Introduction à la microbiologie et aux microorganismes Flashcards
Quelles sont les grandes catégories de microorganismes d’importance médicale ?
1 - Bactéries 2 - Champignons 3 - Parasites 4 - Virus 5 - Prions (protéines)
Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des bactéries ?
- Structure : Unicellulaire
- Reproduction : Fission binaire
- Paroi : Peptidoglycans
- Relation avec l’hôte : Free-living (intracellulaire facultatif ou obligatoire)
Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des champignons ?
- Structure : Unicellulaire (1) vs Pluricellulaire (2)
- Reproduction : Fission binaire (1) vs Reproduction sexuée (2)
- Paroi : Paroi chitine
- Relation avec l’hôte : Free-living (intracellulaire facultatif)
Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des parasites ?
- Structure : Unicellulaire (1) vs Pluricellulaire (2)
- Reproduction : Fission binaire (1) vs Reproduction sexuée (2)
- Paroi : Complexité variable jusqu’à petits animaux
- Relation avec l’hôte : Free-living
Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des virus ?
- Structure : Acellulaire
- Reproduction : Réplication via machinerie génétique de l’hôte (comme notre organisme qui reproduit le covid)
- Paroi : Capside +/- enveloppé
- Relation avec l’hôte : Intracellulaire obligatoire
Quelle est la structure, le mode de reproduction, le type de paroi et la relation avec l’hôte des prions ?
- Structure : Protéine (pas matériel génétique)
- Reproduction : Réplication via machinerie génétique de l’hôte
- Paroi : Aucune
- Relation avec l’hôte : Intracellulaire obligatoire
À quoi correspond une structure acellulaire ?
Structure de protéines dans laquelle se retrouve du matériel génétique
Quelle catégorie de microorganisme cause la maladie de la vache folle ?
Les prions
Les champignons levure et filamenteux sont-ils uni ou pluricellulaire ?
- Levure : unicellulaire
- Filamenteux : pluricellulaire
Nomme un parasite
Amibe
Nomme un virus autre que le covid
VIH
Nomme les différents types d’interactions hôte et agent infectieux
1 - Commensal : hôte et pathogène vivent ensemble, pas de dommage ou de bénéfice à l’hôte ou à l’agent
2 - Saprophyte : bénéfice pour l’agent infectieux sans avoir de dommages pour l’hôte
3 - Parasite : avantage pour l’agent infectieux et dommage pour l’hôte
4 - Symbiose : avantages pour les deux
***Parasite : mécanisme d’interaction, peut être bactéries ou champignons, ne pas confondre avec le groupe des parasites
Différencie les colonisants vs les pathogènes
Colonisant :
- Cause aucun problème à l’hôte, tant qu’il y reste en équilibre
- Microorganisme vivant sur une surface interne ou externe du corps
- Commensal > saprophyte > symbiose (+ utile, - fréquent)
Pathogène :
- Dommage pour l’hôte (parasite)
- Pathogène obligatoire (infection pour tous les hôtes)
- Pathogène opportuniste (infection seulement chez les hôtes immunosupprimés)
Quelles sont les utilités des bactéries ?
- Carnivores : essentielles à la désintégration des tissus morts
- Industrielle ; décontamination, fuite toxique, yogourt,…
Quelles sont les utilités des champignons ?
- Végétariens : dégradation des matières végétales
Qu’est-ce que la virulence et de quels éléments dépend-t-elle ?
C’est la capacité à produire une infection.
- Environnement : ex bactérie de la peau ou de l’intestin dans la circulation sanguine
- Hôte infecté : immunité
- Microorganisme :
Quelles sont la 4 grandes modalités diagnostiques de la microbiologique ?
1 - Examen direct (comme coloration de Gram)
2 - Culture (gellose, gélatine/sang de mouton, encensement)
3 - Immunodiagnostic
4 - Dx moléculaire
En quoi consiste l’antibiogramme ?
Bactéries étalées sur un nouveau milieu de culture, on y met des pastilles avec des antibios. On incube le tout en répliquant les conditions du corps humains et on visualise la prolifération. Plus il y a un grand cercle autour de la pastille, plus l’antibio a une grande efficacité.
