Base moléculaire des maladies génétiques et aspects opérationnels d’un laboratoire de diagnostic moléculaire Flashcards
Quelle est la 1ère cause de mort subite chez le jeune et quels sont les moyens pour la prévenir?
-maladie génétique cardiovasculaire: 1ère cause identifiable mort subite jeune
Moyens de prévention:
-Dépistage familial efficace (clinique et moléculaire)
-Prévention efficace via défibrillateur implantable, médication, chirurgie de l’aorte
Quelle est la définition de la médecine de précision/personnalisée?
C’est une médecine cherchant à améliorer la stratification et la prise en charge des patients en utilisant des informations biologiques et biomarqueurs au niveau des voies moléculaires des maladies, génétique, protéomique et métabolomique
Qu’est-ce que la pharmacogénétique, oncogénétique et cardiogénétique?
Pharmacogénétique: relation/influence profil génétique sur réponse aux médicaments. Choix Mdx (sélection/dose) adapté selon le profil du patient
Oncogénétique: Thérapies adaptées en fonctions des caractéristiques génétique de la tumeur (recherche marqueur génétique particulier) et du profil génétique patient
Cardiogénétique: Caractéristiques génétiques du patient servent à guider le traitement et dépister les membres de la famille à risque
Discute des points suivants:
-gène, exons et introns
-réplication de l’ADN
-traduction de l’ARN
-rôle des protéines
-génotype –> phénotype
-Gène: unité de base de l’hérédité (2% génome)
Exons: régions codantes
Introns: séquences intercalantes
-ADN: répliqué lors division cellulaire par ADN polymérase et matrice pour transcription en ARN par ARN polymérase
-ARN (rarement employé en clinique): sert de matrice pour traduction en protéine par le ribosome
-protéine (majorité analyse de labo; quantification sérum/plasma) participe à multiples fonctions cellulaires (structure, métabolisme, régulation)
Transfert d’info permet l’expression du génotype dans phénotype.
Combien avons-nous de chromosomes nucléaires (autosomes et gonosomes) ainsi que mitrochondriaux?
-nucléaires:
23 paires (22 paires autosome et 1 paire gonosomes (sexuels))
XX: féminin
XY: masculin
-mitochondriaux:
Forme circulaire
encode 37 gènes
exclusivement transmis par la mère
variants dans les gènes mitochondriaux sont associés à des maladies à transmission maternelle
-nucléaire + mitochondriaux = encodent génome
Quelle est la définition de génotype vs phénotype et quelle est la corrélation entre les 2?
Génotype
-information codé dans le génome
-correspond à composition et séquence génétique spécifique
-défini par la séquence des deux allèles d’un gène
Phénotype
-manifestation physique/clinique du génotype
-discret: présence ou absence d’une maladie
-représenté par une quantité mesurable (IMC, niveaux sanguins de cholestérol)
Corrélation génotype-phénotype
Association entre présence de certain(s) variant(s) (génotype) et leurs expressions cliniques ou physiologiques (phénotype)
Décrit les 3 types de zygotie (hétéro-, homo- et hémizygote).
-Hétérozygote : deux allèles sont différents
-Homozygote: deux allèles sont identiques
-Hémizygote: génotype d’un individu qui n’a qu’un chromosome, ou segment de chromosome. Réfère spécifiquement aux gènes localisés sur le chromosome X pour un individu XY.
Définit l’incidence.
Incidence: nombre de nouveaux cas sur un temps donné (ex: par année) indicateur à laquelle la vitesse apparaît dans la population.
Exprimé en : X personne par an
Définit la prévalence:
Prévalence: désigne le nombre total de cas (anciens et nouveaux) dans une population à un moment donné. Donne une image de l’ampleur ou la charge de la maladie dans la population.
Exprimé en % ou en nombre de cas.
Comment décrit-on l’hérédité mendélienne et quels sont les modes de transmission?
