DNA Replication 1 Flashcards

1
Q

What are Trois éléments requis pour répliquer adéquatement un chromosome

A

1) Origines de réplication
2) Centromère (s’attache au fuseau mitotique)
3) Télomères

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2
Q

What are the properties of OOR?

A

Usually these are regions rich in AT → less stable regions
Plusieurs origines de réplication sur un même chromosome

Initiation proteins can recognize the origin
Liaison de l’hélicase -> This is what splits the DNA in two

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3
Q

Dans quel direction la réplication est effectuée

A

SYNTHÉTISER QUE DANS LE SENS 5’ à 3’

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4
Q

Replication of DNA is done by what protein?

A

DNA Polymerase

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5
Q

What does DNA Polymerase require to work?

A

-ELLE REQUIERT UNE AMORCE d’ADN ou d’ARN
ne peut pas initier la réplication, doit ajouter un nouveau nucléotide à un bout 3’ déjà existant

-ELLE REQUIERT UNE MATRICE (brin matrice à copier)

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6
Q

Where does the energy of DNA polymerase come from?

A

C’est l’énergie libérée par la coupure de 2 phosphates (sur 3, car les nucléotides
ajoutés sont des nucléotides triphosphates) liés au nucléotide servant à la synthèse qui permet la réplication

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7
Q

What is a primase?

A

DNA polymerase needs an amorce, primase ties to the OOF and creates small ARN amorces.

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8
Q

Difference between brin avancé et le brin tardif

A

Brin conducteur: Synthèse d’ADN continue a partir d’une seule amorce
Brin retardé (tardif): doit être synthétisé de façon discontinue, sous
forme de courts fragments (fragments d’Okasaki)

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9
Q

Entre deux fragments d’Okazaki donnés il reste un ? What is this sealed by?

A

« nick » -> rupture (manque) d’un lien phosphodiester

L’ADN polymérase avance jusqu’à l’amorce suivante

Une activité ribonucléase élimine l‘amorce en ARN

Une ADN polymérase de réparation complète l’ADN entre les fragments d‘Okazaki

Une ligase selle le « nick »

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10
Q

Role of ADN polymérase III?

A

Utilise les amorces d’ARN sur le brin retardé pour
synthétiser les les fragments d’Okasaki du brin tardif

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11
Q

Role of ADN polymérase I?

A

Enzyme avec deux activités requises;
1) Activité de Nucléase (enlève l’amorce d’ARN);
2) Activité d’ADN polymérase dite de réparation

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12
Q

Role of DNA Ligase?

A

Une enzyme qui lie deux bouts d’ADN en créant un lien
phosphodiester et en utilisant de l’ATP

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13
Q

What is Sliding clamp?

A

Clamp coulissant protéine circulaire maintient l’ADN
polymérase et l’ADN pendant la synthèse d’ADN

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14
Q

What is SSB?

A

protein binding simple DNA strand,
role -> prevent strand from pairing with complementary strand

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15
Q

What is Topoisomérase?

A

enzymes that catalyze changes in the topological state of DNA, interconverting relaxed and supercoiled forms and knotted and unknotted DNA

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16
Q

Which strand do we have the telomere problem with?

A

The trailing strand

17
Q

Why can the traling strand not go all the way to the end?

A

Car l’ADN polymérase ne peut pas démarrer la synthèse
d’ADN dans le vide, elle a besoin d’un bout 3’OH de l’amorce

18
Q

What is telomerase?

A

télomérase ajoute une séquence répétée d’ADN à
l’extrémité 3’-OH du brin matrice du brin tardif

permet d’allonger l’extrémité des chromosomes et
d’assurer leur intégrité lors de la réplication

19
Q

What are the two parts of telomerase?

A

PARTIE PROTÉIQUE: ADN polymérase capable d’utiliser de l’ARN comme matrice
PARTIE ARN: Matrice d’ARN faisant partie intégrante de la télomérase

20
Q

What is the issue with telomerase in terms of its activity?

A

télomérase est uniquement active dans les gamètes et les
cellules souches

21
Q

What is the relation of telomeres and cancer?

A

Il y a une réactivation de la télomérase dans certains types de cancer

-> mechanisme de protection contre les checkpoints and DNA damage -> more replication