Intro mycologie Flashcards

1
Q

Mycètes

A

-Caractéristiques générales :
* Organismes, micro ou macroscopiques
* Appartiennent au domaine des eucaryotes
* Règne distinct des plantes et des animaux
-Nomenclature :
* Règle de la botanique
* Critères morphologiques et physiologiques
* Noms différents selon la forme sexuée ou asexuée
-Métabolisme :
* Nutrition : dégradation matière organique (= hétérotrophes)
* Majorité sont aérobies stricts
-Distinction :
* Saprobes = vivent aux dépens d’organismes morts ou en
décomposition
* Symbiontes = vivent en association bénéfique pour les 2 organismes
* Saprophytes = vivent aux dépens d’un organisme sans être pathogène ou bénéfique
* Parasites = vivent aux dépens d’un organisme en étant pathogène

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2
Q

Multiplication des champignons

A

-Reproduction par formation de spores:
* Reproduction sexuée :
- Différentiation du thalle avec apparition d’un appareil reproducteur dans lequel se déroulera la méiose
- Dissémination de méiospores
* Reproduction asexuée :
- x simple par mitose avec dissémination de mitospores
- Bourgeonnement ou via différentiation du thalle
-Reproduction sexuée ou thélémorphe :
* Fungi perfecti :
- Champignons possédant une phase de reproduction sexuée
- Selon les espèces, il existe 4 types de méioses
- Structures sexuelles ne sont pas les formes habituelles des
champignons pathogènes
* Fungi imperfecti :
- Champignons ne possédant pas de phase sexuée (connue)
-Reproduction asexuée ou anamorphe :
* x végétative sans méiose :
- Des filaments, levures et formation de spores asexuées
* Hyphes
- Allongement au niveau de la zone apicale: Des filaments, levures et formation de spores asexuées
- Transformation et segmentation du thalle: Arthrospores, chlamydospores
- Formation d’un conidiophores de spores ou d’un sporange contenant des spores
- Les spores formés s’appellent: Blastospores, conidiospores (ou conidies), dictyospores, sporangiospores

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3
Q

Structures morpho

A

-Champignons filamenteux :
* Aspect macroscopique :
- Colonies filamenteuses, chevelues, cotonneuses = hyphe aérien
* Aspect microscopique :
- Dvlpt d’un réseau de filaments +/- ramifiés appelé thalle ou mycélium
- Les filaments (ou hyphes) peuvent être septés ou non
- Dvlpt de structures spécialisées pour la reproduction asexuée
* Importante clinique :
- Dermatophytes: champignons kératinophiles, adaptés à la peau et aux phanères
- Moisissures, environnement: opportunistes
-Champignons levuriformes :
* Aspect macroscopique :
- Colonies lisses, parfois rugueuses sans formation d’hyphe
* Aspect microscopique :
- Unicellulaires de forme ronde ou ovalaire de petite taille 10 μm
- Formation d’un pseudo-mycélium : bourgeonnement successif
- Reproduction par bourgeonnement ou scission
* Importante clinique
- Candidoses et autres
-Champignons dimorphiques :
* Champignons qui existent sous les 2 formes :
- Levures souvent à 35-37°C
- Filamenteux à T° plus basses à 25-30°C
* Importante clinique
- Mycoses tropicales et subtropicales: histoplasmoses,
blastomycoses

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4
Q

≠ entre champi et bactéries : noyaux

A
  • C : eucaryote, mb nucléaire, méiose
  • B : procaryote, pas de mb nucléaire, nucléoïde
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5
Q

≠ entre champi et bactéries : cytoplasme

A
  • C : mito, RE, ribosome 80S
  • B : absence de mito et RE, ribosome 70S
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6
Q

≠ entre champi et bactéries : mb cytoplasmique ⚠️

A
  • C : ergostérol
  • B : absence de stérols
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7
Q

≠ entre champi et bactéries : paroi mb

A
  • C : glucanes, mannanes, chitine
  • B : muréine, acides teichoïques, prot
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8
Q

≠ entre champi et bactéries : métabolisme

A
  • C : hétérotrophes, svt aérobies, absence de photosynthèse
  • B : hétérotrophes, aérobies facultatifs ou strict anaérobies
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9
Q

≠ entre champi et bactéries : grandeur, diamètre moyen

A
  • C : levures 3-10𝜇m
  • B : 1-5 𝜇m
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10
Q

≠ entre champi et bactéries : dimorphisme

A
  • C : présent chez qq champi
  • B : absent
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11
Q

mycoses superficielles

A

-Limitées à la surface de la peau et des cheveux
-Non invasives mais aspect esthétique
-Clinique :
* Pityriasis versicolor: décoloration ou dépigmentation et desquamation de la peau
* Tinea nigra: macules pigmentées brunes ou noires
-Agents pathogènes :
* Malasezzia furfur, Piedraia hortea, Trichosporon spp

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12
Q

mycoses cutanées

A

-Infections de la couche kératinisée de la peau, des ongles, des cheveux
-Lésions prurigineuses, desquamations, cheveux cassants, lésions cutanées annulaires, hyperkératoses des ongles
-Agents pathogènes :
* Dermatophytes: Microsporum, Trichophyton, Epidermophyton
* Autres: Candida spp et Aspergillus spp peuvent causer des lésions unguéales

