Hépatite C - ID et infection

Question 1

Comment faire l’identification du HCV ?

Answer 1

Sérum d’un chimpanzé contaminé, ultracentri et extraction des AN. Puis, transcription inverse pour avoir ADNc, et clonage de ces derniers. On cherche les clones positifs et non-soi, et on trouve le génome viral.

Question 2

Combien de génotypes et de sous-types différents a-t-on pour le HCV ?

Answer 2

7 génotypes et plus de 100 sous types différents.

Question 3

Combien de protéines de capside et de protéines d’enveloppe sont dénombrées pour le HCV ?

Answer 3

1 seule protéine de capside, et 2 glycoprotéines d’enveloppe : E1 et E2.

Question 4

D’ou provient la membrane enveloppant le HCV ?

Answer 4

Provient du réticulum endoplasmique.

Question 5

Qu’est-ce que la Lipoviroparticle ?

Answer 5

Il s’agit d’une association des particules virales de l’HDV avec des lipoprotéines dans la circulation sanguine, la rendant invisible au système immunitaire.

Question 6

Quels sont les facteurs expliquant l’attachement des virions du HCV avec beaucoup de nos molécules ?

Answer 6

La présence des GAG et des récepteurs LDL.

Question 7

Quels récepteurs sont particulièrement importants pour le HCV ?

Answer 7

Le récepteur CD81m ainsi que SRB1 et CLDN1 (identifié comme retrouvé dans le foie).

Question 8

Quelles sont les différentes étapes de la maladie de l’hépatite ?

Answer 8

Infection aigue, généralement asymptomatique, puis hépatite chronique, cirrhose et éventuellement carcinome hépatocellulaire.

Question 9

Quels sont les traitements standarts contre le VHC ?

Answer 9

Interféron Alpha pégylé et Ribavirine.

Question 10

Rappeler le type de virus qu’est un HCV.

Answer 10

C’est un flavivirinae, petit, enveloppé et à ARN+.

Question 11

Donner les 5 étapes du modèle d’entrée de HCV actuel.

Answer 11

1) Attachement, via LDL-R, GAG et SRB1.
2) Liaison de E2 à SRB1 et CD81, trainant une transduction de signaux.
3) Mouvement latéral de HCV associé au CD81 : Le virus entre, et CLDN1 intéragit avec CD81.
4. Endocytose, clathrine dépendante
5. Fusion membranaire pH-dépendante.

Question 12

Quelle taille fait le génome du VHC ?

Answer 12

9,6 kb.

Question 13

Aue trouve-t-on en 5’ du génome du VHC ?

Answer 13

Des IRES.

Question 14

Quelles parties du génomes servent à l’assemblage ? A la réplication et maturation ?

Answer 14

Assemblage : il s’agit des 3 premières parties en 5’, soit C, E1 et E2.
La partie suivante seCrt à la réplication et maturation.

Question 15

Combien de cadres de lectures a le génome du HCV ? Pour quoi code(nt)-il(s) ?

Answer 15

Un seul cadre de lecture ouvert, codant pour la polyprotéine qui sera divisée en 10 protéines différentes.

Question 16

A quoi correspond la structure secondaire qu’on retrouve avant l’IRES, en 5’ ?

Answer 16

Il s’agit d’un site de fixation d’un microARN non codant cellulaire, responsable soit d’un arrêt de traduction ou d’une dégradation chez la cellule. Or, chez le virus, il stabilise son ARN et le rend indégradable.

Question 17

De combien de tiges boucles sont constituées les IRES de l’HCV ? Qu’est-ce que psk1 et 2 ?

Answer 17

Composé de 4 tiges boucles. Psk1 et 2 sont des pseudonoeuds.

Question 18

Quels sont les facteurs nécessaires pour recruter la 40S sur le ribosome ?

Answer 18

eIF3 et eIF2.

Question 19

De quelles trois parties est constituée la région 3’ NTR du HDV ?

Answer 19

D’une région variable, de 40 nt, puis d’une polyUC et finalement d’une région X de 98nt.

Question 20

Quel est le rôle de la région 3’ NTR ?

Answer 20

C’est un site de reconnaissance du complexe de réplication.

Question 21

Trouve-t-on des structures uniquement aux extrémités du génome du HCV ?

Answer 21

Non, il existe d’autres structures le long du génome sur la partie codante, qui permettent de stimuler la traduction ou la réplication.

Question 22

Qu’est-ce que la protéine p7 ?

Answer 22

Il s’agit d’un canal ionique, utile au niveau de l’enveloppe cellulaire.

Question 23

Qu’est-ce que la protéine NS2 ?

Answer 23

Forme un domaine protéolitique : c’est une protéase cystéine qui s’autoclive pour libérer et maturer Ns2 et Ns3.

Question 24

Qu’est-ce que la protéine NS3 ?

Answer 24

Protéase sérine maturant toutes les autres protéines de la nucléocapside.
Porte aussi une activité hélicase pour ouvrir les structures secondaires au cours de la réplication..

Question 25

Qu’est-ce que la protéine NS4A ?

Answer 25

Simple cofacteur de NS3.

Question 26

Qu’est-ce que la protéine Ns4b ?

Answer 26

Protéine déformant les membranes du RE pour former le réseau nécessaire à la réplication virale.

Question 27

Qu’est-ce que la protéine Ns5a ?

Answer 27

Protéine phosphorylable, pouvant donner une résistance à l’interféron.

Question 28

Qu’est-ce que la protéine Ns5b ?

Answer 28

C’est l’ARNpolARNdep.

Question 29

Pourquoi certaines protéines du HCV s’associent avec certains facteurs cellulaires comme CYP après traduction ?

Answer 29

L’association avec ces facteurs confère une très forte affinité pour l’ARN viral, renforcant donc le recrutement du complexe réplicatif.

Question 30

Que cible les tests de dépistage de l’HCV ?

Answer 30

Les ARN antigénomiques, car ceux-ci prouvent qu’il y a eu traduction et formation d’un complexe réplicatif fonctionnel.

Question 31

Quelles sont les étapes précoces de la réplication du génome du HCV?

Answer 31

La protéine core de capside subit une translocation qui aboutit à un tapissement des gouttelettes lipidiques (GL VLDL). les GL ensuite relâchées dans la lumière du RE.

Question 32

Comment sont formées les GL ?

Answer 32

Enzyme.

Question 33

Quelles sont les étapes tardives de la réplication du génome de HCV ?

Answer 33

NS5A intéragit très fortement avec core et l’entraine avec elle. La proximité des génomes avec les protéines de capside entrainent l’autoassemblage et bourgeonnement.