-mode de transmission monogénique (monofactorielle)
-maladie mendélienne peut être homogène (gène impliqué = le même chez tous les patients; mucoviscidose, myopathie de Duchenne, phénylcétonurie) ou hétérogène (gène affecté peut être différent d’un patient à l’autre; Hémophilie A ou B, Cardiomyopathie hypertrophique)
-Quatre mode de transmission : autosomal dominant, autosomal récessif, lié à l’X dominant, lié à l’X récessif
Décrit la transmission autosomique dominante:
-définition
-risque de transmission
-exemple de pathologies
-pénétrance vs expressivité variable
Transmission autosomique dominant
-présence d’un seul gène muté = maladie (hétérozygotes = malades et homozygotes = atteinte plus sévère)
-à chaque grossesse = 50% de risque de transmettre la maladie
-Ex: Cardiomyopathie hypertrophique, Syndrome Marfan, hypercholestérolémie familiale
-pénétrance:
–liée ou non à l’âge
–pourcentage d’individu ayant un génotype donné qui présentent le phénotype associé au génotype
–pénétrance incomplète = individu ayant le génotype associé à la maladie sans la développer
–pénétrance 100% = tous les individus présentant le génotype développent la maladie
-expressivité variable : expressivité mesure niveau d’expression d’un génotype donné a/n phénotypique
-mutation de novo
Décrit la transmission autosomique récessive:
-définition
-risque de transmission
-exemple de pathologies
-présence des deux allèles mutés pour présenter la maladie (Aa = porteurs, aa = malades)
-à chaque grossesse: risque de 25% d’enfant homozygote, 50% enfant porteur et 25% enfant sain
-Ex: syndrome du LQT1 (KCNQ1), Fibrose kystique, Hémochromatose
Décrit le mode de transmission dominant lié à l’X et donne des exemples de pathologies.
-mère malade heterozygote (X dominant): filles ou garçons malades (50%)
-père malade (X dominant): seulement les filles malades, garçon sain
-Ex: syndrome de l’X fragile, déficit en ornithine transcarbamylase
Décrit le mode de transmission récessif lié à l’X et donne des exemples de pathologies.
-mère porteuse hétérozygote (X récessif): fils malades (50%) et fille porteuse (50%)
-père porteur (X récessif): seulement filles porteuses (100%), garçon sain
-Ex: Hémophilie, dystrophie musculaire de Duchenne, Déficit en G6PD
Qu’est-ce que l’hérédité mitochondriale? Comment les enfants sont atteints selon le père ou la mère atteints? Donne quelques exemples de pathologies.
-lors de la fécondation, spermatozoïde apporte un noyau d’origine paternelle qui va fusionner avec noyau ovule maternelle, mais cytoplasme de l’ovocyte ainsi réalisé est exclusivement d’origine maternelle.
!! tous les enfants d’une femmes atteintes sont malades!!
!! tous les enfants d’un homme malade seront sains!!
-variants dans gènes mitochondriaux très fréquents (10-20x plus fréquents que les gènes nucléaires)
-Ex: syndrome de Myopathie mitochondirale (MELAS), encéphalopathie, acidose lactique et pseudo-épisodes vasculaires cérébraux ou “stroke-like”
neuropathie optique héréditaire de Leber désigne un dysfonctionnement du nerf optique
Qu’est-ce que l’hérédité multifactorielle (non-mendélienne) et donne des exemples de pathologies?
-Dépend de l’hérédité et de l’environnement
-Expression d’un certains nombre de caractères (taille d’un individu) est multigénique et multifactorielle selon distribution normale
-Ex pathologies courantes: Hypertension artérielle, coronaropathies, diabète de type II, arthrite
Quelle est la fréquence des variants génétiques fréquents vs rares? Comment les variants génétiques ont un effets (ADN, maladies vs cancers, GOF ou LOF)?
-plus de 10 millions de variants fréquents
deux individus ont un génome identique à 99,5%
chaque individu présente près de 5 millions de variant (0,5%: explique variations interindividuelles; bénin)
-variants rares (fréquence allélique＜1%) peuvent être associés au développement de maladie
affecte une énorme (ex: trisomies) ou une infime (ex: un seul nucléotide) partie de l’ADN
source des maladies génétiques (variant germinal) et des cancers (variant somatiques)
peuvent augmenter (gain de fonction) ou diminuer (perte de fonction) la fonction de la protéine encodée
Nomme 3 catégories de variants qu’on peut associer à la pathophysiologie.
-Variants structuraux (8%)
-Petites insertions ou délétions (InDel) (24%)
-Changement d’un seul nucléotide (SNPs, mutations ponctuelles) (68%)
Nommes les 3 types de variants structuraux et donne des exemples de maladie.
