Hepadnaviridae

Question 1

Quel est l’origine du nom de famille des hepadnaviridae?

Answer 1

L’origine du nom de la famille vient du mot grec «hepar» qui signifie «foie»

Question 2

Ces virus infectent quoi?

Answer 2

Ces virus infectent les oiseaux, les rongeurs, les primates et les humains

Question 3

La famille Hepadnaviridae comprend quoi?

Answer 3

La famille Hepadnaviridae comprend le virus de l’hépatite B, un virus qui peut causer la cirrhose et le cancer du foie chez l’homme

Question 4

Quels sont les deux genres de la famille?

Answer 4

-les Orthohepadnavirus, qui infectent les mammifères

-les Avihepadnaviruses, qui infectent les oiseux

Question 5

Le virus de l’hépatite B est dans quel genre?

Answer 5

Le virus de l’hépatite B est dans le genre Orthohepadnavirus et est l’espèce- type de la famille

Question 6

Les hepadnaviridae ont quel type de génome?

Answer 6

Les hépadnavirus ont des génomes extrêmement petits, un ordre unique des ORFs et une stratégie de réplication inhabituelle où le génome d’ADN du virus est répliqué par la transcription inverse en l’ARN viral

Question 7

Quelle est la classification de batimore pour les hepadnaviridae?

Answer 7

Les hepadnaviridae sont classifiés dans le groupe Baltimore VII

Question 8

Quelle est la forme du VHB?

Answer 8

Le VHB est un virus sphérique avec un diamètre extérieur de ~42 nm

Question 9

Quel est le diamètre de l’enveloppe interne du VHB?

Answer 9

L’enveloppe interne du virus a un diamètre de ~22 nm et est composée de 120 dimères de la protéine de nucléocapside

Question 10

La capside du VHB est recouverte de quoi?

Answer 10

La capside est recouverte d’une membrane de lipoprotéines qui comprend trois protéines d’enveloppe virale, appelées grande (L), moyenne (M) et petite (S)

Question 11

La capside du VHB contient quoi?

Answer 11

La capside contient une seule copie du génome partiellement ADNdb, qui est lié de manière covalente à la transcriptase inverse virale à l’extrémité 5’ du brin complet

Des protéines d’origine cellulaire sont aussi présentes dans la capside

Question 12

La réplication de VHB conduit à la production de quoi?

Answer 12

La réplication de VHB conduit à la production de particules sous-virales non infectieuses qui souvent sont plus nombreuses que les particules infectieuses

Question 13

Le génome est composé de quoi?

Answer 13

Le génome est composé d’un brin complet d’ADN polarité negative de 3,227 nt et d’un brin incomplet positif, qui mesure seulement 2/3 de la longueur du brin négatif

Question 14

La RT virale est fixée de quelle manière?

Answer 14

La RT virale est fixée de manière covalente à une courte redondance terminale simple brin à l’extrémité 5’ du brin négatif

Question 15

Quels sont les deux types d’ARN que le virus produit?

Answer 15

• les ARNm, qui ont une coiffe en 5’ et une queue de poly A
• le prégénome, qui fait 3,4 kb de longueur, sert de gabarit pour la traduction des protéines de la nucléocapside et de la transcription inverse et est également le gabarit pour la synthèse de l’ADN viral par transcription inverse

Question 16

Tous les ARN viraux sont codés par quoi?

Answer 16

Tous les ARN viraux sont codés par le brin négatif de l’ADN et synthétisés par l’ARN polymérase cellulaire II

Question 17

Les amorces de la synthèse de l’ADN + et L restent attachés tout au long de la maturation du virus, Vrai ou Faux?

Answer 17

Vrai

Question 18

Vrai ou Faux? les CLO (ORF) du virus sont tous organisés dans le même sens?

Answer 18

Vrai

Question 19

Les protéines importantes codées par le génome comprennent quoi?

Answer 19

L’ADN polymérase, le protéine du noyau, la protéine S et la protéine L

Question 20

L’ADN polymérase comprend quoi?

