Organization of Genome: 1 Flashcards
Qu’est-ce qu’une séquence codante et qu’est-ce qu’une séquence non-codante
séquences codantes (transcrites en ARN
messagers) et traduites en protéines
séquences non-codantes (non transcrites, ou transcrites
en ARN, mais non traduites
What is the definition of a gene?
Séquence d’ADN qui contient toute l’information pour produire un ARN
True or False, Non-Codant ARN are non functional units not really involved in cellular processes.
FALSE, RNA non-codants pour de protéines sont toutefois fonctionnels et sont impliqués en divers processus cellulaires essentiels:
What is a locus?
Place spécifique sur un chromosome (comme
une adresse postale
Locus est invariable, car il s’agit d’un
endroit physique sur le chromosome,
caractérisé par des coordonnés
What is an allele?
version donnée d’un gène.
Les allèles du même gène varient entre les individus
Chez un individu chaque gène possède 2 allèles (une version par chromosome)
True or False, procaryotes and eucaryotes have continoues gene information?
FALSE,
eucaryotes: l’information génétique est discontinue
Qu’est-ce qu’un intron et qu’est-ce qu’un exon
EXONS séquences du gène qui codent pour des parties des protéines
INTRONS séquences du gène qui ne codent pas pour des parties des protéines et vont être éliminés lors de l’épissage
Quelles sont les différences entre les génomes bactériens et le génome humain
Gènes des eucaryotes: l’information génétique est discontinue
eucaryotes: l’information génétique est discontinue
Pure definition of coding vs non coding genes?
séquences codantes (transcrites en ARN messagers) et traduites en protéines
séquences non-codantes (non transcrites, ou transcrites en ARN, mais non traduites
What are the two major classes of sequences?
SÉQUENCES « UTILES » CORRESPONDANT AUX GÈNES
SÉQUENCES INTERGÉNIQUES (« INUTILES » / « JUNK » )
What are the three categories of UTILES sequences?
1- GÈNES SOLITAIRES: Une seule copie dans tout le génome
2- GÈNES DIVERGENTS: Des gènes qui dérivent d’un gène ancestral
3- GÈNES RÉPÉTÉS EN TANDEM: Gènes dupliqués (répétés)
What is an example of GÈNES DUPLIQUÉS DIVERGENTS and is this junk or not?
Obviosly not junk -> sequence utile
GÈNES DES GLOBINES (hemoblobines)
What are genes en tandem and what is the advatage?
Rpeated sequences of the same gene
Exemple gènes qui codent pour des histones
Advantages:
Mutation of one gene can mean you can use another one
Adaptability:
Diversite Fonctionelle
What is the difference between tandem genes and tandem sequences?
Genes -> they are utile genes that will be transcribed and translated
Sequences -> SRT and VNTR -> useless repeats
What is the clinical relevance of SRT and VNTR?
Le nombre varie dans un même locus pour chaque individu
- Utiles pour le “ DNA FINGERPRINTING” en médecine légale
What are SÉQUENCES RÉPÉTÉES DISPERSÉES?
-Éléments transposables (éléments mobiles, ou transposon
Difference between transposon and retrotransposon?
transposon est une séquence d‘ADN capable
de se déplacer de manière autonome
rétrotransposons, d’abord transcrit en ARN et ensuite en ADN qui s’insére dans un autre locus
What is the relevance in bacteria in relation to transposons?
Les transposons de bactéries sont en partie responsables de la transmission de la résistance à des antibiotiques
How do transposons affect gene expression?
peuvent mobiliser avec eux des exons ou des gènes d’une partie du génome à autre,
créant ainsi de nouveaux gènes ou affectant la régulation d’un gène
What are LINEs and what is the one specific one to remember?
Lines are rétrotransposons → needs to first be transcribed as a gene → RNA and then back into DNA
LINE-1/L1 est le seul élément encore actif de façon automne dans le
génome humain (n’ont pas besoin de protéines encodées par d’autres
transposons pour se déplacer dans le génome)
L1 ont été observés chez des patients avec schizophrénie
LINE pourrait jouer de rôles dans certaines maladies neurologiques
Cancer Related
What are SINES and what is the most common one?
Retrotransposons
ALU est la plus répandue
Dépend de rétrotransposons LINE pour leur réplication
Quels sont les pourcentage de séquence codantes et séquence non-codantes dans le génome humain
Dans le génome humain, environ 1,5% de l’ADN est codant, c’est-à-dire qu’il code pour les protéines. Le reste, soit environ 98,5%, est constitué d’ADN non codant.