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13
Q

mycoses sous-cutanées

A

-Infections des couches profondes de la peau et des tissus sous-cutanés dont la cornée, les muscles et le tissus conjonctif
-Infections localisées non disséminées : inoculation traumatique avec formation d’abcès localisés, d’ulcères chroniques, de fistules
-Destruction tissulaire variable avec réaction immunitaire, hyperplasie épithélioïdes
-Agents pathogènes très variés :
* Moisissures hyalins: Acremonium spp, Fusarium spp
* Moisissures pigmentées: Alternaria spp, Chladiosporum spp, Exophiala spp

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14
Q

mycoses endémiques

A

-Vrais pathogènes pouvant causer des infections chez des patients en bonne santé
-Dimorphisme en fonction de la T°: levures à 35°C et moisissures à 25°C
-Champignons endémiques dans certaines régions du monde dans des niches écologiques spé
-Infections mycosiques systémiques: infections pulmonaires avec localisations secondaires
-Champignons dimorphiques :
* Histoplasma capsulatum, Blastomyces dermatidis, Coccidioidomycosis immitis et C.posadasii,Paracoccidioidomycosis braziliensis

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15
Q

mycoses opportunistes

A

-Champignons commensaux ou de l’environnement
-Virulence relativement faible à l’exception des Cryptococcus neoformans et C. gattii
-Infections chez des patients immunodéprimés, ayant des corps étrangers (prothèses vasculaires, articulaires, cathéter intraveineux….)
-Agents pathogènes très variés :
* Moisissures: Aspergillus spp, Rhizopus spp, Mucor spp
* Levures: Candida spp, Cryptococcus neoformans et C.gattiii
* Pneumocystis jirovecii
* Microsporidies

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16
Q

Diagnostic au labo

A

-Directement par isolement de l’agent infectieux:
* Microscopie
* Culture sur milieux spé
* Biologie moléculaire: détection d’ADN ou d’ARN
* Ag
* Histologie
-Indirectement = sérologie:
* Détection de la réponse immunitaire vis-à-vis d’un pathogène
* AC: IgG, IgM

17
Q

Microscopie

A

-Principes généraux :
* Champignons microscopiques —> agrandissement 1000X
* Technique rapide endéans les qq heures
-Colorations :
* Non spé: encre de Chine, Gram, Giemsa, calcofluor
* Immunofluorescence
-Indications :
* Recherche directement dans des échantillons cliniques: levures, hyphes, pseudohyphes
* Identification de champignons filamenteux après culture entre lame et lamelle

18
Q

Interprétation d’un examen direct positif

A

-Selon le type d’éléments fungiques
* Mise en évidence de Pneumocystis ou de Cryptococcus: diagnostic de
certitude
-Selon le type de prélèvement :
* Prélèvements normalement stériles: hémocultures, liquides de ponctions, biopsies, LCR: diagnostic de certitude
* Prélèvements superficiels non stériles: fonction de la clinique

19
Q

Culture et identification

A

-Méthode de référence :
* La + sensible
* Identification des champignons filamenteux
- Aspect macroscopique des colonies
- Aspect microscopique des hyphes avec la présence de
conidiophores, de sporangiophores
-Types de milieux :
* Croissance sur la plupart des géloses non sélectives utilisées pour les bactéries
* Géloses sélectives et enrichies pour les champignons
- Antibiotiques: inhibition croissance des bactéries
- Addition de lipides pour certains champignons (ex:Malassezia)
- Milieux chromogènes: substrats enzymatiques permettant
l’identification présomptive de certaines levures

20
Q

Identification des levures

A

-Milieux chromogènes :
* Identification présomptive de certains Candida
-Tests biochimiques :
* Assimilation de sucres, tests enzymatiques (production d’uréase)
* Galeries manuelles ou automatisées
-MALDI-TOF :
* Spectrométrie de masse: mesure la masse et la charge des protéines ou de peptides
* Identification en 5 minutes des levures, de certaines moisissures

21
Q

Détermination de la sensibilité aux antifongiques

A

-Détermination de la concentration minimale inhibitrice (=CMI)
* Par E-test gradient croissant d’antifungique sur une gélose
* En microplaque contenant des concentrations croissantes de 2 en 2 dilutions d’antifongique
-Méthode par disque :
* Disque contenant une concentration unique d’antifungique
* Mesure du diamètre d’inhibition -Interprétation :
* Selon les espèces: Résistance naturelle à certains antifongiques (ex Candida krusei : résistant au fluconazole)
* Selon des critères d’interprétation internationaux: EUCAST (Europe), CLSI (USA)

22
Q

Autres techniques diagnostic

A

-Biologie moléculaire
* Indications :
- Identification et détection de mécanismes de résistance sur culture
- Détection et identification dans échantillons
* Méthodes: PCR, séquençage
-Détection d’Ag :
* Indications: aspergillose invasive, cryptococcose
-Sérologie :
* Détection d’Ac