Introduction aux virus eucaryotes

Question 1

De quoi est formé l’hôte eucaryote au niveau cellulaire?

Answer 1

• Noyau
• Organites
• Mécanismes de sécrétion et d’import complexes et précis
• Gros génome

Question 2

De quoi est formé l’hôte eucaryote au niveau organisme?

Answer 2

• Souvent pluricellulaire
• Compartimenté (tissus)
• Phases de vie complexes
• Grande diversité de structures
• Grandes différences entre les espèces

Question 3

Quelles informations sont codées dans un génome viral?

Answer 3

Les produits de gènes et les signaux de régulation nécessaires pour:
- la réplication du génome
- l’assemblage et l’emballage du génome
- la modulation des défenses de l’hôte
- la régulation et la cinétique du cycle de réplication
- la propagation à d’autres cellules et hôtes

Question 4

Quelles informations ne sont pas codées dans un génome viral?

Answer 4

• pas de gènes ou de reliques évolutives de gènes permettant la synthèse des protéines
  -pas de gènes codant pour des protéines du métabolisme énergétique ou la biosynthèse de la membrane
  -pas de télomères ou de centromères

Question 5

Qu’est-ce que la classification de baltimore?

Answer 5

Les génomes viraux ne codent pas les mécanismes nécessaires pour réaliser la synthèse des protéines. Tous les génomes viraux doivent être copiés pour produire l’ARNm qui peut être lu par les ribosomes de l’hôte.

Le système de classification Baltimore met en évidence la relation obligatoire entre le génome viral et son ARNm et décrit les voies de formation de l’ARNm qui doivent être suivies par les virus.

Avec cette méthode, tous les virus peuvent être classés en sept types principaux de génomes viraux et moins de 10 voies de formation de l’ARNm

Question 6

Comment fonctionne la classification de baltimore?

Answer 6

Brin + contient des informations immédiatement traduisibles
Un brin d’ADN qui est de la séquence équivalente est également désigné comme un brin positif
Les ARN et l’ADN complémentaires du brin positif sont désignés comme des brins négatifs
En connaissant la nature du génome viral, on peut déduire les étapes de base qui doivent avoir lieu pour produire l’ARNm

Question 7

Qu’est-ce qu’un virus à ARN?

Answer 7

Un virion avec un génome composé d’ARN
Le premier virus décrit était un virus à ARN (TMV, 1892)
Les virus à ARN sont responsables de maladies humaines telles que le sida, la poliomyélite, la grippe, la rage, l’Ebola et le rhume

Question 8

Combien de prix Nobel sont liés à l’étude des virus à ARN?

Answer 8

9 Prix Nobel sont liés à l’étude des virus à ARN. Ce travail a produit:
-un aperçu du rôle des virus à ARN causant des maladies importantes
-a conduit au développement de nouveaux outils de biologie moléculaire (transcriptase inverse)
-et a la technique du “gene silencing” (l’interférence ARN)

Question 9

Quelle est la différence fondamentale entre les virus à ARN et à ADN?

Answer 9

Pour la plupart des virus à ADN, la synthèse d’ARNm est réalisée par l’enzyme cellulaire qui produit les ARNm de la cellule, soit, l’ARN polymérase II

En revanche, les cellules ne possèdent pas de mécanismes connus pour copier des gabarits d’ARN viraux et en produire des ARNm viraux.

Alors, les génomes à ARN viraux doivent coder pour une polymérase d’acide nucléique pour la réplication de leur génome et la synthèse de leurs ARNm

Question 10

Qu’est-ce que la taxonomie des virus à ARN?

Answer 10

• domaine Riboviria: 2 royaumes, 6 phyla, 21 classes, 29 ordres, 111 familles, 934 genres, 3850 espèces de virus depuis 2022
• 41 % des « espèces » virales sont des virus avec des génomes d’ARN
• La majorité des virus à ARN ont des génomes à ARNsb +

Question 11

Quelles sont les caractéristiques générales des virus à ARN?

Answer 11

En comparaison des virus à ADN, les virus à ARN infectent plusieurs espèces de plantes et moins d’espèces de bactéries

Il n’y a pas de rétrovirus connu qui infecte les bactéries

Question 12

Quelles sont les morphologies diversifiées des virus à ARN?

Answer 12

Icosaédrique, aucune enveloppe

Hélicoïdale, aucune enveloppe

Complexe, avec enveloppe

Question 13

Quelle est la caractéristiques générale ne terme de taille pour les virus à ARN?

Answer 13

Les virus à ARN les plus grands sont beaucoup plus petits que le plus grand virus à ADN
Les génomes varient en taille de 1,7 à 31 kb

Question 14

Comment peuvent être les génomes des virus à ARN?

Answer 14

Les génomes des virus à ARN peuvent être:
- db, sb +, sb - ou ambi-brin
- ARN lié de manière covalente à une protéine - linéaire
- circulaire
- segmenté
La structure du génome détermine le procédé de réplication et l’encapsidation

Question 15

Quelle est la structure du génome?

Answer 15

Les génomes de virus ne sont pas des structures unidimensionnelles
Par exemple, la structure secondaire du génome du poliovirus est indispensable à la traduction du génome

Question 16

Quelle est la stratégie de réplication?

Answer 16

Les cellules n’ont aucun moyen de reproduire l’ARN à partir d’un gabarit d’ARN Deux stratégies ont évolué pour résoudre ce problème:
-certains virus à ARN codent pour une ARN polymérase dépendante de l’ARN (RNA dependent RNA polymerase («RdRp»)) qui produit l’ARN à partir de gabarits d’ARN

-certains virus transcrivent à l’inverse leur génome d’ARN en ADNdb, qui peut être transcrit par l’ARN polymérase de l’hôte

Question 17

Comment se fait la réplication des ARN sb+?

Answer 17

Le génome peut être traduit directement en protéine(s) par les ribosomes de l’hôte

Pendant la réplication:
-le brin + est copié en un brin - de pleine longueur
-dans certains cas, un ARNm sous génomique est produit

Le génome est une molécule unique. Les génomes codent pour les ARN polymérases virales nécessaires pour répliquer les génomes et synthétiser les ARNm

Le plus souvent, une polyprotéine est produite et clivée en protéines individuelles par des protéases

Question 18

Comment se fait la réplication des ARN sb-?

Answer 18

Les virions contiennent une RdRp

Les génomes brins - ne peuvent pas être traduits directement en protéines, mais doivent d’abord être copiés en brin + par la RdRp

L’ARNm est traduit en protéines virales, et copié pour produire les génomes d’ARN négatif

Le génome peut être soit une molécule simple (non segmenté) ou segmentée

Des ARNm avec une coiffe en 5’ et une queue de poly A sont produits par la polymérase virale

L’épissage de l’ARNm alternatif

Les orthomyxovirides ont un mécanisme de «cap-snatching» pour amorcer la traduction

Les orthomyxovirides se répliquent dans le noyau

Question 19

Comment se fait la réplication des ARN db?

Answer 19

Bien que les virus à l’ARNdb contiennent un brin +, ils ne peuvent pas être traduits dans sa forme duplex

Le brin - du duplex est copié en un ARNm par la RdRp virale pour produire les protéines virales

L’ARNm nouvellement synthétisé est encapsidé puis copié pour produire l’ARNdb

Les génomes de réovirides sont segmentés (10 segments)

La RdRp et d’autres enzymes nécessaires à la synthèse de ARNm sont encapsidées dans la particule virale

L’ARNm monocistronique est unique et copié à partir de chaque segment d’ARN

L’ARNm a une coiffe en 5’ et n’a pas de queue poly A