1) Anomalies chromosomiques de nombre (affecte nbr de chromosomes)
-Monosomie (aneuploïdie par défaut (absence chromosome)
–Syndrome de Turner (monosomie 45, X)
–Autres monosomies en général incompatible avec la vie
-Trisomie (aneuploïdie par excès, gain chromosome)
–Trisomie 13 (Syndrome Pateau), PQDNS
–Trisomie 18 (Syndrome Edwards), PQDNS
–Trisomie 21 (Syndrome de Down), PQDNS
–Trisomie 47 (XXY, Syndrome Kleinefelter)
2) Anomalies chromosomiques de structure (pas examen)
-si 1 chromosome impliqué:
–Délétion: portion manquante
–Duplication: portion dupliquée (matériel génétique suppl.)
–Inversion: portion tournée et réattachée (mat. gen. inversé)
-si 2 chromosome impliqués:
–Insertions: portion de chromosome supprimé d’un inséré dans l’autre chromosome
–Translocation: échange de matériel entre 2 chromosomes non homologues après cassure sur chacun des chromosomes impliqués
3) Variation du nombre de copie (copy number variants, CNVs)
En quoi consiste les petites insertions/délétions?
Courtes insertions/délétions (＜50nt)
-Si multiple de 3nt: pas de changement du cadre de lecture
-si multiple différent de 3: changement du cadre de lecture
–Implique changement des aa et introduction potentielle d’un codon stop dans la séquence
Nomme les 5 types de mutations ponctuelles (changement d’un seul nucléotide) (SNPs).
1) Faux-sens (missence): variant qui entraîne le changement d’un codon spécifique d’un a.a. pour un autre a.a. (ex: Ser → Tyr)
2) Non-sens (nonsense): variant qui entraîne introduction d’un codon stop prématuré (ex: Tyr → Stop)
3) Synonyme: changement d’un nt qui n’entraîne pas de modification du codon (ne change pas a.a.) (ex: Tyr → Tyr)
4) Site d’épissage: variant qui affecte sites donneur 5’ ou accepteur 3’
5) Non-codants (introniques ou intergénique)
Quels sont les effets fonctionnels des mutations (LoF et GoF)?
-Perte de fonction: altérations séquences codantes, régulatrices ou autres séquences critiques menant à la perte de fonction partielle ou complète de la protéine codée par le gène
-Gain de fonction: augmentation de l’abondance de la protéine, généralement via l’augmentation de son expression
Quels sont les impacts des tests génétiques?
-chaque maladie associée à variants dans certains gènes spécifiques (années de recherche).
-Cas-index: Dx clinique ou suspecté peut mener à dépistage génétique pour recherche de cause génétique
-si résultat positif (variant pathogénique) = dépistage en cascade dans famille peut être initier pour identifier individus porteurs et à risque (rassure les non-porteurs)
-Prise en charge clinique différentielle (médication, chirurgie, suivis rapprochés, congé) selon les résultats de génétique.
À quoi sert la génétique médicale?
-Pour le patient atteint: Dx clinique et prise en charge précoce (traitement préventif)
-Pour les grossesses futures: détermination risque récurrence et suivi de grossesse adapté
-Pour les familles: Dépistage en cascade des personnes à risque
-Pour la société: Médecine préventive et médecine légale
Quel est le rôle du laboratoire dans l’analyse moléculaire des gènes et quelles sont les étapes d’analyse?
-Analyse permettant d’identifier les modifications dans l’ADN des gènes associés au développement de maladies.
-Étapes:
1) Prélèvement (sang total, tissus, salive)
2) Extraction de l’ADN
3) Séquençage
4) Analyse des séquences d’ADN
5) Classification des variants (selon lignes directrices)
Quelle est l’offre de service provinciale pour la cardiogénétique?
Dans le cadre des travaux du RQDM (réseau québécois de Dx moléculaire), l’ICM a développé, validé et implanté l’offre de service provinciale en cardiogénétique
-Service de traitement accéléré des échantillons prioritaires
-Service unique d’autopsie moléculaire pour cas mort subite cardiaque inexpliquée
Prescription test génétique par MD → extraction ADN sang total → séquençage 97 gènes → analyse de mutation pathogéniques → rapport remis au MD
Quelle sont les lignes directrices de l’American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG)?
Selon la fréquence dans la population (fréquence allélique), étude de ségrégation (arbre généalogique), le type de variant (épissage, codant, non-codant et type de mutation), études fonctionnelles et outils de prédiction bio-info: indique le niveau que le variant est suspecté être classé (très fortement pathologique à fortement bénin)
-variant bénin → probablement bénin → signification incertaine → probablement pathogénique → pathogénique
Nomme 4 catégories de maladies cardiovasculaires héréditaires et donne un exemple pour chaque.