Answer 20

-un domaine de protéine terminale qui agit comme amorce pour la synthèse du brin -

-un domaine de transcriptase inverse qui synthétise l’ADN à partir d’un gabarit d’ARN

-un domaine qui dégrade le gabarit d’ARN au cours de la RT

Question 21

La portéine du noyau sert à quoi?

Answer 21

la protéine du noyau («core»), qui s’assemble pour former la nucléocapside

Question 22

Qu’est-ce que la protéine S?

Answer 22

la protéine S, une glycoprotéine transmembranaire intégrale qui est la protéine la plus abondante dans l’enveloppe virale

Question 23

La protéine L sert à quoi?

Answer 23

la protéine L, un polypeptide myristoylé, qui se lie au récepteur des cellules

Question 24

Quel est le gabarit initiale pour la transcription inverse?

Answer 24

Le gabarit initial pour la transcription inverse est l’ARN prégénomique
- le prégénome a une coiffe en 5’ et une queue de poly A
- le prégénome est déjà encapsidé quand la transcription inverse a lieu

Question 25

Comment se passe l’initiation de la synthèse du brin - d’ADN?

Answer 25

1. L’initiation de la synthèse du brin - d’ADN est initiée à l’extrémité 5’ du prégénome

• la réaction est amorcée par le domaine TP de la polymérase
• le gabarit pour cette réaction est une région riche en structure secondaire à l’extrémité 5‘ du prégénome

Question 26

Comment se passe le premier échange de gabarit?

Answer 26

2. Le premier échange de gabarit est favorisé par l’interaction de l’ADN nouvellement synthétisé avec une séquence proche de l’extrémité 3’ du prégénome appelé «phi»

Question 27

Comment se passe la continuité de la synthèse de l’ADN?

Answer 27

3. La synthèse de l’ADN continue, à partir du site de dr1 à l’extrémité 3’ de l’ARN prégénomique

• pendant que la synthèse du brin - d’ADN se déroule, le gabarit d’ARN est dégradé par le domaine de RNAse H de la polymérase

Question 28

Que se passe t-il avec l’ensemble du gabarit d’ARN prégénomique?

Answer 28

4. L’ensemble du gabarit d’ARN prégénomique est copié par la transcriptase inverse, produisant une copie complète de brin - d’ADN avec des extrémités redondantes

-l’amorce pour la synthèse du brin + d’ADN est générée à partir de l’extrémité 5’ de l’ARN prégénomique

-l’amorce a une coiffe en 5’ et comprend la séquence dr1

Question 29

Que se passe t-il dans une minorité des cas dans la transcription inverse?

Answer 29

5a. Dans une minorité de cas (5-10%), l’amorce de brin + est allongée, ce qui entraîne un génome duplex et linéaire

Question 30

Que se passe t-il dans la majorité des cas dans la transcription inverse?

Answer 30

5b. Dans la majorité des cas, l’amorce est transloquée pour se lier à la séquence DR2 près de l’extrémité 5’ du brin d’ADN -

Question 31

Que se passe t-il après que la synthèse du brin+ soit initiée?

Answer 31

6. Après que la synthèse du brin + soit initiée, l’allongement débute

Question 32

Que se passe t-il en arrivant à l’extrémité 5’ du brin négatif d’ADN?

Answer 32

7. En arrivant à l’extrémité 5’ du brin négatif d’ADN, un échange de gabarit s’effectue ce qui produit un génome d’ADN circulaire

• cet échange est favorisé par la courte redondance terminale dans le brin - d’ADN
• la synthèse du brin positif se poursuit sur une distance variable, ce qui entraîne la forme circulaire du génome trouvée dans les particules virales matures

Question 33

Quelles sont les caractéristique partagées entre hépadnaviridae et rétrovirus?

Answer 33

• une transcriptase inverse
• ils peuvent causer des infections chroniques où le génome persiste à l’intérieur de la cellule
• l’ordre des gènes est le même (les gènes C, P et S de l’hépadnavirus sont dans le même ordre que les gènes GAG, Pol et Env du rétrovirus)
• ils ont des propriétés transformantes