La transcription et la réplication de l'ADN Flashcards

1
Q

Que code l’ADN des bactéries?

A

majoritairement pour des protéines

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2
Q

Quel est le pourcentage d’ADN qui code pour des protéines chez les eucaryotes? Comment s’apelle la portion qui les code?

A
  • 2% (donc minoritaire)
  • ADN codant
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Q

Quel est le rôle du reste de l’ADN chez l’eucaryote?

A
  • Code pour ARNr, ARN qui régule l’expression des gènes et finalement ARNt
  • participent à stabilité et diversité fonctionnelle de expression génétique
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4
Q

Quel est le genre de transcription de gènes auquel on s’intéresse?

A
  • ceux codant pour les protéines
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5
Q

Qu’est-ce que le gène?

A

une portion d’ADN qui contient les instructions nécessaires pour synthétiser une molécule fonctionnelle (généralement une protéine, mais aussi un ARNr, ARNt, etc) .

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6
Q

Quel ARN est crée suite à la transcription des gènes et que contient-il?

A

ARNm: a information génétique permettant synthèse protéique, porte message permettant synthèse de protéines

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7
Q

Qu’arrive-t-il à l’ARNm crée par la transcription des gènes codant pour les protéines?

A

traduit en protéines dans le ribosome

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8
Q

Quelle est la particularité du ribosome?

A

capable de reconnaître la séquence qui indique où doit démarrer la traduction, il s’agit du codon initiateur
(=codon AUG = codon start). Il existe aussi des codons de terminaison (=codon stop) qui indiquent au ribosome où doit arrêter la traduction.

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9
Q

Quel est l’autre concept qui montre une capacité de reconnaitre ou commence et ou finit un gène?

A

Transcription des gènes

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10
Q

Comment s’appelle le signal ADN disant ou démarrer la transcription des gènes pour les procaryotes et comment fonctionne-t-il?

A

Promoteur: situé en amont du gène
Au niveau de ce promoteur, va venir se positionner l’ARN polymérase qui est une enzyme qui va copier un des deux brins pour donner une copie sous forme d’ARNm

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11
Q

De quoi est composé le promoteur procaryote?

A

deux éléments principaux appelés boîtes TATA qui sont situés 10 nucléotides et 35 nucléotides en amont du codon initiateur

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12
Q

Ou s’installe le promoteur et comment avance l’ARN polymérase?

A

situé en amont du gène, sur l’extrémité 5’-P. L’ARN polymérase avance sur le gène, de l’extrémité 5’-P vers 3’-OH

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13
Q

Qu’est-ce que le brin codant et le brin matrice?

A
  • brin codant: Le brin qui contient l’information génétique (le gène)
  • brin matrice (ou non-codant): Le brin complémentaire au brin codant
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14
Q

Comment l’ARN polymérase lit l’information?

A

lit l’ADN du brin matrice (ou non codant) dans le sens 3’-OH vers 5’-P et construire l’ARNm par complémentarité de bases avec le brin matrice

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15
Q

Quelle est la différence entre l’ADN et l’ARNm?

A

les thymines (T) sont remplacées par des uraciles (U) dans l’ARNm, sinon identique

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16
Q

Que sont les NTP et quelles sont leurs fonctions?

A

Nucléotides triphosphates: source d’énergie et de nucléotide pour faire réaction de transcription des gènes

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17
Q

Quelle est la vitesse de transcription chez les Procaryotes?

A

50 à 100 nucléotides
par seconde

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18
Q

Quel est le type de liaison formé par le ARN polymérase après la réaction?

A

Liaison phosphodiester

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19
Q

Que marque la séquence qui marque la fin de la transcription des gènes chez les procaryotes

A

le terminateur

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20
Q

Quel est le processus marquant la fin de la transcription des gènes chez les propro

A

Lorsque l’ARN polymérase rencontre la séquence terminatrice, la polymérase se détache de l’ADN et libère l’ARNm

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21
Q

Quels sont les types d’ARN polymérases différentes chez les Eucaryotes?

