Ploetz 2 Flashcards
Que peut induire un stress ?
Des dommages dans l’ADN (UV ou chaleur ou stress oxydatif)
Quels sont les deux mécanismes de réparation majeurs et leurs causes sur la stabilité ?
Le premier mécanisme conserve l’information génétique et favorise donc la stabilité.
Le 2e mécanisme génère des mutations en réparant et est donc en faveur de l’instabilité.
Qu’est-ce que le proof reading ?
QUand la pol passe peut parfois mettre des bases mal incorporées à cause de tautomères. Du coup, la pol I ou III ont une activité exonucléase 3’5’ qui permet de retirer le nucléotide mal apparié.
Quel pb du proofreading ?
Ralentit la réplication mais plus ou moins efficace selon les polymérases.
Dans quel cas est-ce que le mécanisme de base excision repair se met en place ?
Quand les bases sont endommagées sans distorsion de l’ADN ou quand il y a des dimères de pyrimidines.
Comment fonctionne le mécanisme de nucléotide excision repair ?
il y a détection d’une distortion de l’ADN par UvrA et B qui le scannent et détectent si la pol est coincée. A ce moment UvrB fait la vérification des dommages et sépare les 2 brins, provoquant le recrutement de UvrC et le décrochement de A. C fait alors l’excision en coupant 7 nt en 5’ et B 4nt en 3’. UvrD enlève l’ADN coupé et C.
Finalement polI et D réparent l’ADN et font une ligation.
Que se passe-t-il si la fourche est bloquée à cause d’une lésion ?
la pol III ou la pol I ré initie plus loin, ce qui implique l’action d’une primase.
Qu’est-ce que la translésion polymérase ?
Une polymérase qui est une exception est capable de continuer à répliquer même dans le cas d’une lésion de base.
Quel mécanisme sert à réparer des coupures simple ou double brins ?
Il s’agit de la recombinaison qui arrive à recoller les morceaux.
quels sont les deux types de recombinaison ?
Il y a la recombinaison nécessitant des homologies de séquence entre ADN recombinants, c’est à dire la légitime et rec-A dépendante
Et la recombinaison qui nécessite pas d’homologie, donc illégitime et RecA indépendante.
A quoi sert la recombinaison légitime ?
A maintenir l’intégrité du génome en réparant les cassures sb et db ainsi que les fourches de réplication.
Qu’est-ce que le complexe RecBCD et comment fonctionne-t-il ?
Il initie la recombinaison en dégradant l’ADN sur un seul brin par son activité exonucléase 3’5’ jusqu’à arriver à un site chi qui désactive l’activité 3’5’ et active la 5’3’. Forme un simple brin étendu en 3’ qui contient le site chi. RecB favorise alors le contact avec RecA et l’ADNsb et formation d’un D-loop
Qu’est-ce que la voie recF ?
C’est quand il reste unt rou dans l’un des brins après réparation de la lésion, alors ça requiert RecF et recO en plus de RecR qui aide RecA à se lier ReqQ qui fait hélicase et RedJ qui fait exonuclease.
QU’est-ce que le système SOS ?
Quand trop de mutations et lésions s’accumulent la petite quantité de RecA est débordée. Du coup SOS confère à RecA une fonction protéolytique pour cliver LexA qui retient sa synthèse : du coup, plus de RecA et plus de réparation.
