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Internat > Infectiologie > Flashcards

Infectiologie Flashcards

1
Q

Diagnostic de S. aureus

A
  • -> Prélèvement selon la clinique
  • -> Examens directs
  • Examen microscopique
  • Culture (gélose Chapman/ Gélose au sang columbia +ANC)
  • Recherche des facteurs de virulence (coagulase libre par coagulation de plasma de lapin, clumping factor par agglutination, PVL par PCR)
  • BM par PCR
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2
Q

Ttt S. aureus

A
  1. Pénicilline M (Oxa/Cloxa)

2. Vancomycine

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3
Q

Caractéristiques de S. Aureus

A
  • Cocci Gram + en amas
  • Non capsulé, Non sporulé
  • Immobile
  • Bactérie non exigeante, AAF, halophile
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4
Q

Caractéristiques de Sterptococcus pyogenes

A
  • Cocci Gram + en chainettes
  • Capsulé, Non sporulé
  • Immobile
  • Strepto béta-hémolytique du groupe A
  • Bactérie exigeante, AAF
  • R à l’Optochine, sensible à la Bacitracine
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5
Q

Diagnostic de S. pyogenes

A

–> Prélèvement selon le contexte
–> Examens directs
- Examen microscopique
- Culture (gélose au sang Columbia +/- ANC, atm enrichie en CO2, colonies en 24h à 37°C)
- Sérogroupage de Lancefield (polyoside C) = groupe A
- Test de diagnostic rapide (TDR)
test immunochromatographique sur écouvillon de gorge si score de Mac Isaac > 2

–> Diagnostic indirect
- Sérologie dans les complications post-strepto
Ac anti-streptolysine O (lors d’infections pharyngées)
Ac anti-strepdonormase B dans les infections pharyngées et cutanées

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6
Q

Epidémiologie de S. pyogenes

A

Streptocoque du groupe A, Espèce pyogène, Strictement humain, Réservoir essentiellement pharyngé
Transmission directe par voie aérienne ou par contact

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7
Q

Les complications post streptococciques

A
  • Rhumatisme articulaire aigu
  • Glomérulonéphrite aiguë
  • Erythème noueux (atteinte cutanée)
  • Chorée de Sydenham (atteinte neuro)
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8
Q

Caractéristiques de Neisseria gonorrhoeae = gonocoque

A
  • Diplocoque Gram -
  • Non capsulé, non sporulé
  • Immobile
  • Incubation de 2 à 7 jours
  • bactérie exigeante
  • Aérobie stricte
  • Fragile (milieu de transport)
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9
Q

Epidémiologie du gonocoque

A
  • Strictement humaine
  • Agent de la blennoragie, gonorrhée
  • IST !
  • transmission par voie sexuelle exclusive
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10
Q

Diagnostic du gonocoque

A

–> Diagnostic direct uniquement
- Prélèvement
Femme = 1er jet d’urine, sécrétions cervicales ou écouvillonnage endo-urétral
Homme = 1er jet d’urine, écoulement urétral ou écouvillonnage endo-urétral
- Examen microscopique
- Culture en aérobie + 5% CO2
Gélose au sang cuit + supplément vitaminique + VCN ou VCAT
lecture en 2 à 5 jours
- Recherche du génome bactérien = PCR sur le 1er jet

Tjs rechercher une infection à chlamydia en parallèle (co-infection dans 20-40 %)

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11
Q

ttt du gonocoque

A

–> C3G : Ceftriaxone en (IM) ou (IV) dose unique

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12
Q

Caractéristiques de Chlamydia trachomatis

A

–> Bactérie IC obligatoire
- corps réticulé : Forme IC de réplication, non infectieuse
- corps élémentaire : Forme EC infectieuse incapable de multiplication
–> Transmission strictement interhumaine
18 sérovars
> A-C = trachome
> D-K = IST
> L = Lymphogranulomatose vénérienne

Agent responsable de stérilité tubaire ++

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13
Q

Diagnostic de Chlamydia trachomatis

A

–> Prélèvement
1er jet d’urine ou écouvillonnage vulvo-vaginal
–> Examens directs
- Recherche du génome bactérien par PCR
- Recherche des Ag bactérien par IFI/ELISA

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14
Q

ttt chlamydia

A
  • Azithromycine dose unique 1g per os

- Doxycycline 200mg/J per os 7j

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15
Q

Caractéristiques de Treponema pallidum subsp pallidum

A
  • Bactérie spiralé (=spirochète) prenant mal la coloration de Gram
  • Non capsulé, non sporulé
  • Immobile
  • non cultivable
  • Transmission strictement humaine
  • Bactérie fragile
  • Incubation = 3 semaines

Agent de la syphilis vénérienne

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16
Q

Diagnostic Syphilis

A

–> Diagnostic direct
- Examens directs
> Prélèvement des lésions
> PCR
> Microscopie à fond noir ou coloration argentique
> Immunofluorescence

–> Diagnostic indirect
1. Test tréponémique automatisable type ELISA/EIA
> Si - : on s’arrête là
Refaire un test 3 semaines après si doute
> Si + : Faire test non tréponémique (RPR)

