Koblingsanalyse Flashcards
Hvad er en haplotype?
Allelkombination på hvert kromosom
Hvad er genetisk afstand?
Rekombinationsfrekvens (måles i centimorgan)
Hvad er en centimorgan?
ca 1 % rekombinationssandsynlighed, omkring 1 Mb.
Hvad betyder begrebet syntenic?
På samme streng
Definer LOD score:
Log(sandsynlighed for observerede data hvis der er kobling/sandsynlighed for observerede data hvis der ikke er kobling)
> 3 sandsynligvis kobling
Informativ mating
når der kan konkluderes noget ud fra resultater fra koblingsanalyse
Koblingsuligevægt
Forekomsten af to gener der optræder samtidigt er anderledes end den man regner med ud fra teoretiske frekvenser.
Kobling:
Grundet genetisk afstand (mindre end 50 cM) nedarves to gener sammen.
Hvad er association?
Når to træk i befolkningen ses oftere sammen end det ville være tilfældet hvis man kun kigger på sandsynligheden.
Fx koblingsuligevægt
Hvad er mapping?
Præcisering af et gens placering på genomet.
Hvad er et GWAS?
Genome wide association study. Sammenligning af SNP’er i syge og ikke sygo populationer.
Hvad er rekombination?
Fremstilling af nye haplotyper via overkrydsninger i meiosen.
Hvad er gør et markørlocus godt?
høj grad af polymorfisme
Hvor mange basepar varierer fra person til person?
ca 2 mio.
Kandidatområde:
Et område som man er ret sikker på et bestemt gen ligger inden for.
