Introduction à la physiologie bactérienne Flashcards
Qu’est-ce qui différencie les procaryotes des eucaryotes ?
- Beaucoup plus petites
- Pas d’enveloppe autour de leur nucléoïde (donc ce n’est pas un noyau)
- Pas d’organelles spécialisées, tel les mitochondries
Qu’est-ce qui caractérise la paroi bactérienne ?
- Enveloppe rigide qui protège la bactérie et maintien sa forme
- Varie énormément entre les bactéries Gram positif et négatif
- Principal constituant : peptidoglycane (polymère de disaccharides)
Quels sont les rôles de la paroi bactérienne ?
- Protéger contre l’environnement
- Maintenir une pression intra-cellulaire élevée
- Conférer une rigidité bactérienne
À quoi correspond la structure finale de la paroi de peptidoglycane ?
Un gros trailli
À quel processus s’attaque la plupart des antibiotiques ?
La formation de la paroi de peptidoglycane
La coloration de Gram est une coloration du nom du scientifique danois Hans Christian Gram qui la mise au point en _____. Elle permet de mettre en évidence les _________.
1 - 1884
2 - Propriétés de la paroi bactérienne
Lors de la coloration de Gram, qu’est-ce qui permet de différencier les bactéries Gram positives des bactéries Gram négatives ?
- Gram positif : Les bactéries qui retiennent la coloration de Gram
- Gram négatif : Les bactéries ne retiennent pas la coloration de Gram.
Quelles sont les 4 grandes classes de bactéries ?
1 - Cocci Gram positif (souvent en amas)
2 - Bacilles Gram négatif
Pourquoi est-ce que les bactéries Gram négatives ne retiennent pas le colorant ?
Leur paroi est très perméable, elles sont donc délavées par l’alcool.
Pourquoi est-ce que les bactéries Gram négatives ne retiennent pas le colorant ? Et pourquoi est-ce que les Gram positives retiennent-elles le colorant ?
- Gram négatives : Leur paroi est très perméable, elles sont donc délavées par l’alcool. Leur membrane externe est riche en lipopolysaccharides.
- Gram positives :
Elles possèdent un paroi épaisse de peptidoglycan.
Qu’est-ce qui joue le rôle de déterminant antigénique responsable de l’antigénicité somatique (antigène O des entérobactéries) ?
Les LPS : lipopolysaccharides
Qu’est-ce qui caractérise le cytoplasme des bactéries ?
- Fluide constitué à 95% d’eau dans lequel se retrouve des substances dissoutes
- Contient de nombreux ribosomes et l’appareil nucléaire
- Contient peu d’organelles
Quel est un moyen super efficace qui permet aux bactéries de s’échanger du matériel génétique ?
- Il y a parfois de l’ADN extra-chromosomal sous forme de plasmide (moyen de transmission des gènes de résistance).
- Pili sexuels
Qu’est-ce qui caractérise les ribosomes ?
- Synthèse des protéines en décodant l’info de l’ARNm
- 2 sous-unités : Grande sous unité (50S) et Petite sous-unité (30S)
- Total = 70S
Qu’est-ce qui caractérise les flagelles des bactéries ?
- Assure la mobilité
- Peut constituer un facteur de virulence
- Déterminant antigénique majeur (antigène H)
Qu’est-ce que les Pilis (fimbriae) ? Décrit les 2 types
Plus fins et plus rigides que les flagelles, leur but n’est pas le déplacement
- Pili communs : fixation des bactéries aux tissus, adhésion, facteur de virulence important
- Pili sexuels : interviennent dans la conjugaison bactérienne (transfert de matériel génétique)
Qu’est le que métabolisme et quelles en sont les utilités ?
C’est l’ensemble des réactions biochimiques d’un être vivant.
- Comprendre habitat et interaction avec l’être humain
- Taxonomie
- Identifier les bactéries selon les caractéristiques phénotypiques
- Définir les conditions optimales pour cultiver les bactéries d’intérêt médical
Sous quelles catégories peut-on classer les différents types de métabolismes ?
- Autotrophe : Source de carbone est le CO₂
- Hétérotrophe : Source de carbone est un substrat organique
- Catabolisme : Réactions de dégradations qui assurent la production d’énergie
- Anabolisme : Consommation d’énergie (réactions de biosynthèse et fonctions mécaniques tel que le déplacement cellulaire ou le transport de métabolites)
Les pathogènes humains sont tous hétérotrophes ou autotrophes ?
