecté par la ResT qui résoudra le problème et clivera au milieu, séparant les deux molécules d’ADN.

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16
Q

Qu’est-ce que l’incompatibilité ?

A

Deux plasmides ne peuvent pas cohabiter dans la même bactérie si ceux ci font partie du même groupe Inc, car compétition pour les sites de réplication donc un des plasmide va être sous représenté puis perdu.

17
Q

Comment fonctione l’initiation de la réplication chez COlE1 de E.Coli ?

A

Production d’un ARN II. Quand l’origine provoque la formation de la bulle, l’ARN II entre dedans et s’apparie sur le brin du dessous pour empêcher sa fermeture, puis la RNase H la dégrade quand la pol arrive pour se fixer dans la bulle. En revanche, si RNA I et Rop est produite, alors Rop aide l’ARN I à s’enrouler et dimériser avec la RNA II ce qui la tire de la bulle et provoque sa fermeture.

18
Q

Comment se fait le système Par du plasmide R1 pour la répartition des AN dans les cellules filles ?

A

Par R se lie au domaine parC du plasmide R1. Puis, polymérise du ParM couplé à de l’ATP ce qui pousse les deux plasmides l’un de l’autre. Finalement le filament formé est distabilisé et les deux plasmides se retrouvent aux pôles.

19
Q

Comment se fait le système Par du phage P1 ?

A

ParB est une protéine se liant au domaine parS du plasmide P1, tandis que ParA forme un filament sur le nucleoide. ParB sur le plasmide interagit avec ParA-ATP et le transforme en parA-ADP ce qui le dissocier du nucléoide. Ce faisant, ça tire le plasmide le long du nucléoide.

20
Q

Quels sont les trois systè,es permettant la stabilité des plasmides et la répartition dans les cellules filles ?

A

Système de résolution des multimères
Système tueur post-ségrégationenel HokSok
Système de restriction modification plasmidique

21
Q

Quand est-ce que des multimères peuvent se former

A

Quand recombinaison entre deux ou plus plasmides identiques ou encore réplication en RC, avec terminaison de chaque cycle peu efficace.

22
Q

Quel est le problème avec les multimères ?

A

Problème pour les séparer lors de la ségrégation cce qui entraine la perte de copies dans une cellule.

23
Q

Comment résoudre le pb des multimères ?

A

Recombinaison cycle spécifique codé sur chromosome ou plasmide. Ex de Cre-loxP de P1.

24
Q

Comment est-ce que le système toxine antitoxine influe sur la stabilité ?

A

Si l’antitoxine est régulée par plasmide et le plasmide est perdu, l’antitoxine plus codée et du coup toxine stable lâchée ce qui peut tuer la cellule.

25
Q

C’est quoi hok sok ?

A

Hok est une protéine qui dépolarise la membrane. Sok est un ARN qui peut se fixer sur un domaine de hok pour induire sa dégradation (très instable.)

26
Q

Par quoi est-ce que la génétique bactérienne est facilitée ?

A

Génome bactérien haploide, donc une seule copie ce qui fait que les effets mutations sont directement visibles
Reproduction asexuée, donc chaque cellule fille est identique
Temps génération court
Possibilité d’échanges génétique, permettant la complémentations etc.

27
Q

Par quoi est-ce que la génétique bactérienne est facilitée ?

A

Génome bactérien haploide, donc une seule copie ce qui fait que les effets mutations sont directement visibles
Reproduction asexuée, donc chaque cellule fille est identique
Temps génération court
Possibilité d’échanges génétique, permettant la complémentations etc.