Physiologie bactérienne, taxinomie, virus et mycètes partie 2 Flashcards
Quelles sont les 4 caractéristiques principales pour l’identification bactérienne?
- Morphologie cellulaire: forme, arrangement, présence de spores, motilité
- Coloration de Gram
- Réponse à l’oxygène: aérobie stricte, anaérobie stricte, anaérobie facultative, microaérophile
- Tests biochimiques: fermentation de sucres, production de métabolites (indole, acides gras, etc.) et d’enzymes (protéases, glycosidases, etc.)
Donnez un exemple de test biochimique utilisé pour l’identification bactérienne.
Test de la catalase
Pendant leur respiration aérobie, certaines bactéries produisent du peroxyde d’hydrogène (H2O2) qui est toxique. Ces dernières produisent la catalase qui est une enzyme capable de décomposer l’H2O2 selon la réaction suivante: 2H2O2 –> 2H2O + O2
Le peroxyde n’est donc plus toxique grâce à la catalase. Ce test est très important pour l’identification des bactéries Gram +
Qu’est-ce qu’une galerie d’identification?
C’est des tests colorimétriques qui vont être négatif ou positif. Le résultat est obtenu après 4 heures d’incubation. Ça donne un code général qui est lié à une banque de données pour avoir l’espèce bactérienne ou son représentant le plus près.
Pour l’identification génétique, nommez 2 techniques de génie génétique.
- La PCR pour cibler un gène présent uniquement chez une famille ou un genre bactérien par réhybridation spécifique de courtes séquences d’ADN synthétique précises (amplifie le matériel génétique)
- Le séquençage de l’ADN, précision allant jusqu’à la souche.
Complétez la phrase:
La réaction en chaîne de polymérase est une méthode de _________ d’amplification génique in vitro.
biologie moléculaire
Pourquoi on utilise la technique PCR (qu’est-ce que ça nous permet de détecter)?
- Présence du VIH
- Mesurer une charge virale (concentration du virus dans le plasma)
- Traces d’OGM
- Virus d’hépatites B, C et D
Quel est le principe de la PCR (comment ça marche)?
Elle permet de dupliquer en grand nombre (avec un facteur de multiplication de l’ordre du milliard) une séquence d’ADN ou d’ARN connue, à partir d’une faible qté (de l’ordre de quelques picogrammes) d’acide nucléique (séquence spécifique d’ADM (Amplicon)) et d’amorces spécifiques constituées d’ologonucléotides de synthèse de 20 à 25 nucléotides.
Nommez les 2 méthodes de conservation des bactéries.
- Congélation
-80°C (congélateur) / -180°C (azote liquide) - Lyophilisation
Déshydratation sous vide, ce qui permet de les conserver pendant plusieurs années et ça ne prend pas bcp d’espace en lab.
Pourquoi conserve t’on des bactéries à basse température?
Afin d’empêcher leur croissance et d’éliminer les chances de mutations spontanées pour changer les caractéristiques du microorganisme isolé.
Permet donc d’avoir des échantillons représentatifs de notre culture pure et de garder les mêmes caractéristiques de base à chq fois qu’on veut commencer une expérience en lab.
Qui suis-je?
Sans moi, lorsqu’on préserverait des bactéries, il y aurait présence de cristallisation de l’eau dans les microorganismes ce qui mèneraient à une lyse cellulaire et toute la culture mourrait.
Le glycérol!
Les bactéries sont donc dans un milieu de congélation qui contient du glycérol.
V/F
Les virus sont les plus petits agents infectieux.
Vrai
V/F
La multiplication des virus ne requiert pas toujours des cellules hôtes.
Faux. La multiplication des virus requiert des cellules hôtes.
V/F
Les virus ne peuvent se reproduire dans des milieux artificiels.
Vrai. Le virus ne peut pas se reproduire en milieu de culture. Il faut cultiver le virus avec des cellules hôtes pour permettre l’infection de ces cellules et permettre la réplication du virus.
V/F
Les dimensions et les formes de virus ne varient pas beaucoup.
Faux. Les dimensions et les formes de virus varient considérablement et est propre à chaque type de virus.
On peut même retrouver une enveloppe additionnelle chez certains virus.
- 20-300 nm
- Circulaire, cubique et cylindrique
V/F Les virus ont la caractéristique de pouvoir avoir 2 types de matériel génétique soit de l’ADN et ARN (circulaire ou linéaire / simple brin ou double brin)
Vrai
