Introduktion till virologi + virusinteraktioner

Question 1

Vilka är teorierna till hur virus uppkom?

Answer 1

1. Utbruten cellulär gen (transposon/plasmid) Liknande genetiska fragment.
2. Förstadie till celler

Question 2

Vad består en viruspartikel av?

Answer 2

Hölje, tegument, kapsid och en kärna.

Question 3

Vad innebär obligat intracellulär parasit?

Answer 3

Viruset behöver en värdecell för att kunna överleva.

Question 4

Vilka konfirmationer kan viruskapsiden anta?

Answer 4

Helikala, polyhelikala och komplexa.

Question 5

Vad är icosahedral kapsidstruktur?

Answer 5

Bildas då flera proteiner går ihop och bildar kapsiden.

Question 6

Vad är ett icke-höljebärande virus?

Answer 6

Proteinstruktur som innesluter genomet.Kan inta olika strukturer m.h.a. kapsomerer. De är tåliga för uttorkning, syra. Finns i vår mag- och tarmkanal.

Question 7

Vad är höljebärande virus?

Answer 7

Ett yttre höljde beståendes av cellulära membran som är känsligt för uttrokning då det används vid virus-cell-interaktioner. Dessa sorters virus sprids ofta via droppsmitta, kroppsvätskor m.m.

Det yttre membranet består av glykoproteiner som har som funktion att binda till värdcell antigen-site samt fusion (flera virus sitter ihop). Matrixprotein täcker insidan av höljet som fungerar som ett skelett.

Question 8

Vilka övriga viruskomponenter krävs för en replikation?

Answer 8

Polymeraser, integraser, topoisomeraser, histoner, endonukleaser m.m.

Question 9

Hur sker virusklassifikationen?

Answer 9

a) DNA eller RNA, ss eller ds samt polaritet.
b) kapsidsymmetri (helikal/kubisk/komplex)
c) Hölje eller inte?

Sorteras sedan i familj –> genus –> typ –> stam

Question 10

Vad slutar familjenamnet med?

Answer 10

• viridae

Question 11

Va slutar genusnamnet med?

Answer 11

• virus

Question 12

Vad har man för användning av virusgenetik?

Answer 12

1. Förstå/förklara patogenes
2. Spåra infektioner
3. Utveckling av vaccin och läkemedel

Question 13

Vad är kvasiespecies?

Answer 13

Avkommor får olika mutationer från ett virus. De konkurrerar men alla dessa olika varianter, de som inte fungerar bryts ner.

Question 14

Vad menas med selektionstryck?

Answer 14

Viruset är åtkomligt för antikroppar. Selektionstrycket från antikroppar favoriserar mutanter som antikropparna inte känner igen. Immunförsvaret får svårt att täcka upp alla typer av virus. De virus som muterar ytproteinerna överlever.

Question 15

Vad menas med fylogeni?

Answer 15

Fylogeni är en hypotes som säger att alla organismer är besläktade. Man kan använda sig av rotade respektive icke-rotade träd för att kartlägga släktskap.

Question 16

Hur ser rekombination ut i virus?

Answer 16

Om två virus infekterar samma cell kan de om de är homologa, överkorsas och det blir en rekombination.

Question 17

Vad kan hända med ett virusprotein om det uppstår en additions/deletions mutation?

Answer 17

Frame-shift blir annorlunda och hela avläsningen inom läsramen blir annorlunda. Viruset kan antingen dö eller ge uttryck till helt andra gener.

Question 18

Vad kan hända med ett virusprotein om det uppstår en punktmutation?

Answer 18

Frame-shift blir annorlunda och hela avläsningen inom läsramen blir annorlunda. Viruset kan antingen dö eller ge uttryck till helt andra gener.

Question 19

Hur kan man framkalla mutationer?

Answer 19

kan ske genom kemisk väg (kemikalier kan påverka vissa nukleotider och därmed orsaka mutationer på vissa baser), UV-strålning, oxidativ stress samt molekylär biologiskt.

Question 20

Vad menas med reassortment?

Answer 20

Sker när två olika virus infekterar samma cell. Blir flera olika mutationer som blir kombinationer av de två virus.

Question 21

Vad menas med fenotypisk blandning?

Answer 21

När två närbesläktade virus infekterar samma cell. Leder till virion: viruset har fått med sig komponenter från det andra viruset.

Question 22

Beskriv händelseförloppet för en infektion.

Answer 22

1. Viruspartikeln kommer att binda till receptorer på värdcellen.
2. Virusgenomet kommer in i cellen.
3. Virusets hölje och kapsid bryts ner så att DNA/RNA (virusgenomet) är fritt inne i cellen.
4. Virusets DNA bryter ner och inhiberar cellens kromosomer och genom, så att cellen bara tillverkar virusproteiner.
5. Nya virusgenom bildas och proteinerna kommer att syntetiseras av virusgenomet.
6. En spontan sammanfogning kommer att ske mellan nukleinsyrorna och proteinbyggstenarna. Detta är en mer fördelaktig konfiguration, ur energisynpunkt. Resultatet blir nya viruspartiklar.
7. Cellen kommer att lysera och på så sätt släpps nya viruspartiklar ut.