A
  • ARN polymérase I, présente dans le nucléole, permettant la transcription des ARNr
  • L’ARN polymérase II est responsable de la transcription des ARNm
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22
Q

Quelles sont les différences de transcription des eucaryotes avec les procaryotes

A

L’ARN polymérase II n’est pas capable seule de reconnaître le promoteur, elle a besoin de protéines qu’on appelle facteurs de transcription qui vont reconnaître en premier le
promoteur et s’assembler entre eux.
Une fois les facteurs de transcription assemblés sur le
promoteur, l’ARN polymérase II est recrutée et la transcription peut démarrer.

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23
Q

Comment se réalise la fin de la transcription chez les eucaryotes?

A
  • grâce à une séquence sur l’ADN appelée signal de polyadénylation AAUAAA souvent répétée.
  • l’ARN polymérase II reconnaît ce signal et la transcription s’arrête généralement 10 à 30
    nucléotides après le signal de polyadénylation, libérant le transcrit et l’ARN polymérase.
24
Q

Est-ce que comme les procaryotes on obtient directement un ARNm?

A

non, le transcrit n’est pas directement appelé ARNm après sa transcription car des étapes de maturation dans le noyau sont
nécessaires avant d’obtenir un ARNm qui sera traduit en
protéines dans le cytoplasme

25
Q

Quelle est la première étape pour la maturation de l’ARN menant à la production d’ARNm

A
  • coiffe est ajoutée à l’extrémité 5’ de l’ARN pré-messager; protège ARN de dégradation par nucléases-enzyme dégradant acides nucléiques-et facilite liaison de ARNm aux ribosomes pour trad. participe aussi à l’export de ARNm hors du noyau.
26
Q

Quelle est la deuxième étape pour la maturation de l’ARN menant à la production d’ARNm

A
  • ajout queue poly-A (vient se fixer sur extrémité 3’ de l’ARN et ajt 100-250 adénines. joue rôle dans protection de l’ARN contre les enzymes de dégradation et participe au mécanisme d’Export de ARNm hors du noyau.)
27
Q

Quelle est la troisième étape pour la maturation de l’ARN menant à la production d’ARNm

A
  • Épissage de l’ARN:
    Chaque gène contient des régions que l’on appelle introns et exons :
  • Un exon est une portion transcrite et codante du gène qui contient l’information génétique
    pour produire les protéines. Ce sont les exons que l’on retrouve sur l’ARNm
  • Un intron est une séquence non codante du gène qui sont transcrits puis retirés (=on dit
    excisés) de l’ARN lors du processus de maturation de l’ARN. On parle d’épissage
28
Q

qu’Est-ce que le processus d’épissage

A

processus d’excision et de réarrangement de l’ARN pré-messager

29
Q

qu’est-ce que le complexe d’épissage

A

aussi appelé splicéosome constitué de protéines et de petites molécules d’ARN. Ce complexe se lie a plusieurs courtes séquences de nucléotides le long d’un intron, y compris les séquences clés situées à chaque extrémité
L’intron est ensuite libéré et dégradé. Le complexe
d’épissage réunit les deux exons qui étaient à l’extrémité de l’intron excisé.

30
Q

Quelle est la conséquence importante de la présence des introns

A

Ils permettent à un gène unique de produire plusieurs protéines différentes. Selon le contexte
cellulaire ou les besoins de l’organisme, certains exons sont inclus ou exclus de l’ARNm. Cette régulation est permise grâce au complexe d’épissage (spliceosome).

31
Q

Que permet l’épissage alternatif?

A
  • permet à un gène de coder pour
    plusieurs protéines ayant des
    fonctions, des localisations
    cellulaires ou des régulations
    différentes.
  • permet d’augmenter la diversité des produits génétiques :
    L’exon peut être sauté cad qu’un exon est enlevé de l’ARNm, modifiant ainsi la séquence codante ou encore, des exons peuvent être mutuellement exclusifs cad que si l’un est inclus, l’autre est exclu.
32
Q

Qu’est-ce que la division cellulaire?

