Hepadnaviridae Flashcards
Quel est l’origine du nom de famille des hepadnaviridae?
L’origine du nom de la famille vient du mot grec «hepar» qui signifie «foie»
Ces virus infectent quoi?
Ces virus infectent les oiseaux, les rongeurs, les primates et les humains
La famille Hepadnaviridae comprend quoi?
La famille Hepadnaviridae comprend le virus de l’hépatite B, un virus qui peut causer la cirrhose et le cancer du foie chez l’homme
Quels sont les deux genres de la famille?
-les Orthohepadnavirus, qui infectent les mammifères
-les Avihepadnaviruses, qui infectent les oiseux
Le virus de l’hépatite B est dans quel genre?
Le virus de l’hépatite B est dans le genre Orthohepadnavirus et est l’espèce- type de la famille
Les hepadnaviridae ont quel type de génome?
Les hépadnavirus ont des génomes extrêmement petits, un ordre unique des ORFs et une stratégie de réplication inhabituelle où le génome d’ADN du virus est répliqué par la transcription inverse en l’ARN viral
Quelle est la classification de batimore pour les hepadnaviridae?
Les hepadnaviridae sont classifiés dans le groupe Baltimore VII
Quelle est la forme du VHB?
Le VHB est un virus sphérique avec un diamètre extérieur de ~42 nm
Quel est le diamètre de l’enveloppe interne du VHB?
L’enveloppe interne du virus a un diamètre de ~22 nm et est composée de 120 dimères de la protéine de nucléocapside
La capside du VHB est recouverte de quoi?
La capside est recouverte d’une membrane de lipoprotéines qui comprend trois protéines d’enveloppe virale, appelées grande (L), moyenne (M) et petite (S)
La capside du VHB contient quoi?
La capside contient une seule copie du génome partiellement ADNdb, qui est lié de manière covalente à la transcriptase inverse virale à l’extrémité 5’ du brin complet
Des protéines d’origine cellulaire sont aussi présentes dans la capside
La réplication de VHB conduit à la production de quoi?
La réplication de VHB conduit à la production de particules sous-virales non infectieuses qui souvent sont plus nombreuses que les particules infectieuses
Le génome est composé de quoi?
Le génome est composé d’un brin complet d’ADN polarité negative de 3,227 nt et d’un brin incomplet positif, qui mesure seulement 2/3 de la longueur du brin négatif
La RT virale est fixée de quelle manière?
La RT virale est fixée de manière covalente à une courte redondance terminale simple brin à l’extrémité 5’ du brin négatif
Quels sont les deux types d’ARN que le virus produit?
- les ARNm, qui ont une coiffe en 5’ et une queue de poly A
- le prégénome, qui fait 3,4 kb de longueur, sert de gabarit pour la traduction des protéines de la nucléocapside et de la transcription inverse et est également le gabarit pour la synthèse de l’ADN viral par transcription inverse
Tous les ARN viraux sont codés par quoi?
Tous les ARN viraux sont codés par le brin négatif de l’ADN et synthétisés par l’ARN polymérase cellulaire II
Les amorces de la synthèse de l’ADN + et L restent attachés tout au long de la maturation du virus, Vrai ou Faux?
Vrai
Vrai ou Faux? les CLO (ORF) du virus sont tous organisés dans le même sens?
Vrai
Les protéines importantes codées par le génome comprennent quoi?
L’ADN polymérase, le protéine du noyau, la protéine S et la protéine L
L’ADN polymérase comprend quoi?
-un domaine de protéine terminale qui agit comme amorce pour la synthèse du brin -
-un domaine de transcriptase inverse qui synthétise l’ADN à partir d’un gabarit d’ARN
-un domaine qui dégrade le gabarit d’ARN au cours de la RT
La portéine du noyau sert à quoi?
la protéine du noyau («core»), qui s’assemble pour former la nucléocapside
Qu’est-ce que la protéine S?
la protéine S, une glycoprotéine transmembranaire intégrale qui est la protéine la plus abondante dans l’enveloppe virale
La protéine L sert à quoi?
la protéine L, un polypeptide myristoylé, qui se lie au récepteur des cellules
Quel est le gabarit initiale pour la transcription inverse?
Le gabarit initial pour la transcription inverse est l’ARN prégénomique
- le prégénome a une coiffe en 5’ et une queue de poly A
- le prégénome est déjà encapsidé quand la transcription inverse a lieu
Comment se passe l’initiation de la synthèse du brin - d’ADN?
- L’initiation de la synthèse du brin - d’ADN est initiée à l’extrémité 5’ du prégénome
- la réaction est amorcée par le domaine TP de la polymérase
- le gabarit pour cette réaction est une région riche en structure secondaire à l’extrémité 5‘ du prégénome
Comment se passe le premier échange de gabarit?
- Le premier échange de gabarit est favorisé par l’interaction de l’ADN nouvellement synthétisé avec une séquence proche de l’extrémité 3’ du prégénome appelé «phi»
Comment se passe la continuité de la synthèse de l’ADN?
- La synthèse de l’ADN continue, à partir du site de dr1 à l’extrémité 3’ de l’ARN prégénomique
- pendant que la synthèse du brin - d’ADN se déroule, le gabarit d’ARN est dégradé par le domaine de RNAse H de la polymérase
Que se passe t-il avec l’ensemble du gabarit d’ARN prégénomique?
- L’ensemble du gabarit d’ARN prégénomique est copié par la transcriptase inverse, produisant une copie complète de brin - d’ADN avec des extrémités redondantes
-l’amorce pour la synthèse du brin + d’ADN est générée à partir de l’extrémité 5’ de l’ARN prégénomique
-l’amorce a une coiffe en 5’ et comprend la séquence dr1
Que se passe t-il dans une minorité des cas dans la transcription inverse?
5a. Dans une minorité de cas (5-10%), l’amorce de brin + est allongée, ce qui entraîne un génome duplex et linéaire
Que se passe t-il dans la majorité des cas dans la transcription inverse?
5b. Dans la majorité des cas, l’amorce est transloquée pour se lier à la séquence DR2 près de l’extrémité 5’ du brin d’ADN -
Que se passe t-il après que la synthèse du brin+ soit initiée?
- Après que la synthèse du brin + soit initiée, l’allongement débute
Que se passe t-il en arrivant à l’extrémité 5’ du brin négatif d’ADN?
- En arrivant à l’extrémité 5’ du brin négatif d’ADN, un échange de gabarit s’effectue ce qui produit un génome d’ADN circulaire
- cet échange est favorisé par la courte redondance terminale dans le brin - d’ADN
- la synthèse du brin positif se poursuit sur une distance variable, ce qui entraîne la forme circulaire du génome trouvée dans les particules virales matures
Quelles sont les caractéristique partagées entre hépadnaviridae et rétrovirus?
- une transcriptase inverse
- ils peuvent causer des infections chroniques où le génome persiste à l’intérieur de la cellule
- l’ordre des gènes est le même (les gènes C, P et S de l’hépadnavirus sont dans le même ordre que les gènes GAG, Pol et Env du rétrovirus)
- ils ont des propriétés transformantes