Question 23

Vilka är faserna under virustillväxt?

Answer 23

1. Adsorptionsfasen
2. Penetration
3. Transport
4. Avklädning av DNA
5. Värdcellens egna syntes stängs av
6. Virusproteiner uttryck
7. Slutligen får man proteiner och virusgenom som sätt samman till nya virioner
8. Frisättning från värdcell

Question 24

Beskriv vad som händer i adsorptionsfasen.

Answer 24

Sker mellan VAP och receptorn på värdcellen (som har hög bindningsspecifitet).
Bindningen förstärks genom att fler receptorer binder in, denna bindning är temperaturberoende.

Question 25

Vad är VAP i höljebärande virus?

Answer 25

Glykoproteiner

Question 26

Vad är VAP i icke-höljebärande virus?

Answer 26

Kapsomerer

Question 27

Vad innebär djurspecifitet?

Answer 27

Protein som är specifikt för ett visst djur som viruset binder till: ex. polio

Question 28

I vilket avseende varierar receptorförekomst och receptortäthet?

Answer 28

- Djurslag - Vilket organ cellerna kommer från - Cellernas differentieringsgrad

Question 29

Varför blir inte alla som exponeras för vinterkräksjukan sjuka?

Answer 29

De som inte blir sjuka saknar attachmentfactor eller ligand så viruset kan binda till receptorn.

Question 30

Vad menas med attachmentfactor?

Answer 30

Enbart inbindning av viruset på cellen, inget annat händer.

Question 31

Vad är en co-receptor?

Answer 31

Co-receptorn är den sekundära receptorn som kommer hjälpa till att binda in viruset närmare membranet på värdcellen. Är dock inte nödvändig för infektionen.

Question 32

Beskriv penetrationsfasen hos höljebärande respektive icke-höljebärande virus.

Answer 32

Höljebärande: Binder in till receptorn och fuserar. Vissa har två separata höljeproteiner för detta, men vissa har ett och samma höljeprotein för både inbindning och fusion. Icke-höljebärande: Viruset bildar en endosom (vesikel) som tar sig in i cellen. Hamnar antingen i cytoplasman eller kärnan beroende på om det är DNA eller RNA.

Question 33

Beskriv syntesfasen.

Answer 33

Här sker relikation av virusgenomet som exempelvis icke-strukturella proteiner, reverse transkriptas, RNA-beroende RNA polymeras. Sker även syntes av strukturella proteiner som höljeproteiner, kapsomerer, mRNA m.m. Allt ovan nämnt är sådant som följer med viruset. DNA-virus: replikation av genomet i cellkärnan. RNA-virus: virusets RNA-beroende RNA polymeras kommer att göra ett antigenom som blir ett templat.

Question 34

När enkelsträngade RNA-virus replikeras så uppstår ett problem. Vilket? Hur löser viruset problemet?

Answer 34

Vid positiv och negativ strand finns hög affinitet, blir stopp i replikationen om de sitter för hårt då +RNA inte kan gå vidare till replikationen. Lösning: man gör få kopior av -, för att använda +RNA fler gånger.

Question 35

Vad är (+) Positive strand och (-) Negative strand?

Answer 35

(+) Positive strand: RNA har startkodon och fungerar som mRNA (-) Negative strand: RNA är komplementärt till (+)RNA och fungerar ej som mRNA.

Question 36

Vad är sammanfogningsfasen?

Answer 36

Proteinerna som syntetiserats och genomet som har replikerats sätts samman till nya virioner.

Question 37

Beskriv frigörelsefasen för höljebärande respektive icke-höljebärande virus.

Answer 37

Icke-höljebärande virus lyserar cellen. Så pass många viruspartiklar bildas att cellen spricker. Höljebärande virus: Avknoppning av golgiapparat eller cellmembran. Detta gör dessa virus till höljebärande.

Question 38

Vad menas med primär cellkultur?

Answer 38

Celler som plockas direkt från ett organ.

Question 39

Vad menas med diploid cellkultur?

Answer 39

Cellerna delar sig i odlingsflaskor, men växer inte i en evighet.

Question 40

Vad menas med transformerad cellkultur?

Answer 40

Cellerna växer i evighet, ex. cancerceller.

Question 41

Vad menas med virusorsakad cellulär transformation?

Answer 41

Vissa virus innehåller genom som ändrar konfirmationen av cellen.

Question 42

Vad menas med en latent virusinfektion?

Answer 42

Lever i symbios med värdcellen, där genomet antingen är integrerat med värdecellens eller så är genomet extrakromosomalt. Viruset kan sedan övergå till lytisk cykel. E. vattkoppor och herpes.

Question 43

Vad är viroplexis?

Answer 43

Icke-höljebärande virus har en membranblåsa när de kommer in i cellen, som de måste snabbt bli av med, vilket de gör genom att sänka pH-värdet. Liknas fagocytos.

Question 44

Vad menas med onkolatenta virusinfektioner?

Answer 44

Onkogener är gener som kodar för felaktigt protein. Detta virus som ger dessa onkogener kommer ligga i kroppen latent (symbios med värdcellen) tills den vill uttrycka sig --> ger felaktiga proteiner --> cancer