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Biochimie > Module 1 - Introduction > Flashcards

Module 1 - Introduction Flashcards

1
Q

Que sont les principales différences entre les cellules procaryotes et les cellules eucaryotes?

A

Procaryote: Pas de noyau ni autres organites, petites cellules, unicellulaires
Eucaryote: Présence d’un noyau et autres organites, grosses cellules, unicellulaires et pluricellulaires.

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Q

Que sont les composantes d’une cellule procaryote?

A

Paroi cellulaire, membrane cellulaire (aussi appelé membrane plasmique ou membrane cytoplasmique), Nucléoide, ribosomes. Les bactéries Gram négatif ont aussi une membrane externe.

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3
Q

Que sont les composantes d’une cellule eucaryote?

A

Paroi cellulaire, membrane cellulaire (aussi appelé membrane plasmique ou membrane cytoplasmique), noyau, reticulum endoplasmique, appareil de Golgi, ribosome, mitochondrie et/ou chloroplaste, peroxysome.

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4
Q

Que sont les différences entre des cellules végétales et des cellules animales?

A

Végétales: Présence de chloroplast, vacuoles, et d’une paroi cellulaire.
Animales: Pas de chloroplast, vacuoles ou paroi cellulaire.

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5
Q

Que sont les similarités de toute cellules vivantes?

A

1 - Toutes les cellules sont constituées à partir des mêmes molécules
2 - Toutes les cellules utilisent le même code génétique
3 - Les sentiers métaboliques centraux sont similaires chez tous les organismes.

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6
Q

Quelle phénomène est l’origine des mitochondries et des chloroplastes?

A

La théorie de l’endosymbiose - Les mitochondries et les chloroplastes seraient les descendants directs de symbiotes d’origine bactérienne

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7
Q

Quelle est le rôle de la compartimentation dans les cellules eucaryotes?

A
  1. Donner une polyvalence plus grande à la cellule et 2. servir de mécanisme de contrôle - 1: différents processus, pas toujours compatible les uns avec les autres, peuvent avoir lieu en même temps. 2: le transport des molécules entre les compartiments peut servir de mécanisme de contrôle
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8
Q

Que sont les 6 éléments chimiques qui représentent 97% des éléments retrouvés dans le vivant?

A

Carbone (C), Hydrogène (H), Oxygène (O), Azote (N), Sulfur (S), Phosphore (P).

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9
Q

Qu’est-ce qu’un groupement hydroxyle (alcool)?

A

R-OH. Ex. glucides

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10
Q

Qu’est-ce qu’un groupement carbonyle (aldéhyde/cétose)?

A

Aldéhyde: Un carbone lié à un hydrogène, double-lié à un oxygène et lié à un groupment R. Cétose: Un carbone double-lié à un oxygène et lié à deux groupement R. Ex. glucides (aldose et cetose)

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11
Q

Qu’est-ce qu’un groupement carboxyle (acide carboxylique)?

A

Un carbone lié à un groupement R, double-lié à un oxygène et lié à un groupement OH. Ex. acides gras (lipides), acides aminés.

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12
Q

Qu’est-ce qu’un groupement amine?

A

Un azote lié à un groupement R et deux hydrogène (primaire) ou à deux groupement R et un hydrogène (secondaire). Ex. Primaires: acides aminés, secondaires: proline.

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13
Q

Qu’est-ce qu’un groupement phosphate? Un groupment phosphoryle?

A

Un phosphore lié à trois oxygène, un d’entre eux lié à un groupement R, et double-lié à un oxygène (phosphate, PO4). Un phosphoryle (PO3) remplace un oxygène par un hydrogène. Ex. Acides nucléiques, lipides, acides aminés, glucides.

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14
Q

Qu’est-ce qu’un groupement sulfhydryle (thiol)?

A

R-SH. Ex. cystéine (un seul acide aminé)

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15
Q

Qu’est-ce que l’imidazole?

A

Un groupement cyclique (pentène) contenant deux azotes en position 1 et 4, un d’entre eux lié à un hydrogène. Ex. Histidine.

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16
Q

Qu’est-ce que l’indole?

A

Un anneau de benzène lié à un pentène contenant un azote lié à un hydrogène. Ex. Tryptophane

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17
Q

Qu’est-ce que la pyrimidine?

A

Un hexène avec deux azotes en positions 1 et 3. Ex. Thymine, cytosine, uracile.

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18
Q

Qu’est-ce que la purine?

A

Un anneau de pyrmidine et un anneau d’imidazole. Ex. Adénine, guanine.

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19
Q

Qu’est-ce que l’éléctronégativité?

A

La tendance d’un atome a attirer les éléctrons vers lui dans un lien covalent.

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20
Q

Vrai ou Faux: La polarité d’une molécule dépends uniquement de la polarité de ses liens covalents.

A

Faux. Elle depends également de sa géométrie.

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21
Q

Qu’est-ce qu’un lien amide?

A

Un carbone lié à un groupement R, double-lié avec un oxygène et lié à un azote. L’azote est également lié avec un groupement R’ et un hydrogène. Ex. Lien peptidiques.