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17
Q

Clinique de la syphilis

A

–> Syphilis primaire
- Chancre d’inoculation indolore, propre, rosé à base indurée + adénopathies satellites régionales
Guérison apparente en 4-6 semaines

–> Syphilis secondaire
- Eruptions généralisées très contagieuses
> Roséole syphilitique
> Syphilides papuleuses

–> Syphilis latente
phase silencieuse asymptomatique et non contagieuse

  • -> Syphilis tertiaire
  • dans 20% des cas, 2 à 30 ans après infection
  • Atteintes viscérales, neuro, osseuses et cutanéo-muqueuses

(–> Syphilis congénitale)

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18
Q

Ttt de la Syphilis

A
  • -> Syphilis précoce (<1an)
  • Benzathine benzylpénicilline 2,4 MUI en IM dose unique
  • Si CI des béta-lactamines : Doxycycline 14j
  • -> Syphilis tardive
  • Benzathine benzylpénicilline 2,4 MUI en 3 IM à une semain d’intevalle
  • -> Neurosyphilis
  • Pénicilline G en IV continue de 18 à 24 MUI/j pdt 14-21j
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19
Q

Caractéristiques de Streptococcus agalactiae

A
  • Cocci Gram + en chainettes
  • Parfois capsulé, non sporulé
  • Immobile
  • Commensale des voies pharyngées, génitales et intestinales
  • Streptocoque du groupe B
  • AAF
  • bactérie exigeante
  • R à l’Optochine et à la Bacitracine
  • Hyppuricase +
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20
Q

Diagnostic de Streptococcus agalactiae

A

–> Prélèvements
–> Examens microscopiques
–> Culture
Gélose au sang Columbia +/- ANC
–> Sérogroupage de Lancefield
–> PCR

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21
Q

ttt de de Streptococcus agalactiae

A

–> Infections néonatales

= Urgence : Amox + gentamicine

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22
Q

Caractéristiques de Listeria monocytogenes

A
  • Bacille Gram +
  • Non capsulé, non sporulé
  • Mobile à 22 mais immobile à 37°C
  • Ubiquitaire, saprophyte et IC facultative
  • Croissance entre 4 et 45°C
  • Non exigeante
  • AAF
  • Esculine + rapide

Contamination d’origine alimentaire (fromage au lait cru, poissons fumés, charcuteries..)
MDO

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23
Q

Clinique de la listériose

A
  • -> Listériose néonatale
  • granulomatose septique infantile
  • Méningite aiguë++

Chez la mère : avortement tardif, mort foetale in utero, accouchement prématuré

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24
Q

Diagnostic de la listeriose

A

–> Prélèvements : hémocultures
–> Examens directs
- Examen microscopique
- Examen du LCR
> cytorachie panachée, clair-opalescent
> PCR
- Culture (gélose au sang Columbia + ANC, lecture en 24h, zone étroite d’hémolyse complète)
(–> Diagnostic indirect : Ac anti listériolysine O)
(–> Sérotypage pr enquête épidémio)

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25
Q

ttt Listériose

A

R naturelle aux Céphalosporines !!

–> Amox IV + Gentamicine ou cotrimoxazole

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26
Q

Caractéristiques de Neisseria meningitidis

A
  • Diplocoque Gram -
  • Capsulé, non sporulé
  • Immobile
  • Bactérie exigeante, Aérobie stricte
  • Fragile et strictement humaine
  • Commensale du rhinopharynx
  • 13 sérogroupes (A, B, C, W135, Y)
  • Transmission interhumaine aérienne lors de contacts directs rapprochés via gouttelettes respi
  • Incubation = 2-10j

MDO

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27
Q

Diagnostic du méningocoque

A
  • -> Prélèvements
  • -> Examens directs
  • Examen microscopique
  • Examen du LCR (LCR purulent, pléiocytose à prédominance de PNN)
  • Culture (Gélose au sang cuit + supplément vitaminique + VCN/VCAT sous 5% CO2, lecture en 24-48h à 37°)
  • Sérogroupage obligatoire
  • PCR
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28
Q

Ttt du méningocoque

A
  • -> Céfotaxime ou Ceftriaxone

- -> Amox IV si CMI<0,1 mg/L

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29
Q

Vaccination méningocoque

A
  • -> Vaccin conjugué
  • Monovalent (C) –> à 5 et 12 mois
  • Tétravalent (A, C, Y, W135)
  • -> Vaccin non conjugué (utilisable chez les plus de 2 ans)
  • -> Vaccin multicomposant contre le sérogroupe B
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30
Q

Prophylaxie méningocoque

A
  • -> Vaccination autour d’un cas d’IIM
  • Le + rapidement possible ! Délai max de 10j
  • -> Antibioprophylaxie
  • Eliminer le portage oropharyngé dans l’entourage et limiter sa diffusion
  • Rifampicine 2/j pdt 2j
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31
Q

