Introduction aux virus eucaryotes Flashcards
De quoi est formé l’hôte eucaryote au niveau cellulaire?
- Noyau
- Organites
- Mécanismes de sécrétion et d’import complexes et précis
- Gros génome
De quoi est formé l’hôte eucaryote au niveau organisme?
- Souvent pluricellulaire
- Compartimenté (tissus)
- Phases de vie complexes
- Grande diversité de structures
- Grandes différences entre les espèces
Quelles informations sont codées dans un génome viral?
Les produits de gènes et les signaux de régulation nécessaires pour:
- la réplication du génome
- l’assemblage et l’emballage du génome
- la modulation des défenses de l’hôte
- la régulation et la cinétique du cycle de réplication
- la propagation à d’autres cellules et hôtes
Quelles informations ne sont pas codées dans un génome viral?
- pas de gènes ou de reliques évolutives de gènes permettant la synthèse des protéines
-pas de gènes codant pour des protéines du métabolisme énergétique ou la biosynthèse de la membrane
-pas de télomères ou de centromères
Qu’est-ce que la classification de baltimore?
Les génomes viraux ne codent pas les mécanismes nécessaires pour réaliser la synthèse des protéines. Tous les génomes viraux doivent être copiés pour produire l’ARNm qui peut être lu par les ribosomes de l’hôte.
Le système de classification Baltimore met en évidence la relation obligatoire entre le génome viral et son ARNm et décrit les voies de formation de l’ARNm qui doivent être suivies par les virus.
Avec cette méthode, tous les virus peuvent être classés en sept types principaux de génomes viraux et moins de 10 voies de formation de l’ARNm
Comment fonctionne la classification de baltimore?
Brin + contient des informations immédiatement traduisibles
Un brin d’ADN qui est de la séquence équivalente est également désigné comme un brin positif
Les ARN et l’ADN complémentaires du brin positif sont désignés comme des brins négatifs
En connaissant la nature du génome viral, on peut déduire les étapes de base qui doivent avoir lieu pour produire l’ARNm
Qu’est-ce qu’un virus à ARN?
Un virion avec un génome composé d’ARN
Le premier virus décrit était un virus à ARN (TMV, 1892)
Les virus à ARN sont responsables de maladies humaines telles que le sida, la poliomyélite, la grippe, la rage, l’Ebola et le rhume
Combien de prix Nobel sont liés à l’étude des virus à ARN?
9 Prix Nobel sont liés à l’étude des virus à ARN. Ce travail a produit:
-un aperçu du rôle des virus à ARN causant des maladies importantes
-a conduit au développement de nouveaux outils de biologie moléculaire (transcriptase inverse)
-et a la technique du “gene silencing” (l’interférence ARN)
Quelle est la différence fondamentale entre les virus à ARN et à ADN?
Pour la plupart des virus à ADN, la synthèse d’ARNm est réalisée par l’enzyme cellulaire qui produit les ARNm de la cellule, soit, l’ARN polymérase II
En revanche, les cellules ne possèdent pas de mécanismes connus pour copier des gabarits d’ARN viraux et en produire des ARNm viraux.
Alors, les génomes à ARN viraux doivent coder pour une polymérase d’acide nucléique pour la réplication de leur génome et la synthèse de leurs ARNm
Qu’est-ce que la taxonomie des virus à ARN?
- domaine Riboviria: 2 royaumes, 6 phyla, 21 classes, 29 ordres, 111 familles, 934 genres, 3850 espèces de virus depuis 2022
- 41 % des « espèces » virales sont des virus avec des génomes d’ARN
- La majorité des virus à ARN ont des génomes à ARNsb +
Quelles sont les caractéristiques générales des virus à ARN?
En comparaison des virus à ADN, les virus à ARN infectent plusieurs espèces de plantes et moins d’espèces de bactéries
Il n’y a pas de rétrovirus connu qui infecte les bactéries
Quelles sont les morphologies diversifiées des virus à ARN?
Icosaédrique, aucune enveloppe
Hélicoïdale, aucune enveloppe
Complexe, avec enveloppe
Quelle est la caractéristiques générale ne terme de taille pour les virus à ARN?
Les virus à ARN les plus grands sont beaucoup plus petits que le plus grand virus à ADN
Les génomes varient en taille de 1,7 à 31 kb
Comment peuvent être les génomes des virus à ARN?
Les génomes des virus à ARN peuvent être:
- db, sb +, sb - ou ambi-brin
- ARN lié de manière covalente à une protéine - linéaire
- circulaire
- segmenté
La structure du génome détermine le procédé de réplication et l’encapsidation
Quelle est la structure du génome?
Les génomes de virus ne sont pas des structures unidimensionnelles
Par exemple, la structure secondaire du génome du poliovirus est indispensable à la traduction du génome
Quelle est la stratégie de réplication?
Les cellules n’ont aucun moyen de reproduire l’ARN à partir d’un gabarit d’ARN Deux stratégies ont évolué pour résoudre ce problème:
-certains virus à ARN codent pour une ARN polymérase dépendante de l’ARN (RNA dependent RNA polymerase («RdRp»)) qui produit l’ARN à partir de gabarits d’ARN
-certains virus transcrivent à l’inverse leur génome d’ARN en ADNdb, qui peut être transcrit par l’ARN polymérase de l’hôte
Comment se fait la réplication des ARN sb+?
Le génome peut être traduit directement en protéine(s) par les ribosomes de l’hôte
Pendant la réplication:
-le brin + est copié en un brin - de pleine longueur
-dans certains cas, un ARNm sous génomique est produit
Le génome est une molécule unique. Les génomes codent pour les ARN polymérases virales nécessaires pour répliquer les génomes et synthétiser les ARNm
Le plus souvent, une polyprotéine est produite et clivée en protéines individuelles par des protéases
Comment se fait la réplication des ARN sb-?
Les virions contiennent une RdRp
Les génomes brins - ne peuvent pas être traduits directement en protéines, mais doivent d’abord être copiés en brin + par la RdRp
L’ARNm est traduit en protéines virales, et copié pour produire les génomes d’ARN négatif
Le génome peut être soit une molécule simple (non segmenté) ou segmentée
Des ARNm avec une coiffe en 5’ et une queue de poly A sont produits par la polymérase virale
L’épissage de l’ARNm alternatif
Les orthomyxovirides ont un mécanisme de «cap-snatching» pour amorcer la traduction
Les orthomyxovirides se répliquent dans le noyau
Comment se fait la réplication des ARN db?
Bien que les virus à l’ARNdb contiennent un brin +, ils ne peuvent pas être traduits dans sa forme duplex
Le brin - du duplex est copié en un ARNm par la RdRp virale pour produire les protéines virales
L’ARNm nouvellement synthétisé est encapsidé puis copié pour produire l’ARNdb
Les génomes de réovirides sont segmentés (10 segments)
La RdRp et d’autres enzymes nécessaires à la synthèse de ARNm sont encapsidées dans la particule virale
L’ARNm monocistronique est unique et copié à partir de chaque segment d’ARN
L’ARNm a une coiffe en 5’ et n’a pas de queue poly A
