Lunes 31 de Octubre Flashcards
¿Qué aportaciones realizó Waddington?
Dibujos de paisaje epigenético y experimentos en moscas y mamíferos en los que cambiaba el entorno químico y se modificaba el fenotipo
¿Cuál fue una de las preguntas que dieron pie a la epigenética?
¿Cómo a partir de una célula se pueden originar diferentes tejidos con diferentes características
¿Qué es el epigenoma?
La interfaz dinámica entre los genes y el entorno
¿Cuál es la definición de epigenética?
Regulación de la expresión de los genes sin afectar la secuencia del DNA
Menciona las ciencias ómicas
-Epigenómica
-Transcriptómica
-Proteómica
-Metabolómica
¿Cuáles son algunos factores que inducen cambios epigenéticos?
Desarrollo
Conducta materna
Aprendizaje
Drogas
Estrés
Toxinas
¿entre qué ciclos se encuentran los cambios epigenéticos?
Entre el desarrollo y los ciclos generacionales (ya que se pueden heredar)
¿Por qué fenómeno se descubrió que las marcas epigenéticas se podían heredar?
Por hambruna
¿Qué es una histona?
Conjuto de proteínas que forman un octamero (nucleosoma) sobre las cuales se enrolla el DNA
¿Cuántos pares de bases se pueden enrollar en un nucleosoma?
147
¿Cuál es el nombre de la histona que hace que se compacten más los nucleosomas y se forme el solenoide?
Histona 1
¿Cuáles son las 2 formas en las que se puede encontrar la cromatina?
Eucromatina: Más laxa (transcribe más)
Heterocromatina: más compacta (transcribe menos)
¿Cuáles son los 6 mecanismos de regulación epigenética?
1.Metilación de DNA
2.Modificación de histonas
3. Intercambio de histonas
4.Formación de asas y conformación local
5.Remodelación de la cromatina dependiente de ATP
6.Determinación del destino celular
¿Cuál es la metilación más conocida?
La de citocinas en dinucleótidos CpG
¿Qué efecto tiene la metilación del DNA?
Hace que se compacte más por lo que reduce la probabilidad de que se transcriba el gen
¿Qué puede causar que una célula se vuelva cancerosa?
-La hipermetilación del gen supresor de tumores
-Hipometilación de otros genes
¿La metilación es irreversible?
No, así como existen metilaciones existen demetilaciones
¿Cuales son las 4 principales modificaciones de las histonas?
-Metilaciones
-Acetilaciones
-Ubiquitinaciones
-Fosforilaciones
¿Qué otras moléculas se ha observado que pueden modificar a las histonas?
Neurotransmisores
¿Qué efecto tiene la H3.3?
En vez de compactar el DNA reduce la interacción entre histonas haciendo una región más accesible para transcribirse
¿Qué hace la macro H2A?
Inactiva un cromosoma X en las hembras
¿De que manera la formación de asas modifica la expresión de genes?
Regula la expresión por interacción entre áreas lejanas lo que activa la transcripción
¿Cómo se forman asas?
un factor de transcripción se une a activador y forman bucle lo que hace que se reclute más fácilmente la polimeraza y se transcriba
¿Mediante que proceso se remodela la cromatina?
SWItch
¿Cuáles son las 3 formas en las que SWItch afecta a la cromatina?
-Eyectando un dímero de una histona
-Eyectando una histona
-Desplazando nucleosomas
¿Para qué SWItch afecta a la cromatina?
Para exponer cierta región del DNA
¿C on qué se ha relacionado la remodelación de la cromatina?
Con la función cognitiva
¿Qué factor se encarga de la determinación del destino celular neuronal o no neuronal?
REST
¿Cuáles son los 6 ejecutores de las modificaciones epigenéticas?
1.Metiltransferasas
2.Prot. modificadoras de histonas
3.Chaperonas intercambiadoras de histonas
4.Insulator
5.Complejos modificadores de la cromatina
6.Transcritos no codificantes
¿Qué efecto tienen las metiltransferasas?
Marcan con grupos metil el DNA
¿Cuáles son las proteínas modificadoras de histonas?
-Metiltransferasas
-Acetiltransferasas
-Desacetilasas
-Cinasas
¿Qupe hacen las proteínas insulator o delimitadoras?
Reconocen secuencia de DNA a la que se unen y forman una barrera para bloquear o facilitar la formación de asas
¿Las proteínas insulator soloa actúan en presencia de una cohesina?
No, pueden actuar con o sin cohesinas
¿Qué hacen los complejos modificadores de la cromatina?
Interactuan con el DNA y movilizan el nucleosoma para dejar el DNA descubierto o para bloquear otras secuencias
¿De qué forma actuan el complejo Polycomb y Trithorax en las neuronas Kisspeptinérgicas?
Polycomb bloquea el gen para kisspeptina durante toda la infancia y al quitarse + la acción de Trithorax se favorece la expresión del gen para neuronas kisspeptinérgicas
¿Qué son los transcritos no codificantes?
ARN no codificante y micro ARN que interviene a nivel transcripcional y post trasncipcional silenciando genes en el núcleo
¿Qué tamaño tienen los transcritos no codificantes?
menos de 200 pares de bases
¿Cuáles son los 3 marcadores epigenéticos más estudiados?
-Metilaciones de DNA
-Modificación de histonas
-Micro RNA
¿Cuáles son lso 2 espacios en el que pueden estar los cromosomas en el núcleo?
-Compartimento A
-Compartimento B
¿Cuáles son las características del compartimento A?
-Está en el centro
-Más factores de transcripción
-Más eucromatina
-Más activo transcripcionalmente
¿Cuáles son las características del compartimento B?
-En la periferia
-Tiene dominios asociados a la lámina
-Tiene territorios cromosomales
-Forma dominios topologicamente asociados
¿Qué son los dominios topológicamente asociados?
Formación de dominios gracias a proteínas arquitecturales que forma bucles lo quehace que se asocien regiones distales de DNA
¿Cuál es la importancia de la organización en 3D de los cromosomas?
Se ha observado que fallas en la organización pueden causar diferencias entre las interacciones de genes lo que se ha asociado con patologías
¿Qué mide la HI-C?
La frecuencia con la que 2 fragmentos de DNA se asocian fisicamente en el espacio 3D
¿Cuáles fueron las modalidades previas al HI-C?
-3C:Compara interacción 1 a 1
-4C:Compara interacción 1 al resto del genoma
-5C:Compara muchos con muchos
¿Qué interacciones compara HI-C?
Todos los genes con todos los genes
A grandes rasgos ¿cuáles son los pasos para la HI-C?
1.Se fija el DNA
2. Se hace digestión (se quitan excesos)
3. Se hace biotinilación
4. Se ligan fragmentos cortados
5. Se remueven fragmentos ligados
6. Perlas de biotina permite por PCR amplificar fragmentos
¿Las proteínas arquitecturales solo se encuentran en mamíferos
No, también se encuentran en otras especies menos desarrolladas
¿Los mecanismos epigenéticos ocurren como eventos aislados?
No, ocurren muchos al mismo tiempo
¿Cuál es la histona más estudiada?
H3
¿En qué parte de la histona se hacen las modificaciones epigenéticas principalmente?
En la “colita” de la histona
¿Qué es la Neuroepigenética?
El estudio de los mecanismos epigenéticos para explicar las Conductas adquiridas , Trastornos del SN, Plasticidad neuronal, Neurotoxicidad y Drogadicción