Caractéristiques de Streptococcus pneumoniae

A
  • Diplocoque lancéolé Gram +
  • Capsulé, non sporulé
  • Immobile
  • Bactérie exigeante, AAF
  • Sensible à l’Optochine
  • Alpha hémolytique
  • Streptocoque non groupable, 91 sérotypes capsulaires
  • Strictement humaine
  • Commensale du rhinopharynx
  • Pneumolysine
  • Transmission interhumaine via gouttelettes
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32
Q

Diagnostic du pneumocoque

A
  • -> Prélèvements
  • -> Examens directs
  • Examen microscopique
  • Examen du LCR (Purulent, pléiocytose à prédominance de PNN)
  • Culture (gélose au sang columbia enrichie en CO2, lecture en 24h)
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33
Q

ttt du pneumocoque

A

Diminution de la sensibilité aux béta-lactamines = PSDP

  • Modification de l’affinité des PLP (35%)
  • recombinaison génétique = gène mosaïque
  • acquisition de gènes des streptocoques oraux

–> ttt = Amox ou C3G (IV)

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34
Q

Vaccination du pneumocoque

A
  • -> Vaccin conjugué à 13 valent
  • à 2, 4 et 11 mois
  • -> Vaccin polyosidique non conjugué 23 valent
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35
Q

Caractéristiques Haemophilus inflenzae

A
  • Coccobacille Gram -
  • Capsulé, non sporulé
  • Immobile
  • Exigeante en facteur X et V, AAF
  • 6 sérotypes
  • Strictement humaine
  • Commensale des voies respiratoires supérieures
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36
Q

Diagnostic Haemophilus inflenzae

A

–> Prélèvements
–> Examens directs
- Examen microscopique
- Examen du LCR (purulent, pléiocytose à prédominance de PNN)
- Culture
> Gélose au sang de mouton (facteur X) + Polyvitex (V)
> Gélose au sang cuit ou sang de cheval
> Lecture en 18h
- Sérotypage

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37
Q

Ttt Hib

A

R naturelles aux Macrolides C16, Lincosamides, glycopeptides

  • -> ttt = Amox, Cefpodoxime
  • -> C3G (IV) pour les méningites
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38
Q

Vaccination Hib

A

Vaccin conjugué polyosidique

- à 2, 4, 11 mois

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39
Q

Caractéristiques de Legionella pneumophila

A
  • Bacille Gram -
  • Non capsulé, non sporulé
  • Mobile (ciliature monotriche)
  • Aérobie stricte
  • Pathogène strict obligatoire
  • 15 sérogroupes (le 1 dans 90% des cas)
  • Habitat hydrique et hydrotellurique
  • Pas de transmission interhumaine

MDO

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40
Q

Diagnostic Legionellose

A

–> Prélèvements
–> Examens directs
- Examen microscopique
- Antigénurie (technique immunochromatographique/ ELISA mais ne détecte que le sérogroupe 1)
- Immunofluorescence directe
- Culture
> Systématique
> Gélose nutritive BCYE (cysteine+fer+charbon)
> Colonies en verre fritté
> Spectrométrie de masse
- PCR

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41
Q

Ttt Légionellose

A
  1. Macrolides
  2. FQ
  3. +/- Rifampicine
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42
Q

Caractéristiques de Mycobacterium tuberculosis

A

= Bacille de Koch = BK

  • Bacille acido-alcoolo résistant
  • Non capsulé, non sporulé
  • Immobile
  • Aérobie stricte
  • Croissance lente et exigeante
  • Incubation de 1 à 3 mois
  • Strictement humain
  • Transmission aérienne via gouttelettes de Pflügge

MDO

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43
Q

Diagnostic Tuberculose

A

–> Prélèvements
(ECBC sur 3 j, lavage gastrique, LBA, aspirations bronchiques)
–> Examens directs
- Examen microscopique
> Coloration de Ziehl Neelson
> Coloration à l’auramine
- Examen du LCR (clair, prédominance lymphocytaire)
- Culture
> Milieux solides : Loewenstein-jensen / coletsos (à l’oeuf) ou Middlebrook
> Milieux liquides : Middlebrook (en 8-10j)
- BM : PCR

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44
Q

Ttt Tuberculose

A
  • –> Tuberculose maladie
  • Rifampicine + Isoniazide + Ethambutol + Pyrazinamide
  • -> Tuberculose latente
  • Bithérapie RIF + INH 3 mois
  • Monothérapie RIF ou INH 6 ou 9 mois
45
Q

Vaccination tuberculose

A
  • -> BCG = bacille de calmette et guérin
  • Vaccin vivant atténué
  • Injection intradermique stricte
46
Q

Caractéristiques de Escherichia coli

A
  • Entérobactéries
  • Bacille Gram -
  • non capsulé, non sporulé
  • Mobile ou Immobile
  • Non exigeante, AAF
  • Nitrate réductase +, H2S -, lactose +
  • Commensale du microbiote
  • Transmission oro-fécale, contamination directe ou indirecte
47
Q

Diagnostic de E. coli

A

–> Prélèvements
–> Examens directs
- Examen des selles
> Etat frais
> Examen microscopique (Gram)
- Culture
> Gélose ordinaire (MH)
> Spectrométrie de masse
- Sérotypage (recherche de l’Ag O, K, H par agglutination)
- PCR