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22
Q

Qu’est-ce qu’un lien ester?

A

Un carbone lié à un groupement R, double-lié avec un oxygène, et lié avec un autre oxygène. Ce dernier est également lié avec un groupement R’. Ex. acylglycérols.

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23
Q

Qu’est-ce qu’un lien éther?

A

Un oxygène lié à un groupement R et un groupement R’. Ex. liaison osidique.

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24
Q

Qu’est-ce qu’un lien ester phosphorique (phosphoester)?

A

Un phosphore lié à deux groupement OH, un oxygène qui est lié à un groupement R, et double-lié à un autre oxygène. Ex. Protéines phosphorylées.

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25
Q

Qu’est-ce qu’un lien phosphodiester?

A

Un phosphore lié à un groupement OH, double-lié à un oxygène et lié à deux oxygène, qui sont liés à un groupement R et R’ respectivement. Ex. Nucléotides, phospholipides.

26
Q

Qu’est-ce qu’un lien anhydride phosphoryque (phosphoanhydrique)?

A

Un phosphodiester et un phosphoester lié par un de leur oxygène. Ex. Nucléotides.

27
Q

Qu’est-ce qu’un lien sulfure (thioéther)?

A

R-S-R’. Ex. Méthionine

28
Q

Qu’est-ce qu’un lien disulfure?

A

R-S-S-R’. Ex. Pont disulfures (cystéine-cystéine).

29
Q

Qu’est-ce qu’un lien thioester?

A

Un carbone lié à un groupement R, double-lié à un oxygène et lié à un sulfur. Le sulfur est également lié à un groupement R’. Ex. Acétyl-CoA.

30
Q

Comment se forme un lien covalent?

A

Par la mise en commun d’une paire d’électrons entre 2 atomes.

31
Q

Comment se nomme la tendance d’un atome à attirer des électrons vers lui?

A

L’éléctronégativité.

32
Q

Qu’est-ce qu’un lien polaire?

A

Quand un lien covalent est formé de deux molécules avec une grande différence en éléctronégativité.

33
Q

Qu’est-ce qu’une charge nette? En quoi est-elle différent de la polarité?

A

La charge nette a rapport au nombre inégal d’électrons dans un atome comparé au nombre de protons. La polarité a rapport à la distribution inégale d’électrons entre deux atomes de la même molécule.

34
Q

Qu’est-ce qu’une liaison hydrogène (ponts hydrogène/liens H)? Quels groupements sont impliqués?

A

Un lien H est le partage partiel d’un atome d’hydrogène entre deux atomes électronégatifs. Ce type de lien est formé entre deux groupement polaires. C’est une interaction dipôle-dipôle. Les groupements impliqués sont les amines, les carbonyles, les thiols, les hydroxyles, etc. Par contre, si l’eau est présent, les liens H se formeront préférentiellement avec les molécules d’eau.

35
Q

Qu’est-ce qu’une liaison ionique (pont salin/pont-sel/Interaction charge-charge/Ion pairing)? De quoi dépends la force de ce type de lien?

A

Une liaison résultant de l’attraction entre deux groupements fonctionnels de charges nettes opposées. La force de ce type de liaison dépends du solvant (faible dans l’eau).

36
Q

Que sont les forces de Van der Waal?

A

Des interactions entre des atomes ou des molécules qui sont très proches l’un de l’autre. Ils sont à la foi repulsive et attractive.

37
Q

Que sont des interactions hydrophobes? Qu’est-ce qu’une clathrate? Quel est le but de la clathrate?

A

La réorganization de molécules d’eau autour de molécules hydrophobes pour formé une cage autour de la molécule. Cette cage s’appele une clathrate. La clathrate se réorganise avec les autres clathrates formées dans l’eau pour former une grande cage, qui a pour but de diminuer la surface de contact avec l’eau et les molécules hydrophobes, diminuant ainsi l’entropie. NOTE: les interactions hydrophobes ne sont PAS des liens chimiques.

38
Q

Vrai ou Faux: Les forces chimiques faibles sont importantes parce qu’ils aident a garder la forme tridimensionnelle d’une molécule. Elles se brisent et se reforment constamment.

A

Vrai.

39
Q

Pourquoi l’eau est-elle un bon solvant?

A

Sa polarité (et donc sa capacité de former des liens H), sa petite taille ainsi que sa constante dielectrique élevée.

40
Q

Pourquoi dit-on que l’eau est un solvant presque universel?

A

L’eau est un excellent solvant pour les substances ioniques et polaires, mais un terrible solvant pour les substances non-polaires.

41
Q

Pourquoi la glace est-elle moins dense que l’eau?

A

Parce que les molécules d’eau ne sont pas libres de se rapprocher les unes des autres. Les liens hydrogènes dans la glace amènent la formation d’une structure avec beaucoup d’espaces vide entre les molécules.

42
Q

En quoi la capacité thermique de l’eau est-elle particulière?