Hétérotrophes
Qu’est-ce qui caractérise le catabolisme, quelles sont les molécules catabolisées et via quelles réactions ?
- Production d’énergie
- Molécules catabolisées : glucides, alcools, acides organiques, acides aminés, etc…
- Via de réactions d’oxydo-réduction
Quelles sont les 3 phénomènes biochimiques interdépendants dans le catabolisme ?
1 - Voie enzymatique d’oxydation du substrat
2 - Voie de transfert des électrons (et protons) vers un accepteur final d’électrons (réduction)
3 - Production de métabolites phosphorylés riches en énergie
À quoi servent les réactions de réduction ?
Elles servent à transporter les électrons issus de l’oxydation via différents types de respiration.
Qu’est-ce qui caractérise la respiration aérobie, la respiration anaérobie et la fermentation ?
- Respiration aérobie : Cytochrome-dépendante, l’accepteur final est l’O₂
- Respiration anaérobie : Cytochrome - dépendante, l’accepteur final est le substrat organique oxygéné ou le substrat inorganique réductible
- Fermentation : Cytochrome - indépendante, l’accepteur final est le substrat organique oxygéné
Vrai ou Faux : Plus les bactéries sont capables d’utiliser plusieurs voies (réduction, respiration) plus elles sont ‘‘bien’’ dans plusieurs environnement.
Vrai
Quelle est la voie de respiration la plus favorable pour les bactéries ?
L’aérobie : fournie plus d’ATP
Quels sont les différents type d’atmosphères de croissance (5) ?
1 - Aérobie obligatoire : nécessite de l’oxygène pour la croissance
2 - Anaérobie obligatoire : organisme qui ne croit pas en présence d’oxygène
3 - Anaérobie facultatif : peuvent utiliser la respiration aérobie ou la fermentation
4 - Microaérophile : peuvent croître en avec peu d’oxygène (4-5%), certaines sont aussi capnophile donc requièrent le CO2 pour croître
5 - Anaérobies aérotolérants : anaérobie pouvant survivre (mais pas se reproduire) en présence de 2 a 8 % d’oxygène
Quel est l’atmosphère de croissance le plus utilisé pour les bactéries ?
Anaérobies facultatifs : peuvent utiliser la respiration aérobie ou la fermentation, produit beaucoup d’ATP et est plus efficace
Quels sont les différents besoins cellulaires ?
1 - Atmosphère 2 - Nutriment 3 - Température 4 - pH 5 - Humidité
Quels sont les sont les différents nutriments des bactéries ?
1 - Carbone 2 - Azote 3 - Phosphores 4 - Métaux 5 - Facteurs de croissance
Qu’est-ce qui caractérise les bactéries mésophiles, thermophiles et psychrophiles ?
- Mésophiles : T de croissance près de celle du corps humain (37C)
- Thermophiles : T de croissance entre 45 et 70 C
- Psychrophiles : T de croissance près de 0C
La plupart des bactéries pathogènes sont neutrophiles, acidophiles ou alcalophiles ?
Neutrophiles
Qu’est-ce qu’un facteur de virulence ?
Composante structurelle ou produits synthétisés par une bactérie qui lui permet d’attaquer l’hôte avec sévérité variable (peuvent être au niveau de la structure de la cellule ou extracellulaire)
Quels sont les 2 catégories des pathogènes bactériens ?
- Pathogènes strictes (ou spécifique) : causeront une maladie infectieuse chez tous les patients
- Pathogènes opportunistes : causeront une maladie infectieuse sous certaines circonstances cliniques ou chez es immunosupprimés
Qu’est-ce que la pathogénèse bactérienne ?
1 - Colonisation d’une (nouveau) site
2 - Invasion ou contournement des défenses de l’hôte
3 - Multiplication
4 - Dommages
Qu’est-ce que l’adhérence bactérienne ?
Il s’agit d’une facteur de virulence presque universel chez les pathogènes.
Qu’est-ce qui peut permettre aux bactéries d’adhérer ?
