Cours 3 Flashcards

Question

qu'est ce qu'un enhancer et un isolateur

Answer 1

enhancer: région d'adn (50/1500 pb) liée par facteurs de transcription pour influencer initiation et formation du PIC peuvent etre jusqu'à 1Mb d'un gène (loin) peuvent etre en amont, a l'interieur ou en aval du gène qu'ils régulent ou dans un intron dun gène quil régule ou d'un autre gène voisin par exemple isolateurs: région d'ADN qui bloquent l'action non désirée d'un enhancer sur un promoteur

Answer 2

truc : mediateur =milieu liaison 1:agit comme un pont entre les facteurs liés aux séquences régulatrices et machinerie de transcription de base. (différentes de ses s-u vont lier diff protéines) liaison 2: il se lie au domaine carboxy terminal de l'ARN pol2 non phosphorylé (au promoteur) et facilite la formation du complexe de préinitiation (PIC) Lors de l'élongation, la queue CTD devient phosphorylé ce qui abolit la liaison avec le mediateur

Answer 3

les activateurs lient le mediateur le mettant dans une conformation qui favorise la formation du PIC les represseurs lient le mediateur le mettant dans une conformation inhibant l'interaction entre l'ARN pol II et le promoetuer donc bloque la formation du PÏC

Answer 4

le facteur de transcription se liant à l'enhancer peut aussi lier le complexe mediateur qui peut lier l'ARN polII pour favoriser la formation du PIC. Cela cré des booucles de chromatine.

Answer 5

fomration de boucles par l'interaction entre sequences isolatrices permet de restreindre l'activité d'un enhancer a un domaine particulier a l'int de la boucle en question (si l'enhancer est dans la boucle mais pas le gène, il ne peut pas l'atteindre)

Answer 6

1. capable de se fixer à l'ADN ou d'interagir avec une protéine qui lie l'ADN (dans ce cas on appelle les prot co-activateur/co-represseur) 2. capable d'interagir directement avec le PIC, mediateur ou d'autres facteurs de transcription afin de moduler la transcription les facteurs de transcription ont donc un domaine de fixation a l'ADN et un domaine d'activation

Answer 7

d'activation les TAFs (TBP-associated factors) ou le complexe mediateur interagissent physiquement avec les domaines d'activation de la transcription peut suggérer un rôle de cette protéines dans la régulation de la transcription

Answer 8

doigt de zinc hélice tour hélice Zipper de leucine Hélice boucle hélice

Answer 9

1. en forme de doigt 2. hélice alpha 3. n'interagissent pas tous avec l'ADN, certain avec ARN, prot, lipide ou petites molécules 4. souvent 2 cystéines, 2 histidines (CYs2/His2) ou 4 cystéines (CYS2/CYS2) qui coordonnent l'atome de Zinc

Answer 10

1. dimère typiquement 2. 3, l'hélice 2 et 3 lient l'ADN 3. majeur (la dimérisation fait que les protéines lient les deux sillons majeurs adjacents) 4. facteur de transcription HOX

Answer 11

1. séquence d'acide aminé ayant une leucine à tous les 7 résidus et formant une hélice alpha 2. résidus de leucine interagissent avec les residus de leucine d'une autre prot pour former dimère (homo ou hétéro) 3. la region adjacente aux leucines est basique et interagit avec le sillon majeur de l'ADN 4. protooncogène (C-jun et C-fos)

Answer 12

1. deux segments helicaux séparés par une boucle non structurée 2. les helices permettent la dimerisation des facteurs la contenant 3. une des helice est suivie d,une region basique qui lie l'ADN souvent au sillon majeur 4. protooncogène Myc

Answer 13

les facteurs de transcription se fixent souvent à l'aDN sous forme de dimères /multimères chaque monomère reconnait un demi-site du complexe. ainsi diverses combinaisons reconnaissent des elements distincts on appelle ca la regulation combinatoire (ex: l'expression pourrait seulement se produire dans la cellule si les deux regulateurs transcriptionnels sont exprimés simultanément)

Answer 14

les deux memebres du dimère de prot hélice boucle hélice doivent avoir le domaine basique pour se fixer à l'ADN. Par contre certains HBH n'ont pas ce domaine. Ainsi, un HBH n'ayant pas le domaine basique va empêcher la fixation du dimère. la protéines libre sans domaine basique va donc agir comme un dominant négatif en inhibant l'activation des gènes sous controle de ce facteur

Answer 15

1. phosphorylation / déphosphorylation du régulateur transcriptionnel (FT) 2. liaison de ligand pour translocation au noyau (ex: classe 1 des recepteurs nucléaires) 3. liaison par un inhibiteur protéique (ex: classe deux des recepteurs nucléaires) 4. formation de dimère actif/inactif (ex: helice boucle helice)

Answer 16

liaison des facteurs de transcription de base (PIC) on débute la polymérisation de l'aDN TFIIH a une activité hélicase qui ouvre les brins d'ADN à partir de -10 et ouvre environ 25 pb l'arn pol peut générer ses premiers fragments

Answer 17

1. plusieurs cycles d'élongation avortés (relachement d'arn tronqué de courte taille) 2. promoter clearance: éloignement de l'ARn pol du promoteur et des facteurs de transcription de base (environ 10 bases d'ARN synthétisées) 3. pause aux position +20 à +50 (autre opportunité de régulation) 4. phospho de la CTD régule les pauses /promoter clearance

Answer 18

1) complexe enzymatique lie le CTD de l'ARN pol II et clive l'ARN dans le signal de polyadénylation (queue 3' possède 80-250 A) 2) l'ARN relaché des alors polyadénylé par un complex enzymatique