Mécanisme d'action des enzymes Flashcards
Chymotrypsine : nom de l’enzyme ? Rôle ?
Sérine protéase, enzyme de digestion des protéines dans le duodénum
Chymotrypsine : coupe à l’aval de quel AA ?
Tyr ¡ Phe ¡ Trp
Triade catalytique de la chymotrypsine
Ser Asp His
Spécificité de la chymotrypsine
hydrophobe –> Tyr Phe
Spécificité de la trypsine
Acide ~~> Lys Arg
Spécificité de l’elastase
AA gras
Mécanisme d’action des enzymes 4 étapes
1) Formation du complexe E/S 2) Catalyse acide/base 3) Catalyse covalente 4)Désacylation
Mécanisme de la catalyse covalente
Ser effectue une catalyse nucléophile sur le C de la L.pept = Acylation Intermédiaire –> acyl-enzyme, état de transition tétraedrique - O se trouve dans le trou oxyaonique avec 3 points de stabilisation
Mécanisme de la désacylation + quel est le 2eme produit ?
O de l’H2O effectue une attaque nucleophile sur le C de la L. peptidique 2eme produit = début de la protéine (Nter)
Fonctions biologiques des sérines protéases
Digestion, coagulation
Fonctions biologiques des metallo-protéases
Digestion, pression artérielle
Quand Vo augmente, [S] … ?
[S] augmente
Quand Vo augmente quand ?
Quand [E] augmente linéairement
On parle de Vo tant que..
Tant que [P] est négligeable
Formule de la courbe de Michaelis
Vo = Vm × ( [S] ÷ (Km + [S]))
Équation de la courbe de Michaelis
Vo = f [S]
Km : formule + explication
La moitié de l’enzyme est sous forme complexée _ Km = 1 ÷ Aff environ = Kd
[ES] = ? (2 formules)
[ES] = 1/2 × [Et] [ES] = [Et] × ([S] ÷ (Km + [S]))
Kcat = … = … = …
Kcat = constante catalytique = K+2 = turn over number
Efficacité catalytique = ?
Eff catalytique = kcat ÷ Km
Si [S]»_space; Vm alors
Kcat = Vmax ÷ [Et]
Détermination de Vm et Km > Graphe d’Eadie équation + Pente
Graphe d’Eadie.. Vo÷[S] = f(vo) pente : 1÷Km
Graphe d’Eadie ~ Interception entre l’axe de ordonnés et la courbe
Vm ÷ Km
Graphe d’Eadie ~ Interception entre l’axe des abscisses et la courbe
Vm
Graphe de Lineweaver, équation
1÷Vo = f (1÷[S])
Graphe de Lineweaver - Interception entre l’axe des abscisses et la courbe
1÷ (-Km)
Courbe de Lineweawer : Interception entre l’axe des ordonnées et la courbe
1 ÷ Vm
Courbe de Lineweawer
Pente : Km÷Vm
Facteurs impactant l’activité enzymatique
Température, pH, Ions metalliques
Influence de la température
°C augmente –> vitesse augmente passé la température optimale, la vitesse diminue jusqu’à la °C d’inactivation (les protéines dénaturent)
Influence des ions métalliques
Activateurs : cations metalliques souvent divalents (Mg2+) Inhibiteurs : métaux lourds
Effecteurs réversibles compétitif, évolution de Vm et de Km ?
Vm augmente Km =
Effecteurs réversibles compétitifs, cas des leucémies
utilisation de méthotrexate qui entre en compétition avec le tétrahyd. qui est le substrat de la dihydrifolate réductase
Effecteurs réversibles compétitifs, AZT et ddl
~> SIDA (reverse transcriptase)
Effecteurs utilisés pour la leucémie
Effecteurs réversibles compétitifs
Effecteurs incompétitifs, se fixe sur ? Vm, Km ?
Se fixe sur le complexe enzyme/substrat, Vm diminue Km diminue
Effecteurs non compétitifs, se fixe sur ? Vm, Km ?
Se fixe sur l’enzyme ou le complexe, Vm diminue et Km =
Détermination de l’activité enzymatique, condition
La mesure doit être faite à °C sarurante en substrat
Katal définition
Quantité d’enzyme transformant 1 mole de S en une seconde (mole.s-1)
Effecteurs de l’activité enzymatique, 3 mécanismes ?
● Analogue de substrat ● Spécificité de groupe ● “suicide” exemple : penicilline et protéase alpha
