Maladies infectieuses Flashcards
Nommer des modes de transmission direct et indirect des maladies infectieuse
Direct : Contact peau à peau, contact muqueuse, contact avec du sang
Indirect: aérosols, gouttelettes, surfaces ou aliments contaminés
Pourquoi monitorer les maladies infectieuses?
Pour anticiper les problèmes et les maladies en émergence et pour soutenir les interventions de santé publique visant à protéger la population de la propagation d’infections et d’éventuelles épidémies.
Quels sont les 4 domaines/champs d’expertise de l’INSPQ/LSPQ?
-Immunisation
-ITSS et biovigilance
-Infection nosocomiales et risques infectieux en milieu de soin (aide à savoir l’efficacité d’un hopital)
-Surveillance, prévention et contrôle des maladies infectieuses
Quels sont les avantages des méthodes TAAN en infectiologie
-Méthode de choix en identification de microorganismes
–Méthode la plus sensible
–Rapidité d’exécution par rapport à la culture
–Permet l’identification de pathogènes difficile/impossible à faire croitre en culture
–Capacité analytique élevée
–Potentiel de détection de plusieurs organismes en simultané (multiplex)
–Appareillage relativement simple
–Application de méthodes commerciales et potentiel de développement interne selon les besoins
-Applications diverses
–Diagnostic/dépistage/surveillance
–Détermination de la charge virale (ex: évolution de la réplication et pronostic pour infection VIH-1)
–Suivi thérapeutique
—Retesting
—Test of cure
—Test de résistance thérapeutique
Quels sont les désavantages des méthodes TAAN en infectiologie
-Questionnements et indications cliniques
–Que veut dire un résultat positif et quoi faire avec?
—Rémanence cellulaire post-traitement
—Identification microorganisme = cause pathologie?
—Ne permet pas d’identifier la résistance aux antibiotiques
—Contamination et spécificité de méthode (ex: Neisseria gonorrhoeae vs autres Neisseria)
–Que veut dire un résultat négatif?
—Faux-négatifs sont possibles
-Qu’est-ce qu’on cherche à identifier?
–Tests très spécifiques et donc très ciblés. Ne permet pas de rechercher un spectre large de pathogène
–À l’inverse, l’utilisation de multiplex doit être contrôlé. On devrait rechercher des pathogènes que l’on peut traiter (ex: quoi faire avec un adénovirus positif?)
-Aspects de laboratoire
–Requiert des espaces physiques adéquats (pré et post-PCR)
–Attention aux contaminations environnementales
Avantages et inconvénients des culture et antibiogrammes en infectiologie
AVANTAGES:
-Technique traditionnelle (souvent encore gold-standard)
-Très bonne spécificité
-Identification large de l’agent infectieux
-Différents milieux possibles pour une bonne sélectivité
-Peu coûteux
-Permet d’orienter le traitement
-Permet de distinguer les souches susceptibles aux souches résistantes (Staph aureus vs SARM)
DÉSAVANTAGES:
-Certains microorganismes croissent mal en culture
-Sensibilité variable selon les organismes
-Délai de croissance
-Nécessite des cultures diverses (aérobie, anaérobie, milieux sélectifs, chromogéniques, etc.)
Avantages et inconvénients des tests antigéniques en infectiologie
AVANTAGES:
-Rapide, automatisable
-Faible coût
-Très grande capacité analytique
DÉSAVANTAGES:
-Sensibilité et spécificité variable et généralement moins bonnes que TAAN et culture
-Cible un nombre limité de pathogènes
Avantages et inconvénients de la sérologie en infectiologie
AVANTAGES:
-Disponible dans presque tous les laboratoires
-Utile pour l’évaluation de séroprévalence et études épidémiologiques
DÉSAVANTAGES:
-Utilité limitée en diagnostic
-Performance variable selon les tests (IgM, IgG, IgA, Ig totaux) (IGM en premier, ensuite IgG ou IgA, peut être intéressant de doser Ig totaux)
Avantages et inconvénients de la spectrométrie de masse (MALDI-TOF) en infectiologie
AVANTAGES:
-Permet d’identifier les micro-organismes sur la base de leur signature protéique.
-A le potentiel de passer la barrière « pan-domaine » (nécessite en ce moment une culture préalable mais des approches par TAAN en première ligne se développent)
DÉSAVANTAGES:
-Très dispendieux et requiert une expertise
-Pas parfait (Ex: utilisation limitée pour Shigelle, E. coli O157 et pour virus)
-Requiert quand même un antibiogramme
Nommez 4 symtômes d’allure grippale (SAG)
- Fièvre
- Toux
- Arthralgie / myalgie
- Fatigue extrême
Chez quelles populations la symptômalogie et les complications tendent à être plus importante pour les infections respiratoires?
- Nouveau-nés
- Patients immunodéprimés ou immunosupprimés
- Patients ayant certains facteurs de risque
- Femmes enceintes
- Personnes âgées
Chez quel population le VRS est plus fréquent?
