Manipulation des acides nucléiques Flashcards

1
Q

Quels sont les propriétés physico-chimiques utilisées pour purifier les acides nucléiques?

A

la taille varie avec le nombre de nucléotides, une forte charge négative, structure en double brins

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2
Q

V/F l’ADN est très soluble dans l’eau.

A

VRai

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3
Q

Pourquoi l’ADN est très soluble dans l’eau?

A

molécule très chargée, peu de groupements hydrophobes

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4
Q

Avec quoi varie la solubilité de l’ADN?

A

les conditions salines et/ou la présence de substances organiques

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5
Q

En quoi consiste la précipitation à l’éthanol?

A

en l’ajout de 2.5 volumes d’éthanol à une solution contenant de l’ADN et 0.25M d’acétate de sodium, mise à -20°C pendant au moins 30 minutes, centrifugation dans une
microcentrifugeuse, des lavages avec de l’éthanol.

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6
Q

Que pouvons nous utiliser d’autre que l’éthanol comme solvant organique pour faire précipité l’ADN?

A

Isopropanol

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7
Q

L’extraction de l’ADN au phénol est quel type de méthode?

A

De partition de phase.

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8
Q

Dans l’extraction de l’ADN au phénol où se retrouve les acides nucléiques? Les protéines?

A

Les acides nucléiques dans la phase aqueuse, les protéines dans le phénol.

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9
Q

Pourquoi dans l’extraction au phénol l’ADN le phénol doit être d’un pH autour de 8?

A

car l’ADN est partiellement soluble dans le phénol acide.

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10
Q

Quels sont les étapes de l’extractions de l’ADN au phénol?

A

ajusté à pH autour de 8 du phénol, agiter doucement 1 vol du phénol neutralisé avec 1 vol de la solution contenant de l’ADN, extraire 2 fois le phénol éliminé par extraction avec du chloroforme, le chloroforme est éliminé par précipitation avec de l’éthanol .

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11
Q

V/F les acides nucléiques pénètrent difficilement dans les
gels de polyacrylamide.

A

Vrai

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12
Q

Pour quelle taille d’acide nucléique utilise-t-on les gel de polyacrylamide?

A

quelques centaines de nucléotide.

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13
Q

Quel gel utilise-t-on habituellement pour faire migrer l’ADN?

A

les gels d’agarose.

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14
Q

Pourquoi pour l’électrophorèse sur gel d’agarose utilise-t-on un tampon d’EDTA?

A

Pour inhiber l’activité des nucléases.

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15
Q

De quoi dépend la migration de l’ADN dans le gel?

A

de la taille des fragments

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16
Q

Quel colorant utilise-t-on pour l’ADN dans le gel?

A

Le bromure d’éthidium. Il est fluorescent qu’en état libre.

17
Q

V/F Les mêmes techniques de chromatographies utilisées pour purifier les protéines sont aussi applicables pour la purification des acides nucléiques.

A

Vrai.

18
Q

À quoi sert la chromatographie à échange d’ions pour l’ADN?

A

pour purifier des oligonucléotides.

19
Q

À quoi sert la chromatographie filtration sur gel pour l’ADN?

A

surtout utilisée pour déssaler des oligonucléotides.

20
Q

À quoi sert la chromatographie d’affinité pour l’ADN?

A

utilisé pour purifier les ARNm des cellules eucaryotes

21
Q

Nomme moi une méthode couramment utilisée pour purifier et séparer l’ADN.

A

ultracentrifugation sur gradient de chlorure de césium

22
Q

La densité de flottaison de l’ADN dans un tel gradient de chlorure de césium pour l’ultracentrifugation dépend de quoi?

A

de sa composition en bases