Maladies infectieuses Flashcards
Nommer des modes de transmission direct et indirect des maladies infectieuse
Direct : Contact peau à peau, contact muqueuse, contact avec du sang
Indirect: aérosols, gouttelettes, surfaces ou aliments contaminés
Pourquoi monitorer les maladies infectieuses?
Pour anticiper les problèmes et les maladies en émergence et pour soutenir les interventions de santé publique visant à protéger la population de la propagation d’infections et d’éventuelles épidémies.
Quels sont les 4 domaines/champs d’expertise de l’INSPQ/LSPQ?
-Immunisation
-ITSS et biovigilance
-Infection nosocomiales et risques infectieux en milieu de soin (aide à savoir l’efficacité d’un hopital)
-Surveillance, prévention et contrôle des maladies infectieuses
Quels sont les avantages des méthodes TAAN en infectiologie
-Méthode de choix en identification de microorganismes
–Méthode la plus sensible
–Rapidité d’exécution par rapport à la culture
–Permet l’identification de pathogènes difficile/impossible à faire croitre en culture
–Capacité analytique élevée
–Potentiel de détection de plusieurs organismes en simultané (multiplex)
–Appareillage relativement simple
–Application de méthodes commerciales et potentiel de développement interne selon les besoins
-Applications diverses
–Diagnostic/dépistage/surveillance
–Détermination de la charge virale (ex: évolution de la réplication et pronostic pour infection VIH-1)
–Suivi thérapeutique
—Retesting
—Test of cure
—Test de résistance thérapeutique
Quels sont les désavantages des méthodes TAAN en infectiologie
-Questionnements et indications cliniques
–Que veut dire un résultat positif et quoi faire avec?
—Rémanence cellulaire post-traitement
—Identification microorganisme = cause pathologie?
—Ne permet pas d’identifier la résistance aux antibiotiques
—Contamination et spécificité de méthode (ex: Neisseria gonorrhoeae vs autres Neisseria)
–Que veut dire un résultat négatif?
—Faux-négatifs sont possibles
-Qu’est-ce qu’on cherche à identifier?
–Tests très spécifiques et donc très ciblés. Ne permet pas de rechercher un spectre large de pathogène
–À l’inverse, l’utilisation de multiplex doit être contrôlé. On devrait rechercher des pathogènes que l’on peut traiter (ex: quoi faire avec un adénovirus positif?)
-Aspects de laboratoire
–Requiert des espaces physiques adéquats (pré et post-PCR)
–Attention aux contaminations environnementales
Avantages et inconvénients des culture et antibiogrammes en infectiologie
AVANTAGES:
-Technique traditionnelle (souvent encore gold-standard)
-Très bonne spécificité
-Identification large de l’agent infectieux
-Différents milieux possibles pour une bonne sélectivité
-Peu coûteux
-Permet d’orienter le traitement
-Permet de distinguer les souches susceptibles aux souches résistantes (Staph aureus vs SARM)
DÉSAVANTAGES:
-Certains microorganismes croissent mal en culture
-Sensibilité variable selon les organismes
-Délai de croissance
-Nécessite des cultures diverses (aérobie, anaérobie, milieux sélectifs, chromogéniques, etc.)
Avantages et inconvénients des tests antigéniques en infectiologie
AVANTAGES:
-Rapide, automatisable
-Faible coût
-Très grande capacité analytique
DÉSAVANTAGES:
-Sensibilité et spécificité variable et généralement moins bonnes que TAAN et culture
-Cible un nombre limité de pathogènes
Avantages et inconvénients de la sérologie en infectiologie
AVANTAGES:
-Disponible dans presque tous les laboratoires
-Utile pour l’évaluation de séroprévalence et études épidémiologiques
DÉSAVANTAGES:
-Utilité limitée en diagnostic
-Performance variable selon les tests (IgM, IgG, IgA, Ig totaux) (IGM en premier, ensuite IgG ou IgA, peut être intéressant de doser Ig totaux)
Avantages et inconvénients de la spectrométrie de masse (MALDI-TOF) en infectiologie
AVANTAGES:
-Permet d’identifier les micro-organismes sur la base de leur signature protéique.