Nouveau-nés/jeunes (0-17 ans)
Selon les tests sérologiques aux États-Unis, le taux de séroprévalence dépasse 10 fois le taux d’incidence basé sur les tests moléculaires. Qu’est-ce que ça suggère?
Le nombre connu de cas serait grandement sous-estimé
Nommez les S&S lié à une infection à SRAS-CoV-2
Symptômes respiratoires :
–Toux (50%)
–Dyspnée (5%)
–Rhinorrhée (75%)
Symptômes généraux :
–Fièvre (35%)
–Maux de tête (75%)
–Myalgie (30%)
–Mal de gorge (70%)
Symptômes gastro-intestinaux :
–Diarrhée (20%)
–Nausée / vomissements (20%)
Symptômes neurologiques :
–Anosmie (estimé à 30%)
–Agueusie (4%)
-L’évolution clinique la plus fréquente est le développement d’une pneumonie atypique avec infiltrats bilatéraux au CT scan
Quelles sont les complications associées à une infection à SRAS-CoV-2
-Insuffisance respiratoire (détresse respiratoire aigu)
-Complications cardiovasculaires (Arythmie, atteinte cardiaque ou arrêt cardiaque)
-Complications thromboemboliques
(AVC, thrombose veineuse profonde)
-Complications inflammatoires (Syndrome de Guillain-Barré, Kawasaki)
-Séquelle à long terme (Détérioration respiratoire, fatigue, faiblesse)
Quels sont les marqueurs élevés lors d’infection sévère à la COVID-19
↑ D-Dimère (> 1000 ng/mL)
↑ CRP (> 75 mg/L)
↑ LDH (> 245 U/L)
↑ Troponine (> 2x la limite supérieure)
↑ Ferritine (> 500 ug/L)
Quels sont les avantages et inconvénients à une stratégie de pooling
Avantages:
–Augmente la capacité analytique
–Diminue le besoin de réactifs d’extraction
Désavantages:
–Besoin de temps technique pour pooler
–Quelle population? (Communauté, hospit, urgences, employés, etc…)
–L’utilité du pooling dépend de l’incidence
En contexte de rupture de stock de réactifs d’extraction, il est possible de chauffer le spécimen a 90’C pour 2 min (lyse thermique). Nommer deux avantages et deux inconvénients de cette méthode
Avantages:
-pas besoin de stock de réactif d’extraction
-inactivation et extraction dans la même étape
Inconvénients:
-Ne permet pas de pooler (moins grande capacité)
-Nécessite l’ajout d’un contrôle interne (choix du contrôle, essentiel car possibilité d’inhibiteurs réactionnel, validation requise)
Quels sont les processus pré-analytique et analytique (initial) pour les aspects labo SRAS-CoV-2
Préanalytique:
-Prélèvement oronasopharyngé (maintenant possibilité d’Oro-nasal, salive, gargarisme)
-Transport, réception, enregistrement des spécimens
Analytique (contexte 1 éch à la fois):
-Inactivation
-Extraction
-Amplification
-Interprétation
-Rapport
Pour l’analyse SRAS-CoV-2 en TAAN, quelle est la matrice à privilégier, les avantages et désavantages de la méthode
Matrice: swab oronasopharyngé (ou autres possible)
+ :
–test le plus sensible (95,2%)
–fonctionne pour asymptomatique et pré-Sx
–Automatisable (M2000, Cobas 6/8800, BDMax)
–Haute cadence et rapidité
-:
–Détecte encore du virus non actif post guérison
–risque FP/FN
–Performance variable selon les matrices
Pour l’analyse SRAS-CoV-2 en sérologie, quelle est la matrice à privilégier, les avantages et désavantages de la méthode
Matrice: sérum
+: détection des infections passées (3-4sem)
-:
–ne permet pas le Dx
–Performance variable (IgG, IgM, IgA, Ac totaux)
–Peu d’application
Pour l’analyse SRAS-CoV-2 en tests antigéniques, quelle est la matrice à privilégier, les avantages et désavantages de la méthode
Matrice: swab oronasopharyngé (ou autres possible) comme TAAN
+: rapiditié, cadence, automatisable, self-testing
-: Moins performant que TAAN
Dans une stratégie de pooling pour économie des réactifs, est-il intéressant de pooler les populations venant d’hospit?
Non car il s’agit d’une population pour laquelle il y a des chances augmentées pour lequel le pool ne passe pas, et donc ça même à l’augmentation du temps de sortie du résultat.
Pourquoi il n’est pas possible de pooler lorsqu’on utilise la méthode de lyse thermique?
L’inactivation thermique rend l’approche moins sensible et moins “propre” avec plus d’interférence. On a donc besoin d’un contrôle interne pour s’assurer qu’un NEG est NEG et que ce n’est pas en raison d’un interférence cellulaire.
C’est principalement en raison de l’approche qui est moins sensible avec cette méthode
