Jacky de Montigny - les levures Flashcards

1
Q

Quels sont les trois raisonnements pour étudier les gènes ?

A

Génétique classique, ou on regarde des phénotypes différents pour remonter aux gènes.
Génétique réverse, ou un mute un gène et regarde le phénotype que ça donne.
Génomique : On regarde l’ensemble du génome

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2
Q

Quels sont les mutants généralement utilisés pour étudier la génétique d’un être vivant

A

On utilise généralement des mutants d’auxotrophie, catabolisme, résistance, de type conditionnel.

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3
Q

Comment obtient-on les mutants, et comment les isole-t-on ?

A

On obtient les mutants par mutagénèse dirigés ou mutation spontanée, puis

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4
Q

Pourquoi dit-on du génome qu’il est dynamique ?

A

Car il résulte de l’accumulation d’évènements qui se sont produits dans le passé, et donc de mutations.

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5
Q

Pourquoi est-ce que s. cerevisae est un modèle d’étude en génétique ? (4 raisons)

A

La génétique classique est applicable avec
Sa séquence est connue depuis 1996, et étant la première elle a été très étudiée
D’autres hémiascomycètes ont été étudiés, on peut faire de la génomique comparative.
Facile de faire de la sélection avec ses mutants.

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6
Q

Quelle est la différence notable entre S. Cerevisae naturel et la souche de laboratoire ?

A

La souche de laboratoire est hétérothallique, c’est à dire que il n’y a pas de risque d’autofécondation : il existe deux sexes bien définis qui ne peuvent se reproiduire qu’entre eux.

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7
Q

Comment peut on caractériser les génomes de S. Cerevisae etc ?

A

C esont des génomes compacts de petite taille (>21MB) avec peu de répétitions et 70% de régions codantes.

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8
Q

Quelle est la particularité des hémiascomycètes au niveau distance évolutive ?

A

Elle est très grande.

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9
Q

Définir gène homologues.

A

Gènes dérivant d’un gène ancêtre commun qui a subi un évènement de duplication.

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10
Q

Définir gènes orthologues.

A

Gènes identiques, dans deux espèces différentes. Ces gènes sont homologues, et leur ancêtre commun a subi un évenement de spéciation.

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11
Q

Définir spéciation.

A

Evènement créant de nouvelles espèces, lorsque deux espèces différentes se reproduisent et donnent une descendance fertile.

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12
Q

Définir gène paralogue.

A

Gènes homologues présents dans un même génome. Issus d’une duplication dans le génome.

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13
Q

Quel évènement est généralement à l’origine de nouvelles fonctions ?

A

La duplication.

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14
Q

Quels sont les 4 évènements de duplications pouvant survenir dans un génome

A

Duplication génique, ou un gène est dupliqué
Duplication de segments, ou plusieurs gènes sont dupliqués
Duplication de chromosome, soit aneuploidie
Duplication du génome soit polyploidie.

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15
Q

Quel est le devenir d’un gène dupliqué (4 cas) ?

A

Une copie est maintenue, tandis que la deuxième accumule les mutations
Les deux copies gardent la même fonction
Subfonctionnalisation : partage des fonctions entre les copies et division de l’expression génique.
Neofonctionalisation : création de nouvelle fonction sur la copie.

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16
Q

A partir de quel % de similitude détermine-t-on si deux gènes sont paralogues ?

A

30%.

17
Q

Quel est le rôle d’un centromère ?

A

c’est le point d’accroche des 2 chromatides, des microtubules.

18
Q

Qu’est-ce qu’un bloc génique ?

A

Il s’agirait d’un agencement des gènes paralogues en blocs contenant plusieurs gènes, issus de duplication segmentale. bout à bout, couvre 50% du génome !

19
Q

Si deux blocs entiers sont dupliqués, qu’est-ce qui est aussi conservé ?

A

L’ordre et l’orientation des gènes.

20
Q

D’ou pense-t-on que l’organisation en bloc provient ?

A

Duplication complète du génome suivie de délétions et translocation.

21
Q

Qu’est-ce que protoploide ?

A

Une levure qui n’a pas subit de WGD. Moins ils ont de paires d’orthologues + le génome est dynamique.

22
Q

Moins il y a de gènes orthologues…

A

Plus le génome est dynamique