Coronaviridae Flashcards
Quelles sont les principales caractéristiques des coronavirus?
Les coronavirus sont des virus à ARN enveloppés qui infectent les mammifères et les oiseaux
Leur nom dérive de la frange de spicules observée avec un microscope électronique, qui ressemble à une couronne
Ces virus ont les génomes les plus grands de tout type de virus à ARN
Les coronavirus provoque quelles maladies?
Les coronavirus provoquent les maladies respiratoires et gastro-intestinales significatives chez les humains et les animaux domestiques
Les coronavirus importants incluent le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère («SARS coronavirus») et le coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient («MERS coronavirus»)
Quelles sont les caractéristiques distinctives de cette famille?
Les caractéristiques distinctives de cette famille comprennent:
-une particule enveloppée qui est décorée avec des spicules à la surface
-les gènes de la polymérase se réunissent dans des groupes monophylétiques selon leur taxons
- une nucléocapside composée d’ARN et de copies multiples d’une seule protéine de capside
- un génome linéaire d’ARN simple brin, de polarité positive, avec une coiffe en 5’ et une queue de poly-A à l’extrémité 3’
- une organisation identique du génome parmi les genres de cette famille
Comment est le virions de coronavirus?
Le virion de coronavirus est pléomorphique et a un diamètre qui peut varier en taille de 118 à 136 nm
L’enveloppe est composée de quoi?
L’enveloppe est composée de:
- une bicouche lipidique
- des protéines membranaires (M): les protéines qui donnent au virion sa forme
- des protéines d’enveloppe (E): les protéines qui sont essentielles pour l’infectivité
- protéines de spicule (S): protéines qui forment des spicules, ~20 nm de long, qui sont impliquées dans l’attachement du virus
Encapsidée à l’intérieur du virion il y a une nucléocapside à symétrie hélicoïdale, qui est constituée du génome d’ARN et de nucléoprotéines (N)
Comment est le génome du coronavirus?
Les génomes de coronavirus peuvent varier en taille de 26 à 32 kb
L’ARN génomique est traduit pour produire les polyprotéines 1a et 1ab
Ces polyprotéines sont traitées pour former le complexe d’ARN polymérase
Les protéines structurales sont codées par six ARNm imbriqués
Au départ, seulement le premier cadre de lecture ouvert (CLO,«open reading frame») de chaque ARNm est traduit
Comment fonctionne l’adsorption?
Les infections de Coronavirus sont initiées par la liaison des virions aux récepteurs cellulaires
L’interaction entre la protéine S et le récepteur de la cellule est le déterminant principal de la gamme d’hôtes et du tropisme tissulaire
- les coronavirus se lient à une variété de protéines de surface cellulaire
- par exemple, les coronavirus du SRAS et du SRAS 2 se lient à la carboxypeptidase ACE2, une enzyme impliquée dans la régulation de la fonction cardiaque et de la pression artérielle
Comment fonctionne la décapsidation?
La décapsidation du virus est déclenchée par la liaison au récepteur, le clivage de la protéine de spicule et par l’exposition à un pH bas
- certains coronavirus fusionnent avec la membrane plasmique, tandis que d’autres entrent dans la cellule par endocytose médiée par le récepteur
- le changement de conformation de la protéine S entraîne le mélange des bicouches lipidiques du virus et de la cellule hôte et, par la suite, la libération du contenu du virion dans le cytoplasme
Quelle est la première étape après la libération de la nucléocapside dans le cytoplasme?
Après la libération de la nucléocapside dans le cytoplasme, la première étape est la traduction du gène de la réplicase de l’ARN génomique
- la traduction de l’ensemble de la réplicase dépend d’un mécanisme appelé «le changement de cadre de lecture causé par le ribosome» («ribosomal frameshifting»)
- le changement de cadre de lecture causé par le ribosome se produit lors de la traduction de l’ARN viral lorsque le ribosome recule d’un nucléotide (-1)
Quels sont les deux facteurs du changement de cadre de lecture causé par le ribosome?
Le changement de cadre de lecture causé par le ribosome est le résultat de deux facteurs:
- une séquence glissante (« slippery sequence») en amont de la jonction des gènes 1a et 1b
- la structure secondaire dans le génome appelée un pseudo-noeud d’ARN («pseudoknot»)
- ce changement incite le ribosome à passer du CLO 1a au CLO 1b
- le rôle du changement de cadre de lecture causé par le ribosome serait d’assurer que la bonne proportion de composants de réplicase soit produite
Comment les polyprotéines 1a et 1ab sont auto-protéolytiquement («autoproteolytically») clivées en protéines distinctes?
- elles forment le complexe de la réplicase
- elles interfèrent avec la synthèse des protéines de l’hôte
- elles provoquent la formation de vésicules dans le cytoplasme qui sont les lieux de la réplication de l’ARN viral et ceux de la transcription des gènes viraux
Quelles sont les principaux composants du complexe de réplication d’ARN?
- une ARN polymérase ARN-dépendante qui synthétise l’ARN
- une hélicase qui déroule l’ARN génomique viral
- une primase qui synthétise une amorce qui est nécessaire à la polymérase pour initier la synthèse de l’ARN
- des protéines impliquées dans la synthèse de la coiffe en 5’ («5’ cap»)
- un exonucléase qui fournit une capacité de relecture à la polymérase
La synthèse d’ARN viral par la réplicase mène à quoi?
La synthèse d’ARN viral par la réplicase mène à la réplication du génome d’ARN et à la transcription de multiples ARN sous-génomiques (sg)
- chaque ARNsg est constitué d’un ARN leader, qui est identique à l’extrémité 5’ du génome, joint à un ARN qui est identique à un segment de l’extrémité 3’ du génome
Que se passe-t-il avec les ARNsg?
Chaque ARNsg partage une séquence régulatrice de la transcription «transcription regulating sequence (TRS)» identique, qui initie la synthèse d’ARN
Les intermédiaires de brin négatif servent comme gabarit pour la synthèse d’ARNsg
Cette série d’ARN imbriquée (d’où «nido» de Nidovirales) est une caractéristique déterminante des virus de l’ordre Nidovirales
Comment est apparu le SRAS?
SRAS est apparu chez l’homme dans la province de Guangdong, en 2002
Le médecin qui a traité ces patients a voyagé à Hong Kong, où il est mort dans un hôpital le lendemain
Il a infecté 10 travailleurs hospitaliers
Moins d’un an après cet événement, ~ 8 000 personnes étaient tombées malades et 1 personne infectée sur 10 est décédée
L’agent causal était un coronavirus, SRAS («SARS-CoV»)