Immunodiagnostic :
- Définit antigène
- Définit anticorps
- Nomme 2 méthodes de diagnostiques
- Composante sur la surface d’un microorganisme
- Réponse immune de l’hôte à l’antigène
- ELISA et Agglutination
Quelles sont les différentes classes des champignons ?
- Levure
- Dimorphes
- Filamenteux
Nomme les différents types/genres de champignons à levure
- Candida
- Cryptococcus
- Malassezia
Nomme 2 types de champignons filamenteux
- Hyalins (Aspergillus, dermatophytes, mucorales)
- Dématiés (champignons noirs)
Les champignons à levure se retrouve plus à ________ de l’être humain et les champignons filamenteux plus à __________ de l’être humain.
1 - intérieur
2 - extérieur
Nomme les différentes classes (7) d’antifongiques
1 - Azoles (ex : fluconazole, pricipalement pour levure)
2 - Allylamines (terminafine, pied d’athlète)
3 - Echinocandins
4 - Polyènes (nystatin)
5 - 5 - fluorocytosine (5-FC)
6 - Griséofulvine (infection dermatophyte : peau, cheveux, ongles)
7 - Cyclopirox
Nomme des antifongiques azoles (identifie les 3 principaux)
***3 principaux
1 - Clotrimazole (topique, vaginite à levure)
2 - Kétoconazole (po ou topique, nisoral)
3 - Fluconazole (po ou IV, muguet/vaginite/balanite)
**
4 - Itraconazole (po ou IV)
5 - Voriconazole (po ou IV)
6 - Posaconazole (po ou IV)
Qu’est-ce qui caractérise les levures Candida spp. ?
- Unicellulaire
- Plus gros qu’une bactérie (1-2 microns vs 5-8 microns0
- Ovale ou ronde
- Réplication par bourgeonnement
- Colonise peau, muqueuse, tube GI humain (colonise partout où il y a muqueuses)s buccale et génitale, peau/plis et ongles)
- Infx endroits humides (muqueuse
- C. albicans, C. krusei, C. glabrata (différentes espèces)
Quels antifongiques sont efficaces pour les infections aux Candida/Cryptococcus ?
Tous*
- +/- terbinafine
- +/- échinocandins
Qu’est-ce qui caractérise les candidoses oropharyngées ?
- Atteinte muqueuse orolabiale
- Douleur buccale +/- lors d’avaler
- Pseudomembranes blanches dans la bouche +/- érythème sous-jacent
- Associés à la prise d’antibios, corticostéroïdes inhalés ou immunosuppression (déséquilibre entre bactéries et levures)
- Plaques blanches ou rougeurs peuvent être absentes
- **Différents de pharyngite streptocoque (amygdales enflées, pu)
Qu’est-ce qui caractérise la perlèche ?
Érythème = sécheresse et craquelure commissures labiales (coins bouche)
***Différent de l’herpes orolabiale (petites vésicules de liquides dans le coins de la bouche)
Quels sont les traitements pour la candidose oropharyngée ?
Topique
- Azoles (clotrimazole) 1er choix
- Polyènes : nystatin rince-bouche 1er choix, amphotericine B (magistrale, rare)
Systémique :
- po : fluconazole (voriconazole, posaconazole0
- IV (rare) : amphotéricine B, caspofongine
Qu’est-ce qui caractérise les vulvovaginite candida ?
- Femme post pubère
- Symptômes : Érythème, douleur, +/- écoulement blanchâtre
- Même facteurs de risque que candidose oropharyngée SAUF récidives fréquentes sans explication
- Homme = balanite
- Si 1er épisode : référer au md, 50% autre diagnostic (itss, uti, allergie, eczéma)
- Si épisode dans la passé, servir mvl
Quels sont les traitements pour la vulvovaginites candida ?
Topique :
- Clotrimazole (canesten)
- 1 jr vs 3 jrs vs 7 jrs (efficacité équivalente)***
- Amphotéricine B (rare)
- Acide borique, %-FC (rare)
- minimum 3 jrs recommandé, exposition + prolonger à l’antifongique souhaitable, pas dose unique
Systémique :
- Fluconazole
- 1 dose de 150 mg
- Autres traitements idem candidose oropharyngée (rare)
**Azoles : tératogène si administration haute dose et prolongée (embryotoxique)
Où peuvent survenir les infections Candida systémique ? Quels sont les traitements ?