48
Q

Caractéristiques des Salmonelloses Typhiques

  • Salmonella enterica Typhi
  • Salmonella enterica Paratyphi
A
  • Entérobactéries
  • Bacille Gram -
  • Capsulé, non sporulé
  • Mobile (ciliature péritriche)
  • Non exigeante, AAF
  • Pathogène strict et strictement humain
  • Transmission oro-fécale interhumaine
  • Contamination directe mais surtout indirecte

Fièvre typhoïde = MDO

49
Q

Diagnostic des Salmonelloses Typhiques

A

–> Prélèvements
- Hémoculture
- Coproculture
–> Examens directs
- Examen microscopique
- Culture
> Milieu SS
> Spectrométrie de masse
- Diagnostic d’espèce (recherche des Ag O, H et vi par agglutination grâce à des antisérums spécifiques)

50
Q

ttt des salmonelloses typhiques

A
  • C3G ou FQ

- Tétracyclines per os 7 j

51
Q

Caractéristiques des Salmonelloses non typhiques

  • Salmonella enterica Typhimurium
  • Salmonella enterica Enteritidis
A
  • Entérobactéries
  • Bacille Gram -
  • Non capsulé, non sporulé
  • Mobile
  • Pathogène strict du TD
  • Réservoir Animal et humain
  • Transmission oro-fécale interhumaine
  • Contamination directe ou indirecte
52
Q

Diagnostic des Salmonelloses non typhiques

A

–> Prélèvements = Copro
–> Examens directs
- Examen des selles
> Aspect, couleur, consistence
> Etat frais
> Coloration Gram (déséquilibre de la flore)
- Culture
> SS
> Spectro de masse
- Diagnostic d’espece par agglutination
- PCR sur les selles

53
Q

Caractéristiques de Shigella spp

A
  • Enterobactéries
  • Bacille Gram -
  • Non capsulé, non sporulé
  • Immobile
  • Non exigeante, AAF
  • Strictement humain et pathogène strict
  • Transmission oro-fécale interhumaine
  • Contamination directe ou indirecte

4 sérogroupes (dysenteriae, flexneri, boydii, sonnei)

54
Q

Diagnostic des shigelloses/dysenteries bacillaires

A

–> Prélèvements
–> Examens directs
- Examen des selles
> Aspect, couleur, consistence
> Etat frais
> Coloration Gram
- Culture (SS)
- Diagnostic d’espèce
- PCR

55
Q

Caractéristiques de Clostridium difficile

A
  • Bacille fin et droit, Gram +
  • Capsulé et sporulé
  • Mobile
  • Anaérobie stricte
  • Commensale de la flore digestive (A* et humaine)
  • Transmission par voie oro-fécale directe ou indirecte
56
Q

Diagnostic de Clostridium difficile

A

–> Prélèvements = selles liquides
–> Examens directs
- Examen microscopique
- Mise en évidence de la bactérie : recherche de la glutamate déshydrogénase dans les selles (agglu)
- Détection directe des toxines A et/ou B
> ELISA
> Test immunochromatographique
> PCR
- Culture
> Milieu sélectif CCFA (coeur-cervelle + sg de cheval + cyclosérine + Céfoxitine)
> Lecture en 48h
> Odeur de crottin de cheval

57
Q

ttt Clostridium difficile

A
  1. Metronidazole
  2. Vancomycine
  3. Fidaxomicine
  4. Transplantation fécale
58
Q

Caractéristiques Campylobacter jejuni

A
  • Bacille spiralé Gram -
  • Capsulé, non sporulé
  • Mobile en vol de mouette
  • Exigeante
  • Microaérophilie
  • Capnophile
  • Thermotolérante
  • Zoonose
  • Transmission alimentaire ++ (volaille)
59
Q

Diagnostic de Campylobacter jejuni

A

–> Prélèvements
–> Examens directs
- Examen microscopique
- Culture
> Karmali
> Lecture en 48h
> Spectrométrie de masse
- BM = PCR

60
Q

ttt Campylobacter jejuni

A

–> ATB non reco
Dans les cas graves : Azithromycine ou FQ

–> Ttt symptomatique (antipyrétique et réhydratation)

61
Q

Caractéristiques de Helicobacter pylori

A
  • Bacille spiralé Gram -
  • Non capsulé, non sporulé
  • Mobile (ciliature péritriche)
  • Microaérophilie
  • Fragile
  • Uréase + !!
  • Pathogène strict et strictement humaine
  • Transmission par voir orale
62
Q

Diagnostic de Helicobacter pylori

A
  • -> Méthodes invasives
  • Biopsies gastriques (antrales et fundiques)
  • Recherche de l’activité uréasique
  • Examen anatomo-pathologique
  • Culture (que si nécessité d’un antibiogramme) lente
  • PCR
  • -> Méthodes non invasives
  • Test respiratoire à l’urée (heli-kit)
  • Détection des Ag dans les selles (contrôle éradication)
  • Sérodiagnostic
63
Q

