Partie C Flashcards
dans le concept d’opéron, le répresseur peut se lier à deux endroits pour faire son action
sur le gène de l’opérateur
ou sur l’ARNm au niveau de la section codante pour l’operateur
croissance de bactérie en présence de glucose et de lactose
au début beaucoup de division de bact parce quon utilise rapidement le glucose. Ensuite quand pu de glucose on doit prendre la beta-galactosidase pour transformer le lactose en galactose et glucose qui sera utiliser par la bact. Cependant on a une periode ou on a pas de croissance de bact parceque ca prend un temps pour activer l’opéron lacz qui va former l’enzyme beta galactosidase
à quoi ressemble l’opéron lac/ quels sont les acteurs
promoteur, répresseur et opérateur sont des elements en cis ou en trans
P et O en cis parceque font parti de la molécule d’ADN
répresseur en trans parceque agit sur une partie de l’ADN
comment fonctionne l’opéron lac
sans presence d’inducteurs, répresseur se lie à l’opérateur empêchant la transcription de l’opéron lac
si présence d’inducteurs (ex: allolactose ou isopropylthiogalactoside (IPTG)) ils agissent comme un ligand pour la prot represseur qui ne peut plus aller se lier sur l’opérateur et donc ne bloque pu la transcription des gènes de l’opéron lac qui permet de transformer le lactose en galactose et glucose (métabolisable par la bactérie)
donne deux exemple de mutation qui affecte la regulation de l’opéron lac
mutation du gène represseur (mutation dominante) : represseur non formé donc on transcrit toujours l’opéron
mutation de l’opérateur : répresseur ne peut pas venir se lier donc on transcrit toujours les gènes de l’opéron
qu’est ce qui se passe avec l’opéron lac quand
1.pas de lactose mais beaucoup de glucose
2.beaucoup de lactose et de glucose
3.beaucoup de lactose et peu de glucose
- pas de lactose donc pas d’inducteur qui s’accroche sur le represseur. L’opéron n’est pas transcrit
- lorsque beaucoup de glucose présent, on a peu d’AMPc parceque inhibe Adénylyl cyclase. Peu de recrutement de la polymérase donc peu de transcription de l’opéron mais on en a un peut parceque notre represseur est pas lié à l’opérateur
- peu de glucose= bcp d’AMPc. AMPc se lie à CAP qui va se lier au promoteur et augmente le recrutement de la pol donc on va avoir beaucoup de transcritption de l’opéron lac (en plus notre represseur est pas lié parce quon a du lactose)
le glucose inhibe quelle enzyme
adenylyl cyclase qui produit AMpc
le site de liaison de CAP-Ampc se situe ou
sur une partie du promoteur
décrit la liaison du represseur avec l’ADN
c’est un tetramère
donc chaque monomère lie l’ADN via un domaine HTH (hélice coude hélice), courbe d’ADN d’environ 60 degré
Décrit la liaison de CAP-Camp avec l’ADN
c’est un dimère de protéine
lie les motifs sur 2 tours successifs du sillon majeur de l’ADN via domaine HTH, courbure d’ADN environ 90 degrée
exemple d’interactions non spécifiques ADN prot
résidus basiques chargés positivement (LYs, Arg, His) interagissent avec le squelette phosphate-sucre acidique chargé négativement (ex: histones hautement basiques organise l’ADN en chromatine via liaisons non-spécifiques )
interactions séquence spécifiques
protéines rconnaissent les séquences spécifiques des bases azotées au niveau du sillon majeur (ex: répresseur lac et protéine CAP)
explique lessai de retard de mobilité sur gel
le fragment O1 est plus spécifique au represseur que le fragment O3
explique la regulation de l’operon arabinose
Ara C en présence d’arabinose en grande concentration est un dimère qui se lie aux site d’initiation de la transcription et qui active la transcription des gènes araBAD
Ara C avec arabinose en faible concentration va faire une boucle dans l’ADN qui empêche la transcription de AraBAD
quand ARAc est abscente, AraC est transcrit et AraBAD est transcrit a son niveau de base
explique la régulation de l’opéron trp
une augmentation de TRP empêche la transcription des enzymes formant le tryptophane (grace a l’atténuateur)
l’aporepresseur est formé, mis en dimère et sa liaison avec le TRP fait quil peut se lier au niveau de l’opérateur pour empêcher la transcription
Une diminution de TRP active la transcription des enzymes formant le tryptophane
l’aporespresseur est formé, mis en dimère mais ne peut s’accrocher à l’opérateur donc la transcription contiue d’avoir lieue
comment l’atténuateur qui se trouve sur l’adn codant pour le gène tprL fait pour arreter ou continuer la transcription des enzymes du tryptophane
bcp de TrP: favorise la formation de boucle 3-4 dans l’arnm du TRPL: bloque la traduction par les ribosomes
peu de trp: favorise la formation de boucle 2-3 dans l’arnm du TRPL: favorise la traduction par les ribosomes
la structue secondaire de l’ARNm dans la région TRPL controle la transcription du locus. en quoi l’ARNm de TRPL est traduite
14 a.a contenant deux codons TRp consécutifs (position 10-11)
quels autres opérons sont connus pour influencer a prod d’a.a
opéron His (histidine) et ilv (isoleucine, leucine et valine)
place les opérons Lac, Ara et TRP dans la bonne catégorie
-inactivation d’un répresseur constitutif
-Activation d’un activateur
-Activaiton d’un répresseur
-Inactivation d’un activateur constitutif
Lac: inactivation d’un répresseur constitutif
Ara: inactive un répresseur
TRP: activation d’un répresseur (en présence de TRP, on active notre répresseur)
