Ploetz - suppléments

Question 1

Qu’est-ce qui permet d’enrouler les ADN des chromosomes pour les condenser ?

Answer 1

Il s’agit des topoisomérases.

Question 2

Il y a 5 DnaA box. Quand est-ce que la réplication peut se faire ?

Answer 2

En gros DnaA peut se fixer sur certaines box sans être liée à l’ATP et sur d’autres quand liée à l’ATP. quand toutes les box liées alors recrutement du gros complexe et initiation de réplication.

Question 3

Comment fonctionne le réplisome dans la réplication en trombone ?

Answer 3

Un brin est synth de manière continue alors que le 2e se fait au fur et à mesure en ajoutant des amorces.

Question 4

A quoi sert FtsZ ?

Answer 4

A part lier FtsK et tirer l’ADN, elle permet d’intéragir avec une protéine pour former le septum. Tant que FtsK fait passer l’ADN pas de septum se forme.

Question 5

Pourquoi est-ce que la régulation dela réplication dépend de l’hémiméthylation d’un brin ?

Answer 5

La méthylation del’ADN se fait assez tard. Du coup, lorsque l’ADN est hémiméthylé c’est qu’il vient d’être répliqué. Du coup, SeqA peut se fixer dessus et empêcher DnaA de venir.

Question 6

Qu’est-ce qu’un xénobiotique ?

Answer 6

Il s’agit d’un plasmide crée par l’homme et lâché dans la nature, comme celui qui code pour des pesticides.

Question 7

Que code un plasmide ?

Answer 7

Vu que c’est autoréplicatif code pour toutes les protéines nécessaires à sa réplication.

Question 8

Qu’est-ce qu’un itéron ?

Answer 8

C’est des petites séquences répétées se trouvant proche des ORI et reconnues par RepA.

Question 9

Comment marche CoLE1 pour la réplication ?

Answer 9

Code 2 petits ARNs dont la séquence est complémentaire en cis : système avec l’ARN II et l’ARN I en bref.

Question 10

Comment marche PT181 pourla rép?

Answer 10

Régule la production de RepC nécessaire pour initier.

Question 11

Comment marche ParB ParS etc ?

Answer 11

Au niveau de l’ADN du plasmide parS est reconnu par la protéine ParB, qui tapisse le plasmide à cet endroit. ParA se fixe sur le chromosome un peu partout et va polymériser le long du chromosome. ParB interagit avec Par A et induit la dépolymérisation progressive de parA ce qui pousse le plasmide le long du chromosome. En gros, ça couple la répartition du plasmide avec la répartition du chromosome.

Question 12

C’est quoi une gyrase

Answer 12

c’est une topoisomérase II, peut libérer deux plasmides

Question 13

c’est quoi transfert vertical vs transfert horizontal ?

Answer 13

Vertical : cellule mère transmet à la fille. Hori : rencontre entre deux bactéries, ADN exogène transféré dans une bactérie qui est donné aux cellules filles.

Question 14

détailler le BER

Answer 14

Glycosylase coupe la liaison sucre base et libère la base. Puis, endonucléase reconnaît le site abasique et génère un 3’OH pour réparer la base par la pol I.

Question 15

Lors de la réparation d’un mésappariement quel brin est utilisé comme “brin correct” et comment est-il reconnu ?

Answer 15

On utilise le vieux brin vu que c’est la réplication qui a merdé, et on peut le reconnaître car il est méthylé.

Question 16

quels sont les 3 étapes de la recombinaison recA dépendante ?

Answer 16

pré-s, synapse et post-s.

Question 17

Quel est le complexe présynapse et que fait il ?

Answer 17

C’est recBCD avec une activité hélicase qui ouvre l’ADN et exonuc 3’5’ qui le dégrade.

Question 18

c’est quoi recF ?

Answer 18

une 2e voie qui fait intervenir RecR RecQ J et F. Reconnait un trou sur les brins, et Q et J reconnait le brin et dégrade avec exo5’3’ en agrandissant le trou. SSB se fixent sur le sb et recF recrute recA et remplace les SSB par un filament de recA.

Question 19

role de recA?

Answer 19

met en contact 2 séquences homologues, c’est la synapse : Permet recombinaison.

Question 20

mécanisme de recA ?

Answer 20

Le brin d’ADN avec recA vient en contact avec l’ADN db homologue : favorise appariement des ADN homologues et chasse l’autre brin. Forme jonctions holliday

Question 21

C’est quoi le complexe post synapse ?

Answer 21

C’est RuvABC qui reconnait les jonctions holliday et font une activité endonucléase : A lie la jonction, B déroule et déplace la jonction pour trouver le site spécifique, et ruvC se lie au complexe et coupe un brin pour le coller surl ‘autre.

Question 22

c’est quoi la reponse des archées aux uv

Answer 22

mécanismes pour exprimer des pilis qui permettent l’adhésion cellulaire pr que l’adn d’une cellule non endommagée crée une recombinaison homologue avec l’ADN d’une cellule endommagée pr se réparer.