M3S6 - Structure Acides Amines Flashcards

1
Q

L’alimentation apporte quelle quantité d’acides aminés par jour?

A

environ 70 g

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2
Q

Qu’est ce que l’extraction splanchnique?

A
  • le foie utilise 20 % des AA pour sa propre utilisation (synthèse de nombreuses protéines comme les protéines plasmatiques) ;
  • environ 50 % des AA sont éliminés directement sous forme d’urée et ne seront pas utilisés par l’organisme ;
  • les 30 % restant sont distribués dans les tissus périphériques afin d’être utilisés. Ces AA ont été triés et ce sont surtout les acides aminés essentiels (AAE) et à chaîne ramifiée (AACR).
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3
Q

Quantifier la quantité de protéines catabolysées et resynthétisées quotidiennement

A

400g de protéines soit 1kg de masse sèche
= turn over des protéines

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4
Q

Quelle est la structure moléculaire commune des AA?

A

1 carbone asymétrique α, lié à :
* 1 fonction carboxylique (COOH) ou groupement acide ;
* 1 fonction amine primaire (NH2) ou groupement aminé
* 1 radical R qui est de nature différent d’un acide aminé à l’autre. C’est la composition de R qui fera la particularité de l’AA.

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5
Q

De combien d’AA sont constituées les protéines animales, végétales, et bactériennes?

A

20 AA standards (contre 250 dans la nature)

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6
Q

Qu’est un AA aliphatique?

A

Un AA avec un radical, qui est uniquement composé d’une chaîne hydrocarbonée plus ou moins longue
==> AA hydrophobe
* glycine (GLY/G) = le plus simple
* alanine (ALA/A)
* valine (VAL/L), leucine (LEU/L), isoleucine(ILE/I) AAE à chaine ramifiée

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7
Q

Qu’est un AA dicarboxylique (diacide)?

A

AA portant une seconde f° carboxylique au niveau de son radical.
Cette fonction rend l’AA très hydrophile.
* acide aspartique (ASP / D) ;
* acide glutamique (GLU / E).

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8
Q

Qu’est ce qu’un acide aminé amide?

A

Un AA portant une f° amide –CO-NH2 sur son radical
Forte ressemblance avec les AA dicarboxyliques parce qu’ils peuvent en être issus (f° amide au lieu de la f° carboxylique)
==> AA très hydrophile
* asparagine (ASN / N)
* glutamine (GLN / Q)

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9
Q

Qu’est ce qu’un AA aminé dibasique?

A

AA portant une seconde f° amine sur son radical qui peut être ionisée à pH basique, d’où le nom.
==> AA hydrophile.
* Lysine (LYS / K) AAE : composition du collagène.
* Arginine (ARG / R) ** AA semi-essentiel ** car en situation traumatique (de cicatrisation par ex lors d’une chirurgie),
l’apport endogène est insuffisant et l’apport exogène est alors nécessaire.
* Histidine (HIS / H) AAE chez le nourrisson car l’enzyme est longue à être exprimée

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10
Q

Qu’est ce qu’un AA alcool?

A

AA portant une f° alcool –OH sur son radical
==> AA hydrophile.
Cette f° alcool peut être estérifiée (par un phosphate => phosphoprotéine)
* Sérine porte un alcool primaire (SER /S)
* Thréonine porte un alcool secondaire (THR / T) AAE

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11
Q

Qu’est-ce qu’un AA souffré ?

A

Le radical comporte un atome de soufre :
* cysteine (CYS / C)
* methionine (MET / M) AAE

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12
Q

Qu’est-ce qu’un AA aromatique ?

A

Leur radical comporte un cycle aromatique:
* phenylalanine (PHE / F) AAE
* tyrosine (TYR / Y)
* tryptophane (TRP / W) AAE

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13
Q

Qu’est-ce qu’un AA hétérocycle ?

A

Son radical fait un cycle avec la f° amine du carbone asymétrique :
* proline (PRO / P)

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14
Q

Quelles sont les 8 acides aminés essentiels et les 2 acides aminés semi essentiel ?

A

Hystérique, le très lyrique Tristan fait vachement méditer Iseult, archi niaise

AAE :
- valine
- leucine
- isoleucine
- lysine
- thréonine
- methionine
- phenylalanine
- trytophane

AA semi-essentiels :
- histidine
- arginine

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15
Q

Qu’est-ce qu’un facteur limitant ?

A

AA pas ou peu présent, dans un aliment protéique :
- lysine => blé, orge, avoine, seigle, millet
- lysine et thréonine => riz
- tryptophane et lysine => maïs
- methionine et cysteine => bœuf
- methionine => légumineux

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16
Q

Sous quelle forme (stéréo isomérie) se trouvent les AA dans une protéine?

A

Forme L

17
Q

Quelles sont les particularités des acides aminés non ionisables (forme, pH…) ?

A

Leur radical n’est pas ionisable.
* 3 formes différentes selon le pH (cation/amphotère/anion)
* leur forme changera à 2 pH :
==>pK1 (COOH devient COO-) : pH acide
==>pK2 (NH3+ devientNH2) : pH basique
* Ils seront neutre au pHi= (pK1+pK2)/2

18
Q

Qu’est ce que le pH isoélectrique?

A

pH auquel on retrouve la forme neutre.
==> pHi = (pK1+pK2)/2

19
Q

Qu’est ce qu’un acide aminé ionisable?

A

Il possède un radical ionisable.
* AA dicarboxyliques : fonction COOH
* AA dibasiques : fonction NH3

Il a donc une constante de dissociation supplémentaire : pKr
==> 4 formes possibles selon le pH
* si R porte COOH : pHi = (pK1+pKr)/2
* si R porte NH3+ : pHi = (pKr+pK2)/2

20
Q

Quelles sont les réactions de transformation peuvent subir les AA pour le métabolisme des protéines (3 attendues)

A
  • décarboxylation (f°carboxyle modifiée en f° amine vie des décarboxylases)
  • amidification de la f° carboxylique du radical
  • désamination