-Cardiomyopathies (au niveau du muscle cardiaque) - cardiomyopathie hypertrophique
-Arythmies (au niveau du rythme cardiaque et électricité) - Syndrome du QT long
-Aortopathies (au niveau de l’aorte, le plus gros vaisseau sanguin du corps) - Syndrome de Marfan
-Dyslipidémies familiales (au niveau du métabolisme des lipides) - Hypercholestérolémie familiale et hyperchylomicronémie familiale
Pour la Cardiomyopathie hypertrophique (CMH), discute des points suivants:
-Généralités
-Prévalence
-Mode de transmission
-Présentations cliniques
-Bases moléculaires
-Implications cliniques de la génétique (confirmation Dx, dépistage, indication sur le traitement)
Généralité
-Épaississement (hypertrophie) du muscle cardiaque (cardiomyocarde, grosseur du muscle faisant rappetisser ventricule droit)
-1ère cause de mort subite chez les moins de 40 ans
-maladie du sarcomère cardiaque (perte alignement des myofibrilles)
-peut se développer à tout âge (adolescence et début âge adulte)
-expressivité variable (même au sein d’une même famille)
Prévalence: 1 individu sur 500 à 1 sur 200
Autosomique dominant
Présentations cliniques: Fatigue, essoufflement à l’effort, Angine, Palpitations/arythmines, étourdissement, syncopes (perte connaissance brutale), oedème jambes, souvent asymptomatique (1er symp = mort subite)
Bases moléculaires: maladie sarcomérique, variant pathogéniques dans gènes codant pour sarcomère cardiaque : MYBPC3 (15-20%), MYH7 (10-15%), TNNT2 (1-2%), TNNI3 (1-2%) et TPM1 (0,1-1%). Perte alignement myofibrilles
Implications cliniques de la génétique:
-confirmation Dx (identification variant cliniquement pertinent chez 30-50%)
-dépistage familial (identification membres famille à risque de mort subite)
-indication sur le traitement (défibrillateur préventif selon résultat, suivi)
Pour le Syndrome du QT long (SQTL), discute des points suivants:
-Généralités
-Prévalence
-Mode de transmission
-Présentations cliniques
-Bases moléculaires
-Implications cliniques de la génétique (confirmation Dx, dépistage, prévention)
Généralités
-Anomalies électriques sur ECG (allongement segment QT et anomalie de l’onde T)
-risque arythmie ventriculaire, syncope et arrêt cardiaque
-structure et fonctionnement du muscle cardiaque sont normaux
-peut se développer à tout âge (mais + enfance et adolescence)
-expressivité variable (même au sein d’une même famille)
Prévalence: 1 sur 3000 à 1 sur 2000
Autosomique dominant
Présentations cliniques: parfois asymptomatique, allongement segment QT (parfois découvert de manière fortuite; >470ms homme et >480ms femme). Chez d’autres, arythmies ventriculaires → symptômes = palpitations, tachyarythmie (torsade de pointe), syncopes, lipothymies (faiblesse sans perte connaissance), mort subite.
-Anomalie électrique déclenchée par différents stimuli (activité physique, auditif, émotion intense, post-partum, repos, médicament)
-épisode de noyade dans arbre généalogique peuvent être associé à SQTL
Bases moléculaires: maladie canaux ioniques (potassique et sodique)
-LQT1: gène KCNQ1 (K+; 30-35% des cas; perte de fonction)
-LQT2: gène KCNH2 (K+; 25-30% des cas; perte de fonction)
-LQT3: gène SCN5A (Na+; 5-10% des cas; gain de fonction, syndrome de Brugada aussi associé à ce gène mais en perte de fonction)
Implications cliniques de la génétique:
-confirmation du Dx (près de 30% ayant SQTL ont un intervalle QT dans valeur de référence). présence variant causal aide au Dx
-Dépistage familial (identification membres famille à risque de mort subite)
-Prévention (défibrillateur, arrêt de certaines activités physiques intenses (nage), arrêt de certains types d’emplois (pilote), éviter mdx allongeant segment QT (informer personnel médical et pharmacien)
Pour le Syndrome de Marfan (SM), discute des points suivants:
-Généralités
-Prévalence
-Mode de transmission
-Présentations cliniques
-Bases moléculaires
-Implications cliniques de la génétique
Généralités
-désordre génétique multisystémique qui affecte tissu conjonctif
-systèmes atteints: squelettique, oculaire, pulmonair, cardiovasculaire, peau