-A le potentiel de passer la barrière « pan-domaine » (nécessite en ce moment une culture préalable mais des approches par TAAN en première ligne se développent)
DÉSAVANTAGES:
-Très dispendieux et requiert une expertise
-Pas parfait (Ex: utilisation limitée pour Shigelle, E. coli O157 et pour virus)
-Requiert quand même un antibiogramme
Nommez 4 symtômes d’allure grippale (SAG)
- Fièvre
- Toux
- Arthralgie / myalgie
- Fatigue extrême
Chez quelles populations la symptômalogie et les complications tendent à être plus importante pour les infections respiratoires?
- Nouveau-nés
- Patients immunodéprimés ou immunosupprimés
- Patients ayant certains facteurs de risque
- Femmes enceintes
- Personnes âgées
Chez quel population le VRS est plus fréquent?
Nouveau-nés/jeunes (0-17 ans)
Selon les tests sérologiques aux États-Unis, le taux de séroprévalence dépasse 10 fois le taux d’incidence basé sur les tests moléculaires. Qu’est-ce que ça suggère?
Le nombre connu de cas serait grandement sous-estimé
Nommez les S&S lié à une infection à SRAS-CoV-2
Symptômes respiratoires :
–Toux (50%)
–Dyspnée (5%)
–Rhinorrhée (75%)
Symptômes généraux :
–Fièvre (35%)
–Maux de tête (75%)
–Myalgie (30%)
–Mal de gorge (70%)
Symptômes gastro-intestinaux :
–Diarrhée (20%)
–Nausée / vomissements (20%)
Symptômes neurologiques :
–Anosmie (estimé à 30%)
–Agueusie (4%)
-L’évolution clinique la plus fréquente est le développement d’une pneumonie atypique avec infiltrats bilatéraux au CT scan
Quelles sont les complications associées à une infection à SRAS-CoV-2
-Insuffisance respiratoire (détresse respiratoire aigu)
-Complications cardiovasculaires (Arythmie, atteinte cardiaque ou arrêt cardiaque)
-Complications thromboemboliques
(AVC, thrombose veineuse profonde)
-Complications inflammatoires (Syndrome de Guillain-Barré, Kawasaki)
-Séquelle à long terme (Détérioration respiratoire, fatigue, faiblesse)
Quels sont les marqueurs élevés lors d’infection sévère à la COVID-19
↑ D-Dimère (> 1000 ng/mL)
↑ CRP (> 75 mg/L)
↑ LDH (> 245 U/L)
↑ Troponine (> 2x la limite supérieure)
↑ Ferritine (> 500 ug/L)
Quels sont les avantages et inconvénients à une stratégie de pooling
Avantages:
–Augmente la capacité analytique
–Diminue le besoin de réactifs d’extraction
Désavantages:
–Besoin de temps technique pour pooler
–Quelle population? (Communauté, hospit, urgences, employés, etc…)
–L’utilité du pooling dépend de l’incidence
En contexte de rupture de stock de réactifs d’extraction, il est possible de chauffer le spécimen a 90’C pour 2 min (lyse thermique). Nommer deux avantages et deux inconvénients de cette méthode
Avantages:
-pas besoin de stock de réactif d’extraction
-inactivation et extraction dans la même étape
Inconvénients:
-Ne permet pas de pooler (moins grande capacité)
-Nécessite l’ajout d’un contrôle interne (choix du contrôle, essentiel car possibilité d’inhibiteurs réactionnel, validation requise)
Quels sont les processus pré-analytique et analytique (initial) pour les aspects labo SRAS-CoV-2
Préanalytique:
-Prélèvement oronasopharyngé (maintenant possibilité d’Oro-nasal, salive, gargarisme)
-Transport, réception, enregistrement des spécimens
Analytique (contexte 1 éch à la fois):
-Inactivation
-Extraction
-Amplification
-Interprétation
-Rapport
Pour l’analyse SRAS-CoV-2 en TAAN, quelle est la matrice à privilégier, les avantages et désavantages de la méthode
Matrice: swab oronasopharyngé (ou autres possible)
+ :
–test le plus sensible (95,2%)
–fonctionne pour asymptomatique et pré-Sx
–Automatisable (M2000, Cobas 6/8800, BDMax)
–Haute cadence et rapidité
-:
–Détecte encore du virus non actif post guérison
–risque FP/FN
–Performance variable selon les matrices
Pour l’analyse SRAS-CoV-2 en sérologie, quelle est la matrice à privilégier, les avantages et désavantages de la méthode
Matrice: sérum
+: détection des infections passées (3-4sem)
-:
–ne permet pas le Dx
–Performance variable (IgG, IgM, IgA, Ac totaux)
–Peu d’application
Pour l’analyse SRAS-CoV-2 en tests antigéniques, quelle est la matrice à privilégier, les avantages et désavantages de la méthode
Matrice: swab oronasopharyngé (ou autres possible) comme TAAN
+: rapiditié, cadence, automatisable, self-testing
-: Moins performant que TAAN
Dans une stratégie de pooling pour économie des réactifs, est-il intéressant de pooler les populations venant d’hospit?