A

processus par lequel une cellule mère se divise pour former deux cellules filles, et c’est un mécanisme fondamental pour la croissance, la réparation des tissus, et la reproduction des organismes.

33
Q

quelle est l’étpe fondamentale avant la division cellulaire ne se produise

A

la cellule doit copier son ADN dans un processus appelé réplication de l’ADN

34
Q

Quels sont les 3 modèles qui ont tenté d’expliquer la réplication de l’ADN

A
  • Le modèle conservateur: (les deux brins parentaux de l’ADN restaient ensemble après la réplication et nouveau deux brins d’ADN était synthétisé)
  • Le modèle semi-conservateur: (chaque brin d’ADN de molécule parentale sert de modèle (ou matrice) pour la synthèse d’un nouveau brin)
  • Le modèle dispersif ADN se fragmentait en petits segments avant réplication, chaque servant de matrice pour de nouveaux segments. Après la réplication, l’ADN serait constitué de segments mélangés d’ADN ancien et nouveau le long de chaque brin
35
Q

Quelle est la bonne hypothèse pour la réplication

A

modèle semi-conservateur

36
Q

comment se passe la réplication chez les bactéries

A
  • La réplication de l’ADN commence au site appelé origine de réplication. Il s’agit d’un court segment d’ADN riche en paires de nucléotides AT
  • La synthèse du nouveau brin se fait du sens 5’-P vers 3’-OH dans les deux sens car la double hélice d’ADN est orientée de façon antiparallèle
  • La zone où le complexe protéique commence à répliquer l’ADN est appelé fourche de réplication.
  • Ainsi, on aura deux fourches de réplication qui s’opposent lors de la réplication de l’ADN bactérien
37
Q

comment se passe la réplication chez les eucaryotes

A
  • Eucaryotes ont plusieurs origines de réplications permettant la séparation facilitée des brins d’ADN et le démarrage simultané de la réplication à plusieurs endroits.
  • Lorsque deux fourches entrent en contact, ils fusionnent les deux extrémités du brin nouvellement formé, ce qui accélère le recopiage des molécules d’ADN
38
Q

Qu’Est-ce que l’hélicase?

A
  • enzyme impliquée dans la
    séparation des deux brins complémentaires de
    l’ADN parental.
  • En utilisant de l’ATP, cette protéine, rompt les liaisons hydrogène entre les bases azotées.
  • Cela permet de rendre ainsi ces deux brins disponibles pour servir de brins matrice
39
Q

Suite a la séparation des deux brins d’ADN que fait-on pour éviter que les bases nucléiques s’apparient à nouveau?

A

de petites protéines appelés SSB vont se fixer sur chaque brin d’ADN

40
Q

Comment évite-t-on le surenroulement de l’ADN lors de la séparation des brins

A

La topo-isomérase (ou ADN gyrase) est une enzyme qui
est localisée en amont de la fourche de réplication et qui
va diminuer les tensions d’enroulement de l’ADN en
clivant puis en liant à nouveau le brin
Avant de lier à nouveau le brin, elle le fait tourner sur lui-même pour diminuer le nombre d’enroulements

41
Q

Quelles sont les enzymes responsables de la synthèse du nouveau brin d’ADN chez les bactéries?

A

l’ADN polymérase I, la primase et l’ADN polymérase III

42
Q

qu’ont besoin les ADN polymérases pour démarrer la synthèse

A

courte séquence d’ARN appelée amorce ainsi qu’une extrémité 3’-OH libre

43
Q

qui synthétise l’amorce?

