Nucleinezuren en eiwitten

Question 1

initiator proteins

Answer 1

eiwitten die aan replication origins binden en de DNA strengen uit elkaar halen door waterstofbruggen te verbreken

Question 2

DNA polymerase

Answer 2

enzym dat de additie van nucleotiden aan de 3’ kant katalyseert

Question 3

replicatie vork

Answer 3

bij elke replication origin worden twee Y-vormige punten gevormd. Hier vind DNA synthese plaats

Question 4

deoxyribonucleoside triphosphate

Answer 4

de structuur waarin een nucleotide de reactie in komt
Hydrolyse van de fosfaten zorgt voor de benodigde energie om de nucleotide aan de keten te krijgen

Question 5

In welke richting wordt DNA gevormd?

Answer 5

5’ naar 3’

Question 6

Ozaki fragmenten

Answer 6

kleine stukjes DNA gevormd bij replicatie lagging strand

Question 7

leading vs. lagging strand

Answer 7

leading: synthese continu
lagging: synthese niet continu

Question 8

proofreading

Answer 8

tegelijk met DNA synthese wordt gecheckt of de net toegevoegde nucleotide klopt met het basepaar.

Mogelijk doordat DNA polymerase alleen DNA vormt in de 5’ -> 3’ richting

Question 9

RNA primer

Answer 9

een klein stukje RNA (+- 10 nucleotiden) dat zorgt voor een 3’ uiteinde dat gebruikt kan worden als beginpunt voor polymerase

Question 10

primase

Answer 10

enzym dat RNA primer synthetiseert

Question 11

repair polymerase

Answer 11

vervangt RNA primers door DNA
ook wel DNA polymerase I -> gat opgevuld

doet ook proofreading

Question 12

DNA ligase

Answer 12

maakt Osaki fragmenten aan elkaar
- ATP nodig!

Question 13

DNA helicase

Answer 13

enzym dat de dubbele helix openmaakt

Question 14

DNA topoisomerases

Answer 14

Als je de dubbele helix openmaakt zorgt dat ervoor dat het stuk daarnaast gedraaider wordt. Deze enzymen verlichten de spanning opgebouwd voor de replicatie vork door een tijdelijke breuk te maken in 1 streng en daarna deze weer dicht te maken

Question 15

sliding clamp

Answer 15

houdt DNA polymerase vast aan de template

Question 16

clamp loader

Answer 16

gebruikt de energie van ATP hydrolyse om de sliding clamp aan het DNA vast te maken

Question 17

telomeren

Answer 17

stukjes DNA die extra aan de uiteindes van chromosomen zitten omdat de lagging strand niet helemaal gerepliceerd kan worden

worden hersteld door telomerase

Question 18

gen

Answer 18

deel van DNA dat omgezet wordt in mRNA

Question 19

nuclease

Answer 19

verwijdert RNA primer -> gat ontstaat

Question 20

depurination

Answer 20

purine base (A of G) wordt van een nucleotide verwijderd door reactie met water

Question 21

deamination

Answer 21

verlies amino groep in cytosine in DNA zodat uracil gevormd wordt (ook door reactie met water)

Question 22

thymine dimeer

Answer 22

door ultraviolet in zonlicht hechten 2 thymine bases aan elkaar en vormer zo een thymine dimeer

Question 23

non homologous end joining

Answer 23

bij een double strand break worden de gebroken uiteindes snel door ligase aan elkaar geplakt. Vaak gaan nucleotides verloren.

Question 24

homologous recombination

Answer 24

bij een double strand break na replicatie van dat stuk DNA kan deze nieuwe gevormde dubbele helix als template dienen. De twee DNA moleculen zijn homoloog (vrijwel identiek). Op deze manier gaat geen genetische informatie verloren.

Question 25

RNA polymerase

Answer 25

synthetiseert RNA - geen proofreading - geen primers nodig

Question 26

promoter

Answer 26

een stukje gen dat een bepaalde sequentie bevat die herkend wordt door RNA polymerase en transcriptie factoren bindt waarna transcriptie begint

Question 27

terminator

Answer 27

stukje gen waar RNA polymerase stopt (terminator sequentie wordt nog getranscribeerd)

Question 28

RNA polymerase II

Answer 28

de polymerase die al het eiwit-coderende RNA, micro RNA en genen voor niet coderend RNA synthetiseert

Question 29

TATA box

Answer 29

stukje promotor dat vooral bestaat uit A en T nucleotiden waar transcriptie factor TFIID bindt

Question 30

RNA capping

Answer 30

een guanine met methyl groep wordt aan het 5' uiteinde vastgemaakt

Question 31

polyadenylation

Answer 31

nieuw mRNA krijgt aan het 3' uiteinde een poly-A staart (herhaling van adenine)

Question 32

RNA splicing

Answer 32

introns worden uit het RNA gehaald en exons worden aan elkaar geplakt

Question 33

spliceosome

Answer 33

RNA en eiwitmoleculen die splicing uitvoeren (snRNA en snRNP)

Question 34

codon

Answer 34

drie opeenvolgende nucleotiden in het RNA

Question 35

alfa helix

Answer 35

structuur waarbij een peptideketen een cylinder vormt door h-bruggen tussen de backbone van de aminozuurketen

Question 36

coiled coil

Answer 36

stabiele structuur van twee alfa helices om elkaar heen gedraaid met de hydrofobe e zijketens naar binnen