Isolasi DNA Bakteri, Cendawan, Tanaman

Question 1

Bakteri yang digunakan

Answer 1

Escherichia coli dan Staphylococcus aureus

Question 2

Cendawan yang digunakan

Answer 2

Rhizopus oryzae dan Aspergillus brasiliensis

Question 3

Pada bakteri langkah yang dilakukan sebelum inkubasi

Answer 3

Diambil koloni di media miring menggunakan ose dan ditaruh di 500 mikroL ddH2O sentrifuse 10.000 rpm 20C 5 menit (diulang 2 kali) kemudian peletnya diambil dan ditambahkan 600 mikroL buffer CTAB kemudian divortex

Question 4

Pada cendawan langkah yang dilakukan sebelum inkubasi

Answer 4

Ambil menggunakan tusuk gigi cendawan diatas membran kemudian digerus menggunakan pestle kemudian ditambahkan 600 mikroL buffer SDS

Question 5

Waktu suhu inkubasi

Answer 5

65C 30 menit (setiap 10 menit dibolak balik

Question 6

volume C:I yang ditambahkan dan volume PCI yang ditambahkan

Answer 6

1. C:I 600 mikroL
2. P:C:I 1x volume supernatan

Question 7

DNA barcoding merupakan suatu teknik molekuler untuk

Answer 7

mengidentifikasi spesies dengan memanfaatkan 600-800 pasang basa segmen primer genetik gen mitokondria sitokrom oksidase I

Question 8

Primer yang diguanakan dalam DNA barcoding cendawan

Answer 8

ITS 1 F
ITS 4 R

Question 9

Primer ITS-1F dan ITS-4 memiliki spesifisitas untuk jamur

Answer 9

ascomycet, basidiomycet, dan zygomycet

Question 10

Gen 16S rRNA bersifat universal untuk bakteri sehingga

Answer 10

dapat mengukur hubungan filogeni antar spesies bakteri karena perbandingan urutan gen 16S rRNA memungkinkan diferensiasi antar organisme di tingkat genus dan spesies.

Question 11

Fungsi inkubasi 65C 30 menit di heatblock

Answer 11

Mengoptimalkan proses pelisisan sel dan memaksimalkan keluarnya DNA dari sel

Question 12

Larutan yang digunakan untuk proses pelisisan sel DNA cendawan

Answer 12

Buffer SDS

Question 13

Berapa volume buffer CTAB dan SDS yang ditambah saat proses isolasi DNA

Answer 13

600 mikroL

Question 14

Apakah larutan yang digunakan pada tahapan purifikasi DNA

Answer 14

Chloroform : Isoamylalcohol

Question 15

Fungsi dari penambahan EtOH 70% pada saat isolasi DNA

Answer 15

Pencucian DNA

Question 16

Jika volume supernatan yang diambil adalah 550 mikroL maka berapa jumlah volume penambahan larutan P:C:I

Answer 16

550 mikroL

Question 17

Berapa jumlah volume dan konsentrasi larutan RNAse yang digunakan

Answer 17

0,2x dan 1 mg/mL

Question 18

Berapa suhu dan waktu yang digunakan untuk sentrifugasi sampel DNA setelah tahapan freezer overninght

Answer 18

4C 25 menit

Question 19

Urutan isolasi DNA

Answer 19

liat papan

Question 20

Tumbuhan yang digunakan (1) dan digerus menggunakan (2)

Answer 20

1. Tembakau dan Nanas sebanyak 0,1 gram
2. N2 cair