A

l’enzyme primase qui est capable, seule, de synthétiser une courte chaîne d’ARN complémentaire en
se servant du brin parental comme matrice

44
Q

Quel est le rôle de l’ADN polymérase III

A
  • L’ADN polymérase III avance uniquement sur le brin parental de l’extrémité 3’-OH vers l’extrémité
    5’-P
  • Elle synthétise un brin qui va de l’extrémité 5’ vers l’extrémité 3’.
  • Ce brin synthétisé qui va en direction de la fourche de réplication est appelé brin directeur
45
Q

Que se passe-t-il pour le brin d’en dessous si l’ADN polymérase ne peut avancer que de 3’ vers 5’ ?

A

Il y a une discontinuité dans la synthèse de ce brin d’ADN. On l’appelle le brin discontinu. Les
petits fragments d’ADN produits sont appelés fragments d’Okazaki

46
Q

qu’est-ce que le brin directeur?

A

Dans chaque fourche de réplication, il y a un brin qui est continu (1 seule amorce pour initier la réplication de l’ADN). C’est le brin qui s’allonge vers son extrémité 3’

47
Q

Pourquoi on appelle l’autre brin discontinu

A

son sens de prolongement est opposé à la direction de la fourche.
Pour permettre la réplication, de courts segments sont synthétisés; on parle des fragments d’Okazaki.

48
Q

Quelles sont les étapes de synthèse du brin discontinu?

A

1) La primase créé de nombreuses amorces d’ARN 5’ vers 3’ en direction de la fourche de réplication.
2) L’ADN polymérase III reconnait les amorces d’ARN et synthétise un brin d’ADN de 5’ vers 3’
3) L’ADN polymérase I est capable de reconnaître et d’éliminer l’amorce d’ARN et de la remplacer par de l’ADN en avançant de 5’ vers 3’
4) La ligase permet de lier les fragments entre eux

49
Q

Quelle est la particularité de l’ADN polymérase?

A

L’ADN polymérase a la capacité lors de la synthèse du nouveau brin d’ADN, de détecter l’ajout de
la mauvaise base et de corriger cette erreur. On parle d’activité de relecture. Cette activité est commune à de nombreuses ADN polymérases et est plus efficace chez les Eucaryotes

50
Q

comment se fait l’activité de relecture

A

L’ADN polymérase recule en allant de 3’ vers 5’ pour retirer la mauvaise base. Le retrait de base est permis grâce à une fonction qu’on appelle activité exonucléase (ici activité exonucléase 3’ vers 5)

51
Q

Qu’arrive-t-il si l’adn polymérase ne corrige pas l’erreur

A

D’autres enzymes interviennent pour enlever les paires de bases mal appariées et les remplacer.
Des anomalies héréditaires sur les gènes codant ces enzymes mène à l’augmentation du taux de cancers.

52
Q

Pourquoi la réplication d’un brn retardé pose probleme pour l’adn eucaryote

A

Eucaryotes ont un ADN linéaire ce qui signifie qu’ils ont deux extrémités; ADN polymérase I doit disposer séquence d’ADN en amont pour pouvoir remplacer l’ARN de l’amorce en ADN.
ADN est de plus en plus raccourci au niveau des extrémités de l’ADN
à chaque fois que l’ADN est répliqué, soit à chaque division cellulaire.

53
Q

Le brin retardé n’est pas un problème pour les procaryote pk?

A

ont un ADN circulaire ce
qui fait que l’ADN n’a pas d’extrémités. Ils peuvent se
diviser à l’infini sans craindre de raccourcir leur ADN.

54
Q

Qu’Est-ce que les télomères

A
  • structures protectrices situées aux extrémités des chromosomes.
    Composés de séquences répétitives d’ADN non codant (chez l’humain, cette séquence est
    généralement “TTAGGG”), ils forment une sorte de “couvercle” qui empêche la dégradation et
    la fusion des chromosomes entre eux.
  • Leur fonction principale est de protéger l’ADN des cellules contre la perte d’informations génétiques au cours des divisions cellulaires successives.
55
Q
A