-caractérisé par dysfonctionnement fibrilline-1 (glycoprotéine matrice extracellulaire) distribuée de façon ubiquitaire
Prévalence: 1 sur 10 000 à 1 sur 5000
Autosomique dominant
Présentations cliniques: luette bifide, subluxation cristallin, très grande taille disproportionnée (anomalie squelette), Pectus excavatum ou carinatum, hyperlaxité ligamentaire, Anévrisme de l’aorte initiale (à son émergence du coeur) et dissection aortique, prolapsus de la valve mitrale, pneumothorax spontanés
Bases moléculaires: variants dans le gène FBN1 qui code pour fibrilline 1 (25-35% des patients présentent un variant de novo; variant généralement uniques à chacune des familles atteintes)
Implications clinique de la génétique:
-abaissement du seuil chirurgical
-séquençage du gène FBN1 est l’étalon d’or pour la génétique
-identification variant pathogénique/probablement patho = signe Dx
Pour la Mort subite cardiaque, discute des points suivants:
-Généralités
-Prévalence
-Autopsie moléculaire (Dx)
Généralités
-étiologie de la mort subite cardiaque varie selon l’âge
–90% des cas: maladie coronarienne et infarctus aigu du myocarde
–moins de 40 ans: arythmie ou anomalie structurelle du coeur
-anomalies cardiaque non-structurelles correspondent aux arythmies héréditaires
–Syndrome QT long
–Syndrome Brugada (SBr)
–Tachycardie ventriculaire polymorphe catécholaminergique (TVPC)
-anomalies cardiaques de structure correspondent aux maladies de la structure de la cellule musculaire cardiaque
–Cardiomyopathie hypertrophique (CMH)
–cardiomyopathie arythmogène ventricule droit (CAVD)
Prévalence: cause majeure de mortalité, 15-20% de tous les décès mondialement, près de 4% non expliqué
Autopsie moléculaire (74 gènes) pour mort subite inexpliquée:
Analyse génétique post-mortem pour identifier modification ADN gènes associés à la mort cardiaque subite.
But = identifier déterminant pouvant expliquer la cause du décès (taux détection de 13%) et identifier membre de la famille à risque
Pour l’hypercholestérolémie familiale (HF), discute des points suivants:
-Généralités
-Prévalence
-Mode de transmission
-Présentations cliniques
-Bases moléculaires
-Implications cliniques de la génétique
Généralités
-désordre génétique du métabolisme des lipides associé à élévation des concentrations plasmatique du LDL-Cholestérol
-niveau élevé LDL-C entraîne développement prématuré maladie cardiovasculaires athérosclérotiques (MCVAS)
–apparaît tôt dans la vie si patient non-traités
-si HF demeure non-traité: risque développer MCVAS est de
–50% chez homme avant 50 ans
–30% chez femme avant 60 ans
Prévalence: HF hétérozygote 1/250 vs HF homozygote 1/16000 à 1/300000, Effet fondateur 1/81 à 1/270 Canadiens français
Semi-dominant (gravité change selon le variant pour chaque individu)
Présentation clinique: élévation niveau LDL-C circulant (indiv non-traités)
-HF hétérozygote : LDL-C: 5-13 mmol/L
-HF homozygote: LDL-C: > 13 mmol/L
-Xanthome tendineux, Xant. jointure main, Xanthélasmas, Arcs cornéens
Bases moléculaires: dans tous les cas = augm. LDL-C dans circulation
l’une n’est pas nécessairement plus “dangereuse” qu’une autre
-LDLR (85-90%)
-ApoB (5-10%)
-PCSK9 (< 5%)
-LDLRAP1 (rare)
Implications clinique de la génétique:
-Dx précoce essentiel (traitement hypocholestérolémiant prévention) et dépistage membre de la famille au premier degré
-pronostic patient traité: hétéroz = vie normale, homoz = MCVAS repoussée dans le temps par aphérèse plasmatique
-connaissance génétique = contribution majeure (dév. traitement)
–statine qui cible synthèse de novo du cholestérol
–anticorps monoclonaux contre PCSK9
Pour la Dystrophie musculaire de Duchenne (DMD), discute des points suivants:
-Généralités
-Prévalence
-Mode de transmission
-Présentations cliniques
-Bases moléculaires
-Implications cliniques de la génétique
Généralités
-maladie neuromusculaire caractérisée par atrophie et faiblesse musculaires progressives dues à dégénérescence progressive des muscles squelettiques, lisses et cardiaques
