Partie 2.4-métabolisme Flashcards
C’est quoi le catabolisme
réactions chimiques de dégradation pour conserver l’énergie
C’est quoi l’anabolisme
réactions chimiques de synthèse qui utilisent l’énergie. Processus réducteur
C’est quoi une oxydation
perte d’électrons par agent réducteur
C’est quoi une réduction
gain d’électrons par agent oxydant
C’est quoi le potentiel de réduction standard
mesure la tendance à perdre des électrons. Plus la valeur est négative, plus la capacité de donner des é sera meilleure
équation d’une réaction d’oxydo-réduction
accepteur+é=>donneur
Pourquoi l’anabolisme a besoin d’une source d’électrons
car c’est un processus réducteur et il ajoute des électrons aux petites molécules qui sont utilisés pour construire des macromolécules
12 métabolites précurseurs de l’anabolisme
1) acétyl-CoA
2) erythrose 2-P
3) fructose 6-P
4) glucose 6-P
5) glycéraldéhyde 3-P
6) α-cétoglutarate
7) oxaloacétate
8) phosphoénol pyruvate
9) 3- phosphoglycérate
10) pyruvate
11) ribose 5-P
12) succinyl-CoA
2 source d’énergie possibles en général chez microorganismes
1) phototrophes–>capture d’énergie du soleil
2) chimiotrophes–>oxydent composés chimiques
3 types d’accepteurs pour les chimio-organotrophes
1)exogènes organiques
2)exogènes inorganiques
3)endogènes
c’est quoi la respiration
électrons qui traversent un système de transfert d’é et génerent une force proton-motrice (FPM). FPM est utilisée pour produire de l’ATP par la phosphorylation oxydative
C’est quoi la respiration aérobie
substrat énergétique est dégradé en utilisant l’oxygène comme accepteur d’électrons exogène
C’est quoi la respiration anaérobie
substrat énergétique dégradé en utilisant substances autre que l’oxygène comme accepteur d’é exogène
C’est quoi la fermentation
molécules endogènes agissent comme accepteurs d’é pour dégrader le substrat. ATP peut seulement être produit par la phosphorylation du substrat
3 étapes de la respiration aérobie pour les chimio-organotrophes (en général)
1) dégradation des grosse molécules (pas de liberation d’énergie)
2) petites molécules dégradées en pyruvate et/ou acetyl-coA (produit ATP et NADH et/ou FADH2)
3)pyruvate/acétyl-coA oxydés dans cycle de TCA (fomation de NADH,FADH2 et ATP)
Respiration aérobie en utilisant les lipides (3 étapes)
1) triglycérides dégradés en glycérol et acides gras
2) glycérol dégradé par glycolyse et acides gras oxydés dans la voie de β-oxydation
3) acides gras oxydés et dégradés en acétyl-coA pour passer dans cycle TCA et produire NADH,FADH2 (et ATP par chaine de transfert d’électrons)
Respiration aérobie en utilisant les protéines (3 étapes)
1) protéines hydrolysés en A.A par les protéases
2) désamination des A.A qui produit un acide organique
3) acide organique converti en pyruvate, acétyl-coA ou un intermediaire
Respiration aérobie en utilisant les glucides
monosaccharides vont dans la voie de glycolyse après phosphorylation par ATP
Disaccharides/polysacc. sont clivés par hydrolyse/phosphorylase
3 voies métaboliques pour les glucides
1) voie d’embden meyerhof (glycolyse)
2) voie d’Entner-doudoroff
3) voie des pentoses phosphates
C’est quoi la voie d’Embden-meyerhof
se produit dans cytoplasme, peut être avec ou sans oxygène, produit 2 ATP, 2 pyruvates et 2 NADH
C’est quoi la voie des pentoses phosphate
peut se produire avec ou sans oxygène, produit 6NADPH
C’est quoi la voie d’Entner-Doudoroff
voie spécifique à gram+, enzymes communes avec les 2 autres voies, dégradation de glucose en pyruvate et production de 1 ATP, 1 NADPH, 1NADH
Pour chaque molécule d’acétyl-CoA, le cycle de TCA produit:
2 CO2, 3NADH, 1FADH2 et 1 GTP
Où se passe le transfert des électrons (pour eucaryotes et procaryotes)
membrane interne des mitochondries pour eucaryotes et membrane cytoplasmique pour procaryotes
Comment se passe le transfert des électrons
transporteurs d’électrons transportent les é de donneurs (NADH et FADH2) aux accepteurs (comme O2). l’énergie est libérée lors du transfert
C’est quoi l’hypothèse chimio-osmotique
postule que les électrons vont être transportés à l’intérieur de la matrice et les protons vont être transportés à l’extérieur de la matrice. Résulte en force proton-motrice
Quelle enzyme utilise le mouvement edes protons pour catalyser la synthèse de l’ATP?
ATP synthétase/synthase
3 exemples de la respiration anaérobie chez les chimio-organotrophes
1) réduction catabolique du nitrate–>
dénitrification–>
réduction du nitrate en azote gazeux
2) réduction du sulfate
3) réduction du CO2
Pourquoi les chimio-lithotrophes sont importants pour l’écologie
car ils participent aux cycles de l’azote, du soufre, du fer, etc..
Rôle des bactéries nitrifiantes
oxyder l’ammoniac du sol en nitrate (nitrification)
4 bactéries nitrifiantes
nitrosomonas sp. , nitrosophira sp. , nitrobacter sp. , nitrococcus sp.
Rôle des bactéries sulfo-oxydantes
oxydent soufre, sulfure d’hydrogène, thiosulfates et réduisent d’autres composés en acide sulfurique. Produisent de l’ATP par phosphorylation oxydative et phosphorylation du substrat
C’est quoi la photosynthèse
énergie lumineuse convertie en énergie chimique. Fournit l’ATP et le pouvoir réducteur nécessaire à la synthèse des matières organiques importantes
2 phases de la photosynthèse
1) phase claire
2) phase obscure
C’est quoi la phase claire de la photosynthèse
énergie lumineuse captée et convertie en énergie chimique
C’est quoi la phase obscure de la photosynthèse
énergie chimique est maintenant utilisée pour réduire/fixer le CO2 et synthètise constituants cellulaires
3 types de photosynthèse
photosynthèse oxygénique, anoxygénique et phototrophie basé sur la rhodopsine
C’est quoi la photophosphorylation
quand phototrophes utilisent la lumière pour générer force proton-motrice qui va synthétiser l’ATP
