Les Récepteurs Nucléaires Flashcards
Qu’est-ce qu’un récepteur nucléaire?
Un facteur de transcription
Comment classe-t-on les récepteurs nucléaires?
Ils se divisent en 7 sous-familles basés sur la ressemblance de leur séquence d’acides aminés
Quels sont les étapes générales du fonctionnement d’un RN?
1- Ligand (souvent lipophile) pénètre dans le noyau
2- Détection du signal par le domaine de liaison du ligand du RN
3- Reconnaissance du gène cible par le domaine de liaison à l’ADN du RN
4- Réponse transcriptionnelle
Quelles sont les caractéristiques des ligands de RN orphelins adopté?
- Liaison au ligand de faible affinité
- Les ligands sont des lipides d’origine alimentaire et de xénobiotiques
Quelles sont les caractéristiques des ligands des RN classiques?
- Leur liaison qui ligand est de haute affinité
- Les ligands dont des lipides hormonaux
Quelles sont les régions d’un RN (de N-terminale à C-terminale)
- AF-1
- DBD
- NSL
- LBD
- AF-2
Quelles sont les caractéristiques de la région AF-1?
- Structure primaire très variable
- De moins de 50 à plus de 600 acides aminés
- activité transactivatrice constitutive indépendante du ligand
- Sensibles aux modifications post-traductionnelles
Quelles sont les caractéristiques de la région DBD?
- structure bien conservée
- Liaison à l’ADN (P-box)
- Dimérisation
Quelles sont les caractéristiques de la région NLS?
- Région charnière flexibles
- Contient la séquence signal de localisation nucléaire
Quelles sont les caractéristiques de la région AF-2?
- Liaison au ligand
- Activité transactivatrice dépendante du ligand
- Dimérisation (forte)
- Structure secondaire : 12 hélice alpha
- Lie les coactivateurs
- Lie les protéines chaperonne Hsp
Quelle est la région du RN la plus variable?
Région AF-1 (elle varie en longueur de a.a et la séquence de ceux ci peut aussi varier)
Quel est le rôle de l’élément proximal du DBD?
Reconnaît le demi site de l’élément de réponse
Quel est le role de l’élément distal du DBD?
Impliqué dans al Dimérisation et la reconnaissance de la distance entre les demi-sites de l’élément de réponse
Quels sont les différent modes de liaisons à l’ADN des RN et quels sont leur éléments de réponse ?
- Sétoridiens : palindrome
- Hétérodimère de RXR : répétition directe
- Homodimère : répétition directe
Comment caractérisent-on la cavité de liaison du ligand?
- Hydrophobe
- Volume va varier selon le type de récepteur et le type de ligand
Quels sont les impacts de changements allostériques du LBD?
- Formation d’une pince électrostatique entre H12 et H3
- Cette pince expose une surface d’interaction avec les coactivateurs sur H12
- Les coactivateurs se lient via un motif LxxLL
- Donc un agoniste se décrit comme un ligand qui augmente l’interaction entre le LBD et le motif LxxLL d’un ou plusieurs coactivateur(s) et produit ainsi l’activation transcriptionnelle du récepteur nucléaire
Quels sont les conséquences d’une liaison d’un antagoniste sur le LBD?
- Un antagoniste positionne H12 pour compétition physiquement et bloquer l’accès de la pince électrostatique aux coactivateurs
- Un antagoniste peut également induire la formation d’une crevasse plus volumineuse entre H12 et H3
- L’antagoniste favorise le recrutement de corépresseurs au LBD, puisque la crevasse peut accommoder le segment LxxxlxxxL des co-répresseurs
Quels sont le mode d’activation des récepteurs stéroididens?
1- Complexe RN-hsp séquestré dans le cytoplasme
2- Dissociation des hsp et Dimérisation
3- La Dimérisation entraine une migration au noyau, le recrutement de co-activateurs et débutera la transcription des gènes
Quel est le mode d’activation des récepteur non stéroidiens?
1- Complexe RN-corépressuers présents sur la région promotrice du gènes cibles
2- Dissociation des corépresseurs et associations avec les coactivateurs (transcription des gènes cibles)
Quels sont les effets de la Dimérisation d’un récepteur?
Augmente l’affinité, la spécificité et la diversité de la liaison à l’ADN
Comment la transcription peut-elle être réprimée ?
Les RN associés aux corépresseurs recrutent des histones désacétylases. La désacétylation des histone conduit à la répression transcriptionnelle, puisque la chromatine est condensée
Comment peut-on décondenser la chromatine?
La liaison du ligand dissocie le complexe de répression et favorise l’association avec le complexe de co activation. Ce complexe comprend des co activateurs, qui ont une activité histones acétyltransférase permettant la décondensation de la chromatine suite à l’acétylation des histone
Quelles sont les caractéristiques des co activateurs?
-Plus de 200 protéines qui sont regroupées en différents complexes
- Activité HAT
- Certains ont une activité histone méthyltransférase (HMT)
- Possède la séquencée LxxLL
Pourquoi y a-t-il une diversité de coactivateurs?
1- Épissage alternatif
2- Spécificité de la réponse