Ttt Helicobacter pylori

A
  1. Trithérapie : IPP + Amox + Clarithromycine 14j
    OU + Levofloxacine
    OU + Metronidazole
  2. ttt probabiliste
    Quadri bismuthée : IPP + Bismuth + Métronidazole + tétracycline 10j

Quadri concomitante : IPP + Amox + Clarithromycine + Métronidazole 14j

64
Q

Caractéristiques de Pseudomonas aeruginosa

A
  • Bacille fin Gram -
  • Capsulé, non sporulé
  • Mobile (monotriche)
  • Aérobie stricte
  • Non exigeante, non fermentante
  • Ubiquitaire, aquaphile
  • Saprophyte de l’environnement
  • -> Pathogène opportuniste
65
Q

Diagnostic de Pseudomonas aeruginosa

A

–> Prélèvements
–> Examens directs
- Examen microscopique
- Examen du LCR
- Culture
> milieu ordinaire ou gélose au sang
> Après 24h : odeur de fleurs de seringa avec production de pigments verts (pyoverdine et pyocyanine)
> Milieu spécifique : King A ou King B (mise en évidence des pigments)
> Spectrométrie de masse

66
Q

Caractéristiques du HSV

A
  • Herpesviridae
  • Virus enveloppé avec spicules
  • tégument entre enveloppe et capside
  • Capside à symétrie icosaédrique
  • ADN double brin linéaire
  • Strictement humain
  • Contamination par contact direct cutanéomuqueux
  • Incubation courte = 2-7 j
67
Q

Diagnostic HSV

A
  • –> Diagnostic direct
  • Ecouvillonnage des lésions
  • Recherche du génome par PCR
  • Recherche d’Ag viraux par ELISA/immunofluorescence
  • Recherche du virus par culture (MRC5) –> Cytopathigène
  • -> Diagnostic indirect
  • Sérologies peu utilisées
  • Recherche des Ac spécifiques IgG/M
68
Q

ttt HSV

A
  • -> Inhibiteurs de l’ADN polymérase virale, analogues de la guanosine nécéssistant une tri-P dépendante de la thymidine kinase virale
  • -> Aciclovir
  • -> Valaciclovir
69
Q

Caractéristiques du Cytomégalovirus

A
  • Herpesviridae
  • Virus enveloppé d’origine nucléaire avec spicules
  • tégument entre enveloppe et capside (protéine pp65)
  • Capside à symétrie icosaédrique
  • ADN double brin linéaire
  • Génome divisé en 2 segments
    Incubation longue : 15 à 30 jours
  • Strictement humain
  • Ubiquitaire, pathogène opportuniste
  • Contamination par contacts directs :
    > Via sécrétions oro-pharyngées et liquides biologiques infectés
    > Materno-foetale in utero
    > Transfusion de sang ou allogreffe
70
Q

Clinique des infections congénitales du CMV

A

–> Suite à virémie maternelle
> 30-50% suite à primo-infection

–> Transmission materno-foetale fréquente = 1% de ts les nouveau-nés
- 10% symptomatiques à la naissance = maladie des inclusions cytomégaliques
foetopathie avec atteinte neuro, multiviscérale = 30% de mortalité… ou des séquelles …

  • 90% asymptomatiques mais
    > 5-10% = séquelles neuro-sensorielles tardives (surdité, retard psychomoteur)
71
Q

Diagnostic du CMV

A

–> Systématique devant une suspicion d’infection materno-foetale, d’anomalies à l’échographie ou toute forme sévère ou chez l’ID

  • -> Diagnostic direct
  • Recherche du génome viral par PCR
  • Antigénémie pp65
  • Culture (cellules MRC5)
  • Examen histologique sur biopsie tissulaire –> Cellules à grosses inclusions intra-nucléaires

–> Diagnostic indirect
- Sérologie anti-CMV
- Datation de l’infection par l’indice d’avidité des IgG
> Avidité faible si infection récente

Démarche diagnostic :
> Primo-infection chez la femme enceinte : IgG + IgM
avec contrôle sérologique 15j après + Avidité des IgG
> Infection congénitale : PCR ou culture sur le liquide amniotique ou les urines de bébé
> ID : PCR sur biopsie du tissu ou Ag pp65

72
Q

ttt CMV

A
  • -> Inhibiteurs de l’ADN polymérase virale
  • Ganciclovir
  • Valganciclovir
73
Q

Caractéristiques de l’entérovirus

A
  • Picornaviridae
  • Virus non enveloppé
  • Symétrie icosaédrique
  • ARN simple brin à polarité positive
  • Réservoir strictement humain
  • Très résistant dans l’environnement
  • Contamination oro-fécale directe et indirecte, respiratoire ou transplacentaire

Entérovirus A, B, C, D = non poliomyélitiques
Poliovirus

74
Q

Diagnostic de l’Entérovirus

A
  • -> Prélèvements
  • -> Diagnostic direct
  • Recherche du génome viral par RT-PCR
  • Recherche et typage du virus sur culture cellulaire
  • Identification par Immunofluorescence, séroneutralisation ou RT-PCR
75
Q