Non car il s’agit d’une population pour laquelle il y a des chances augmentées pour lequel le pool ne passe pas, et donc ça même à l’augmentation du temps de sortie du résultat.
Pourquoi il n’est pas possible de pooler lorsqu’on utilise la méthode de lyse thermique?
L’inactivation thermique rend l’approche moins sensible et moins “propre” avec plus d’interférence. On a donc besoin d’un contrôle interne pour s’assurer qu’un NEG est NEG et que ce n’est pas en raison d’un interférence cellulaire.
C’est principalement en raison de l’approche qui est moins sensible avec cette méthode
Quelles interférences sont importantes à contrôler pour le développement de test multiplexe respiratoire maison?
-Channeling
-Sensibilité relative des sondes
-Optimisation des masterMix
-Intégration systématique de contrôle interne (processus technique devant être contrôlé)
Nommer quelques complications de la chlamydia et de la Gonorrhée
-Infertilité
-Cancer du col de l’utérus
-Infections chroniques
-Grossesse ectopique
-Maladies chroniques 2aire (douleur pelvienne chronique, infection permanente)
Quels sont les objectifs du dépistage des ITSS
-Prise en charge et traitement du patient
-Enquête relationnelle, dépistage et traitement des partenaires
-Limitation de la transmission et des réinfections
-Retesting, test de cure et test de résistance aux traitements
quel est l’épidémiologie des la Chlamydia et de la Gonorrhée
Mode de transmission contact direct et se présentent de façon similaire
Chlamydia trachomatis (CT):
-incidence chez 20-24 ans de 1,8% (F) et 0,77% (H)
-incubation 5 à 14 jours
Neisseria gonorrhoeae (NG):
-incidence chez les 15-24 ans de 0,3% (F) et 1,2% (H)
-incubation environ 10 jours
Quelles sont les indications de dépistage de la chlamydia et de la gonorrhée?
- Personne de moins de 25 ans actif sexuellement
- Homme ayant des relation sexuelles avec d’autres hommes (HARSAH)
- Travailleurs du sexe
- Personne avec un nouveau partenaire sexuel depuis son dernier dépistage
- Personne ayant eu un partenaire anonyme depuis son dernier dépistage
- Personne ayant eu >3 partenaires dans la dernière année
- Personne diagnostiquée pour CTNG (retesting ou test de cure) ou d’un autre ITSS
- Personne ayant un partenaire ayant été testée positif
- Femme en processus d’IVG
- Femme enceinte
- Personne requérant un counseling
Quels sont les S&S de la chlamydia pour les femmes
Manifestation d’infection urogénitale
- Cervicite (pertes, saignements, décharge mucopurulente)
- Urétrite (dysurie et pyurie stérile)
- Douleurs pelviennes et abdominales avec potentielle périhépatite (inflammation de la capsule de Glisson)
- Complications de grossesse
Quels sont les S&S de la gonorrhée pour les femmes
Asymptomatique: Jusqu’à 70%
Manifestations d’infection urogénitale
-Cervicite (pertes, saignements, décharge mucopurulente)
-Urétrite (dysurie et pyurie stérile)
-Douleurs pelviennes et abdominales (avec potentielle périhépatite)
-Complications de grossesse
Quels sont les S&S de la chlamydia pour les hommes
Asymptomatique: >40%
Manifestations d’infection urogénitale
-Urétrite (décharge mucoïde ou aqueuse)
-Épididymite (douleur testiculaire, enflure de l’épididyme)
-Prostatite (dysurie, douleur pelvienne, douleur à l’éjaculation,
Quels sont les S&S de la gonorrhée pour les hommes
Manifestations d’infection urogénitale
-Urétrite (décharge mucoïde ou aqueuse)
-Épididymite (douleur testiculaire, enflure de l’épididyme)
Quels sont les S&S de la gonorrhée pour les hommes ET les femmes
Manifestations extragénitales
-Proctite
-Pharyngite
-Infection disséminée (arthrite purulente ou triade ténosynovite/dermatite/polyarthralgie)
-Conjonctivite