1 - Pili
2 - Fimbriae (adhésines)
3 - Protéines d’adhésion
4 - Biofilm (résistance bactérienne, permet de ‘‘cacher’’ la bactérie dans la ‘‘glue’’)
Vrai ou Faux : La capsule bactérienne est essentielle à leur survie.
Faux : Celle-ci apporte certains avantages, mais n’est pas essentielle à leur survie.
Qu’est-ce qui caractérise la capsule bactérienne et quels sont ses rôles (4) ?
Capsule de nature glucidique qui protège la bactérie et qui cache ses antigènes. La bactérie devient soit trop grosse ou inconnaissable donc invisible pour les anticorps.
Rôles :
1 - Mécanisme de protection
2 - Empêche la formation de complexes de compléments
3 - Empêche la phagocytose en rendant la bactérie non immunogène
4 - Interfère également dans la liaison des antibiotiques à leur cible
Quel organe joue un rôle qui aide à gérer les bactéries encapsulées ?
La rate
Qu’est-ce qui caractérise les sidérophores ?
Elles ont un système de chélation et d’emmagasinage du fer permettant de croître en milieu appauvri.
Qu’est qu’une protéine promotrice d’invasion ?
Protéine ayant un rôle dans l’invasion par divers mécanismes
Les toxines : Les bactéries peuvent produire des effets toxiques via des exotoxines et des endotoxines. Qu’est-ce qui différencie ces 2 types de toxines ?
- Endotoxines : Sont retrouvées uniquement chez les Gram négatif
- Exotoxine : Sont retrouvées autant chez les Gram positif que négatif
Les ________ sont responsables de beaucoup d’effets néfastes lors des chocs ________. Le test du ______ a longtemps été utilisé en production pharmaceutique pour détecter la présence d’_________ dans les préparations stériles.
1 - Endotoxines
2 - Septiques
3 - Limulus
4 - Endotoxines
Quels sont les effets des exotoxines ? Quelles sont les différentes classes d’exotoxines (nomme la plus fréquente) ?
Effets : - Diarrhée - Tous de la coqueluche - Spasticité du tétanos Classes : - Type A-B (plus fréquent) - Cytotoxines (toxines qui vont tuer les cellules) - Superantigène
Comment fonctionne les exotoxine de type A-B ?
La cellule accepte l’exotoxine. Un coup dans la cellule, la partie A se transforme et exerce son effet toxique.
Les superantigènes induisent une …..
1 - Stimulation excessive des lymphocytes T
2 - Hyperproduction de cytokines
3 - Choc toxique
Quels sont les différents types de critères qui peuvent être utilisés pour classifier les bactéries ?
1 - Morphologiques 2 - Biochimiques 3 - Métaboliques 4 - Physiologiques 5 - Génétiques 6 - Sérologiques
Comment classons-nous les bactéries en fonction de la nomenclature ?
- Les bactéries sont classées selon les principes de Linné (1758) en un nomenclature binominale.
- Les sous-classes taxonomiques utilisées couramment sont le genre et l’espèce : Ils sont exprimés en italique, le genre est en premier et prend une majuscule.
Nomme les principaux cocci aérobies Gram positif (3) et Gram négatif
Gram positif :
- Staphylococcus
- Streptococcus
- Enteroccocus
Gram négatif :
- Moraxella
- Neisseria
Qu’est-ce qui caractérise le staphylococcus aureus ?
- Cocci aérobie en amas
- Pathogène très important et fréquent
- Cause souvent des infections liées à la peau, mais peut causer de nombreuses autres infections diverses
Nomme le pathogène qui est :
- l’un des plus fréquents dans les infections des voies respiratoires hautes et basses, et les otites moyennes aïgues.
- fréquemment impliqué dans les méningites bactériennes.
Streptococcus pneumoniae
Les Streptococcus beta-hémolytiques comprennent les Groupe A (Streptococcus pyogènes) et les Groupe B (Streptococcus agalactiae). Quelles infections sont liées au groupe A ? Et Groupe B ?
Groupe A :
- Peau et tissus mous (cellulite, érysipèle, fasciite nécrosante)
- Pharyngite
- Pneumonie
- Post-opératoire
- Choc toxique
- Etc
Groupe B :
- Infections néonatales
Quels sont les 2 types de cocci Gram + aérobie en chaînes ?
- Streptococcus sp.