Vaccin entérovirus

A
  • -> Vaccin trivalent
  • Vaccin inactivé obligatoire à 2, 4, 11 mois 6 et 11-13 ans
  • Puis rappel à âge fixe (25, 45, 65 ans)

Vaccin atténué per os (non utilisé en France)
- CI chez la femme enceinte et l’ID

76
Q

Caractéristiques du Rotavirus

A
  • Reoviridae
  • Virus non enveloppé
  • Capside complexe de symétrie icosaédrique
    3 couches de protéines concentriques
  • ARN double brin segmenté
    11 segments cistroniques : 6 protéines structurales de la capside et 5 non structurales
  • Fréquent, ubiquitaire et très résistant
  • Incubation = 1-2 j
  • Contamination oro-fécale directe ou indirecte
77
Q

Diagnostic Rotavirus

A

Non réalisé en systématique

  • -> Repose sur la détection du virus dans les selles
  • Rechercher d’Ag viraux : protéine VP6 par agglutination, ELISA ou tests rapides immunochromatographiques
  • Recherche du génome par RT-PCR
  • Microscopie électronique : technique de référence (non réalisé en pratique)

Sérologie sans intérêt!

78
Q

Caractéristiques du Papillomavirus

A
  • Papillomaviridae
  • Capside à symétrie icosaédrique
  • ADN double brin linéaire
    codant pour des protéines non structurales (dt les protéines oncogènes E6 et E7) et structurales
  • Réplication intra-nucléaire
  • > 100 génotypes
  • Strictement humain et très résistant
  • Incubation longue
  • Tropisme cutanéo-muqueux
  • Contamination sexuelle, directe ou materno-foetale

Oncogènes ++ (16-18)
Condylome (6-11)

79
Q

Diagnostic Papillomavirus

A

–> Prélèvements = Frottis ou biopsie
–> Examens directs
- Cyto-histopathologie : Recherche de Koïlocytes et de dysplasie
- Détection du génome viral et génotypage sur frottis
> Capture d’hybride
> PCR classique ou en temps réel
- Recherche des génomes viraux et typage sur coupe histologique par hybridation in situ
- Quantification des ARNm codant les protéines oncogènes E6 et E7

80
Q

Vaccination HPV

A
  • -> Vaccin recombinant (protéine L1 de la capside)
  • Nonavalent (6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52, 58) en 3 injections SC à M0, M2 et M6
  • Tétravalent (6, 11, 16, 18) à M0, M1, M6
  • Bivalent (16, 18) à M0, M1 et M6

Autres prophylaxies :

  • Protection des IST
  • Dépistage par frottis cervico-vaginaux et examen cytologique tous les 3 ans à partir de 25 ans chez la femme
81
Q

Ttt HPV

A
  • –> ttt des lésions cancéreuses
  • Cryothérapie, conisation, laser ou hystérectomie
  • Hystérectomie élargie, radioT voire chimioT
  • -> ttt locaux des lésions cutanées et muqueuses
  • Cryothérapie, laser, chirugie
  • Acide salicylique
  • Acide trichloracétique
  • Imiquimod
  • Podophyllotoxine
  • 5-FU
82
Q

Caractéristiques du virus de la grippe

A
  • Orthomyxoviridae
  • Influenzavirus A, B, C
  • Virus enveloppé
    > Hémagglutinine (liaision acide sialique)
    > Neuraminidase (activité sialidase)
  • Symétrie hélicoïdale
  • ARN monocaténaire de polarité négative segmenté (8 pour A et B, 7 pour C)
  • Possède une ARN polymérase et nucléoprotéine = Ribonucléoprotéine
  • Incubation courte = 1-3j
83
Q

Epidémiologie des virus grippaux

A
  • -> Le virus A
  • Infecte l’homme et l’animal : Zoonose
  • Epidémie hivernale
  • Pandémies grippales
  • -> Le virus B
  • Strictement humain
  • Epidémies hivernales
  • -> Le virus C
  • Strictement humain
  • Cas sporadiques

Contamination par voie aérienne directe via aérosols ou indirecte

84
Q

Diagnostic de la grippe

A

–> Non systématique lors d’épidémie
–> Examens directs
- Ecouvillonnage nasal ou aspiration naso-pharyngée
- Recherche d’Ag viraux
> Test immunochromatographique (peu sensible)
> IFI ou ELISA
- Recherche du génome viral par RT-PCR

Diagnostic indirect à visée épidémiologique

85
Q

ttt de la grippe

A

–> ttt symptomatique
antalgiques, antipyrétiques, sédatifs de la toux, repos
–> Inhibiteurs de la neuraminidase virale
- Oseltamivir
- Zanamivir

86
Q

Vaccin de la grippe

A

–> Tri ou tétravalent inactivé
par culture sur oeuf
2 souches A et 1/2 souche(s) B

1 injection SC en octobre/novembre

  • Immunité protectrice efficace à 70-90% après 2-3 semaines et pendant 6-9 mois = vaccination annuelle !
  • Réduit l’intensité des symptômes
  • Recommandé pour les personnes fragiles et les professionnels de santé
87
Q

