Génétique microbienne Flashcards
3 TYPES DE RÉSISTANCE
Perméabilité
Modification ou destruction de l’AB.
Modification de la cible
PERMÉABILITÉ
Altération de la perméabilité, pour bloquer l’entrée aux antibiotiques.
Une pompe qui fait sortir le médicament.
MODIFICATION OU DESTRUCTION AB
Bactérie produise des enzymes qui lysent l’AB. Cela rend l’AB incapable de se fixer à la cible.
MODIFICATION CIBLE
La bactérie fait en sorte de modifier sa cible pour qu’elle ne soit plus reconnue par un AB.
Exemple : Ribosome.
EUCARYOTES VS BACTÉRIES (2)
Ribosomes sont différents, donc AB faiblement toxiques pour humains.
Nos cellules n’ont pas de peptidoglycan, les bactéries oui
CHROMOSOME BACTÉRIE
Le chromosome d’une bactérie est généralement circulaire. Il y a des gènes essentiels, virulence et résistance.
PLASMIDE BACTÉRIE
Le plasmide (plus petit) d’une bactérie n’a pas de matériel essentiel. Virulence + Résistance + Capacité métabolique supplémentaire
COMMENT LES BACTÉRIES SE DIVISENT
par fission binaire
Elle se divise lorsqu’elle devient trop grosse.
CHANGEMENT (3)
Changement séquence ADN
Changement dans le nombre de transcrits (Régulation transcriptionnelle)
Changement dans la qualité de produit de gène actif (Régulation post-transcriptionnelle)
CHANGEMENT SÉQUENCE ADN
Réarrangement de gène (mutation)
Amplification de gène
CHANGEMENT NOMBRE DE TRANSCRITS (RÉGULATION TRANSCRIPTIONNELLE)
Activateurs
Répresseurs
SURTOUT PARASITE ET CHAMPIGNON.
CHANGEMENT DANS LA QUALITÉ DE PRODUIT DE GÈNE ACTIF (RÉGULATION POST-TRANSCRIPTIONNELLE
Ajout de cofacteur ou groupe prostétique.
Clivage protéolytique
Interaction avec d’autres maromolécules
SURTOUT BACTÉRIE.
Stratégies d’activation-inactivation (5)
- Régulation transcriptionnelle
- Regroupement de gènes adjacent dans un opéron
- Contrôle de plusieurs gènes non contigus dans un régulon (même protéine régulatrice)
- Contrôle de plusieurs gènes non contigus dans un stimulon (même stimulus)
- Régulation au niveau traductionnel
MUTATION
définition
Modification de la séquence des nucléotides de l’ADN qui est transmise à la cellule fille.
MUTATION
spontané
Radiation naturelle ou erreur survenue lors de la réplication. Peu fréquent dans une réplication bactérienne, très fréquent dans une rétrotranscription d’un rétrovirus.
MUTATION
induite
Variété d’agents physiques, chimiques et biologiques. Plus fréquent.
altérations (5)
Délétion, insertion, silencieuse, mauvais sens, non-sens.
génotype
Séquence nucléotidique précise du génome.
phénotype
Propriété observable des mutants. (Sélectionnable si ça lui donne un avantage sur les autres bactéries dans l’environnement ayant ces conditions)
système de réparation efficaces (5)
- Réparation directe de l’ADN
- Excision
- Recombinaison
- SOS (Transfert de gènes)
- Réparation sujette à erreur (induit mutation)
Échanges de gènes (3)
transformation
conjugaison
transduction
TRANSFORMATION
définition
Acquérir de nouvelles propriétés comme la résistance ou une infection plus virulente, par simple contact avec l’ADN d’une bactérie morte.
TRANSFORMATION
compétence
Capacité de certaines cellules d’être transformées par de l’ADN externe.
TRANSFORMATION
acquise
CaCl2, décharge électrique.
TRANSFORMATION
naturelle
Bacillus, Influenzae, Neisseria, Strept pneumoniae.
CONJUGAISON
définition
Échange de matériel génétique par un contact cellule-cellule, unidirectionnel passant de mâle à femelle.
CONJUGAISON
plasmide conjugatifs
Codent les gènes nécessaires à l’échange.
CONJUGAISON
plasmide conjugatif type R
Résistance aux AB, observé tant chez G+ que G-.
D. Difficile utilise un mécanisme distinct du pili sexuel afin s’assurer le rapprochement entre les cellules bactérienne.
CONJUGAISON
plasmide non conjugatif
Peut être transféré en même temps que le plasmide conjugatif par un mécanisme de mobilisation.
TRANDUCTION
définition
Transfert d’ADN bactérien d’une cellule à une autre par l’intermédiaire d’une infection par un bactériophage.
TRANDUCTION
bactériophage
Virus parasites des bactéries qui reproduisent l’enveloppe protéique (capside) et le matériel génétique (ADN ou ARN).
TRANDUCTION
cycle lytique
Entraîne la mort des cellules bactérienne. Phage virulent.
TRANDUCTION
cycle lysogénique
Matériel génétique du phage s’intègre dans le chromosome de la bactérie et s’y réplique sans affecter l’hôte. Un événement rompt le cycle lysogénique en permettant à l’ADN du phage de s’exciser du chromosome. Ensuite, de nouvelles particules de phage sont produites et sont libérés, ce qui entraine la lyse cellulaire et la mort de la bactérie dans le cycle lytique. Phage lysogènes aussi appelés phage tempérés.
TRANDUCTION
généralisée
Résultat de l’empaquetage accidentel de fragments de l’ADN de l’hôte à l’intérieur d’une capside de phage.
Ne peut pas se propager suite à l’infection initiale, car pas d’information pour synthétiser les nouvelles capsides.
TRANDUCTION
spécialisée
Un hybride phage-bactérie est créé dans le génome du prophage est improprement excisé du génome de l’hôte puis empaqueté à l’intérieur du phage.
Peut se propager.
TRANSPOSITION
définition
: Mouvement de segments d’ADN à l’intérieur d’une même cellule. Requière une proximité physique. Peut s’opérer entre différents éléments génétiques
séquence insertion
x
transposons complexes
Transposons complexes
(IS + autres gènes)
Encode à l’intérieur de la région centrale des gènes de toxines ou de résistances aux AB.
phage transposable
x
intégron
Recrute des gènes de résistance et les intègrent ensemble devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes en même temps. Peuvent être à l’intérieur des transposons complexes ainsi que sur des plasmides.
Restriction-modification de classe II
Protège les bactéries contre l’invasion d’Adn étranger.
méthylase
Modifie l’ADN de l’hôte à certaines séquences spécifiques pour le protéger d’une digestion éventuelle.
nucléase de restriction
Détruit l’ADN étranger non méthylé, ce qui restreint l’entrée de matériel génétique nouveau.
Administration d’AB…
L’administration d’AB perturbe l’équilibre de la flore. Cela favorise la sélection de souches résistante, dans le patient et son environnement.
Produit pharmaceutiques synthétisé par les bactéries et autre organismes
Hormone de croissance humaine Insuline Alpha-1-antitrypsine Érythropoïétine DNase Activateur du plasminogène Vaccin contre hépatite B
diagnostic PCR
Amplification en chaîne par la polymérase. Grâce à cela, on prévoit que cela prendra 1 heure identifié une bactérie, au lieu de 2-3 jours.
ADN double-brin => Dénaturation => Appariement des amorces => Élongation => 2 copies => 2ème cycle, 4 copies, etc.