Quels sont les matrices à privilégier pour les test TAAN de Chlamydia et Gonorrhée, les avantages et désavantages de la méthode
Matrice à privilégier: urogénital (vaginal swabing (F) et urine first-catch (H) ou swab urétal)
+:
–Méthode de choix pour les deux bactéries + Détection combinée (multiplex)
–Test à haut volume et/ou rapide
–Performance clinique les plus avantageuses pour les prélèvements urogénitaux
-:
–Relativement coûteux, spécificité plus faible pour prélèvements extra-génitaux
–Ne permet pas de tester la susceptibilité aux antibiotiques
–Tests peuvent rester positif malgré un traitement efficace
Quels sont les autres test possibles pour la Chlamydia et pourquoi ces tests ne sont pas privilégier?
Culture: coûteux et long
Sérologie: Peu standardisé, parfois utilisé en support
Détection d’Antigène: prélèvement invasif (swab du col ou urètre) et sensibilité variable entre 80-95% avec la culture
Quels sont les autres test possibles pour la Gonorrhée et pourquoi ces tests ne sont pas privilégier?
Gram: bonne sensibilité pour Sx (94%) mais moins bonne pour ASx (81%)
Culture: long (48h) mais permet de déterminer la résistance (CMI)
Détection Antigène: plaquette ou EIA=faible performance clinique
Décrire l’étiologie de VPH
-petit virus ADN double brin non enveloppé
-infection cell épithéliale des muqueuse anogénitales humaine
-entraine 99% des cancers du col de l’utérus et lésions précancéreuse
-14 génotypes sont considérés oncogéniques
–oncogènes VPH16 et VPH18 sont plus a risque
-Canada: 1femme/168 développera un cancer du col de l’utérus
Mode transmission: contact direct
Décrire les affections et symptômes du VPH pour la femme
Affection néoplasique:
-cancer du col de l’utérus
-cancer vaginal (carcinome malpighien)
-cancer vulvaire (carcinome épidermoïde)
Symptome: saignements vaginaux hors ménorrhées
Décrire les affections et symptômes du VPH pour l’homme
Affection néoplasique:
-cancer du pénis
Symptômes: masse et/ou lésion et/ou décoloration de la couleur de la peau au niveau du pénis
Décrire les affections du VPH pour la femme ET l’homme
Affection néoplasiques:
-Cancer anus
-Cancer oropharyngé
Affection non-néoplasique:
-Verrues génitales
-Verrues non-génitales
-Papillomatose récurrente
-Autre maladie cutanée
Pour quelle raison le dépistage du VPH est important?
Il a été démontré qu’un dépistage accru des lésions pré-cancéreuses (PAP Test) ou du VPH (TAAN) réduit significativement les taux de mortalités
Il y a une nouvelle stratégie de dépistage du VPH au Québec (2023). Qu’est-ce qu’implique ce changement à la pratique?
-Jusqu’à tout récemment, le dépistage du cancer du col de l’utérus se faisait par cytologie via le PAP Test.
Maintenant:
–Dépistage du VPH par méthode TAAN multiplex en 1ère ligne
–Cytologie (PAP Test) en 2e ligne
–Confirmation par colposcopie (biopsie)
-Acceptation du dépistage par auto-prélèvement
-Recommandation d’usage d’un milieu de prélèvement liquide qui permet à la fois TAAN et cytologie
Pour le VPH, quels sont les avantages et désavantages des tests TAAN
Avantages
-Méthode de choix pour la détection des 14 oncogènes + Détection combinée (multiplex)
-Test à haut volume et/ou rapide avec peu d’interventions humaines
-Performance clinique avantageuses, surtout en contexte de « co-testing » ou « Primary HPV testing » comme au Québec
-Permet l’auto-prélèvement
Désavantages
-Relativement coûteux
-Équipements dédiés
Pour le VPH, quels sont les avantages et désavantages du PAP test
Avantages
-Méthode historique pour dépistage du cancer du col
-Pas d’appareils dédiés requis
Désavantages
-Interprétation par cytologiste et pathologiste
-Généralement avec un prélèvement par spécialiste
Quels sont les traitements de la Chlamydia et de la Gonorrhée?
