mod4- structure et fcts prots Flashcards
4 niveaux de structures des prots
- primaire (séquences de résidus d’a.a.)
- secondaire (conformation locale du squelette du polypeptide)
- tertiaire(structure 3D d’un polypeptide complet)
- quaternaire (arrangement spatial des chaines polypeptidiques ds une prots à pls sous unités)
unités constitutives des acides aminés donnent prots. quelle strcuture
primairw
cmb d’a.a. qui different par les caractéristiques chimiques de leurs groupements R?
20
les 20 a.a. different par quoi?
par les caractéristiques chimiques de leurs groupemetns R
a.a. liées ensemble via quoi?
liaison peptidique
3 classes d’a.a.
hydrophobes
polaires
chargées
cmb il y a d’a.a. et quels sont leurs noms?
9
F = phénylalanine
L = Leucine
M = Méthionone
K = Lysine
I = Isoleucine
V = Valine
T = Thréonine
W = Tryptophane
H = Histidine
a.a. doivent provenir de où?
alimentation
nomenclature des a.a.
une à 3 lettres
et une à une lettre
Dans une zone de pH physiologique, les groupes acide carboxylique et amine sont, tous deux, _________
completement ionisés
quand une molécule porteuse de groupes chargés opposés (une charge + d’un bord et une charge -de l’autre):
zwitterions
substances amphotères
les groupes acide carboxylique et amine sont, tous deux, complètement ionisés.
on a plus de gènes ou de protéines?
protéines
3 modifications trans-traductionnelle à savoir
phosphorylations
Glycosylation
Méthylation
comment on appelle le pH auquel une molé est sous forme zwitterion (aucune charge nette)?
point isoélectrique
ecq la plupart des a.a. sont optiquement actifs ou inactifs?
actifs
que signifie qu’une a.a. est optiquement active?
atomes centraux = centres asymétriques/centres chiraux
propriété de chiralité
images miroir ne sont pas superposables (comme nos 2 mains)
qd il y a chiralité, quelles sont les configurations?
S(L) et R(D)
pour la chiralité des 19 a.a, la moajorité sont ___
L(S)
les 2 groupements fonctionnels sont du mm coté: cis ou trans?
cis
les 2 groupements fonctionnels sont cotés différentes (diago). cis ou trans?
trans
La synthèse chimique de molécules chirales conduit à des mélanges racémiques. que veut dire racémique?
(quantité égale de chaque énantiomère)
résidus d’acides aminés des protéines ont tous la configuration ___
L(S)
presque tous les sucres sont en configuration ____?
D(R)
Les molécules biologiques, les protéines, les polysaccharides, l’ADN et l’ARN sont des macromolécules chirales ou non chirales?
chirales
ds la structure seconaire, les résidus d’a.a. sont liés par quoi?
liaisons peptidiques: peu de mobilité
2 familles de structure secondaire
hélice alpha
feuillet plissé beta
structure secondaire: sens de l’hélice?
les 2 possibles
c’est la protéine ou le gene qui détermine la fct?
protéine
forme du polypeptide replié (structure tertiaire des prots)
surface hydrophile
coeur hydrophobe
facteur déterminant des structures protéiques.
Les interactions hydrophobes
l’augmentation de l’entropie des molécules d’eau
. La force motrice des interactions hydrophobes
qu’est-ce qui a un coeur hydrophobe?
protéines
2 formes des prots
repliée (peut interagir)
dépliée (souffre, sera dégradée, peu soluble ou insoluble)
3 types d’interaction imp à connaitre
- interactions dipole-dipole (entre poles pos et pole neg de 2 molé polaires)
- liaisons hydrogene
- interactions électrostatiques (++ – se repoussent +- s’attirent)
ponts disulfures ds quelle structure de la prots?
tertiaire
quelle a.a. est liée aux ponts disuldures?
cystéines
pont disulfure formé par quoi?
liaison covalente entre 2 cystéines (s-s)
ponts disulfures se font qd? et participe donc à quoi?
qd prot est repliée
participe à la stabilisation de la structure 3D
le mauvais repliement des prots est associé à quoi?
à pls maladies
ecq tt les prots ont une structure quaternaire?
non
structure quaternaire:
prots qui ont des sous-unités polypeptidiques (s’associent selon géométrie particuliere)
ex de molé structure quaternaire
hémoglobine
cycle de vie d’une protéine
- SYNTHESE
- REPLIEMENT (obtient structure 2e et 3e)
- MATURATION (ponts disulfures)
- MODIF POST TRADUCTIONNELLES
- TRANSLOCATION (va ds son bon compartiment)
- ACTIVATION
- CATALYSE (S à P)
- VIEILLISSEMENT (oxydation, dénaturation…)
- UBIQUITINATION
- Dégradation (en a.a.)
grande famille qui sont des récepteurs couplés aux prots G
RCPG
fcts prots liées aux memb cellulaires
canal
transporteur
récepteur
reconnaissance
adhérence