-défaut protéine dystrophine (protéine musculaire exprimée principalement dans muscles squelettiques, lisses et cardiaques et certaines neurones)
Récessif liée à l’X
(Prévalence: 1 naissance (sexe masculin) sur 3500)
Présentation clinique:
-Naissance à 2 ans:
–garçons relativement normaux
–Niveau plasmatique de CK élevés (10-100 fois la normale)
-3-5 ans:
–faiblesse musculaire, chutes fréquentes (enfant maladroit)
–pseudohypertrophie des mollets
–Signe de Gowers (façon de se lever = caractéristique)
-Vers l’âge de 12 ans:
–Garçons se déplacent en chaise roulante
–légère déficience intellectuelle
–complications cardiaques et pulmonaires
Bases moléculaires: 3 catégories de variants dans DMD (plus long gène, bcp variants)
1) larges délétions dans le gène DMD (65%)
2) larges duplications (10%)
3) Petites insertions/délétions ou SNPs (25%)
Implications clinique du Dx moléculaire:
-Dx en cherchant larges délétions et duplication
-dépistage familiale = indication 1ère du Dx
-études morphologiques et immunohistochimie permettent Dx mais invasifs
Comment le dépistage populationnel pour risque pangénomique prend place dans notre société?
-prédiction du risque de développer une maladie à partir de génotypage de milliers/millions variants dans l’ADN
-maladie coronarienne, fibrillation auriculaire, cancer du sein, diabète de type 2, maladies inflammatoires chroniques de l’intestin
-calcul de score de risque qui s’en vient à court terme.
Quelles sont les considérations opérationnelles pour un laboratoire de diagnostic moléculaire?
-requête d’analyse
-formulaire consentement pour un test génétique (unique province à venir)
-conservation des enregistrements
-banquage des échantillons (sang total vs ADN purifié)
-système informatique de laboratoire spécialisé en génétique aide bcp (tracking des échantillons entre autres)
Quels sont les types d’équipements pour une laboratoire de diagnostic moléculaire?
Système fermé: conception empêche contact avec produits réactions intermédiaire ou finaux (automatisé en système fermé-cassette).
-circuit unidirectionnel non-nécessaire
-ex: IDnow pour Covid
Système ouvert: implique au moins 1 étape d’amplification des acides nucléiques, comporte 3 ou 4 zone permettant la séparation des activités et éviter la contamination de l’échantillon
-circuit unidirectionnel essentiel
Qu’est-ce que le flux unidirectionnel?
Généralement en 3 zones (1 vers 3 sans retour arrière possible):
-Zone 1, propre (entreposage et préparation réactifs et préparation MasterMix) Pression positive pousse l’air à l’extérieur
-Zone 2, salle (préparer les spécimens et isolation des acides nucléiqes) Pression négative pour ne rien pousser à l’extérieur de la pièce
-Zone 3, très salle (zone d’amplification et détection) Pression négative pour éviter contamination avec amplicon à l’extérieur
Quelles sont les précautions à prendre pour prévenir la contaminations, les aérosols et la rémanence?
-centri brièvement les tubes avant ouverture
-ouverture et fermeture minutieuse des tubes
-embouts pipette avec filtre
-refermer chaque échantillon avant d’en ouvrir un autre (rémanence)
-Aliquoter réactifs (éviter rémanence)
-port des gants
-respect flux directionnel
-préparation et distribution du MM avant ajout ADNg
-Ergonomie!
Quelles sont les étapes pour implanter une test dans un laboratoire de diagnostic moléculaire?
1) sélection de l’approche (seq. génome/exome/profil de gène)
2) validation (guide de l’INESSS pour validation en Bio Mol)
3) qualité: matériel référence (important pour validation et CQi/CQe)
-ADNg extrait sang total = stable mais pas assez grand qté pour long terme
-ADNs Corriel (ADNg provenant de lignées cellulaires, facilement téléchargeable base données publiques
3) Contrôle de la qualité
-CQi: positif (faible qté ADN pour éviter rémanence) et négatif (tout sauf ADNg), effectué à chaque essai, idéalement ch étape a son CQi
-CQe: programmes offerts (CAP, ECMN, GenQA)
–se comparer avec les pairs
–sur une base périodique
doivent être traités comme –échantillons patients
histoire de cas 1
histoire de cas 2
histoire de cas 3