CT: antibiotique (peu de résistance)
–préféré = tétracycline ou maxrolide
–alternatif = Quinolones, érythromycine, pénicilline
NG: antibiotique (de plus en plus de résistance)
–préféré = combinaison céphalosporines de 3e génération avec macrolide
–alternatif = autres combinaisons de céphalosporines ou macrolide si allergie
Quels sont les traitements du VPH
Prévention: vaccin contre VPH
traitement: anti-néoplasique divers selon l’âge et le statut de reproducteur
Qu’est-ce qu’une infection nosocomiale
infections qui se transmettent et s’acquièrent dans les milieux de soins et pouvant engendrer de nombreuses complications
Donnez des exemples d’infection nosocomiale et/ou résistance
- S. aureus résistante à la méthicilline (SARM)
- Entérocoques résistants à la vancomycine (ERV)
- Infection à Clostridium difficile
- Entérocoques et bactéries résistantes aux carbapénèmes
Décrire l’épidémiologie de SARM et son mode de transmission
Épidémiologie:
-nouvelle infection survenant plus de 48h post-admission
-nouvelle infection survenant moins de 12 mois après soins de santé important (chirurgie, hémodialyse)
-il existe souche communautaire
Transmission:
-vecteur = personnel de soin
-contamination par contact entre personnel et patient
-plus patient hospitalisé longtemps - plus risque infection augmente
-cause #1 infection post-chirurgie
Quel est l’impact clinique d’une infection SARM en milieu de santé
-Les patients avec SARM nosocomial ont une plus grand taux de mortalité, des hospitalisations plus longues et des coûts de traitement plus élevés.
-Dans les pires cas, une bactériémie est diagnostiquée, avec potentiel de sepsis et de choc septique.
Quels sont les traitements pour infection SARM
varie selon type infection et sévérité:
Infection de la peau
-Traitement aux antibiotiques oraux -Antibiotiques parentéraux si condition se dégrade
Bactériémie (généralement en infusion parentérale)
-Antibiotiques de choix: Vancomycine ou daptomycine
-Alternatif: céphalosporine (ceftaroline), lipoglycopeptides (telavancin) ou linezolide
À quel gène est associé la résistance des SARM et qu’est-ce qu’encode ce gène
Gène “mec”
* La séquence «mecA» encode la Penicilline Binding Protein 2a (il existe aussi l’homologie mecC)
Pour les infection SARM, quelle matrice est privilégiée, et quels sont les avantages et désavantages des tests TAAN
Matrice: Narine (+ sensible) ou sang en cas de bactériémie
Avantages:
*Cibler à la fois mecA et mecC
*Méthode très sensible. Dans une population à faible prévalence, sert comme résultat d’exclusion (bonne VPN)
*Le génotypage permet d’évaluer les souches nosocomiales vs communautaires
*Permet le diagnostic ciblé de patient suspecté d’infection à SARM
Désavantages:
*Ne permet pas d’évaluer l’intensité de la résistance.
*La surveillance est surtout basée sur le VPN. Les positifs devraient être confirmés
Nommer d’autres tests disponibles complémentaires
–Diffusion sur disque de cefoxitine: Test le plus exact. Cependant, nécessite au moins 24h d’incubation
–Cultures rapides: Spécifiques, utile lorsque les méthodes TAAN non-disponible. Prends 24-48h
–Test de susceptibilité: Permet d’évaluer la susceptibilité du microorganismes aux antibiotiques.
Quels sont les moyen de prévention pour les SARM
Via les initiatives de PCI des microbiologiste et la surveillance de l’INSPQ:
*Lavage des mains, port des EPI, décontamination du matériel de soins et des surfaces
*Traitement adapté et sécuritaire des plaies (éviter de toucher les plaies)
*Éviter le partage de matériel de soins personnels