- Enterococcus sp.
Qu’est-ce qui caractérise les enterococcus sp. ?
1 - Ils font partie de la flore digestive.
2 - Ils sont parfois impliqués dans les infections abdominale (abcès, cholangite) ou urinaires.
Quelle est la résistance des enteroccocus sp ?
- Ils ne sont pas couverts par plusieurs antibio à large spectre.
- Certains entérocoques sont aussi résistants à la vancomycine, donc encore plus difficiles à traiter.
Quels sont les 2 Neisseria d’importance médicale (cocci aérobies Gram négatif) ?
- N. gonorrhoeae : agent de la gonorrhée
- N. meningitidis : un des pathogènes impliqués dans les méningites
Quelles sont les différentes bacilles aérobies Gram négatif ?
- Entérobactéries
- Non-fermenteurs
- Non-entérobacteriaceae
Qu’est-ce qui caractérise les entérobactéries (bacille aérobie Gram négatif) ?
Bactérie qui est capable :
- Fermenter le glucose
- Réduire les nitrates en nitrites
- Oxydase négative
- De nombreuses entérobactéries dont le E. coli sont maintenant porteurs de gènes de résistance multiple les rendant résistants à de nombreuses beta-lactames.
Qu’est-ce qui caractérise les escherichia coli ?
- Fait partie de notre flore digestive
- Pathogène urinaire principal
- Certaines souches toxigéniques sont associées à la diarrhée du voyageur.
Quels sont les pathogènes qui causent des éclosions sporadiques ?
1 - Salmonella sp.
2 - Shigella sp.
Quel type de bactérie est incapable de fermenter le glucose et a tendance à être assez résistants aux antibiotiques en général ?
Les Bacilles Gram négatif non-fermentaires (BNF) (pseudomonas, acinetobacter, stenotrophomonas, burkholderia,…)
Quelle est la bactérie non fermentaire d’importance la plus importante ? Elles causent des infections chez les patients hospitalisés, immunosupprimés et la fibrose kystique du pancréas. Une double couverture antibiotique est parfois utilisée pour les infections sévères (coriace à traiter).
Pseudomonas aeruginosa
Quelles sont les caractéristiques des bacilles Gram négatif fastidieux ?
- Croissance plus lente
- Croissance sur milieux spéciaux
- Pas de croissance in vitro
- Plusieurs ont la caractéristique d’être couvert par seulement quelques antibio, souvent appelés ‘‘antibio couvrant les atypiques’’
Les - Arcanobacterium - Bacillus - Corynebacterium - Erysipelothrix - Gardnerella - Lactobacillus - Nocardia sont des bactéries .....
Bacilles aérobies Gram positif (rarement des pathogènes, partie de flores normales ou de l’environnement , sauf exceptions)
Quelles sont les 3 formes de Bacilles Gram + aérobies ?
1 - Corynéformes ou diphtéroïdes
2 - Bacilles réguliers (sporulés, non-sporulés)
3 - Embranchés (actinomycètes)
Qu’est-ce qui caractérise les listeria monocytogenes ?
- Bacilles Gram positif aérobie
- Pathogènes pouvant causer des infections rares mais sévères (chez les immunosupprimés et les femme enceinte)
- En lien avec la consommation de produit laitier à base de lait cru ou de charcuteries.
Qu’est-ce qui caractérise les Bacillus sp. ?
- Bacillus anthracis : cause l’anthrax
- Bacillus cereus : donne parfois des atteintes digestives
- Dans les 2 cas, les effets de l’infection sont principalement causés par la production de toxines par la bactérie.
Qu’est-ce qui caractérise les bactéries Clostridium sp. ?
- Bacille anaérobie Gram positif
- Anaérobie ayant le pouvoir de sporuler
- Regroupe de C. difficile, le C. tetani, le C. botulinum
Nomme la bacille Gram positif sporulé qui est transmis de façon fécale-orale et qui cause la colite pseudo-membraneuse souvent déclenchée par l’usage d’antibio ?
Clostridium difficile
Qu’est-ce qui caractérise les bactéroides sp. ?
- Pas un pathogène en soi
- Retrouve beaucoup dans les selles
- Anaérobie intestinal qui représente la majorité de la flore digestive
- Plus résistant aux antimicrobiens que le reste des anaérobies