Caractéristiques de la Rubéole

A
  • Togaviridae
  • Virus enveloppé (E2 et E1)
  • Symétrie icosaédrique
  • ARN simple brin de polarité positive
  • Très fragile
  • Strictement humain
  • Contamination directe par voie aérienne (microgouttelettes)
  • Cas sporadiques ou épidémiques
  • Incubation = 16 jours

patient contagieux 1 semaine avant et après le début de l’éruption

88
Q

Clinique de la rubéole

A
  • -> Primo-infection
  • 50% asymptomatique
  • Généralement bénigne
  • Phase d’invasion = Sd infectieux discret, adénopathies cervicales douloureuses, arthralgies, exanthème non prurigineux ou éruption rubéoliforme

–> Rubéole congénitale
- Que si primo-infection maternelle
- Risque de transmission variable selon l’âge
> 90% au 1er trimestre
> 30% au 2eme
> 100% au 3eme
- Risque d’atteinte foetale
> Mortalité in utero
> Embryopathie < 20 SA
Triade de Gregg : Surdité de perception, malformations oculaires, troubles neurologiques, cardiaques et dentaires
> Foetopathie ou rubéole congénitale évolutive si atteinte au 2 ou 3ème trimestre

89
Q

Diagnostic Rubéole

A

Toute éruption chez une femme enceinte doit y faire penser !

  • –> Prélèvements : sécrétions nasales, écouvillon naso-pharyngé, urines, villosités choriales ou liquide amniotique
  • Recherche du génome viral par RT-PCR
  • Recherche du virus par culture (difficile)

–> Diagnostic indirect
- Recherche des IgG par ELISA
Recherche d’une immunité ou élévation du titre des Ac d’un facteur 4
- Indice d’avidité des IgG
- Recherche des IgM
- Recherche des IgA (tjs présentes lors d’une primo-infection mais non spécifiques) –> Pas d’IgA = pas de primo-infection

–> Démarche diagnostic
- Recherche d’infection pdt la grossesse (IgG spécifiques)
> Si - : Refaire une sérologie à 20 SA et vaccination en post partum
- Examen pour contage récent
> Séroconversion ?
> Elevation des IgG ?
- Examen pour contage tardif
> Sérologies IgG+IgM
- Recherche d’infection du foetus
Recherche du génome viral par RT-PCR sur liquide amniotique
Recherche des IgM sur sang foetal 6 semaines après l’éruption de la mère (et > 22 SA)

Tjs confirmer diag pré-natal sur le new-né par RT-PCR sur urines ou salive et recherche d’IgM sur sérum

90
Q

Vaccin rubéole

A

–> Vaccin vivant atténué trivalent
Rougeole - Oreillons - Rubéole

  • à 12 et 16-18 mois
    CI pendant la grossesse
    MDO
91
Q

Caractéristiques du VHA

A
  • Picornaviridae - Hepatovirus
  • Virus nu
  • Symétrie icosaédrique
  • ARN monocaténaire de polarité positive
  • Strictement humain
  • Ubiquitaire
  • Incubation courte = 2-6 semaines
  • Transmission directe oro-fécale et manuportée; indirecte via les eaux sales, crudités et coquillages

MDO

92
Q

Diagnostic VHA

A
  • -> UNIQUEMENT Sérologie par ELISA
  • IgM = hépatite aiguë
  • IgG = marqueur d’une immunité

(recherche du génome viral par RT-PCR ds sang ou selles dans labo spé)

93
Q

Vaccin VHA

A

Vaccin inactivé

  • 1 injection (IM) puis rappel 6 à 12 mois après
  • Immunité protectrice pendant 10 ans
94
Q

Caractéristiques du VHB

A
  • Hepadnaviridae - Orthohepadnavirus
  • Virus enveloppé
  • Symétrie icosaédrique
  • ADN circulaire partiellement bicaténaire
  • Strictement humain
  • Oncogène ++
    Incubation 4 à 28 semaines
  • Modes de contamination (Parentérale, sexuelle, mère-enfant (jms in utero)
  • -> Virus sous 2 formes
  • Particules de Dane = particules infectieuses complètes
  • Sphérules et bâtonnets = enveloppe produit en excès
  • -> Constitution antigénique
  • Ag HBs (à la surface du virus, Ag d’enveloppe)
  • Ag HBc (protéine de capside)
  • Ag HBe (protéine de capside, témoin de la réplication virale, sécrétée dans le sérum)
95
Q

Diagnostic du VHB

A
  • -> Hépatite B aiguë (guérison dans 90%)
  • les transaminases = cytolyse hépatique
  • Ag HBs +
  • IgM anti HBs +/-
  • Charge virale +
  • Ag HBe +

–> Diagnostic Hépatite B chronique (10%)
- Portage chronique inactif
> 30% des sujets porteurs chroniques
> Ag HBs +, IgG anti HBc, charge virale -, Ag HBe -, Ac anti HBe +
contrôle des transaminases et CV par PCR

