Influenza Virus Flashcards
Décrire le génome des orthomyxoviridae.
Il s’agit d’un génome à ARN- formé de 6 à 9 segments.
Est-ce que les virus influenza sont enveloppés ?
Oui.
Quelles molécules de surfaces d’Influenza sont par exemple reconnues par le systèpme immunitaire ?
L’hémagglutinine HA, ou H et la Neuraminidase.
Comment est obtenu le vaccin viral ?
C’est un virus grippal cultivé sur des oeufs embryonnés de poules d’élevages sains qui est inactivé et contient les antigènes analogues.
Comment est-ce que les virus de la grippe varient ?
Surtout au niveau des protéines de surface HA et NA suite à des mutations ponctuelles par l’ARN polymérase virale. Permet d’échapper au SI.
Que provoque l’accumulation des mutations ponctuelles du virus au cours du temps ?
Conduit à l’apparition de nouvelles souches virales, appelées aussi variants.
Qu’est-ce qui est suceptible d’arriver lors d’une co infection d’une même cellule par deux virus grippaux ? Qu’est-ce que ça peut causer ?
Peut y avoir d’un échange d’une partie du patrimoine génétique, et si jamais il s’agit de segments de deux sous types différents, ça peut être à l’origine d’une pandémie.
Comment et à quel moment se fait l’échange de gènes entre deux virus Influenza ?
Se fait par recombinaison, dans une cellule coinfectée au moment de la réplication par un saut de l’ARN pol d’un segment à un autre.
Quel est l’organisme réservoir des virus Influenza A ainsi que l’organisme ou se passe les réarrangements géniques causant les pandémies ?
L’oiseau est le réservoir, le porc est l’endroit des réassortiment.
Quel est le récepteur cible des virus Influenza ?
Il s’agit généralement de l’acide sialique, lié au galactose. L’hémagluttinine s’y attache.
Qu’observe-t-on aux extrémités des génomes d’Influenza ?
On observe des séquences terminales conservées partiellement complémentaires, pouvant mettre en place la structure en poele à frire nécessaire à la réplication et la transcription.
A quoi sert une région polyU, sur le génome des virus ?
Permet de générer les queues poly A lorsque les ARNm viraux seront faits.
Ou et de quelle façon a lieu la synthèse de la protéine HA ?
Elle se fait dans le RE, sosu forme de précurseur qui sera ensuite clivé à l’extérieur de la cellule (souche peu pathogène) ou à l’intérieur (souche pathogène).
Donner les deux fonctions de HA.
Fixation du virus sur les récepteurs cellules avec acide sialique.
Fusion membranaire dans l’endosome (pH dépendante, avec ions H+). HA constitue aussi l’antigène principal du virus.
Pourquoi, moléculairement parlant, certaines souches sont bien plus pathogènes que d’autres ?
Certaines souches arborent des sites de clivage (maturation) de HA beaucoup plus riches en acides aminés basiques, lui garantissant une meilleure accessibilité par des protéases cellulaires. Le clivage a lieu partout, et il peut donc y avoir des infections de tissus non permissibles.
Quelles sont les deux fonctions de la neuraminidase ?
C’est elle qui clive la liaison acide sialique/Galactose pour traverser les mucus. Ce clivage permet aussi d’éviter la réadsorption en fin de cycle.
Qu’est-ce que la protéine M1?
Il s’agit de la protéine de matrice, tapissant l’intérieur de l’enveloppe et maintenant les protéines ensemble. Possède des sites de liaison à l’ARN et un NLS pour importer l’ARN dans le noyau.
Qu’est-ce que M2 ?
C’est la protéine canal ionique, permettant l’entrée d’ions H+ dans la particule virale quand elle est dans l’endosome et permettant la sortie du génome quand il y a fusion membranaire.
Par quoi est bloqué le canal M2 ?
Par amantadine et rimantadine.
Parmi PB1, PB2 et PA, quelle(s) protéine(s) interagit avec les coiffes cellulaires ?
PA coupe les coiffes sur un résidu A et PB2 les vole.
Qu’est-ce que NS1 ?
Non-structural protein 1. C’est un facteur de virulence, clivant CPSF dans le but de retenir les ARNm dans le noyau pour qu’ils se fassent shourer leur coiffe.
Qu’est-ce que NS2 ?
Connue sous le nom NEP. C’est la protéine disposant d’un NES pour agir avec CRMI et sortir les RNP hors du noyau pour permettre leur traduction / encapsidation par la suite.
Sous quelle forme est-ce que l’ADN viral forme le promoteur ?
Il faut que ça soit une structure double brin : c’est pour cela que les séquences sont partiellement complémentaires, et que le complexe polymérase (PB1) se fixe sur les extrémités 5’ et 3’ de la structure en tire bouchon.
Que provoque le pH acide sur HA ?
Change la conformation de HA, exposant le peptide de fusion.
Décrire le cap snatching.
Il y a un clivage par PA de la coiffe d’un ARNm cellulaire au niveau d’un A. Puis, PB2 emporte cette coiffe avec lui, et le A est complémentaire avec un U en 3’ du génome viral. La coiffe sert en gros d’amorce, permettant la réplication. Puis, stuttering de la polymérase sur la poly U et formation d’une queue poly A : le messager viral est formé.
Quels sont les mécanismes permettant la synthèse de N40, PB1-F2, PA-X ?
N40 c’est réinitiation.
Pb1-F2 c’est leaky scanning.
PA-X C’est Framshift.
Quelle est la différence pour la synthèse des ARNc et des ARNv ?
Les ARNc font une initiation terminale en 3’, tandis que les ARNv font une initiation interne, puis se réalignent en 3’.
A quel moment est synthétisée M1 ?
Lors de la phase tardive.
Quels sont les Trois modes d’action antigrippaux ?
Les inhibiteurs de fusion membranaire, c’est à dire l’amantadine et la rimantadine, qui agissent sur le canal ionique en le bloquant.
Les inhibiteurs du relargage : inhibent les neuraminidase en occupant leur site catalytique, car analogues de l’acide sialique : Les viions ne sont pas bourgonnés. Très spécifique.
Les inhibiteurs de réplication (ribavirine).
Comment son faits les vaccins antiviraux ?
A partir de 2 souches A et 2 souches B, inactivées en les cultivant sur des oeufs de poule embryonnés et traités au formaldehyde. 6 mois à produire le vaccin.
