Partie 4.1-évolution, taxinomie et diversité

Question 1

3 parties distinctes de la taxinomie

Answer 1

1) classification
2) nomenclature
3) identification

Question 2

4 importances de la taxinomie

Answer 2

1) met les organismes en ordre
2) permet de faire les prédictions/hypothèses
3) répartit les microorganismes en groupes significatifs pour une étude efficace
4) essentiel pour identification précise

Question 3

c’est quoi la classification naturelle

Answer 3

système basé sur les caractères anatomiques et reflète la nature biologique des organismes

Question 4

C’est quoi une approche polyphasique

Answer 4

inclut des caractères phénotypiques et moléculaires

Question 5

exemples d’un caractère phénotypique

Answer 5

morphologie, porfil biochimique, proptiétés métaboliques, propriétés physiologiques

Question 6

exemples d’un caractère moléculaire

Answer 6

empreintes génétiques, séquences d’ADN, séquences protéiques, génome entier

Question 7

c’est quoi les rangs taxinomiques (9)

Answer 7

espèce, genre, famille, ordre, classe, embranchemenet, règne, domaine, monde vivant

Question 8

définition fondamentales pour une espèce procaryote

Answer 8

espèce de bactérie/archée est un ensemble de souches qui partagent des propriétés stables et diffèrent des autres groupes de souches

Question 9

pourquoi il y a des définitions différentes entre eucaryotes et procaryotes

Answer 9

car les procaryotes ne se reproduisent pas de façon sexuée

Question 10

c’est quoi une souche

Answer 10

constituée des descendants d’une seule culture microbienne pure

Question 11

les souches peuvent être différenciés en:
(4)

Answer 11

1) Biovars
2) morphovars
3) pathovars
4) sérovars

Question 12

c’est quoi une différenciation en biovars

Answer 12

différences biochimiques/physiologiques

Question 13

C’est quoi une différenciation en morphovars

Answer 13

différences morphologiques

Question 14

c’est quoi une différenciation en pathovars

Answer 14

spectres d’hôtes distincts

Question 15

C’est quoi une différenciation en sérovars

Answer 15

propriétés antigéniques distincts

Question 16

c’est quoi une souche type

Answer 16

habituellement la première souche étudiée, plus complétément caractérisée

Question 17

c’est quoi le système binomial de nomenclature

Answer 17

c’est un système développé par Carl von Linné et porte un nom latin composé d’un genre et espèce

Question 18

comment une nouvelle espèce procaryote peut être reconnue

Answer 18

après une publication dans l’International journal of systematic and evolutionary microbiology

Question 19

2 grands groupes de caractéristiques

Answer 19

1) caractéristiques classiques
2) caractéristiques moléculaires

Question 20

4 composantes des caractéristiques classiques

Answer 20

1) morphologie
2) propriétés biochimiques
3) propriétés écologiques
4) propriétés physiologiques

Question 21

5 composantes des caractéristiques moléculaires

Answer 21

1) composition en acides nucléiques
2) hydridation des acides nucléiques
3) séquencage des acides nucléiques
4) prise d’empreintes génomiques
5) séquencage des protéines

Question 22

comment identifier la composition en base des acides nucléiques

Answer 22

calculer le % en G et C et variation doit être under 10%.

Question 23

pourquoi 2 organismes avec % de G+C similaires ne sont pas nécessairement des séquences de bases d’ADN similaires

Answer 23

car deux séquences très différentes peuvent être construits avec les mêmes proportions de GC et AT

Question 24

c’est quoi la mesure de l’hybridation des acides nucléiques

Answer 24

mesure de la similitude entre 2 génomes, utilisé pour étudier microorganismes très apparentés

Question 25

Pourquoi les gènes ribosomaux 16S et 18S sont les outils idéaux pour déduire les phylogénies microbiennes (6)

Answer 25

1)ont le même rôle chez tous les microorganismes 2) indispensables à la survie 3) peuvent pas tolérer mutations 4) évoluent très lentement 5) peuvent pas être transférés par transfert horizontal 6) ont régions très conservées et régions variables

Question 26

Qu'est ce que l'analyse des séquences d'ARNr 16S ou 18S démontre

Answer 26

la présence de signatures oligo-nucléotidiques

Question 27

Comment le séquencage des acides nucléiques est utilisé pour la taxinomie

Answer 27

les génomes complets sont séquencés et comparés de façon directe entre différentes types de bactéries

Question 28

2 approches pour la prise d'empreinte génomique

Answer 28

1) RFLP 2) rep-PCR

Question 29

4 étapes pour RFLP

Answer 29

1) gène amplifié par PCR 2) gène digéré par les enzymes de restrictions 3) fragements d'ADN séparé par électrophorèse sur gel 4) organismes qui présentent des patrons similaires sont taxonomiquement plus proches

Question 30

1 méthode directe pour le séquencage des protéines

Answer 30

déterminer la séquence en acides aminés de protéines par spectrométrie de masse

Question 31

3 méthodes indirectes pour le séquencage des protéines

Answer 31

1) comparer mobilité électrophorétique des protéines 2) déterminer propriétés immunologiques des protéines 3) comparer propriétés enzymatiques

Question 32

que représentent les branches de l'arbre phylogénétique

Answer 32

le nombre de changements moléculaires qui se sont produits à partir du noeud

Question 33

Que représentent les noeuds de l'Arbre phylogénétique

Answer 33

un évènement où une divergence s'est produite

Question 34

2 types d'arbres phylogénétiques

Answer 34

1) arbres non racinés 2) arbres racinés

Question 35

signification des arbres non racinés

Answer 35

n'indiquent pas le chemin évolutif