1 - Sang 2 - Coeur 3 - Urine 4 - Oeil 5 - Cerveau 6 - Os/articulations
Traitements :
- IV prolongé, +/- chirurgie
- Azoles
- Échinocandins
- Polyènes (Amphotéricine B)
- 5 - fluorocytosine
Qu’est-ce qui caractérise les infections à levures Cryptococcus ?
- Levure encapsulée
- Environnement (oiseaux, végétaux), cosmopolite
- Inhalée –> pneumonie –> méningoen céphalite
- Autres : infx cutanées, urinaires
- Tx : fluconazole ou amphotéricine ***pas enchinocandins
Qu’est-ce qui caractérise les infections à levures Malassezia ?
- Levure humaine et animale
- Lipophile (aime le gras)
- Infections cutanées
- Pitysiasis versicolor (hyper ou hypopigmentation cutanée, tronc > membres)
- Autres infections : dermatite séborrhéique, pellicules, fungémie rare (intralipide)…
Quels sont les traitements pour le pityriasis versicolor ?
Topique :
- Selenium sulfide 2.5% (ou Selsun Blue %)
- Ketoconazole (Nizoral)
- Clotrimazole 1%
Systémique (rare) :
- Fluconazole
- Itraconazole
Qu’est-ce qui caractérise les champignons filamenteux ?
- Pluricellulaires
- Hyphes
- Organes de fructification
- Aspect duveteux
- Ex : Penicillium roqueforti (non-pathogène)
- Ex : Aspergillus spp., Fusarium spp., Scedosporium spp.(pathogènes)
Quelles sont les espèces pathogènes de champignons filamenteux les plus fréquentes ?
- Aspergillus fumigatus (aspergillose invasive, poumon)
- Dermatophytes (pied d’athlète, onychomycose,..)
Quels sont les facteurs de risque de l’aspergillose invasive aïgue ?
- Immunosuppression prolongée et profonde (neutropénie, chimiothérapie, corticostéroïdes,…)
- Environnement riche en conidies d’Apergillus (rénovation, agriculture, …)
- **Mortalité : 50-70%
Qu’est-ce qui caractérise l’aspergillose invasive (diagnostic) ?
- Symptômes respiratoires : toux, dyspnée, douleur thoracique, hémoptysie
- Fièvre
- Lésions cutanée/autres organes
- Culture liquide/tissus infectés
- Tests antigéniques sanguins ou sur liquide bronchique (galactomannan)
Qu’est-ce qui caractérise les traitements pour l’aspergillose ?
- Débuter rapidement!
- Diminuer immunosupression si possible
- +/- chirurgie
- Voriconazole
Quel antibiotique n’est pas efficace contre l’aspergillus ?
- Fluconazole
- 5 - FC
Les infections dermatophytes (champignons filamenteux) affectent quelles parties du corps et comment surviennent-elles? Quelles en sont les 3 genres ?
- Infection peau, cheveux, ongles
- Infecitons via contact personne-à-personne, animaux (zoonoses) ou fomites (surfaces, objets)
3 genres :
- Epidermophyton spp.
- Trichophyton spp.
- Microsporon spp.
Que signifie tinea ?
Tinea = infection à dermatophytes
Quels sont les traitements des infections à dermatophytes ?
1 - Azoles (clotrimazole, ketoconazole, fluconazole, itraconazole)
2 - Allylamine (terbinafine)
3 - Griséofulvine
4 - Cyclopirox (Loprox)
Quelles sont les 2 règles de bases concernant le traitement des infections à dermatophytes ?
1 - Si peau et non sévère (pas kérion, petite zone) : Traitement topique (terbinafine 1% bid x 1 sem, Clotrimazole 1 % bid x 4 sem)
2 - Large zone, sévère, kérion, poils/cheveux, ongles : Traitement systémique (terbinafine, azole parfois)
