Électrophorèse Flashcards
En quoi consiste l’électrophorèse?
La migration d’un ion dans un champ électrique, est utilisée
dans les séparations analytiques des molécules biologiques.
Quel est l’équation de la force électrique?
Félectrique = qE
À quoi s’oppose la force électrique?
La force de friction.
Quelle est l’équation de la force de friction?
Ffriction = vf
La vitesse de déplacement des ions est caractérisée par quoi?
Par une mobilité électrophorétique.
Quand est-ce que les protéines possède une mobilité électrophorétique nulle?
À leur point isoélectrique.
Qu’est-ce que l’électrophorèse en zone?
Technique dans laquelle l’échantillon est contraint à se déplacer dans une phase solide, comme le papier filtre, la cellulose, ou d’un gel.
Qu’est-ce qu’on élimine dans l’électrophorèse en zone?
L’agitation provoquée par la convection, un facteur
limitant du point de vue résolution.
En quoi consiste l’électrophorèse sur gel?
La séparation moléculaire est basée non seulement sur la mobilité électrophorètique des molécules, mais aussi sur le principe de filtration sur gel.
Quelle technique est parmi les plus puissantes et les plus faciles à utiliser dans la séparation des macromolécules?
L’électrophorèse sur gel.
À partir de quoi sont fabriqué les gel de polyacrylamide?
D’une polymérisation radicalaire d’acrylamide et N,N’-méthylènebisacrylamide dans un tampon.
Quelles sont les étapes de préparation d’un gel PAGE?
- le mélange est coulé dans un récipient formé par deux plaques de verres et polymérisera
en une couche mince de gel - les échantillons sont déposés dans des puits
- le tampon est le même dans les
réservoirs du haut et du bas - un courant continu de 100 à 200 volts parcourt le gel
Pourquoi utilise-t-on un pH d’environ 9 pour les tampons de migration?
Pour que toutes les protéines aient une charge négative.
Vers quoi les protéines vont migrer lors de l’électrophorèse?
Vers l’anode
En fonction de quoi les protéines vont migrer dans le gel?
Selon leur ratio charge/masse.
Qu’est-ce que la longueur du gel change dans le processus d’électrophorèse?
Plus le gel est long, meilleure est la finesse des bandes et la résolution.
Quelle est la principale différence entre l’électrophorèse sur gel et en pH discontinu?
La présence de deux gel dans le pH discontinu.
Quelle est la différence entre les deux gel dans l’électrophorèse en pH discontinu?
Un gel de séparation (running gel), préparé comme le gel précédent.
Un gel de concentration (stacking gel), qui surmonte le gel de séparation et qui est
de plus haute porosité.
Quelle est la différences entre les tampons des deux gel dans l’électrophorèse en pH discontinu?
Le tampon du gel de concentration possède un pH ~ 2 unités de moins.
Par quoi sont retardée les protéines quand elles entre dans le gel de séparation?
Leur taille, par effet de filtration.
Que détermine le gel SDS-PAGE?
La pureté d’une protéine.
Le SDS est un détergeant faible ou puissant?
Puissant.
Quelle est l’action d’un détergeant?
Par le biais de leurs interactions hydrophobes, sont capables de dénaturer la structure d’une
protéine.
À quoi se lie le SDS?
Aux protéines.
Quel est le taux de saturation de la liaison SDS-chaîne de polypeptide?
1 molécule de détergent par 2 résidus d’acides aminés.
Par apport à quoi calibre-t-on le gel dans l’électrophorèse SDS-PAGE?
Au PM.
Quelle type de relation existe-t-il entre la mobilité électrophorétique et le logarithme du poids moléculaire?
Linéaire
Quelles est la différence de résolution entre le gel PAGE et SDS-PAGE?
PAGE= faible, SDS-PAGE=excellente
Quelles est la différence de migration entre le gel PAGE et SDS-PAGE?
PAGE= ration charge/masse SDS-PAGE= linéaire avec le log de la masse moléculaire des protéines
Y a-t-il une dénaturation des complexes protéiques dans le gel PAGE? SDS-PAGE?
PAGE= non SDS-PAGE= oui
Y a-t-il une dénaturation des agrégats protéiques dans le gel PAGE? SDS-PAGE?
PAGE= non SDS-PAGE= oui
Par quelles méthodes peut-on voir les protéines dans le gel?
- la coloration avec le bleu de Coomassie brillant
- la coloration au nitrate d’argent
- autoradiographie (si les protéines sont marquées avec un isotope
radioactif)
Par quelles méthodes peut-on voir les protéines dans le gel de manière plus spécifique?
Détecter la protéine d’intérêt avec un anticorps qui reconnaît cette protéine -> par immunobuvardage ou “Western blot”.