A

L’eau a une température de fusion et une température d’ébullition substantiellement plus élevées. La chaleur spécifique de l’eau, aussi appelée capacité thermique (quantité d’énergie requise pour augmenter de 1 °C la température d’un gramme d’une substance) et la chaleur de vaporisation (chaleur requise pour transformer l’eau en vapeur) sont aussi très élevées.

43
Q

Comment est-ce que la densité de l’eau, sa capacité thermique et son statut comme solvant presque universel sont-ils important pour la vie?

A

Chaleur: Les propriétés thermique de l’eau permettent à une cellule de minimiser l’influence des variations de température, et explique l’efficacité de la transpiration dans un organisme plus complexe.
Densité: Le fait que la glace sont moins dense que l’eau offre de la protection thermique pour les environnements marins, et a eu un impact important sur le développement de la vie.
Solvant: Le fait que l’eau ne soit pas un solvant universel a entrainé la formation des membranes cellulaires. L’eau est donc le secret de la vie.

44
Q

Que sont les 4 grandes classes de biomolécules?

A

Les protéines, les glucides, les acides nucléiques et les lipides.

45
Q

Comment s’appelle une protéine simple? Une protéine plus complexe (macromolécule)? Quels groupements les caractérisent? Quel type de liens existe entre les monomères?

A

Biomolécule simple: acides aminés
Macromolécules: Peptides, Polypeptides, Protéines.
Groupements: Amines, Carboxyle
Liens: Peptidiques (liens amides)

46
Q

Comment s’appelle un glucide simple? Un glucide plus complexe (macromolécule)? Quels groupements les caractérisent? Quel type de liens existe entre les monomères?

A

Biomolécule simple: Monosaccharide
Macromolécules: Polysaccharide
Groupements: Hydroxyle, Carbonyle
Liens: Glycosidiques

47
Q

Comment s’appelle un acide nucléique simple? Un acide nucléique plus complexe (macromolécule)? Quels groupements les caractérisent? Quel type de liens existe entre les monomères?

A

Biomolécule simple: Nucléotides
Macromolécules: Acides nucléiques, Polynucléotides, ARN ou ADN.
Groupements: Monosaccharide + Base azotée + groupement phosphate.
Liens: Phosphodiester.

48
Q

Comment s’appelle un lipide simple? Un lipide plus complexe (macromolécule)? Quels groupements les caractérisent? Quel type de liens existe entre les monomères?

A

Biomolécule simple: Acides Gras
Macromolécules: Lipides
Groupements: Chaîne hydrocarbonée + Groupement carboxyle.
Liens: Ester.

49
Q

Que sont les facteurs qui favorisent la solubilité d’une molécule dans l’eau?

A

La solubilité d’une molécule dépend des proportions relatives des groupements ioniques ou polaires et des groupements non polaires qui la constituent. Inversement, quand la taille d’une molécule augmente, la solubilité diminue.

50
Q

Qu’est-ce qu’une molécule hydrophile?

A

Une molécule ionique ou polaire facilement soluble dans l’eau.

51
Q

Qu’est-ce qu’une molécule hydrophobe?

A

Une molécule non polaire qui ne se dissout pas dans l’eau.

52
Q

Qu’est-ce qu’une molécule amphiphatique?

A

Une molécule contenant une portion hydrophile et une portion hydrophobique. Ex.: Membrane cellulaire.

53
Q

Que sont des agents chaotrophique? Quel est leur rôle?

A

Ils augmenent la solubilité de molécules hydrophobes dans l’eau en désordonnant les molécules d’eau, déstabilisant les clathrates.

54
Q

Qu’est-ce qu’une micelle?

A

Un sphère formé de molécules amphiphatiques, où les portions hydrophobes se retrouve à l’intérieur du sphère et les portions hydrophiles se retrouve à l’extérieur.

55
Q

Qu’est-ce que la diffusion?

A

Le mouvement aléatoire de molécules de soluté dans une solution.

56
Q

En quoi est-ce que l’encombrement cellulaire est avantageux pour la cellule? En-quoi est-il incovénient?

A

Avantage: Il favorise les rencontres entre les réactifs et les enzymes.
Incovénient: Il ralenti la diffusion.

57
Q

Qu’est ce que l’osmose?

A

Le mouvement de l’eau à travers une membrane semi-perméable.

58
Q

Qu’est-ce que la pression osmotique? Que sont les stratégies utilisées par la cellule pour la contrôler?

A

La pression requise pour empêcher le flux de solvant. La cellule utilise 2 stratégies:

  1. La membrane cellulaire réduit jusqu’à un certain point l’entrée massive de solvant.
  2. La cellule conserve les biomolécules sous forme de macromolécules complexes. La pression osmotique dépend de la concentration molaire du soluté et non de sa taille.
59
Q

Quelle est la formule pour Kw? À quoi est égal Kw dans l’eau?

A

Kw = [H+] [OH-]. Dans l’eau, cette constante est égale à 10^-14 M.

60
Q

Quelle est l’équation pour déterminer le pH d’une substance?

A

pH = -log [H+].

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