  • Hépatite B active (70%)
    > Cytolyse hépatique
    > Marqueurs sérologiques : Ag HBs, IgG anti-HBc, CV +, Ag HBe +, Ac anti HBe -
    > Mesure de l’activité et de la fibrose
    Ponction biopsie hépatique
    Techniques non invasives = élastométrie, combinaison de marqueurs biochimiques

Evolution : Stéatose - Fibrose - Cirrhose - Carcinome

96
Q

Ttt Hépatite B

A

—> Pas de ttt ATV si aiguë
—> Si Hépatite B chronique active :
- Monothérapie en 1ère intention Ténofovir/Entécavir
Obj : Séroconversion (Ac anti HBs +) et réponse virologique MS éradication impossible (persistance sous forme épisomale)
- Suivi biologique ts les 3 mois (transaminases, sérologies)

  • -> Interféron alpha
  • -> Inhibiteurs nucléosidiques (Entécavir, Telvibudine, Lamivudine)
  • -> Inhibiteurs nucléotidiques (Ténofovir, Adéfovir)
  • -> Transplantation hépatique
97
Q

Vaccin VHB

A
  • -> Fraction antigénique recombinante de l’Ag HBs
  • 3 (IM) à 2, 4, 11 mois
  • Vaccination obligatoire chez tous les nourrissons
  • Vaccination obligatoire pour le personnel médical et paramédical
  • -> Sérothérapie du nouveau-né de mère Ag HBs +
  • Injection d’Ig anti-HBs à la naissance
  • Vaccination en 3 injections (M0, M1, M6)

90% de passage en chronicité si infection à la naissance!

98
Q

Caractéristiques du VHC

A
  • Flaviviridae - Hepacivirus
  • Virus enveloppé
  • Symétrie icosaédrique
  • ARN simple brin de polarité +
  • Incubation = 2-12 semaines
  • 6 génotypes principaux
  • Strictement humain
  • Oncogène ++
  • Modes de contamination (Sanguine ++, mère-enfant, sexuelle = IST ++, inconnu ds 20-30%)
99
Q

Diagnostic du VHC

A
  • -> Dépistage
  • ARN-VHC détectable 1-2 semaines après contage
  • Ac 10 semaines après

La sérologie Ac anti-VHC > Test ELISA de 3ème génération (possible test combiné pour rechercher l’Ag de capside)
Toute séro + ou douteuse doit ê confirmée par la détection et la quantification de la CV

–> Autres
- Détection et quantification de la CV
> RT-PCR en temps réel
- Génotypage par RT-PCR (intérêt pronostic)

100
Q

Ttt VHC

A

–> Antiviraux actifs sur le VHC
- Ribavirine
Analogue nucléosidique de la guanosine
- Inhibiteurs de la protéase NS3-4A
-prévir
- Inhibiteurs du NS5A
-asvir
- Inhibiteurs du NS5B
-buvir

101
Q

Caractéristiques du VIH

A
  • Retroviridae - Lentivirus
  • Virus enveloppé (gp 120 et 41)
  • Symétrie icosaédrique
  • ARN monocaténaire diploïde de polarité +

Structure : LTR - gag (p24) - pol - env (gp 160) - LTR

102
Q

Epidémiologie du VIH

A

Virus trèèèès variable et fragile
Réservoir strictement humain

  • -> 2 types
  • VIH-1 = ubiquitaire, classé en 3 gp (M++, O, N, P)
  • VIH-2 = Afrique de l’Ouest (A-H)
  • -> Modes de contamination
  • Sexuelle (IST ++)
  • Sanguine
  • Mère-enfant (surtout accouchement et allaitement)
103
Q

Diagnostic VIH

A

Sérologie :

  • ARN viral détectable dès 11-12 j après contage
  • Ag p24 14-15 j après, persiste 2 semaines
  • Premiers Ac vers 21j

ELISA mixte combiné de 4ème génération –> Sensible +
Si +, Test de confirmation = WB –> Spécifique +

104
Q

ttt cystite aiguë simple

A
  1. Fosfomycine - trométamol dose unique

2. Pivmécilinam 5 jours

105
Q

ttt cystite aiguë à risque de complications

A
  • -> ttt ne pouvant être différé
    1. Nitrofurantoïne 7j
    2. Fosfomycine - Trométamol
  • -> ttt pouvant être différé
    1. Amox
    2. Pivmécillinam
    3. Nitrofurantoïne
    4. Fosfo-Trométamol
    5. Triméthoprime
106
Q

ttt d’une PNA

A
  1. FQ per os ou C3G (IV)
107
Q

Colonisation gravidique

A
  1. Amox
  2. Pivmécillinam
  3. Fosfomycine - Trométamol
  4. Triméthoprime
  5. Nitrofurantoïne, Cotrimoxazole (sauf les 2 premiers mois de grossesse), Amox+Ac clavulanique ou céfixime
108
Q

ttt Cystite aiguë gravidique

A
  1. Fosfomycine - Trométamol
  2. Pivmécillinam
  3. Nitrofurantoïne, céfixime ou ciprofloxacine

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