Hépatite C - ID et infection Flashcards
Comment faire l’identification du HCV ?
Sérum d’un chimpanzé contaminé, ultracentri et extraction des AN. Puis, transcription inverse pour avoir ADNc, et clonage de ces derniers. On cherche les clones positifs et non-soi, et on trouve le génome viral.
Combien de génotypes et de sous-types différents a-t-on pour le HCV ?
7 génotypes et plus de 100 sous types différents.
Combien de protéines de capside et de protéines d’enveloppe sont dénombrées pour le HCV ?
1 seule protéine de capside, et 2 glycoprotéines d’enveloppe : E1 et E2.
D’ou provient la membrane enveloppant le HCV ?
Provient du réticulum endoplasmique.
Qu’est-ce que la Lipoviroparticle ?
Il s’agit d’une association des particules virales de l’HDV avec des lipoprotéines dans la circulation sanguine, la rendant invisible au système immunitaire.
Quels sont les facteurs expliquant l’attachement des virions du HCV avec beaucoup de nos molécules ?
La présence des GAG et des récepteurs LDL.
Quels récepteurs sont particulièrement importants pour le HCV ?
Le récepteur CD81m ainsi que SRB1 et CLDN1 (identifié comme retrouvé dans le foie).
Quelles sont les différentes étapes de la maladie de l’hépatite ?
Infection aigue, généralement asymptomatique, puis hépatite chronique, cirrhose et éventuellement carcinome hépatocellulaire.
Quels sont les traitements standarts contre le VHC ?
Interféron Alpha pégylé et Ribavirine.
Rappeler le type de virus qu’est un HCV.
C’est un flavivirinae, petit, enveloppé et à ARN+.
Donner les 5 étapes du modèle d’entrée de HCV actuel.
1) Attachement, via LDL-R, GAG et SRB1.
2) Liaison de E2 à SRB1 et CD81, trainant une transduction de signaux.
3) Mouvement latéral de HCV associé au CD81 : Le virus entre, et CLDN1 intéragit avec CD81.
4. Endocytose, clathrine dépendante
5. Fusion membranaire pH-dépendante.
Quelle taille fait le génome du VHC ?
9,6 kb.
Aue trouve-t-on en 5’ du génome du VHC ?
Des IRES.
Quelles parties du génomes servent à l’assemblage ? A la réplication et maturation ?
Assemblage : il s’agit des 3 premières parties en 5’, soit C, E1 et E2.
La partie suivante seCrt à la réplication et maturation.
Combien de cadres de lectures a le génome du HCV ? Pour quoi code(nt)-il(s) ?
Un seul cadre de lecture ouvert, codant pour la polyprotéine qui sera divisée en 10 protéines différentes.
A quoi correspond la structure secondaire qu’on retrouve avant l’IRES, en 5’ ?
Il s’agit d’un site de fixation d’un microARN non codant cellulaire, responsable soit d’un arrêt de traduction ou d’une dégradation chez la cellule. Or, chez le virus, il stabilise son ARN et le rend indégradable.
De combien de tiges boucles sont constituées les IRES de l’HCV ? Qu’est-ce que psk1 et 2 ?
Composé de 4 tiges boucles. Psk1 et 2 sont des pseudonoeuds.
Quels sont les facteurs nécessaires pour recruter la 40S sur le ribosome ?
eIF3 et eIF2.
De quelles trois parties est constituée la région 3’ NTR du HDV ?
D’une région variable, de 40 nt, puis d’une polyUC et finalement d’une région X de 98nt.
Quel est le rôle de la région 3’ NTR ?
C’est un site de reconnaissance du complexe de réplication.
Trouve-t-on des structures uniquement aux extrémités du génome du HCV ?
Non, il existe d’autres structures le long du génome sur la partie codante, qui permettent de stimuler la traduction ou la réplication.
Qu’est-ce que la protéine p7 ?
Il s’agit d’un canal ionique, utile au niveau de l’enveloppe cellulaire.
Qu’est-ce que la protéine NS2 ?
Forme un domaine protéolitique : c’est une protéase cystéine qui s’autoclive pour libérer et maturer Ns2 et Ns3.
Qu’est-ce que la protéine NS3 ?
Protéase sérine maturant toutes les autres protéines de la nucléocapside.
Porte aussi une activité hélicase pour ouvrir les structures secondaires au cours de la réplication..
